基于RNA-seq的木霉长链非编码RNA的生物信息学预测及其重寄生相关性分析

[目的]本研究旨在全基因组范围内识别木霉(Trichoderma guizhouense) NJAU 4742(NJAU 4742)的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA),探究lncRNA在重寄生过程中可能参与的调控作用。[方法]用链特异性RNA-seq技术,对重寄生过程中与病原菌互作接触前、后以及独立培养的木霉菌进行转录组测序;构建生物信息学流程,识别lncRNA并用RSEM和DESeq2软件分析lncRNA在重寄生过程中的表达情况;对lncRNA的靶标预测和表达情况进行分析,探索lncRNA在重寄生过程中可能参与的调控作用。[结果]在木霉NJAU 4742中识别了1 676个lncRNA,其中包含1 049个基因间型lncRNA,590个反义型lncRNA,32个正义型lncRNA以及5个内含子型lncRNA。与编码基因相比,lncRNA的外显子数量偏少,序列长度偏短,表达量偏低,在基因组上的跨度偏短。靶标预测结果显示:1 496个lncRNA能够靶向2 269个蛋白编码基因,其中1 492个lncRNA以顺式作用形式靶向2 262个编码基因,4个lncRNA以反式作用形式靶向7个编码基因。GO功能分类结果显示:代谢过程(metabolic process)、催化活性(catalytic activity)和细胞过程(cellular process)是lncRNA靶标分布数量较多的3个类别。KEGG通路分析结果显示:信号转导(signal transduction)、转运与分解代谢(transport and catabolism)和碳水化合物代谢(carbohydrate metabolism)是lncRNA靶标分布数量较多的3类通路。进一步分析发现:147个lncRNA靶向编码碳水化合物活性酶和蛋白酶的基因以及次生代谢物合成相关的基因,其中30个lncRNA在重寄生过程中表达水平发生显著变化,有10个lncRNA的表达和靶标基因显著相关。[结论]木霉在NJAU 4742中存在长链非编码RNA,部分成员参与对病原菌重寄生过程的调控。     

高产广适玉米新品种囤玉3318的选育及栽培技术

囤玉3318是河南省金囤种业有限公司于2010年用自选系J9078作母本、自选系J12Q008作父本杂交组配而成的玉米单交种,并于2018年通过山西省审定。该品种具有高产、稳产、抗病、广适、活秆成熟等特点。适宜在山西省南部复播区种植,适宜密度4 500～4 800株/亩。     

中国木薯产量波动及影响因素分析

利用剩余法将木薯生产波动与长期趋势相分离,对中国48年来木薯生产变化趋势进行分析,计算中国木薯产量及木薯产量短期波动系数。结果表明:我国木薯生产波动幅度较大,整体上属于短期波动和古典波动,生产易出现大起大落的状况。     

关于耕地地力评价工作的几点思考

绥阳县耕地地力评价工作,系由县土肥站协同遵义市土肥站来完成。工作过程中,组织了多次讨论;评价报告交省专家组验收时,又得到了一些很好的指导意见。据此,总结了几点心得体会,非常期望聆听到各位同行、专家、领导的指导意见,旨在能让地力评价工作更上一层。1关于＂评价结果实地校验＂1.1评价结果实地校验工作应该归入验收组所要做的工作之一,而且需要设计一套客观可行的程序、     

太子参无公害高产栽培技术

一、太子参的生长特性太子参是越年生植物,宿根性草本植物。具有15℃以下低温发芽特性,属秋季栽种,冬季生根,春季先开花,后长苗。较适宜温和、凉爽、湿润的气候,生长于500—800米海拔之间的低山地带,怕高温和阳光暴晒,一般年平均温度在10—20℃最适宜太子参的生长,气温超过30℃,植株生长停滞。二、栽培技术1.品种。目前,本区太子参栽培品种主要有2个:①柘参1号。叶片卵形,全缘,无波状;雄蕊数2枚或10枚;种根芽白色;块根纺锤形,淡黄色,较大;适合在海拨600米以上砂质壤土或新开垦地种植。该品种中感     

现代农艺技术专业人才培养模式研究与实践

桃源县职业中专现代农艺技术专业作为国家首批中职改革发展示范校的重点建设项目,现正申报湖南省级示范性特色专业。为将专业做强呈示范特色,专业建设立足桃源县产业结构特征,本着"人才共育、过程共管、责任共担、成果共享"的原则开展校企深度融合,实行双主体育人模式。实践证明,该模式符合中职教育的发展规律和企业行业对人才的需求,实现了学校、企业、行业、学生各方"多赢"。     

恩施州马铃薯加工业现状与发展浅析

本文分析了恩施州马铃薯加工业发展的优势条件,包括自然地理条件、区位优势、良好的原料品质、较强的科技力量等。同时,揭示了目前尚存在的不足,包括原料供给不足、加工产品单一,企业管理不规范等;提出了从马铃薯淀粉、全粉及变性淀粉、休闲食品、马铃薯硒产品和色素产品食品添加剂加工等方面的发展建议和具体的配套措施,即强化马铃薯加工品种选育与相关技术研究,稳定加工专用薯基地建设,在政府加大政策支持力度的前提下,实施较大的马铃薯加工企业的培育、扶持和引进工程。     

平安新乡,以民生为向度

"平安建设只有起点,没有终点". 2009年5月18日,在"全国社会治安综合治理优秀市"表彰会上,河南省新乡市市委书记吴君凝练且厚重的肺腑之言,折射出了560万人民在构筑平安新乡的历程中,一直在尊崇的无止境精神.     

高职院校《森林环境》课程教学改革的探索与实践

根据林业技术专业需要,以培养学生的综合素质和专业实践技能为主线,从教学内容、教学方法与手段、实践教学和考核方法等方面进行了改革探索与实践,取得了较好的效果。     

高等农业院校动物科学本科专业创新型人才培养的探讨

高校作为人才培养的基地，能否培养出高质量的创新型人才，已成为人们讨论的热点。本文结合动物科学专业的自身特点，阐述了动物科学专业创新型人才的基本特征和基本素质，提出了动物科学专业创新型人才培养的对策，以期对提高动物科学专业人才培养质量有所帮助。