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为探究麋鹿(Elaphurus davidianus)肠道菌群的结构和组成,为麋鹿消化道疾病防治提供有价值的基础数据,应用Illumina MiSeq对4个麋鹿栖息地32只麋鹿粪便样本的16S rRNA的V3—V4可变区进行扩增,结合样本的OTU种类及丰度,用R软件进行聚类和主成分分析(PCA),并计算多样性指数。结果表明:共获得1 438 677条有效序列,平均每个样品有(44 959±12 153)条有效序列;将序列拼接优化,在97%相似度条件下获得31 459个物种分类的OTUs,平均每个样品为(983±240)个OTUs;平均读长为426 bp。对测序数据注释后共获得11个门和74个属,在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势菌群;优势菌属(相对丰度大于1%)一共有15种,占89%。Alpha多样性物种指数范围区间较大,香农指数为2.42~5.83,辛普森指数为0.007 3~0.148 6,表明不同麋鹿的细菌多样性存在差异。运用主成分分析,将4地的麋鹿粪便样品聚为3个群落,其中石首麋鹿国家级自然保护区、大部分辽宁辽阳千山鹿场样... 相似文献
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球虫病是畜牧生产中常见的原虫病,在自然界中,球虫病的分布广、发病率高。球虫病是导致孔雀严重死亡的寄生虫病,对雏雀的危害最大,并以20—80日龄的孔雀最易感染,高温、高湿的条件下最适宜球虫的生长发育。每年的6—10月份,气温达到30~32℃,湿度大于80%时,是患球虫病的高峰期。急性暴发球虫病时,会引起孔雀的大批量死亡,慢性发病时则影响孔雀的生长发育,病愈的成年孔雀为带虫者,增重缓慢且繁殖能力下降,给孔雀养殖带来较大损失。2013年6月份,北京麋鹿生态实验中心散放孔雀发生球虫病,经临床诊断和病原分离鉴定,诊断为柔嫩艾美尔球虫病,对其他孔雀及时给予药物治疗,加强饲养管理,保证环境卫生等,控制疫情,取得较好的效果,现报道如下。 相似文献
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2010年3月28日下午,北京南海子麋鹿苑饲养人员发现保护区内一雌性麋鹿有不吃食、离群、精神沉郁、卧地不起等异常现像。2 d后于保护区湖边发现大片血迹,未见胎儿。4 d后发现胎儿死于腹中,兽医助产取出死胎。死亡胎儿肢体残缺不全并腐烂,重 相似文献
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为了查找一例麋鹿发病死亡的原因,采用临床、病理学、微生物诊断等方法进行病因查找和鉴别,并进行综合判定。结果表明:麋鹿茸部位有较大的出血创口;麋鹿口腔黏膜、眼结膜、肺脏等器官颜色浅,尤其是肺脏,表现为贫血症状;在肝脏、脾脏、肾脏、心脏等器官组织严重出血和坏死,表现为败血症;在肝脏病变组织中分离到大肠埃希氏菌(Escherichia coli),在脾脏组织中分离到液化沙雷菌(Serratia liquefaciens)和类志贺邻单胞菌(Plesio shigelloides)。根据检测结果,结合临床病理变化,确诊本次麋鹿死亡原因是大出血继发败血症。 相似文献
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鹿的产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens,C.perfringens)病主要表现为肠毒血症,致死率高。本研究旨在探究C型产气荚膜梭菌感染鹿肠道的关键基因和途径。通过构建C型产气荚膜梭菌感染鹿空肠结扎环模型,HE染色检测C型产气荚膜梭菌感染后空肠的病理学变化,采用Illumina NovaSeq对C型产气荚膜梭菌感染鹿肠道进行转录组测序,并利用qPCR技术进一步验证部分差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs);最后通过STRING网站预测多基因蛋白互作网络。结果显示:形态学分析显示,产气荚膜梭菌感染后鹿肠道组织出现明显的坏死和出血。转录组分析显示,一共存在705个差异表达基因,其中,在感染组肠道中有276个上调的差异基因,有429个下调的差异基因。GO富集分析显示,DEGs主要富集在生物调节、对刺激的反应和免疫系统过程;KEGG富集分析显示,DEGs富集的通路主要是T细胞受体信号传导途径、Toll样受体信号通路和造血细胞谱系等,造成肠道损伤和出血,促进鹿肠毒血症的进程。此外,qPCR结果证实了分析结果准确可信。DEG... 相似文献
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