Implications of using an average relationship matrix in genetic evaluation for a population using multiple-sire matings

SUMMARY: Ambiguous paternity can be incorporated into the mixed model equations (MME) by including the average numerator relatinship matrix (average A), which averages the true sire-offspring relationship over the putative sires. A previous study has shown that some overestimation of genetic trend results from this substitution. A population of 40 breeding females and 2 breeding males was simulated 1,000 times with either random mating or sequential selection continuing for 8 breeding cycles. In the selection case candidates were ranked on estimated breeding values (EBVs) calculated from the MME with an animal model and the average A. Variances of the EBVs and prediction errors were computed. The results showed the average A incorrectly perceives both the variance of family sizes among males and the variance loss due to selection to be smaller. This will lead to an overestimation of genetic trend. ZUSAMMENFASSUNG: Folgerungen aus der Anwendung einer durchschnittlichen Verwandtschaftsmatrix bei der Zuchtwertsch?tzung für eine Population mit mehreren V?tern in einer Paarungsgruppe In den Mischmodellgleichungen kann eine unklare v?terliche Abstammung durch die Verwendung einer durchschnittlichen Verwandtschaftsmatrix, die die Abstammung zu gleichen Teilen über die m?glichen V?ter aufteilt, berücksichtigt werden. Eine frühere Arbeit hat gezeigt, da? diese Ma?nahme zu einer gewissen übersch?tzung des genetischen Fortschritts führt. Eine Population mit 40 weiblichen und 2 m?nnlichen Tieren wurde 1000mal über 8 Paarungsperioden simuliert und zwar mit und ohne gerichteter Selektion. Im Falle der Selektion wurden die Tiere aufgrund der mit einem Tiermodell und der durchschnittlichen Verwandtschaftsmatrix gesch?tzten Zuchtwerte geordnet. Die Varianzen der Zuchtwerte und der Sch?tzfehler wurden berechnet. Die Ergebnisse zeigen, da? durch eine durch-schnittliche Verwandtschaftsmatrix die Varianz der Gr??e der Nachkommensgruppen der V?ter und der Verlust an genetischer Varianz aufgrund der Selektion untersch?tzt wird. Dies führt zu einer übersch?tzung des genetischen Fortschritts.     

Genetic regulation of meat production by embryonic muscle formation - a review

SUMMARY: The biological basis for meat production in livestock animals is localized in the muscles, where lean meat production is under the genetic control of tissue-specific and more ubiquitously operating genes. The muscle tissue-specific MyoD gene family is at the centre of the genetic regulation of myoblast proliferation and differentiation into myofibres. The regulation of embryonic muscle tissue formation (development) by the MyoD genes is duscussed in the context of livestock animals used in meat production. The possibility that the MyoD genes could be useful candidate genes for breeding is discussed. It is concluded that marker assisted selection (MAS) using markers in functional genes is advantageous over MAS using associated markers. ZUSAMMENFASSUNG: Genetische Regulierung der Fleischproduktion bei der embryonalen Muskelbildung - Ein Literaturüberblick Die biologische Grundlage für Fleischproduktion, lokalisiert in den Muskeln, steht unter genetischer Kontrolle durch gewebsspezifische una mehr ubiquit?r arbeitende Gene. Die gewebsspezifische MyoD Genfamilie in den Muskeln befindet sich im Zentrum der genetischen Regulierung des Prozesses der Myoblastteilung und Differenzierung zu Myofasern. Die Ubersicht betrifft Regulierung der Bildung des embryonalen Muskelgewebes (Entwicklung) mit Hilfe der MyoD Gene. Die M?glichkeit, da? MyoD Gene erfolgreiche Kandidatengene für Tierzüchtung sein k?nnen, wird besprochen. 'Marker-assisted selection' (MAS) mit Hilfe von Markern funktioneller Gene sollte vorteilhafter sein als MAS mit gekoppelten DNA-Sequenzen. RéSUMé: Régulation génétique de la production de viande par la formation embryologique des muscles - un résumé La base biologique de la production de viande dans les animaux d'élevage se situe dans les muscles, là où la production de viande maigre est sous contr?le génétique de gènes générals et tissu-spécifiques. La famille des gènes muscle-spécifiques MyoD forme le centre de la régulation des procès de prolifération des myoblastes et de différenciation vers les myofibres. Le but de cet article rétrospectif est de situer la discussion sur la régulation de la formation embryologique des muscles par les gènes MyoD dans le cadre de l'élevage. La possibilité que les gènes MyoD soient des gènes candidats utiles pour l'élevage sera discutée. La conclusion faite est que 'marker assisted selection' (MAS) en employant des marquers situés dans des gènes fonctionnels a plus d'avantages que MAS avec des marquers associés.     

Pathogenic mechanisms of caprine arthritis-encephalitis virus

Goats infected with caprine arthritis-encephalitis virus (CAEV) show chronic arthritis and cachexia, which are progressive in nature. The immunopathogenic mechanisms responsible for these progressive clinical symptoms have not been fully elucidated. Various haematological and immunological parameters were evaluated in experimentally-infected goats showing typical signs of CAEV-induced disease. Infected goats showed recurrent lymphocytosis that may be due to constant presentation of antigen by infected cells of a monocyte/macrophage lineage. The serum alkaline phosphatase and -glutamyl transferase concentrations were elevated in infected goats, a characteristic of hepatic and bone disorders. All other serum chemistry parameters were similar between infected and control goats. Importantly, the serum tumour necrosis factor- (TNF-) levels were higher in infected goats. The cachexia seen in infected goats may be at least partly due to altered metabolism as a result of prolonged elevation of serum TNF- levels. Depressed natural killer cell activity was observed in infected goats and may contribute towards the establishment of a persistent infection with CAEV.Abbreviations AIDS acquired immunodeficiency syndrome - CAEV caprine arthritis-encephalitis virus - GGT -glutamyl transferase - HBSS Hanks' balanced salt solution - HIV human immunodeficiency virus - NK natural killer - PBMC peripheral blood mononuclear cells - PCR polymerase chain reaction - SAP serum alkaline phosphatase - TNF tumour necrosis factor