猪流行性腹泻病毒Nsp5基因的原核表达及生物信息学分析

旨在对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)Nsp5基因进行原核表达,利用生物信息学软件,预测其编码蛋白的结构和功能,为了解PEDV致病机理奠定基础。本研究克隆PEDV/LY/2014/04毒株的Nsp5基因,亚克隆进pET-28a(+)原核表达载体,PCR和酶切验证重组质粒的构建,重组质粒pET-28a(+)-Nsp5转入E.coli BL21(DE3)中,SDS-PAGE检测Nsp5的表达和His band Ni+纯化情况,Vector NTI Advance等软件对Nsp5蛋白氨基酸组成、抗原表位、二级和三级结构进行预测和分析。结果表明,成功克隆并构建了重组质粒pET-28a(+)-Nsp5,表达重组蛋白大小约22 ku,且主要以包涵体形式存在,His band Ni+纯化后获得高纯度重组蛋白。Nsp5蛋白是由196个氨基酸残基组成的多肽,其分子质量的理论值为21 820.07 u,理论等电点(pI)为8.734,略偏碱;二级结构骨架中α-螺旋(h)占55.61%,β-折叠(t)占7.65%,无规则卷曲(c)占20.92%,延伸链(e)占15.82%;Nsp5蛋白质的三级结构中,中间段以α-螺旋为主作为骨架,C端多个复杂二级结构构成该蛋白的酶活性中心;B细胞抗原表位的预测,表明有15个潜在的B细胞优势表位。本研究为猪流行性腹泻病毒Nsp5蛋白质的生物学功能相关研究提供数据支持。     

LncRNA调控病毒感染与复制机制进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一类核酸片段200 bp～100 kb、无典型开放阅读框、不编码蛋白质、具有调节功能的非编码RNA,它广泛存在于各种生命体中,数量大,种类多。其调控细胞内生物学功能包括：参与DNA甲基化、基因组印记及染色质修饰、调控转录激活、干扰细胞核内物质运输、核酸降解等重要过程。lncRNA与病毒感染复制的关系主要表现为：一方面病毒抑制胞内lncRNA的表达,借助lncRNA的转录激活调控功能,引起靶细胞凋亡通路的激活,促进病毒复制;另一方面病毒利用胞内lncRNA表达,调控先天免疫、NF-κB信号、炎症信号通路,进而促进病毒复制和感染。本文总结lncRNA与病毒感染和复制之间的研究最新进展,为研究病毒致病或者免疫逃逸机制提供新的视角。     

反向遗传学技术在PRRSV基础与应用领域中的研究进展

猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)是一种球形、带囊膜的病毒.其基因组为单股正链、不分节段的RNA,大小约为15 kb[1-3],包含10个开放阅读框.PRRSV主要造成妊娠母猪流产、死胎和仔猪呼吸道疾病,高致病性P...     

高羊毛氨酸硒对幼龄比格犬抗氧化指标及狂犬病疫苗免疫效果的影响

为研究日粮中不同水平的高羊毛氨酸硒(SeHLan)对幼龄比格犬抗氧化指标和机体免疫应答的影响,本试验选用25只3月龄比格犬,随机分为空白组、疫苗组和3个SeHLan添加组,SeHLan添加组在接种狂犬病疫苗的同时,分别在基础日粮中添加不同剂量的SeHLan(0.35,1.00,2.00 mg/kg),并分别在接种狂犬病...     

两种启动子拯救猪繁殖与呼吸综合征病毒ZJ-JX-2015株效率的比较研究

为比较不同启动子驱动的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)强毒株ZJ-JX-2015感染性克隆拯救的各重组病毒的效率，本研究将ZJ-JX-2015株全基因组引入无义突变位点(C-G，形成Bst B I酶切位点)作为后期鉴定标签并分成4段经PCR扩增后，分别克隆至含CMV启动子的p SMART-BAC载体和含T7启动子的p WSK-29载体中构建感染性克隆质粒p SMART-BAC-CMV-r PRRSV和p WSK-29-T7-r PRRSV，经PCR及测序鉴定正确后将前者分别转染BHK-21和293T细胞；将后者转染BHK-21 (T7)细胞。48 h后收集上述各细胞上清液接种Marc-145细胞并连续传10代。通过观察细胞病变(CPE)，收集不同代次Marc-145细胞上清液经PCR及间接免疫荧光试验(IFA)鉴定拯救的各重组病毒。将拯救的各重组病毒以MOI 0.1接种Marc-145细胞，通过测定不同时间各病毒上清液的病毒效价(TCID50)绘制生长曲线。结果显示，各细胞上清液[BHK-21、293T细胞及BHK-21细胞(T7)]在Marc-145细胞中传至第2代时均出现CPE...