刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析

本研究在前期构建的刺参(Apostichopus japonicus)高密度遗传连锁图谱和QTL分析的基础上,筛选出26个与体长、体重、体宽、棘刺总数、抗病力相关的SNP位点,设计出可用于HRM检测的SNP扩增引物13对。在扩大群体中利用HRM小片段法对这13个刺参重要经济性状相关的候选SNP位点进行分型和多态性检测,并结合扩大群体的相关性状数据进行了QTL位点验证。多态性结果显示,13个位点中有3个单态性位点,其余10个多态性位点中有3个位点为低等位多态性,7个位点为中等位多态性。10个多态性位点的最小等位基因频率(MAF)介于0.016(SNP113)~ 0.332(SNP160)之间,平均值为0.173;各位点的观测杂合度(Ho)介于0.031(SNP113)~0.818(SNP9)之间,平均值为0.433;期望杂合度(He)介于0.031(SNP113)~0.834(SNP9)之间,平均值为0.402;多态信息含量(PIC)介于0.030(SNP113)~0.393(SNP160)之间,平均为0.248,有6个位点偏离Hardy- Weinberg平衡。QTL验证结果表明,SNP40和SNP160位点为与生长(体长、体重、体宽)相关的位点,各位点的优势基因型分别为SNP40(CC)和SNP160(AA);SNP88、SNP112和SNP126这3个位点为与抗病力相关的位点,各位点的优势基因型为SNP88(CC)、SNP112(AA)和SNP126(TT)。基于这5个位点构建生长和抗病二倍型,发现二倍型K1(CC AA TT)抗病力最强,S1(CC AA)、S3(CC AC)在生长方面优势显著,相关研究结果可为分子标记辅助育种在生产中应用提供基础数据。     

松树枯梢病发生的立地条件及其主要诱因分析

对福建、江西等地227块松树枯梢病的林分病情标准地进行调查.结果表明:病害的发生与林分及立地因子关系密切.由上杭、连城、永新和安福4县有代表性的49块样地推导出了松树枯梢病的病情指数与林龄、造林密度、郁闭度、土壤质地、土壤湿度、坡位、坡向的生态数学模型:y=41.38-16.56x11 5.08x21 18.62x31-3.78x41 19.94x51 7.32x61 4.27x62-4.06x71-10.56x72-13.88x73,其偏相关系数分别为0.606 9、0.612 5、0.268 9、0.1789、0.681 1、0.279 0、0.473 7.该模型模内判别准确率为79.59%,其中病情指数与土壤湿度、郁闭度、林龄和坡位间关系紧密,在0.01水平上显著,它们是松树枯梢病在我国南方发生的主要诱导因子.提出以营林措施为主的生态控制技术.     

中国伊犁天山野果林区系表征地理成分及区系发生的研究

对中国伊犁天山野果林表征植物的组成、特点及性质进行了系统的研究,探讨野果林的来源和发展,结果表明:野果林区系成分是多元的,各类成分在此相互渗透,分布区重叠,使野果林区系没有绝对的本地特色.其中温带成分占有最高的比例(33.33%);西伯利亚-天山过渡成分(17.54%)是野果林植物区系连接北方安加拉(西伯利亚)植物区系的桥梁;天山-沿喜马拉雅成分(10.53%)又把野果林与华夏植物区系紧密联系在一起;新疆的大部分地区过去曾是特提斯海(Tethys)的一部分,所以现代野果林植被仍保留有古地中海成分的残迹(5.25%);天山是新疆境内植物属种最为丰富的地区,天山成分在各分布区类型中的比值也最高(33.33%),尤其是东天山特有的成分,则代表着野果林的土著部分,这一成分无疑是本地发生的适生种.野果林的区系发生是多方面的,主要有安加拉成分、古北极成分、古地中海成分、华夏区系成分和新疆本土成分.     

刺参响应灿烂弧菌侵染差异microRNAs鉴定及靶基因分析

microRNA参与基因的转录后调控,在真核生物的生长发育、细胞分化和免疫防御等过程中发挥重要作用。刺参(Apostichopus japonicus)病害问题已成为产业发展的主要限制因素之一,而其病害发生的分子机制尚待进一步完善。本研究以刺参重大疾病“腐皮综合征”的重要致病原灿烂弧菌(Vibrios splendidus)为侵染菌株,通过人工侵染实验制备患病刺参样本,采用miRNA-seq技术对侵染组(PT16S)和对照组(PT10H)各3头刺参的体壁组织进行miRNA测序,通过相关生物信息学软件对miRNAs进行鉴定和分析,筛选差异表达miRNAs (DEmiRNAs)并预测其靶基因,构建关键调控途径的miRNA-mRNA调控网络。结果显示,PT10H组平均得到5 902 588条有效序列,194个已知miRNA和19个新的miRNA;PT16S组平均得到5 053 529条有效序列,182个已知miRNA和42个新的miRNA。对2组鉴定到的miRNA进行差异表达分析,共筛选到2个上调和11个下调的具有显著差异的DEmiRNAs (P≤0.05),上调的DEmiRNAs靶基因预测结合到3010个靶基因,注释到585个GO terms及24条信号通路(P≤0.05),下调的DEmiRNAs靶基因预测到19 072个靶基因,注释到514个GO terms以及22条信号通路(P≤0.05)。对筛选到的DEmiRNAs进行实时荧光定量PCR (qRT-PCR)验证,显示miRNA-seq与qRT-PCR的一致率达到70%。根据KEGG分析结果构建泛素介导的蛋白水解途径和Notch信号通路的miRNA-mRNA调控网络,结果显示,13个DEmiRNAs分别靶向结合134个与泛素介导的蛋白水解相关的mRNAs和109个与Notch信号通路相关的mRNAs,Aja-miR-184、Aja-miR-2478和Aja-miR-9277p等DEmiRNAs可能参与对Notch信号通路和对泛素介导的蛋白水解的调控。相关研究结果将为刺参疾病发生调控网络建立和机制解析提供依据。     

福建苦茶资源不同叶位儿茶素及嘌呤生物碱组分分析

以福建安溪、云霄和大田苦茶资源为研究对象,‘福鼎大白茶’为对照种,采用高效液相色谱法(HPLC)、超高效液相色谱-质谱联用法(UPLC-MS/MS)测定了茶树春梢不同叶位的儿茶素组分和嘌呤生物碱组分含量。结果表明：福建安溪、云霄和大田苦茶含有特异成分表没食子儿茶素-3-O-(3-O-甲基)没食子酸酯(EGCG3"Me)和苦茶碱(TC),其中云霄苦茶和大田苦茶的TC含量大于30 mg·g^-1,属于高苦茶碱茶树种质,云霄苦茶的嘌呤生物碱总量大于70 mg·g^-1,属于高嘌呤生物碱茶树种质;对照种福鼎大白茶不含TC,仅在第一叶中检出EGCG3"Me(含量为3.07 mg·g^-1)。参试苦茶资源的儿茶素总量在茶树新梢上的分布是随着叶位的增加,其含量先增加再减少,在第三、第四叶位达到最大值,嘌呤生物碱含量与鲜叶成熟度呈负相关关系。不同叶位的EGCG3"Me和TC含量差异显著,安溪苦茶和云霄苦茶的EGCG3"Me和TC含量随叶位增加呈递增,而在大田苦茶中的变化规律不明显;3份苦茶资源春梢第三、第四叶的EGCG3"Me含量均大于10m...     

刺参响应灿烂弧菌侵染的基因组DNA甲基化水平和转录组差异及其关联分析

为探讨病原菌胁迫下刺参(Apostichopus japonicus)基因组DNA甲基化水平和转录组表达的差异,本研究采用人工攻毒侵染胁迫,获得刺参化皮体壁组织,并以未攻毒组的健康体壁组织为对照,对刺参2种体壁组织进行全基因组甲基化测序(WGBS)和转录组高通量测序,解析刺参体壁基因组DNA甲基化差异,筛选响应病原胁迫的差异甲基化区域和差异表达基因。同时,通过基因组甲基化和转录组联合分析,筛选负相关关联基因,为解析刺参响应灿烂弧菌(Vibrio splendidus)侵染的分子机理提供基础数据。结果显示,刺参对照组和侵染组基因组总甲基化水平分别为(3.59±0.04)%和(3.87±0.27)%,侵染组甲基化水平显著升高;在发生甲基化的位点中,攻毒组和对照组的mCpG占比分别为83.06%和81.91%,mCpG为最主要的甲基化形式。本研究共筛选出差异甲基化区域(DMRs) 626 677个,注释到23 706个功能基因。转录组测序共检测到29 290个基因,筛选到差异表达基因496个,其中,上调基因214个,下调基因282个。在基因组甲基化与转录组的关联分析中,筛选到180个负相关关联基因,其中,差异甲基化区域位于启动子区域的负相关基因为60个。对负相关关联基因的GO和KEGG富集分析,筛选到相关通路和LRR、hsp20和CARD等关键基因。本研究将为解析刺参抗病的表观遗传调控机制提供数据,也为刺参抗病性状选育提供科学参考。     

松针贮藏果树砧木种子的试验

果树砧木种子的沙藏中如果对河沙的粗度和湿度把握不好,贮藏的种子不是失水干燥就是过湿霉烂而丧失发芽力。为了克服沙藏的不足,于是笔者在近两年内改用松树的新鲜针叶作材料贮藏多种果树砧木的种子(以下简称叶藏),并用沙藏作对比性贮藏试验,试验结果证明各种种子的叶藏比沙藏高出7%以上的发芽率。现将有关试验结果报道如下。1　试验材料供贮藏试验的种子有板栗、枳壳和毛桃含水量分别是39.4%、35.7%和23.2%,重量各40ｋｇ。贮藏材料分别是新鲜松针,一定粗度含水量为3～5%清洁的河沙,数量各为种子体积的2～3倍。贮藏容器用6只果篓贮放。2　试…     

区块链+5G物联网和大数据在奶牛智能化生产中的应用

近年来,物联网技术和大数据挖掘分析应用逐渐深入到人们生活的各个领域.为综述物联网和大数据在奶牛生产中的发展实践,以期区块链+5G物联网、大数据更加有效的推动奶牛智慧化生产.本文对奶牛个体识别、体重测定、产奶性能、发情监测、精准饲喂、环境控制等奶牛生产区块链各个环节数据采集技术和物联网设备进行简要分析,对国内外广泛应用的...     

四川省营造林工程监理初探

本文描述了营造林工程的施工地点分散性、施工季节性强、单位面积投入小、造林成效影响因素多、可补救性等特点,对四川省营造林工程监理工作使得工程管理更加规范、造林质量明显提高、资金使用更加有效、工程档案更加规范完整等主要成效进行了总结,对今后开展营造林工程监理工作从组织领导、资质管理、经费来源、监理阶段等方面进行了探讨。     

基于地质统计学影像纹理的石河子地区化控期棉花长势监测

化学调控是棉花生长期间的一个重要环节,在较大区域尺度上,化控常常整齐划一,依固定的量而行,忽视其普遍存在的空间差异,结果导致某些棉田投入过量或投入不足,在精细农业所倡导的基于特定场的农业投入这一框架下,为辅助决策者制定有针对性的棉田化控方案,该文提出了应用地质统计学影像纹理进行对化控棉花长势监测,通过借助地质统计学方法在分析空间结构变化上的优势,强化遥感影像上不同长势棉田间的差别,提高样本选择的分离度和长势空间分类精度。实验结果表明,运用变异函数纹理结合光谱波段的最大似然分类方法能够很好地界定棉花长势的不同类型,总分类精度达90.53%,证明了应用地质统计学影像纹理方法在针对化控的棉花长势监测上的有效性。