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一张含有315个SSR和40个AFLP标记的大豆分子遗传图的整合 总被引:6,自引:0,他引:6
本研究是基于“锚定SSR标记”作图策略,利用2个F2群体,选用592对SSR引物,对宛煜嵩等利用重组自交系群体Jinf构建的含有227个SSR标记的图谱的基础上进行整合。整合后的大豆分子遗传图包含315个SSR标记和40个AFLP标记,总图距为1951.7cM,相邻标记间的平均图距为5.48cM。整合后的遗传连锁图归属20个连锁群对应于大豆20条染色体,连锁群长度范围从40.8cM到184.4cM,标记数范围从11到41个。整合后的图谱新增加了87个SSR标记,其中A2、C1、C2、D1b和G连锁群有较多的标记增加。整合后的大豆分子遗传图谱中的标记顺序比原图谱与“公共图谱”有更好的线性符合度。本文还进一步对两种类型的作图群体的配合和不同作图软件的选用等问题进行了比较和深入的讨论。 相似文献
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五种热带水果乙烯受体基因的SNP分析 总被引:17,自引:6,他引:11
根据乙烯受体基因的保守序列设计引物,分别从荔枝、香蕉、木瓜、芒果和莲雾等五种热带水果的基因组DNA中克隆出的乙烯受体基因的保守序列,序列长度分别为1440bp、1441bp、1439bp、1440bp和1440bp,序列分析表明,与栽培稻的ers基因相似性最高。五种热带水果乙烯受体基因保守序列存在明显的单核苷酸变异,在19个核苷酸位点存在SNPs(single nucleotide polymorphisms),其中12个SNPs存在于内含子中,7个SNPs存在于编码序列区。在编码序列区的SNPs,荔枝与其他4种热带水果相比具有较高的单核苷酸多态性,荔枝有4个核苷酸的变异,其余4种热带水果仅有一个核苷酸变异。编码区序列中的单核苷酸的改变,除了第783位核苷酸的不同没有引起氨基酸改变外,其余均导致编码氨基酸的改变。 相似文献
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籼型光敏核不育水稻Hs—1可育和不育幼穗mRNA差异表达分析 总被引:8,自引:1,他引:8
本研究利用DD-PCR技术分析了光酶核不育籼稻Hs-1可育和不育幼穗mRNA的表达差异,结果表明:在148个DD-PCR反应中,10个反应可扩增出有差异且可重复的cDNA片段,其中4个反应可扩增出1-4条差异片段,6个反应可护增出4个以上的差异片段,且这些差异处段可只出现在可育幼穗中或同时出现在可育和不育幼穗中,共获得43个差异cDNA片段,其中21个可能与光敏核不育性相关,本研究认为,寻找光敏核不育基因在可育和不育条件下差异表达的起始发育时期是从mRNA水平分离这一基因的关键。光敏核不育基因的表达可能会引起其它一些mRNA的合成,从而产生较多的差异片段,进一步鉴定这些差异片段与不育的关系十分重要。 相似文献
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应用荧光探针FMA和荧光胺,证明EPS中多肽的一些基因如SH基和NH基参予了与 系粘质的相互作用。NH4^+浓度可诱导EPS中SH基和NH基数量的变化,并导致EPS中多肽的构象改变,EPS中的这些基因在粪产碱菌与水稻根系的结合过程起了重要作用。 相似文献
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【目的】定位大豆粒形性状的主效QTL、环境互作和QTL间上位性。【方法】以栽培大豆晋豆23为母本,半野生大豆灰布支黑豆(ZDD2315)为父本所衍生的447个RIL构建的SSR遗传图谱及混合线性模型分析方法,对3年大豆粒形性状进行主效QTL、环境互作和QTL间上位性检测。【结果】共检测到7个与粒长、粒宽、粒厚以及长宽比、长厚比和宽厚比相关的QTL,分别位于D2、C2、J_2和O连锁群上,其中粒长、长厚比和宽厚比均表现为遗传正效应,说明增加其等位基因来源于母本晋豆23。同时,检测到3对影响粒宽和宽厚比的加性×加性上位性互作效应及其与环境互作的QTL。【结论】主效QTL对粒形性状遗传产生的影响最大,上位性次之,环境互作最小,说明加性效应、加性×加性上位性互作是大豆粒形性状的重要遗传基础。 相似文献
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一张含有227个SSR标记的大豆遗传连锁图 总被引:12,自引:0,他引:12
利用由大豆主栽种晋豆23和农家种灰布支(ZDD2315)杂交培育的F10代大豆重组自交系群体Jinf,共474个家系作为作图群体。依据1999年Cregan等发表的大豆“公共图谱”,选用441对SSR引物,建成了含有227个SSR座位的大豆SSR连锁图,该图覆盖大豆基因组1900cM,两个相邻标记的平均间距为8.3cM,归属于20个大豆连锁群,与Song等2004年发表的公共图谱相比,所有标记都被定位于相同的连锁群,且排列顺序大致相同,具有很好的线性关系。 相似文献
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利用微卫星标记鉴定两系杂交稻两优培胜的种子纯度 总被引:17,自引:0,他引:17
从100对水稻SSR引物中筛选到5对表现共显性标记的SSR引物。通过进一步筛选以培矮64S为母本的杂交稻组合,获得一个对两优培胜特异性的引物RM127(SSR标记),该引物只在两优培胜中扩增出“杂合”带型,在其他37个两系杂交稻组合、不育系和常规品种中均只扩增出1条带(纯合带型)。利用该微卫星标记对两优培胜的商品种子进行了纯度鉴定,其检测结果与田间种植鉴定结果完全一致。研究结果初步表明微卫星标记技术应用于两系杂交稻种子纯度鉴定具有十分显著的商业潜力。 相似文献
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总结了目前植物基因分离的方法及其成就 ,概括出 6种植物基因分离的方法 ,即序列克隆法、功能克隆法、转座子标签法、图谱分离法、消减杂交法和差异表达分析法 (c DNA- RAPD、DD- PCR、RDA和 SSH) ,并对其特点和适用范围进行了评述 . 相似文献
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贵州地方耐冷水稻品种的SSR遗传多样性分析 总被引:8,自引:0,他引:8
用16对SSR引物对11个贵州地方耐冷水稻品种、2个典型的籼稻品种和2个典型的粳稻品种进行遗传多样性分析,在15份材料中共检测到95个等位基因,每一位点的等位基因变幅为4~12个,平均5.9个,其中有效等位基因70个,有效等位基因的百分数为75.8%,多态位点百分率为38%,贵州地方耐冷水稻品种间遗传距离为0.06~0.53。应用NJ法对基于16对SSR标记数据的品种进行聚类分析,结果表明:15份不同材料可分为粳稻组和籼稻组,粳稻组各品种间遗传距离为0.06~0.53,平均遗传距离为0.303,其中贵州地方耐冷水稻品种间的遗传距离为0.21~0.46,籼稻组各品种间遗传距离为0.297~0.377,平均遗传距离为0.329。11个贵州地方耐冷水稻品种除筒恢211外,其他都属粳稻组。用相同SSR标记数据和聚类方法分别对苗期、芽期、孕穗期和开花期耐冷的水稻品种进行聚类分析发现:同一时期耐冷品种在各自聚类图中的排列位置与全部材料聚类时有所不同,但其亲缘关系远近没有变化。结果表明SSR适合贵州地方耐冷水稻品种的遗传多样性研究和籼粳分类。 相似文献
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大豆重组自交系Jinf的构建及主要农艺性状和SSR基因型分析 总被引:6,自引:0,他引:6
本研究以晋豆23为母本,灰布支黑豆为父本,用“单粒混传”法构建了一个含有474个家系的F10代的大豆重组自交系Jinf。2002年本研究组对F8代RIL群体Jinf进行生育期、形态性状、产量构成及抗逆性等29个性状进行了观察记载和统计分析研究。所有观察性状在RIL群体Jinf中均表现有较大的变异范围,绝大部分性状呈连续变异、正态分布,且存在双向超亲分离现象,表明这些观察性状大都为数量性状由多基因控制。从表型分析初步认为各家系内部趋于纯合。本研究进一步选取了能覆盖大豆基因组的355对SSR引物对RIL群体Jinf进行SSR分析,212对SSR在亲本中表现有多态性,多态率为59.72%。212对引物获得213个座位用来评估大豆群体的遗传结构,各座位在群体中的多态性指数趋向于0.5,在0.375—0.500范围内波动。160个SSR座位(75.12%)在群体中呈1:1的分离比,53个SSR座位(24.88%)在群体中偏分离,SSR座位的杂异率在0—9.32%之间。分析还表明111个家系(94.07%)趋于纯合,其中31个家系(26.27%)完全纯合,而有7个家系的杂合率在15.31—42.72%之间。分析表明大豆RIL群体Jinf的各个家系的基因型组成父本灰布支的贡献率为51%,初步表明双亲对子代的遗传贡献基本上是平衡的。偏斜度(Skewness=-0.1052)与峰值(Kutosis=0.1597)及X^2检验表明群体的基因型组成分布呈正态分布。本研究初步认为,大豆RIL群体Jinf是一个遗传结构合理,适合于大豆遗传作图、基因定位等基因组研究和育种应用的RIL群体。 相似文献