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为了研究从云南大额牛(Bas frontalis)瘤胃微生物宏基因组文库中发掘出的纤维糊精酶-1(CDT-1)蛋白的生物信息学特征,试验使用ProtParam、TMHMM Server 2.0、ProtScale、NCBI Conserved Domains、SignalP 5.0、TargetP 2.0、PSORTⅡserver、SOPMA、SWISS-MODEL、NetN Glyc 1.0 Server、NetP hos 3.1 Server、NCBI protein BLASTp和MEGA 7.0等在线分析工具和软件,分析CDT-1蛋白的基本理化性质、跨膜区、亲水性/疏水性、结构域、信号肽、亚细胞定位、二级结构、三级结构、N端糖基化位点和丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸化位点及系统进化情况等生物信息学特征。结果表明：CDT-1蛋白的相对分子质量为38 082.24,理论等电点为4.80,带负电荷的残基总数为45个,带正电荷的残基总数为29个,估计半衰期为30 h,属于亲水型稳定的脂蛋白,定位于细胞壁和细胞外,含有1个由α-螺旋、无规则卷曲、扩展链和β-转角组成的保守结构域,三级结构同... 相似文献