碱裂解法快速提取番茄DNA的研究

以转基因番茄MM-R3a的嫩叶、子叶、下胚轴和根为试验材料,用碱裂解法快速提取番茄总DNA并用于PCR扩增.结果表明,以番茄子叶和幼嫩叶片为材料,使用该方法提取的DNA纯度和质量浓度相对较高,以稀释10倍～30倍的DNA为模板的PCR结果相对稳定.     

鲜食切片黄瓜新品种夏炎的选育

黄瓜新品种"夏炎"是以高代自交系HA-1-1-6-y为母本、8113-1-1-6-y为父本,杂交配制而成的一代杂种。该品种具有早熟、丰产、抗病、果实商品性好等特点。第一雌花节位4~6节,瓜长35 cm,横径2.8~3.0 cm,果形指数大于12,果实硬度11.4 kg/cm2,腔径14.7 mm,单瓜鲜重226 g,产量约90000 kg/hm2,适宜于鲜食切片。该品种高抗霜霉病、白粉病、枯萎病等病害,耐高温,适宜于北方春季、夏茬或南方越夏栽培。     

黄瓜cpSSR引物的多态性与通用性

从黄瓜叶绿体基因组序列中设计15对以A或T为重复单元的微卫星引物,其中12对处于基因组非编码区,3对位于基因编码区。这15对引物在21份黄瓜材料中均有扩增产物,但只有非编码区的微卫星表现出位点多态性。每对引物可检测1~3个等位基因,平均2.0个,引物的多样性值(polymorphic information content PIC)从0至0.484,平均值0.202。15对引物在甜瓜和南瓜中均能通用,13对可在西瓜中通用。这些叶绿体引物可用于黄瓜及其近缘种的叶绿体遗传研究。     

影响盾叶薯蓣微块茎形成因素的研究

研究了离体条件下影响盾叶薯蓣微块茎形成的各种因素。结果表明:6.0或8.0 mg/L BA和1.0 mg/L KT组合适宜于微块茎的形成;提高培养基中蔗糖浓度有利于微块茎形成,在蔗糖浓度为80 g/L的培养基上,微块茎发生频率高达77.3%,平均重量达367.6 mg;黑暗处理有利于微块茎发生,20 d黑暗处理使微块茎发生频率达81.2%,平均重量为386.2 mg,且微块茎质量较好。这些微块茎在离体或田间均能较好的萌发、生长。     

黄瓜EST-SSR位点信息

从NCBI网站下载6344条黄瓜EST,通过前处理得到全长为2．91×10^6bp的无冗余EST6033条。利用SSRHunt-er软件从这些序列中搜寻到729个SSR,分布于667条EST中,出现频率为12．08％,分布频率为1／3．99kb。单、二和三核苷酸重复是主导类型,三者共占总数的89．71％。A／T、AG／CT和AAG／CTT分别是单、二和三核苷酸的优势重复基元,分别占总数的29．77％、21．12％和14．95％。黄瓜EST-SSR以4～10次重复为主,基序长度主要集中于12～20bp。最后对这些EST-SSR的多态性潜能进行了评价。     

甜瓜叶绿素含量全基因组关联分析及候选基因预测

【目的】挖掘与叶绿素含量显著关联的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点和候选基因，为甜瓜叶绿素含量改良提供分子靶点和基因资源。【方法】以118份具有广泛变异的甜瓜种质为自然群体，采用2 531 449个高质量SNP标记对叶片叶绿素含量进行全基因组关联分析，挖掘优异等位变异，并预测候选基因。【结果】甜瓜自然群体叶绿素含量趋向正态分布，包含5个明显的亚群。利用Q模型对2次试验的叶绿素含量及其最佳线性无偏预测(best linear unbiased prediction, BLUP)值进行关联分析，共检测到15个显著位点，分布在甜瓜第1、2、4、8、11、12号染色体上，表型贡献解释率为5.62%～6.69%。其中，8个位点的不同基因型之间存在显著表型差异。结合关联位点的候选区域和转录组数据，共鉴定到28个差异表达基因，其中MELO3C018513.2和MELO3C003666.2是改良甜瓜叶绿素含量的潜在候选基因。【结论】通过高质量SNP标记Q模型的全基因组关联分析，共检测到15个与叶绿素含量显著关联的位点，筛选出2个可能与叶绿素含...     

甜瓜HD-Zip家族基因的鉴定及在表皮毛发育中的表达分析

【目的】研究HD-Zip家族基因在甜瓜表皮毛发育过程中的表达模式和功能。【方法】利用生物信息学方法对甜瓜HD-Zip家族基因进行全基因组鉴定、染色体定位、系统进化分析、基因结构分析、理化性质分析、保守序列分析、顺式作用元件预测、共线性分析、蛋白互作网络预测和调控该家族基因的MicroRNA预测，并结合甜瓜不同组织部位和不同表皮毛材料的转录组分析及qRT-PCR验证，筛选与甜瓜表皮毛发育相关的基因。【结果】甜瓜基因组编码37个HD-Zip家族成员，不均等地分布在9条染色体上。该家族成员分为4个亚家族，各亚家族成员具有相似的基因结构和保守基序。共线性分析显示，甜瓜HD-Zip家族基因的形成存在着连锁遗传且伴随串联复制、片段复制等染色体复制事件的发生，其基因组进化过程与黄瓜高度相似。顺式元件分析显示，该家族成员含有与表皮毛发育相关的赤霉素、茉莉酸、脱落酸和水杨酸响应元件。调控HD-Zip家族基因的MicroRNA主要有miRNA166、miRNA17和miRNA395家族。不同表皮毛甜瓜材料的转录组分析显示，该家族中CmHDZ1、CmHDZ3、CmHDZ14、CmHDZ17和CmHDZ36基...     

基于偏最小二乘回归的挂灰程度和柔软性对烟叶质量的影响分析

烟叶挂灰是烤烟烘烤过程中的一种普遍现象。为了探明烟叶挂灰程度和柔软性对K326品种烟叶质量的具体影响，在重庆奉节烟区开展了进一步研究。按照不同挂灰面积、颜色深浅、不同柔软性采集3个不同水平的烟叶样品，鉴定其外观质量，测定其常规化学成分并感官评吸卷烟小样，结果表明，柔软性与叶片结构、油分、身份、还原糖含量等极显著正相关，相关系数分别为0.90、0.89、0.82、0.72;挂灰面积与烟叶颜色、氮碱比、色度等极显著负相关，与烟碱和氯离子含量极显著正相关，相关系数分别为-0.76、-0.64、-0.50、0.60、0.55。以烟叶质量各指标为因变量，以柔软性、挂灰面积、挂灰深浅为自变量，建立偏最小二乘回归方程，可以较准确地估算柔软性和挂灰程度对烟叶质量的具体影响，对因变量信息总变异的解释比例最高可达86.81%(叶片结构)。探明了柔软性、挂灰面积、挂灰深浅对烟叶质量各指标影响的相对重要性，柔软性、挂灰面积、挂灰深浅对烟叶外观质量影响的相对重要性分别为1.45、0.84、0.45。偏最小二乘回归能很好地用来建立烟叶质量估算模型，烟叶挂灰程度和柔软性对烟叶质量有显著影响。