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为解析二化螟Chilo suppressalis体内参与降解双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)的关键核酸酶的功能,克隆二化螟不同的非专一性核酸酶(non-specific nuclease,NUC)基因,并对这些基因进行生物信息学分析和组织定量表达分析,同时对dsRNA降解酶(dsRNA degrading nuclease,dsRNase)活力的组织分布进行研究。结果显示,共克隆获得5个NUC基因,其中有4个编码dsRNase亚家族基因(CsdsRNase1~CsdsRNase4)和1个编码Endonuclease G亚家族基因(CsEndoG)。5个NUC基因的开放阅读框核苷酸序列长度范围为828~1 338 bp,编码275~445个氨基酸残基,其分子量大小为31.68~49.57 kD,预测等电点为5.48~9.42。CsdsRNase1和CsdsRNase2含有信号肽序列,两者相似度极高,且与家蚕Bombyx mori和斜纹夜蛾Spodoptera litura中具有dsRNA降解酶活力的dsRNase同源聚类;CsdsRNase1和CsdsRN... 相似文献
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为明确引起我国山西晋中地区苘麻叶片表现皱缩和花叶症状的病原物及其基因组分子特征, 本研究利用双生病毒简并引物扩增获得病毒基因组部分序列,经测序、比对后设计特异性引物扩增病毒基因组序列, 进而通过生物信息学方法构建系统发育树并进行序列分析。结果表明:引起苘麻叶片皱缩、花叶的病原物为番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus, TYLCV), 将该分离物命名为TYLCV-Abu, GenBank登录号为OP293347, 但未扩增到β卫星。该病毒DNA-A基因组全长为2 782 bp, 含有6个开放阅读框。TYLCV-Abu分离物与TYLCV茄子分离物KSQ1-3(GenBank登录号KC428753)的核苷酸序列一致性最高, 为98.99%, 其中C4和V2编码的蛋白变异较大。重组结果分析显示,分离物TYLCV-Abu是由TYLCV-F(GenBank登录号KY971326)和TYLCV-KSQ1-3重组得到, 重组区域为其基因组2 617-2 782 nt区域。这是首次从苘麻样品中扩增到TYLCV全基因组序列并进行分析。 相似文献
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ABSTRACTThis study investigated the morphometrics, proximate chemical compositions, pH, total amino acid (TAA), fatty acid profile, and minerals of the processing by-products of Antarctic krill (Euphausia superba). The nutrient compositions and properties of the by-products were revealed by being compared to those of Antarctic krill muscle and the economically important species of freshwater prawns (Macrobrachium nipponense) and penaeid shrimps (Metapenaeus ensis). The by-products are worthy of utilization because of the high ratio to the total weight (65.7%). The crude protein contents in the muscle and by-products of krill are 17.4 and 11.7%, respectively. The krill proteins have higher contents of essential amino acids (EAAs). The EAAs constitute 42 and 37% of the TAAs in muscle and by-products, respectively. The krill processing by-products contain high levels of total lipid (3.3%), and polyunsaturated fatty acids constitute 34% of fatty acids with high levels of eicosapentaenoic acid (EPA; 19.08%) and docosahexaenoic acid (DHA; 10.02%). Krill meat provides considerable iron, zinc, calcium, selenium, and copper. It is imperative to lower the fluoride level (70.1 mg/kg, wet basis) in krill muscle. Sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) reveals that myosin heavy chain (MHC) and actin are the major proteins in muscle, and their contents vary between species. 相似文献