橡胶树炭疽菌孢子的拉曼光谱特征及其在聚类分析中的应用

为了弥补分类学上单纯依靠形态学与分子生物学鉴定炭疽菌的不足，基于共聚焦显微拉曼技术的橡胶树炭疽菌3个种群孢子聚类分析方法，对橡胶树炭疽菌孢子的拉曼光谱进行扫描，找到了其共有的位于1 005 cm?1, 1 155 cm?1和1 515 cm?1处的3个主要的拉曼峰以及其他次级峰，并对峰的产生来源进行初步确认。结合拉曼光谱与主成分分析（PCA），依靠3个主要的拉曼峰以及其他次级峰在PC1、PC2以及PC3的三维空间得分图中快速有效地将3种橡胶树炭疽菌孢子区分开来，为鉴别炭疽菌孢子提供了一种新方法，满足了灵敏与微量的要求，且样品无需预富集和预处理。     

橡胶树白粉菌侵染过程转录组学分析

为明确橡胶树白粉菌Erysiphe quercicola参与致病过程相关基因的表达情况，基于RNA-Seq测序技术对橡胶树白粉菌侵染过程进行转录调控研究，通过对病原菌孢子（0 h）及3个侵染时期（接种1、3和30 d）的转录组进行比较，筛选差异表达基因并对其进行功能注释分析，同时对不同侵染阶段的基因表达趋势进行聚类分析。结果表明，相比于病原菌孢子，3个侵染时期（接种后1、3和30 d）分别有198、458和27个差异表达基因。基因功能富集分析发现氧化还原酶相关基因在侵染1 d阶段显著富集，可能参与病原菌侵染前期对活性氧的防御。基因表达趋势聚类分析显示不同侵染阶段的基因共分为51种表达类型，其中编码候选效应蛋白基因集中分布在侵染1 d后上调表达的6个类型当中。表明橡胶树白粉菌侵染过程相关基因具有明显的功能倾向性和表达趋势特征。