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101.
凤仙花坏死斑病毒的RT-PCR和巢式PCR检测 总被引:2,自引:1,他引:1
根据凤仙花坏死斑病毒(Impatiens necrotic spot tospovirus,INSV)S RNA上的核衣壳蛋白(N)基因序列(登录号为AB109100)保守区设计了3对特异性引物.应用常规RT-PCR和巢式PCR方法从表现同心圆症状的文心兰植株上检测得到了预期DNA片段,且巢式PCR检测灵敏度比常规PCR高.序列分析结果表明,该病毒的N基因序列和已经发表的凤仙花坏死斑病毒(登录号为AB109100、AB207803、DQ425096)核苷酸序列同源性为99%,确定表现同心圆症状的文心兰上携带了凤仙花坏死斑病毒. 相似文献
102.
控制植物开花的途径有光周期现象、GA、春化途径、自主途径,在光周期途径中,CO基因促进开花通过直接上调FT和SOC1基因表达,FT(FLOWERING LOCUS T)是光周期途径植物开花时间决定关键基因,并认为FT基因表达产物可能就是长期追寻的开花刺激物质,这种开花刺激物质经过叶片到茎尖的长距离运输,最终引起茎顶端花器官分化的起始.本研究以莲瓣兰大雪素作为实验材料,用RACE方法快速地克隆全长cDNA,生物信息学分析全长eDNA为662 bp,含有编码框和3'UTR,具有完整的开放阅读框(ORF) 522 bp,编码173氨基酸的蛋白质.通过系统发育分析获得一个FT同源基因.本研究为进一步对这个基因的功能研究奠定了基础. 相似文献
103.
104.
烟草黑胫病菌分子检测 总被引:9,自引:0,他引:9
随着聚合酶链式反应 (PCR)技术的发展 ,用特异引物进行真菌种间核糖体DNA片段进行PCR扩增以达到鉴定生物种的目的已成为一种简便、快捷的技术和方法。本试验根据从GeneBankdatabase获得的疫霉属真菌 (Phytophthoraspp .)rDNAITS区段序列 ,合成了 1对 1 7bp特异寡聚核苷酸引物进行了不同病原菌、病组织及土壤中寄生疫霉菌 (Parasiticavar.nicotianae)的特异扩增试验 ,提供并完善了一套快速检测该菌的技术和方法。1 材料与方法1 1 供试菌株 烟草疫霉菌菌株 ,交… 相似文献
105.
大丽轮枝菌核糖体基因ITS区段的特异扩增 总被引:11,自引:0,他引:11
根据棉花黄萎病菌(Verticillium dahliae)核糖体基因ITS区段的碱基编码序列,设计合成了1对为26 bp的PCR特异扩增引物(引物1:5'CATCAGTCTCTCTGTTTATACCAACG,和引物2:3'CGATGCGAGCTGTAACTACTACGCAA),进行了大丽轮枝病菌PCR特异扩增试验。试验结果表明:本试验设计合成的这对引物,能对大丽轮枝菌全基因组DNA和人工接种棉花黄萎病病株组织特异地扩增到大丽轮枝菌核糖体基因ITS区段的324 bp分子片段,该对引物可用于棉花黄萎病的分子鉴定和分子监测。本试验结果对棉花黄萎病的早期诊断和病原菌的检测和监测有潜在的应用价值。 相似文献
106.
在温室人工接种鉴定了澳大利亚16个棉花种植地区30个棉花黄萎病菌株的致病性.结果表明:根据人工接种5个棉花品种的抗感反应和病情指数,30个供试菌株划分为4种致病类型.致病类型I(3个菌株)具有较强的致病能力,致病类型Ⅳ(5个菌株)的致病能力较弱.致病类型Ⅱ(12个菌株)和致病类型Ⅲ(10个菌株)的致病能力中等,为澳大利亚棉花种植地区的主要菌系类型. 相似文献
107.
为了明确不同地理位置杂草稻群体的遗传多样性现状、遗传分化水平以及杂草稻群体之间的基因流。本研究利用24对SSR引物对来自黑龙江、吉林、辽宁、江苏和广东共17个杂草稻群体的469份杂草稻样本进行的遗传多样性及遗传分化分析。结果表明杂草稻群体的总体遗传多样性较为丰富(I=0.36, He=0.23),不同杂草稻群体间的遗传多样性指数差异较大,He在0.07~0.35之间。AMOVA分析结果表明,杂草稻群体70%的变异来源于群体间,30%的变异来源于群体内。聚类分析显示,相邻地区的种群间相似性较高,江苏省杂草稻的不同种群间存在较高遗传分化;遗传分化与基因流结果表明,17个杂草稻种群间总的Nm值为0.117,总Fst值为0.694。地理位置较近的种群间Nm普遍较高,Fst较低;而地理位置较远的种群间Nm普遍较低,Fst较高。总之,本实验中的杂草稻群体总体的遗传多样性水平较高,群体之间的遗传多样性指数差异较大;杂草稻群体间的遗传分化显著大于群体内的分化,符合遗传距离的空间隔离模型;杂草稻群体间和地区间有一定水平的基因流,本研究对理解杂草稻在农田生态系统中的适应性进化及制定杂草稻控制策略具有重要意义。 相似文献
108.
云南糯稻遗传多样性的SSR分析 总被引:5,自引:1,他引:5
用24对单序列重复(simple sequence repeat,SSR)引物分析云南省63个糯稻品种的遗传多样性,结果显示云南糯稻总体遗传多样性水平较高。24个SSR位点共检测到153个等位基因,均为中度或高度多态位点。总群体平均香农指数为1.4493,平均Nei’s基因多样性指数为0.7187。滇西南、滇南和滇东南是目前云南省糯稻遗传多样性中心,是保护糯稻资源时应重点关注的区域。AMOVA分析表明糯稻的遗传变异主要存在于地区内品种间(79%),只有5%遗传变异存在于地区间,品种内的遗传变异占16%,保护糯稻遗传多样性需要保护较多的品种。聚类分析显示Nei’s遗传相似系数为0.22时云南糯稻品种分为籼糯和粳糯2个类群,但是不能区分地理组。 相似文献
109.
元阳白脚老粳水稻地方品种内遗传异质性及意义 总被引:3,自引:1,他引:3
云南部分水稻(Oryza sativa L.)地方品种栽培历史悠久,是种质资源有效保护、可持续发展研究的极佳材料.本研究对一个栽种历史悠久的水稻地方品种的内部遗传异质性进行了微卫星(SSR)分析.采用24对引物对来自元阳新街镇4个寨子的40份白脚老粳品种以及5份对照品种进行了遗传背景分析,共检测出114个等位基因,其中在40份白脚老粳地方品种中检测到98个等位基因.UPGMA法构建的系统树显示,45份水稻品种遗传相似系数在0.413~1.000之间,而40份白脚老粳地方品种遗传相似系数在0.762~1.000之间,该品种的遗传多样性并非均匀地按地理位置分布,大新寨白脚老粳地方品种遗传丰度最高,小水井的遗传丰度最低.研究表明,相同地方品种不同村寨的居群遗传多样性不同,当地农民通过村寨之间的交换维系地方品种的永续发展. 相似文献
110.
采集昆明地区花卉基地和公园的269份菊花样品,调查并分析侵染菊花的番茄不孕病毒(Tomatoaspermy virus,TAV)和菊花B病毒(Chrysanthemum virus B,CVB)的发病状况。ELISA和RT-PCR检测结果表明,TAV和CVB在菊花植株上的发病率分别为4.62%和16.70%。对3个TAV分离物和8个CVB分离物的外壳蛋白(coat protein,CP)基因的部分序列进行测定,并分别与GenBank登录的TAV和CVB序列进行比对和系统进化分析,结果显示各TAV分离物的CP基因核苷酸序列同源性为85.04%~98.02%。在系统进化树中聚集的2个簇中,昆明分离物都在同一簇。CVB的CP基因存在较明显的序列变异,核苷酸序列同源性为75.09%~84.99%,在系统进化树中聚为3个簇,昆明分离物均集中在同一簇。 相似文献