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为研究CHS(chalcone synthase)基因间的同源性及其进化关系,以矮牵牛的CHS基因为研究对象,利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成和亲疏水性预测,并与其他10个物种的CHS基因序列进行多重比对、进化分析。结果表明:矮牵牛的CHS基因的单链mRNA序列含有1170个碱基对,蛋白质由389个氨基酸编码,相对分子质量为42580.02,其中亮氨酸(Leu)含量最高达10.80%;疏水值最大为2.038,最小为-2.208,无明显的亲水或疏水区域;多重比对发现11个物种同源性达到了80.55%。通过以上结果得出CHS基因处于稳定状态,编码的蛋白为亲水性蛋白,进化过程中是保守的,获得的保守区段的序列信息为新基因的克隆奠定了基础。 相似文献
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杨树ISSR反应体系的建立及正交设计优化 总被引:13,自引:1,他引:13
采用正交设计的方法,对杨树ISSR-PCR反应中5个因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物)在4个水平上进行优化试验。建立了适合杨树的既稳定又能扩出最多数量谱带的ISSR-PCR最佳反应体系,即25μl的反应体系中含有1×buffer,0.12mmol/L dNTP,0.4μmol/L引物,3.5 mmol/L Mg2+,1.5UTaqDNA聚合酶和40ng模板DNA。对杨树ISSR-PCR最佳反应体系的退火温度进行梯度试验,发现引物W95142的最适退火温度为56.1℃,且最适退火温度因引物而异。这一优化的ISSR-PCR反应体系的建立为今后利用ISSR技术进行杨树种质资源分类、遗传图谱构建和基因定位奠定了技术基础。 相似文献
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为提高红梅插穗的扦插成活率,本试验设置了1 kV/cm、2 kV/cm、3 kV/cm、4 kV/cm 4种电场强度的静电场处理,研究了不同电场强度处理对红梅插穗生根及相关生物学效应的影响。结果显示:红梅插穗生根期间,2~3 kV/cm静电场处理的插穗可溶性糖含量、可溶性蛋白质含量、过氧化物酶活性明显高于对照,扦插成活率、根系活力、单株生根数、根鲜重均显著高于对照(P<0.05);4 kV/cm静电场处理插穗的相应检测指标均低于对照。以上结果表明,采用适当强度的静电场处理可促进红梅插穗相关生理生化指标的上升,提高扦插成活率;对于红梅插穗生根,3 kV/cm是最适的电场强度。 相似文献
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为建立最优的栓壳红山茶(Camellia phellocapsa)诱导愈伤组织体系,分别以其嫩叶及嫩茎段为外植体材料,研究了不同的6-BA与NAA激素浓度配比对诱导愈伤组织的影响。结果表明:叶片正面向上放置时的出愈率高于正面向下放置,且褐化率较低;6-BA浓度对诱导叶片愈伤组织的影响达极显著水平,最佳激素配比为6-BA 0.2 mg/L、NAA 2.0 mg/L,此时出愈率高达97.5%;嫩茎段的愈伤组织诱导出现不同程度的褐化,出愈率极低。 相似文献
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氯化钙处理对垂枝樱花扦插生根及抗氧化酶活性的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
使用不同浓度的CaCl2处理垂枝樱花(Cerasus subhirtella var.pendula)插穗来研究氯化钙处理对插穗生根、抗氧化酶活性以及过氧化产物丙二醛(MDA)含量的影响。结果表明:55 mg/L CaCl2处理垂直樱花,其插穗的生根率可达40%,而对照仅有22%。处理的插穗在单株生根数量、根系活力与根鲜样质量方面,均显著优于对照,而且插穗叶片中超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和抗坏血酸过氧化物酶(APX)等保护酶的活性也显著增强,MDA的含量则显著降低。 相似文献
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摘 要:本研究采用生物信息学方法,利用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)和HMM(Hidden Markov Model)工具,对蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)全基因组Mt2.0数据中含有核苷酸结合区NBS结构的抗病基因进行了分析,包括NBS基因数量、类型、基因复制、物理位置分析和系统发生学关系分析。结果表明,在苜蓿全基因组中找到469个有NBS结构的抗病基因,其中包括446个标准结构NBS基因、23个非标准结构NBS基因。通过对全基因组内标准NBS类型抗病基因进行物理位置和系统进化树分析,发现苜蓿基因组中抗病基因在进化过程中存在明显的基因复制现象,基因的复制对苜蓿基因组中抗病基因数量扩张起到了重要的作用。 相似文献
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为研究CHS(chalcone synthase)基因间的同源性及其进化关系,以矮牵牛的CHS基因为研究对象,利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成和亲疏水性预测,并与其他10个物种的CHS基因序列进行多重比对、进化分析。结果表明:矮牵牛的CHS基因的单链mRNA序列含有1170个碱基对,蛋白质由389个氨基酸编码,相对分子质量为42580.02,其中亮氨酸(Leu)含量最高达10.80%;疏水值最大为2.038,最小为-2.208,无明显的亲水或疏水区域;多重比对发现11个物种同源性达到了80.55%。通过以上结果得出CHS基因处于稳定状态,编码的蛋白为亲水性蛋白,进化过程中是保守的,获得的保守区段的序列信息为新基因的克隆奠定了基础。 相似文献