基于WT-CNN-LSTM的溶解氧含量预测模型

溶解氧（Dissolved oxygen, DO）含量是影响水产养殖产量的重要因素之一,具有时序性、不稳定性和非线性等特点,且其影响因子过多、存在复杂的耦合关系,难以实现精准预测。针对传统长短时记忆神经网络（Long short term memory, LSTM）预测模型易引入冗余数据,且在训练过长序列时会出现梯度消失现象,从而不能捕捉因子间长期的依赖性问题,提出了基于小波变换（Wavelet transform, WT）、卷积神经网络（Convolutional neural network, CNN）和LSTM的溶解氧含量预测模型。首先,使用WT降低数据噪声;然后,使用CNN深度挖掘各变量之间的潜在关系;最后,利用LSTM的时序性预测2h后的水产养殖溶解氧含量。结果表明,本文提出的WT-CNN-LSTM模型预测效果良好,其平均绝对误差、均方根误差和决定系数分别为0.138、0.229和0.954,比传统LSTM模型分别优化了28.87%、21.03%和4.61%。     

猪卵巢颗粒细胞中SIRT1基因表达量对卵泡闭锁的影响

SIRT1是一种二氢尿嘧啶脱氢酶(NAD)依赖的具有去乙酰化酶活性的多功能转录调节因子.本研究分析不同闭锁阶段卵泡颗粒细胞中SIRT1基因表达规律性,探讨SIRT1基因表达量与卵泡发育的关系.采用免疫组织化学方法分析SIRT1蛋白表达定位,qRT-PCR方法分析SIRT1 mRNA表达量.结果表明,SIRT1蛋白在晚期闭锁卵泡中最高,健康卵泡中最低,SIRT1 mRNA表达规律性与SIRT1蛋白表达规律性一致.综合分析,颗粒细胞中SIRT1基因随着卵泡的闭锁表达量逐渐升高,SIRT1表达与猪卵巢卵泡发育存在一定相关性.     

转基因技术在动物遗传育种中的应用

转基因是一项新技术,具有广阔发展前景。本文从转基因的概念、应用等方面叙述了目前动物转基因技术的发展现状,以期让民众能够正确地理解转基因技术,促进我国动物转基因技术的发展及技术储备。     

苏钟猪脂蛋白脂肪酶的组织表达谱及其生物信息学分析

为进一步了解猪LPL基因的结构和功能,本研究以苏钟猪为试验对象,利用实时荧光定量PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(心脏、肝脏、肾脏、皮下脂肪和背最长肌)中RNA水平的表达谱信息;对苏钟猪LPL基因的CDS区域进行了克隆测序,并用生物信息学方法分析了苏钟猪LPL蛋白水平的结构和功能.结果表明:LPL基因在各组织中的mRNA表达丰度为:皮下脂肪＞心脏＞肾脏＞背最长肌＞肝脏,其中皮下脂肪的表达量显著高于其他组织(P＜0.01),且公猪背最长肌中的表达量显著高于母猪(P＜0.01),公猪与母猪间的眼肌面积和瘦肉率性状均差异显著(P＜0.05).猪LPL基因编码含479个氨基酸的蛋白,理论等电点为4.99,具有疏水性,存在信号肽,是分泌型蛋白,与牛、绵羊、家猫等的亲缘关系较近.LPL对苏钟猪的皮下脂肪、心脏、肾脏、肌肉等组织的脂肪沉积有重要影响,可成为苏钟猪肉质改良育种中的重要候选基因.     

猪CACNA1S基因的多态性与胴体及肉质性状的相关分析

以金华猪（40头）、皮特兰猪（30头）及其杂交产生的金皮F2代资源猪群（126头）为材料,对钙离子通道主亚基α1的编码基因（CACNA1S）第44外显子A187G突变、第37内含子A37G突变、T179C突变作PCR—RFLP检测（内切酶依次为Cfr42Ⅰ、XbaⅠ、Eco72Ⅰ）,分析其对胴体及肉质性状的遗传效应。结果表明：酶切位点Eeo72J的AA基因型对眼肌面积和肉色（L）存在极显著影响（P〈0．01）,BB基因型对后腿肌肉重存在极显著影响（P〈0．01）和大腿pH存在显著影响（0．01〈P〈0．05）;位点Xba Ⅰ对背膘厚（中）存在显著影响（0．01〈P〈0．05）,但AA、AB、BB基因型间效应差异不显著（P〉0．05）;位点Cfr 42Ⅰ仅在金华、皮特兰纯种猪群中存在多态性,而在屠宰猪群金皮F2代则表现为BB单态型。     

夏季新型发酵床猪舍与普通猪舍温度比较分析

 在夏季7~8月份高温季节对南京市六合区江苏省农科院试验猪场两种不同类型育肥猪舍室内温度进行了观测分析。数据比较分析表明：夏季新型可移动发酵床育肥舍室内日平均温度波动幅度较大,而普通育肥舍室内日平均温度波动幅度较小;新型可移动发酵床育肥舍在夏季中午高温时舍内日平均温度高于普通育肥舍内日平均温度,而早上和晚上的日平均温度低于普通育肥舍内日平均温度。     

日粮添加葡萄籽原花青素对断奶仔猪生长性能、血液指标及肠道损伤的影响

为研究葡萄籽原花青素(GSP)对断奶仔猪生长性能、血液指标及肠道损伤的影响,选择144头21日龄苏农黑猪,随机分为3个处理组,即哺乳对照组、断奶对照组及断奶试验组,每组6个重复,每个重复8头哺乳仔猪。哺乳对照组采食母乳,断奶对照组和断奶试验组分别饲喂基础日粮及含有100 mg/kg GSP的试验日粮。试验期共计7 d,结束时采集血液与空肠样本,用于生化指标检测。结果表明：(1)断奶导致仔猪21～28日龄平均日增质量显著降低(P<0.05),但日粮添加GSP对仔猪断奶后1周内的生长性能无显著影响(P>0.05)。(2)断奶对照组血液D-木糖含量和血浆超氧化物歧化酶(SOD)活性较哺乳对照组显著下降,而血浆二胺氧化酶活性与丙二醛(MDA)含量较哺乳对照组显著升高(P<0.05);经GSP干预后,上述现象得到明显改善(P<0.05)。(3)与哺乳对照组相比,断奶对照组空肠绒毛高度(VH)及其与隐窝深度的比值明显下降,黏膜SOD活性与还原型谷胱甘肽含量显著降低,黏膜MDA含量显著增多(P<0.05);与断奶对照组相比,饲喂GSP试验日粮的断奶仔猪空肠VH和黏膜SO...     

转录组测序分析猪胚胎附植的中期和后期卵巢差异表达基因

胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素,本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因。选用5~7胎次梅山猪母猪4头,在其妊娠第18和24天分别屠宰2头,采集其卵巢组织进行转录组测序(RNA-seq)分析,GO功能富集分析及Pathway分析。结果表明:1)猪胚胎附植中期卵巢(卵_18d)和后期卵巢(卵_24d)两个组织样检测到的表达基因中最多的序列(reads)均为外显子序列;卵_18d测得reads最多的染色体依次为6、14、1和7号,卵_24d依次为1、7、14和M号;卵_24d相较于卵_18d有更多的基因表达,且表达量更高;两个时期卵巢组织中表达量前50位的基因中,线粒体基因占60%以上。2)卵_24d相较于卵_18d,有581个基因上调和103个基因下调,其中二者之间表达差异最大的基因为EN19684,位于线粒体中;表达差异最大的染色体基因为EN11278,位于14号染色体中。3)差异表达基因显著富集于内皮细胞活化等38个生物学过程,宿主细胞质等19个细胞学分区和FAD-AMP裂解酶活性等16个分子功能;差异表达基因在185条生物通路上存在差异,其中前3位极显著差异的生物通路依次为PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路和昼夜周期。综上表明,在卵巢组织表达的基因,重点参与了胚胎附植后期的调控,且高表达量基因多集中在细胞线粒体中,差异表达基因功能以内皮细胞活化为主,生物通路以PI3K-Akt信号通路为主。     

主成分分析和长短时记忆神经网络预测水产养殖水体溶解氧

为了提高水产养殖溶解氧预测的精度,提出了基于主成分分析(principal component analysis,PCA)和长短时记忆神经网络(long short-term memory,LSTM)的水产养殖溶解氧预测模型。首先通过主成分分析提取水产养殖溶解氧的关键影响因子,消除了原始变量之间的相关性,降低了模型输入向量维度;然后,在Tensorflow深度学习框架的基础上建立LSTM神经网络的水产养殖溶解氧预测模型;最后,利用该模型对浙江省淡水水产养殖研究所综合实验基地某池塘溶解氧进行验证。试验结果表明:该模型与BP神经网络等其他浅层模型相比,模型评价指标平均绝对误差、均方根误差和平均绝对误差分别为0.274、0.089和0.147,均优于传统的预测方法;该模型具有良好的预测性能和泛化能力,能够满足水产养殖溶解氧精确预测的实际需要,可以为水产养殖水质精准调控提供参考。     

苏钟猪在云南省的引种、扩繁和推广情况

云南省是除江苏省外苏钟猪推广数量最多的省份,本调查摸清了苏钟猪在云南引种、利用、分布及在当地的生产性能情况.据对832头母猪统计可知,有效乳头为(14.77±1.03)个,363窝初产仔(10.68±2.04)头,产活仔(9.68±1.90)头;247窝经产仔(11.97±2.16)头,产活仔(11.31±2.22)头;苏钟猪与法系大约克杂交生产的二元杂交母猪,其产仔数为12.2头,发情明显,易配种,再与杜洛克杂交生产的三元杂交猪达90kg体重(150日龄),饲料报酬2.8∶1,日增重830 g,胴体瘦肉率64.5％.