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101.
102.
酿酒酵母分泌蛋白组的计算机分析 总被引:13,自引:2,他引:13
结合计算机技术和生物信息学的方法,采用组合的信号肽分析软件SignalP v3.0、TargetP v1.01、Big-PI predictor和TMHMM v2.0对已公布的6 700个酿酒酵母(Saccaromyces cerevieiae)基因的N-端氨基酸序列进行信号肽分析,同时系统分析了信号肽的类型及结构。结果表明,在6 700个酿酒酵母蛋白中,163个为Sec-信号肽分泌蛋白,经Sec途径分泌。在163个分泌蛋白中,有47个的信号肽没有典型的N-区,仅有H-区和C-区,其余116个分泌蛋白的信号肽包含完整的3个区,即N-区、H-区和C-区。比较了酿酒酵母与白假丝酵母菌(Candida albicans)分泌蛋白信号肽的氨基酸组成顺序,表明酿酒酵母与白假丝酵母菌的信号肽的氨基酸组成和顺序差异很大,两者信号肽长度分布范围、氨基酸种类及其出现频率大体一致。在酿酒酵母分泌蛋白中出现了少数氨基酸组成完全一致的信号肽,为进一步确认具有相同信号肽的分泌蛋白是否具有同源性,分别采用BLAST 2 SEQUENECES 和CLUSTAL W 对具有相同信号肽的分泌蛋白进行了序列比对。结果表明具有相同信号肽的分泌蛋白同源性非常高,氨基酸组成也非常保守。由此可以推断,编码这些分泌蛋白的基因属于旁系同源基因(paralogous)。酿酒酵母作为一种模式生物,以其诸多的优点,被认为是表达真核外源蛋白的首选宿主。对酿酒酵母进行基因组水平的分泌蛋白及信号肽结构的分析,可更好地利用该宿主表达分泌型的外源蛋白研究提供参考信息。 相似文献
103.
试验主要研究缩合单宁对苜蓿青贮品质及营养价值的影响。试验采用第2茬初花期经过晾晒的苜蓿作为原材料。处理组的缩合单宁含量分别为16 mg/g(A组)和32 mg/g(B组),不添加任何物质的青贮苜蓿作为对照组(C组)。试验结果表明:随着青贮发酵时间的增加,pH值和NH3-N/TN值A、B组显著低于对照组(P<0.05);两处理组乳酸含量显著增加(P<0.05);青贮50 d内,乙酸的抑制效果由好到差为B组>A组>对照组(P<0.05);NDF和ADF含量在50 d后C组均显著高于B、A组(P<0.05);单宁处理可以抑制青贮过程中氨态氮的产生,改善紫花苜蓿发酵品质。 相似文献
104.
试验以延边地区野生牧草为原料,研究不同来源和不同相对分子质量的缩合单宁对瘤胃体外发酵参数的影响。结果表明,其中添加缩合单宁各组的pH高于对照组;所有添加缩合单宁的处理组的总产气量均显著低于对照组(P0.05),甲烷产量除3h外的其他发酵阶段均显著低于对照组(P0.05);氨态氮与细菌蛋白在培养过程中含量均低于对照组,并且随着培养时间的延长,差异逐渐减小;总挥发性脂肪酸和乙酸产量最低的组为L1组。添加的缩合单宁相对分子质量越大,对瘤胃参数的影响越显著。 相似文献
105.
为开发出具有丰富多态性的、新型的小麦EST SSR标记,利用已公布1071367条小麦表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,对≥24bp的微卫星或简单重复序列进行了系统分析。结果表明,在所分析的小麦EST序列中,搜索到长度大于或等于24bp,基序匹配值大于80%的SSR序列32350个。在这些SSR中,单碱基SSR最多,数量达18075个,占SSR总数的559%;其次为3核苷酸SSR,共6106个,占SSR总数的187%,重复数大于30次以上的达444个,占所有3核苷酸SSR的72%。4核苷酸SSR数量最少,仅有696个,仅占SSR总数的22%。研究中收搜索到的6核苷酸SSR共1562个,其基序组成可分为145类,优势基序为AGCCGC(达214个)。以上结果说明小麦EST序列中含有丰富的SSR,这非常有利于开发多态性较高的EST SSR标记。 相似文献
106.
稻瘟病菌二个无毒基因的初步分析 总被引:3,自引:0,他引:3
分析了2个稻瘟病田间采集菌株Y95-223和Y94-64的杂交后代的54个菌株对合系35号、楚粳3号及日本鉴别品种新2号、梅雨明、PiNo.4和K60共11个水稻品种致病性测定结果。结果表明:陆稻菌株Y94-64对合系35号、楚粳3号、PiNo.4分别持有2个无毒基因,对新2号、K60分别持有一个无毒基因;菌株Y95-223对梅雨明持有一个无毒基因,因为Y95-223对梅雨明不致病,Y94-64对它致病,而杂交后代非致病菌株与致病菌株比为1∶1. 相似文献
107.
候选抗病基因在水稻品种多样性研究中的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
利用19个来源于水稻和大麦、具有抗病基因NBS-LRR结构特点的探针对24个水稻品种的Dra I酶切DNA片段进行候选抗病基因分析,用26个稻瘟病菌株对供试品种进行人工接种试验。结果表明:供试品种中共检测到127个候选基因位点,平均每个探针为6.7个。除齐头谷、八宝谷和紫糯外,籼稻品种的位点数均高于粳稻品种,而这些籼稻品种表现较为抗病。聚类分析将供试品种划分为籼粳差异明显的2个类群和分群结果与其系谱关系及抗性基本吻合的5个亚群,表明候选抗病基因标记可用于水稻品种的遗传关系、水稻病害控制和抗病育种方面研究。 相似文献
108.
用烟草花叶病毒弱毒株系N14预先接种,可以诱导烟草对病原真菌赤星病菌的系统获得性抗性(SAR),减轻病菌引起的赤星病。选择表现诱导抗性最强植株材料进行组织培养与植株再生,通过体细胞无性系变异增强和巩固SAR性状,获得SAR组成性表达的突变体(constitutive expresser of SAR)ces2-1。除了抗病表型,ces2-1还组成性表达多种防卫反应基因。回交实验与遗传分析表明,ces 2-1是在野生型位点上的单基因显性突变。对ces 2-1与野生型进行mRNA差异显示分析,得到一个 ces 2-1独有、在野生型中缺少的转录本,与前人报道的烟草受过氧化氢诱导的一个基因片段同源。用cDNA末端快速扩增技术克隆了这个转录本的全长序列,根据生物信息学分析与功能的初步测定,把这个基因命名为烟草受过氧化氢诱导的抗病相关基因(hydrogen peroxide induced 1,NtHPI1)。 相似文献
109.
试验研究不同发酵剂的发酵饲料对生长育肥猪生长性能、饲料养分消化率及血液生化指标的影响。选择48头30 kg左右的三元杂交商品猪,进行为期102 d的饲喂试验,饲喂试验分为:动物体重<55 kg为生长期,体重>55 kg至出栏为育肥期。随机分配为4组,每组3个重复,每个重复4头。对照组饲喂基础日粮,试验T1、T2、T3组分别利用三菌复合发酵剂、商品酶发酵剂以及菌发酵剂发酵的秸秆饲料替代基础日粮中10%(生长期)和15%(育肥期)的玉米饲料。结果显示,T1组料重比显著小于T3组(P<0.05)。T1组谷丙转氨酶含量显著高于对照组(P<0.05)。在生长期,T1、T2、T3的血磷和三酰甘油含量都高于对照组。在育肥期,T1组碱性磷酸酶含量明显低于其他3组(P<0.05)。综上,秸秆发酵饲料替换部分玉米饲料可以促进猪的生长发育及消化系统的优化,降低饲养成本。 相似文献
110.
研究不同供氮水平对稻瘟病菌群体遗传多样性和遗传结构的影响。用11对SSR引物对180kg N/hm2(N180)和300kg N/hm2(N300)下水稻黄壳糯的35个稻瘟病菌株进行遗传多样性分析。结果表明:在N300和N180两施肥水平下,稻瘟病菌居群的平均等位基因数分别为4.3636和2.9091,Nei′s基因多样性指数分别为0.6497和0.4624, Shannon′s信息指数基因分别为1.2206和0.7853。两个群体间的遗传相似系数为0.6337,遗传距离为0.4561,基因分化系数为Gst=0.1355,表明居群间有一定分化。用UPGMA方法聚类可知,在45%的相似水平上,稻瘟病菌被划为8个宗群,N300条件下分离的稻瘟病菌株较N180占有更多的宗群,表明N300条件下分离的稻瘟病菌株较N180具有更丰富的遗传多样性。 相似文献