荧光实时定量PCR技术及其在水产养殖研究中的应用

荧光实时定量PCR技术是近年来快速发展起来的一门新技术,它是核酸探针技术、荧光共振能量传递技术(Fluorescence Resonance Energy Transfer,FRET)和PCR技术的有机结合。与常规PCR相比,它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自动化程度高、能较准确定量等特点。本文综述了荧光实时定量PCR技术的基本原理及几种广泛应用的荧光化学方法,并概述了荧光实时定量PCR技术在水产养殖研究领域的应用现状,并对荧光实时定量PCR技术的应用前景进行了展望。     

A SCAR marker linked to the N gene for resistance to root knot nematodes (Meloidogyne spp.) in pepper (Capsicum annuum L.)

The root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) are important nematode pests and cause serious diseases in pepper in the world. No molecular markers linked to the nematodes resistance N gene have been reported. In this paper, ‘Carolina Wonder’ (Capsicum annuum L.), a sweet pepper line resistant to root-knot nematode with N gene, ‘20080-5-29’ (C. annuum L.), an inbred line susceptible to root-knot nematode with good horticultural characteristics, and their F₂ progeny with 320 individuals were used as materials. Evaluation of resistance and susceptibility of parental lines, F₁ and F₂ progeny inoculated with root-knot nematodes (Meloidogyne incognita) were carried out. ‘Bulked segregant analysis’ method was used to search for polymorphic markers from 512 pairs of AFLP primers. Based on the assessment of resistance and susceptibility and polymorphism of the AFLP marker in F₂ population, the genetic linkage distance between the AFLP marker and the N gene was estimated. One AFLP marker E39/M41-339 was obtained and transferred to a SCAR marker amplifying a 315 bp DNA fragment linked to the N resistant allele and a 331 bp fragment linked to the N⁺ susceptible allele. The distance between the molecular marker and the nematodes resistance N gene is 6.3 cM. This research delivered a valuable tool for the marker assisted selection of nematodes resistance in pepper.     

Effects of salvianolic acid B on neurons during oxygen/glucose deprivation and reintroduction

AIM: To observe the damage induced in the primary cultured rat cortical neurons by oxygen/glucose deprivation and reintroduction, and to investigate the neuroprotective mechanism of salvianolic acid B (SalB). METHODS: Primary cultured rat cortical neurons were randomly divided into the control group, the model group and the SalB group. The cell model was established by oxygen/glucose deprivation for 3 h followed oxygen/glucose reintroduction for 24 h. The cortical neurons viability was determined by MTT assay. The leakage rate of lactate dehydrogenase (LDH) was measured by chromatometry. The mitochondrial membrane potentials (MMP) and the apoptosis rate were quantitatively analyzed by flow cytometry. The cytosolic free calcium was assessed using LSCM. The morphologic changes of neuronal nuclei were observed by Hoechst 33342 fluorescence staining. RESULTS: Compared to the model group, the cortical neurons viability, the survival rate and the fluorescence value of MMP in the SalB group were obviously increased (P<0.05,P<0.01). In addition, in the SalB group, the leakage rate of LDH, the fluorescence intensity of cytosolic free calcium and the apoptosis rate were significantly lower than those in the model group (P<0.01). CONCLUSION: The neuroprotective mechanism of SalB in the oxygen/glucose deprivation and reintroduction neurons would be due to the fact that SalB maintains the MMP and the calcium homeostasis.     

赤霉素对非洲菊生长开花的影响研究

对非洲菊品种"洛斯"采用不同浓度的GA处理,研究其对非洲菊开花的影响。结果表明:赤霉素可使株高、叶片数、茎粗和叶绿素含量都有增长,不同浓度的赤霉素对花卉的品质影响不同,赤霉素以50 mg/L为最佳浓度处理。     

10种海参16SrDNA 序列多样性及其亲缘关系分析

运用PCR扩增10种海参的16SrDNA部分序列,并测序.获得大小为566bp的序列,利用DNAsp4.0软件分析比较10种海参的碱基组成、各碱基变异位点数、插入或缺失位点数,并采用MEGA4.0软件分析彼此间的遗传距离.结果发现,10种海参富含AT碱基,A T的含量平均为57.0%,不同种海参间发生碱基转换、颠换及发生插入或缺失变异的位点数差异很大,10种海参彼此间的遗传距离在0.007～0.316之间.所得结果与GenBank中10种海参的相应序列进行比对分析,同时用MEGA4.0和PAUP4.0软件构建进化树,分析其亲缘关系.结果表明,利用16SrDNA序列的差异可以将分属于海参科(Holothuriidae)与刺参科(Stichopodidae)的海参完全分开,瓜参科(Cucumariidae)的2个种与刺参科的亲缘关系较近.对不同海参种间亲缘关系的分析结果还表明,同属于剌参科的仿刺参(Apostichopus japonicus)与加州拟刺参(Parastichopus californicus)和具疣拟刺参(Parastichopus parvimensis)亲缘关系最近,同属于海参科的格皮氏海参(Pearsonothuria graeffei)与白尼参属的蛇目白尼参(Bohadschia argus)和图纹白尼参(B.marmorata)亲缘关系最近,而同样为海参科的墨西哥海参(Holothuria mexicana)则与红腹海参(Hothuria edulis)关系最近.这些资料为海参的种质资源管理、新种引进和种质改良提供了基础的分子生物学依据.     

基于RBF网络的联合收获机脱粒滚筒恒速控制

对联合收获机行走、收割、脱粒系统进行分析,提出了系统数学模型的基本形式.针对该模型的高阶次、非线性和难以准确获得具体参数等问题,将模型差分方程的基本形式分解为与控制信号无关和有关的2个部分,利用RBF神经网络技术分别对2个部分进行在线辨识,控制器根据辨识结果进行控制,构建了自适应控制.利用该系统进行了不同条件下的仿真和试验,试验证明利用RBF网络可快速有效地拟合被控对象.当对象参数发生变化时,系统可实现跟踪适应,达到较好的控制效果.     

阳离子交换树脂催化制备生物柴油的工艺优化

以油菜籽油加工下脚料为原料,运用正交实验设计方法对Ｄ００２阳离子交换树脂催化制备生物柴油工 艺参数进行优化。最佳操作参数为：反应温度７０℃、催化剂用量为１０％、油／醇质量体积比１∶０．６,反应时间为４ｈ。 验证实验表明,生物柴油转化率达９７．３％。同时,还比较了Ｄ００２阳离子交换树脂作催化剂与浓硫酸作催化剂制备 生物柴油的效果。     

绿原酸诱导凡纳滨对虾抗氧化功能及抵御低盐度胁迫的响应

选择健康、均匀, 体质量为(6.74 ± 0.08) g的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei),  将360尾随机分为4组, 分别投喂含有0 mg/kg、100 mg/kg、200 mg/kg和400 mg/kg绿原酸的饲料28 d, 随后将对虾从盐度为32的天然海水直接转移至盐度为10的海水中暴露72 h, 测定对虾肝胰腺TAS、GPx、CAT活力和GPx、CAT基因表达水平。结果显示, 在天然海水养殖条件下, 绿原酸对凡纳滨对虾肝胰腺TAS、GPx活性无明显影响, 但投喂含有绿原酸的饲料28 d, 对虾肝胰腺GPx、CAT和GPx、CAT基因表达水平显著高于D0组(P<0.05), 以D2组GPx活性和GPx、CAT基因表达水平最高, 分别为164.29 U/mgprot和1.61、2.14倍。低盐度胁迫24 h, D0组对虾抗氧化反应表现在TAS、GPx活性和GPx基因表达水平较28 d显著升高(P<0.05), 分别增加了31.30%、27.96%和170%, 而绿原酸各组对虾肝胰腺TAS、GPx活性和GPx基因表达水平显著低于D0组(P<0.05), 说明绿原酸可有效缓解低盐度胁迫下对虾抗氧化系统酶活性的剧烈波动。低盐度胁迫72 h, 绿原酸各组对虾肝胰腺TAS、GPx、CAT活性及CAT基因表达水平均明显高于D0组。上述结果表明绿原酸能够诱导凡纳滨对虾的抗氧化系统功能, 在凡纳滨对虾抵抗低盐度胁迫中发挥着重要的作用。本研究旨为开发绿色植物提取物在对虾养殖中的应用, 解决盐度胁迫对机体造成的氧化损伤提供理论依据。

     

鱼糜制品中基因组DNA提取方法的比较

将分别采用普通酚-氯仿抽提法和试剂盒(柱吸附法)提取DNA的两种方法加以比较,以确定最适提取鱼糜制品DNA的方法.将鱼肉和鱼糜制品作为原料,用两种方法提取基因组DNA,利用分光光度计测定其A260与A280的吸光值,计算比率估计核酸的纯度,并利用琼脂糖凝胶电泳观察DNA片段在凝胶中的位置;并用线粒体16S rRNA基因PCR扩增产物鉴定所提取的基因组DNA.     

水稻穴播同步侧位深施肥技术试验研究

根据水稻种植的农艺要求,在同步开沟起垄水稻精量穴播技术的基础上进一步提出了一种水稻穴播同步侧位深施肥技术。调查了在不同种植方式条件下不同品种的水稻根系在稻田中的分布情况,根据根系的分布情况研究了深施肥技术参数,确定了深施肥深度以不超过10 cm为宜,研究了培杂泰丰、玉香油占2种品种水稻施入0~5 cm土层与5~10 cm土层中的肥料比例关系。试验结果表明华南农业大学研制的同步开沟起垄侧位深施肥水稻精量穴播机能满足水稻穴播同步侧位深施肥技术的要求,可以作为实施水稻穴播同步侧位深施肥技术的载体。生产试验表明:水稻穴播同步侧位深施肥技术具有增产、节本的效用。在同等的施肥条件下,机械播种及深施肥处理的有效穗、穗平均实粒数、结实率均高于机械播种人工撒施肥和人工撒直播人工撒施肥,增产418.5~957 kg/hm2,增幅5.86%~13.41%。该文研究可为深施肥机具的设计提供参考依据。