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采集寄生于野猪、牛体表的蜱988只,其中台湾革蜱59只、微小牛蜱12只、台湾血蜱103只、豪猪血蜱214只和微小扇头蜱600只。根据蜱种、宿主、采集地点选取388只代表性蜱进行宏转录组测序分析,获得一个弹状病毒新种的基因组信息,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)与cDNA末端快速扩增技术(RACE)获取了该病毒全基因组序列,命名为龙岩蜱病毒(Longyan tick virus, LYTV)。通过对该病毒的全基因组序列特征分析发现,LYTV具有典型的Ledantevirus病毒属病毒的基因组结构特征。同源性分析表明,LYTV与最近亲缘病毒的核苷酸序列同源性为47.1%~59.1%,RNA依赖性RNA聚合酶L的氨基酸序列同源性为47.0%~56.1%,核蛋白N的氨基酸序列同源性为39.0%~54.6%。通过系统进化分析发现,LYTV与Nkolbisson virus(NKOV)亲缘关系最近,并与A亚群中的Yongjia tick virus 2(YjTV-2)、NKOV、Nishimuro virus(NISV)、Barur virus(BARV)、Fukuoka virus(FU... 相似文献
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