水稻地方品种Pi-ta的3'-UTR遗传多态分析

【目的】分析Pi-ta的3'-UTR区遗传变异与该基因抗性功能之间的关系,了解Pi-ta的抗性决定机制,为培养更持久的抗性品种提供依据。【方法】以遗传多样性极高的云南水稻地方品种为研究对象,收集了137个云南地方水稻品种。育苗后提取三叶一心期的水稻幼苗总DNA,设计引物扩增了Pi-ta的3'-UTR区的DNA序列,并扩增了关键功能位点6 640到终止密码子第6 675处这一段的DNA序列。通过双向序列测定获得了137条3'-UTR区的DNA序列并提交至Gen Bank,通过变异位点检测分析云南水稻地方品种Pi-ta的3'-UTR区的遗传多样性程度,并基于最大简约法构建单倍型网络图,分析不同单倍型之间的谱系关系。同时,联合编码区关键抗病位点6 640的碱基状态对3'-UTR单倍型的分布进行分析,讨论3'-UTR区与Pi-ta抗性功能之间的关系。【结果】云南水稻地方品种Pi-ta的3'-UTR区呈现出高度的遗传多样性,长度为1.1 kb的3'-UTR区共有12个SNP位点,由这些SNP可将137个品种划分成7个单倍型。不同单倍型之间没有重组的信号。Pi-ta的3'-UTR对应的DNA编码区长为1 120bp,是植物基因3'-UTR平均长度(200 bp)的5倍多,G+C含量相对较低,为40.43%,不存在插入或缺失导致的长度多态性。Pi-ta的3'-UTR序列中存在多个非保守的潜在poly A位点,此外,Pi-ta的3'-UTR区还存在非常高频率的TTTT序列,提示Pi-ta在转录终止时可能具有复杂的调控机制;而对Pi-ta的不同转录本的分析也表明3'-UTR对应于DNA编码区序列时呈现复杂多变的剪切方式,3'-UTR这种选择性拼接可能与抗性决定作用有关。对遗传多态的进一步分析表明,3'-UTR的SNP高度多态性都出现在感病品种中,所有抗性品种只共享一种单倍型。有趣的是,唯一的3'-UTR抗性单倍型与Pi-ta编码区唯一的抗性单倍型相对应,也即是6 640G所在单倍型也是3'-UTR唯一抗性单倍型。这表明3'-UTR与其编码区是紧密关联的,在功能上和所受到的选择压力方面是连续和一致的。Pi-ta的抗性单倍型区域已从编码区扩展到了3'-UTR区,在研制广谱抗性品种引入Pi-ta时需要同时保证其3'-UTR区不能有额外的SNP,必须是抗性单倍型特有的SNPs。【结论】Pi-ta的3'-UTR与其编码区紧密连锁,抗性品种的3'-UTR受到纯净化选择,维持单一单倍型,3'-UTR对于Pi-ta的抗性功能具有不可或缺的作用。     

避雨栽培对葡萄白粉病发生的影响及其微气象学原理初探

为给葡萄避雨栽培中白粉病的防治提供参考,于2008和2009年监测了避雨和露天栽培处理中葡萄白粉病的发生流行与植株冠层气象因子的变化情况,研究了避雨棚内外气象因子变化对白粉病的影响.田间监测结果表明,常规露天栽培处理中雨季来临之前有白粉病发生,但集中降雨后白粉病的病情指数显著降低,而避雨栽培处理均加重白粉病的发生.避雨...     

百合属RAPD反应条件优化的研究

以百合DNA为材料,对影响其RAPD反应体系中的6个主要因素(模板DNA、Mg2+、TaqDNA聚合酶、引物、dNTPs、退火温度)进行优化,最终确定了百合RAPD反应的最佳体系(25μL)为:40 ng模板DNA,1.5 mmol/L Mg2+,1.0 U TaqDNA聚合酶,1.0μmol/L引物,200μmol/L dNTPs,引物E 13的最适退火温度为37.3℃.该体系的建立为今后应用RAPD技术鉴定百合属植物的种质资源和遗传多样性研究奠定了基础.     

不同添加剂处理对鲜稻草青贮营养价值及适口性的影响

近几年来,饲草饲料资源越来越短缺,而水稻种植面积呈增加趋势。稻草作为稻谷的伴生物,二者的生产比例为1∶1,稻草资源极为丰富,应充分发挥这一优势。研究在稻草青贮过程中添加不同的添加剂,验证其对青贮稻草的营养价值和动物适口性的影响,为进一步开发利用添加剂青贮稻草提供科     

GA3浸种对羊草种子发芽和幼苗生长的影响

以吉生羊草(Leymus chinensis)(人工繁育品种)和天然野生羊草种子为材料,研究了不同浸种时间对2种羊草种子发芽的影响,并测定不同质量分数赤霉素(GA3)48 h浸种(最佳浸种时间)对2种羊草种子的发芽和幼苗生长的影响.结果表明,吉生羊草和野生羊草种子浸种48 h,发芽率和活力指数均最高,与各自的对照组相比...     

覆盖不同作物对魔芋生长和产量的影响

2012-2013年,在云南省富源县冬季开展大田试验,研究不同覆盖作物对魔芋的生长发育、发病率、产量及经济效益的影响。试验结果表明,覆盖不同的作物会影响魔芋的出苗时间和倒苗时间,不覆盖的出苗最早,覆盖苕子和油菜的出苗最晚,倒苗时间则刚好相反;覆盖苕子、油菜、豌豆对魔芋软腐病的防治有一定作用;覆盖油菜和大蒜的魔芋产量比对照高,其余处理则比对照低;覆盖大蒜的产值最高,1 hm^2达141 264元,比对照（不覆盖）的115 758元高25 506元,其次是覆盖油菜,1 hm^2达135 665元,比对照（不覆盖）高19 907元,其余都比对照低。     

添加低水平缩合单宁对野火球青贮品质的影响

为比较研究添加低水平缩合单宁对野火球青贮品质的影响,试验以新鲜成熟的野豌豆为原料,通过加入不同剂量单宁进行青贮发酵,研究低水平缩合单宁对野火球青贮品质的影响。试验分为4组,CK组为无添加对照组,试验组分别添加单宁0.2%、0.4%和0.6%,每组6个重复。青贮60 d后取样分析各项指标。结果表明,将单宁以不同比例添加到野火球青贮中,可以提高青贮感官评分,降低青贮pH,提高乳酸含量,降低乙酸和丁酸含量,提高青贮野火球粗蛋白质含量,降低青贮中酵母菌含量和好氧性细菌含量,且以添加0.6%单宁的T_3组品质最优。     

烟草抗赤星病突变体ces2-1的产生和鉴定

用烟草花叶病毒弱毒株系N14预先接种,可以诱导烟草对病原真菌赤星病菌的系统获得性抗性(SAR),减轻病菌引起的赤星病.选择表现诱导抗性最强植株材料进行组织培养与植株再生,通过体细胞无性系变异增强和巩固SAR性状,获得SAR组成性表达的突变体(constitutive expresser of SAR)ces2-1.除了抗病表型,ces2-1还组成性表达多种防卫反应基因.回交实验与遗传分析表明,ces2-1是在野生型位点上的单基因显性突变.对ces2-1与野生型进行mRNA差异显示分析,得到一个ces2-1独有、在野生型中缺少的转录本,与前人报道的烟草受过氧化氢诱导的一个基因片段同源.用cDNA末端快速扩增技术克隆了这个转录本的全长序列,根据生物信息学分析与功能的初步测定,把这个基因命名为烟草受过氧化氢诱导的抗病相关基因(hydrogen peroxide-induced 1,NtHPI1).