InvasionDB: A genome and gene database of invasive alien species

Invasive alien species(IAS) are species whose introduction to areas outside of their native range cause harm to economics, biodiversity, and the environment. Understanding the genetic basis of invasiveness is critical for preventing invasion by an alien species and managing IAS with eco-friendly control methods. In addition, uncovering the genomic features of IAS is essential for accurately predicting invasiveness. However, even though increasing efforts have been devoted to sequencing the genomes of IAS, there is still not an integrated genome database for the invasive biology community. Here, we first determined a list of invasive plants and animals by mining references and databases. Then, we retrieved the genomic and gene data of these IAS, and constructed a database, Invasion DB. Invasion DB encompasses 131 IAS genomes, 76 annotated IAS assemblies, and links these data to conventional functions such as searching for gene coding sequences and Pfam, KEGG, NR annotations, BLAST server, JBrowse, and downloads services. Next, we analyzed 19 invasivenessrelated gene families which confer invasiveness in insects. To study the roles of noncoding RNA in invasiveness, we also annotated 135 494 mi RNAs, 89 294 r RNAs, and 2 671 941 t RNAs from these IAS. In summary, Invasion DB is useful for studying the invasiveness at the genomic level, and thus helps to develop novel management strategies to control IAS.     

BP神经网络在焉耆盆地农田排水量

利用BP神经网络技术对焉耆盆地农田排水量进行预测。利用灰色关联度分析确定了排水量与各影响因素的关系，选取了对排水量影响最大的5个因素作为BP网络的输入，利用均匀设计方法，确定了最优的神经网络结构。估算结果表明利用BP神经网络可以准确的估算农田排水量，最大相对误差仅为-2.45％。     

盐酸克伦特罗在牛体不同组织中的代谢和残留分析综述

就盐酸克伦特罗(CL)的理化作用,在牛不同体组织中的代谢和残留特性、残留检测中存在的问题等方面的研究进展进行了综述分析与讨论。结果表明:CL大部分经尿排出,其余大都残留在牛内脏组织、毛发及眼睛中,代谢时间较长。其中毛发和眼睛中的代谢最慢,且与色素沉积有关。另外,CL的残留与样品的保存时间及温度也有一定关系。虽然我国自1997年,已明令禁止将盐酸克伦特罗作为饲料添加剂使用,但是至今没有给出针对生产环节的采样和检测方法;盐酸克伦特罗的非法使用依然给人们的生命安全造成威胁。     

猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)诊断DNA微阵列的构建

为构建猪繁殖与呼吸综合征（PRRS）诊断DNA微阵列，应用RT—PCR从猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）C14—2分离株和欧洲型弱毒疫苗株VP046扩增并克隆获得戋洲型重组质粒C14P9（基因号：AY775132）、PRRS—PS9（基因号：AY775134）、Ulb（基因号：AY775135）、Y11（基因号：AY775133）、Y12（基因号：AY775136）和欧洲型基因重组质粒E6和E8。PCR法制备的靶基因和探针纯化后，质量浓度分别为300～600mg／L和200-400mg／L。芯片杂交动力学研究表明，杂堑信号强度随靶基因和探针浓度的增加而增强，最佳靶基因质量浓度为200mg／L，探针适宜范围为3～3000μg／L，系统灵敏性为3μg／L。靶基因杂交特异性研究表明，除个别靶基因在某一温度下存在交叉反应和杂交信号弱外，大多数靶基因在40～56℃下杂交信号强。采用AY775133、AY775134、E6和E8靶基因构建PRRS诊断DNA微阵列在40℃下预杂交1h、48℃湿盒避光杂交6h后经洗涤和扫读分析，杂交信号强、斑点明显、特异性高，按SNR≥1．5为标准能够区分PRRSV蔓洲型和欧洲型。应用PRRS诊断DNA微阵列检测了AMERVAC-PRRS、PRRSV弱毒疫苗、C14—2株、SCU株和临床样本，能正确区分PRRSV基因型。研究结果表明构建的PRRS诊断DNA微阵列可用于PRRS临床诊断和基因分型。     

盐度波动和中草药制剂对脊尾白虾存活·生长和免疫的影响

[目的]为大规模脊尾白虾的养殖提供理论基础。[方法]研究了盐度波动幅度（S0、S3、S6和S9分别代表盐度波动幅度为0、3、6和9）和中草药制剂（0、1%、2%和4%）对脊尾白虾存活、生长和免疫的影响,试验周期60 d。[结果]1%中草药和S6盐度波动处理组脊尾白虾的特定生长率、饲料转换效率和超氧化物歧化酶活性均高于其他处理,且显著高于同一中草药添加水平的S0,S3和S9盐度波动处理组。回归分析结果表明,在S0、S3和S6 3个盐度波动水平,随盐度波动幅度增加,饲料中的中草药制剂的最适添加量呈下降趋势,分别为2.74%、1.77%和0.51%;在4个中草药制剂添加水平,随饲料中的中草药制剂添加量增加,脊尾白虾生长的最适盐度波动幅度呈下降趋势,分别为5.26、4.95、3.54和1.97。[结论]盐度、中草药制剂及其相互作用对脊尾白虾的存活、生长和免疫均有显著影响,因此在养殖时应加以注意。     

小麦黄矮病抗性遗传研究

采用 3× 4不完全双列杂交 ,对抗黄矮病性母本和丰产性父本的组合效应进行了黄矮病抗性遗传研究。结果表明 :①亲本的一般配合力效应与特殊配合力效应正向相关 ,而一般配合力效应更具重要性 ;②黄矮病抗性遗传符合加性—显性遗传模型 ,以加性基因效应占绝对优势 ,遗传决定度高达 97 6 8% ,狭义遗传力为 90 3%。     

猪圆环病毒分子生物学研究进展

猪圆环病毒是迄今发现的一种最小的动物病毒,是严重影响养猪业发展的重要病毒之一,引起猪出现新的传染病。随着近年来对其研究的不断深入,在病毒分子生物学方面取得了重要进展。文章对该病毒的分子生物学研究进行了简要综述。     

刈割对羊草和全叶马兰生长与种间关系的影响

研究刈割对羊草(Leymus chinensis)和全叶马兰(Kalimeris integrifolia)生长与种间关系的影响。结果表明:刈割强度越大,相对生长速率越大;留茬4.8和12cm之间差异显著;刈割改变植物间相互作用的方向,削弱种间关系在群落中的重要性;刈割对羊草生长的影响较大。     

减毒鼠伤寒沙门菌在雏鸡体内的安全性与免疫原性研究

通过鸡接种不同剂量的SL8132、SL8786、SL8132/pcDNA3s与SL8786/pcDNA3s,测定其致病力与免疫效果,检测了诱导乙肝表面抗体(抗-HBs)的动态变化.结果表明减毒鼠伤寒沙门菌原菌SL8132、SL8786接种后连续观察雏鸡10d,不同剂量组的感染均未引起死亡.接种后7周,肝脏、脾脏中已没有菌落,粪便中仅有极少量的菌落.口服减毒鼠伤寒沙门菌在完成抗原呈递后即被鸡体免疫系统所清除,未发现雏鸡出现明显毒副作用.SL8132/pcDNA3s与SL8786/pcDNA3s疫苗诱导的抗-HBs动态检测发现,抗-HBs在免疫后水平逐渐升高,到第8周最高,此后逐渐下降.原菌SL8132与SL8786与重组菌株SL8132/pcDNA3s与SL8786/pcDNA3s均具有良好的安全性与免疫原性.     

一个紫云英F;重组自交系群体的农艺性状与养分吸收评价北大核心CSCD

利用以闽紫7号紫云英为母本、信阳种紫云英为父本获得的F;代群体,评价了该群体18个株系的农艺性状和养分吸收状况,为筛选优异紫云英株系做参考。结果表明,在盆栽条件下,不同株系紫云英在盛花期表现出一定的性状变异。相关性分析表明,鲜重、干重与氮、磷、钾积累量相关性高,对植株的养分吸收影响较大;株高、分枝数、真叶数是影响植株地上部鲜重、干重的重要因素。主成分分析表明,地上部鲜重、干重以及地上部氮、磷、钾积累量是反映紫云英株系性状优劣的主要指标。聚类分析结果显示,当距离系数d=25时,18份紫云英材料可分为3类,其中Ⅰ类群综合性状最优,包括m83xzh-1-4-4、m83xzh-1-4-6、m83xzh-1-4-8和m83xzh-1-4-13共4个株系。综合考虑紫云英生长性状、鲜草产量及植株养分积累量等因素,m83xzh-1-4-4的地上部磷、钾积累量和地下部氮、钾积累量最高,每盆分别高达11.00 mg,145.18 mg,22.15 mg和15.27 mg,同时该株系具有较高的鲜草产量,每盆高达44.63 g。本研究可为后续按目标性状选育紫云英新品种提供参考。