基于转录组测序分析内蒙古绒山羊毛囊退行期与休止期差异表达基因

为了探究内蒙古绒山羊次级毛囊(SHF)退行期到休止期以及相应时间点的初级毛囊(PHF)的差异表达基因,试验对3只内蒙古绒山羊阿尔巴斯型2周岁成年母羊的退行期和休止期的初、次级毛囊进行转录组测序,并采用生物信息学方法分析数据;在检测测序质量合格的基础上,进行差异表达基因的筛选、GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果表明:在次级毛囊中,退行期(1月份)与休止期(3月份)分别对比到50 626个和50 628个转录本,其中1 199个差异表达基因中有953个上调基因和246个下调基因;初级毛囊在这两个时间点分别比对到50 629个和50 626个转录本,其中1 977个差异表达基因中有1 258个上调、719个下调;这两个时期中,共有100个差异表达基因同时比对到初级毛囊与次级毛囊中。GO功能富集结果显示,次级毛囊两个时期的差异表达基因主要富集在肌肉重建、肌丝滑动等功能上;初级毛囊两个时期差异表达基因主要富集在翻译延伸、转录拼接等功能上。     

山羊氨基酸代谢网络的重构与关键代谢基因的解析

氨基酸是参与生物体生命活动的基本物质之一,其代谢对山羊的诸多经济性状(如羊肉品质、山羊绒)有重要影响。随着生物信息学的快速发展,系统生物学方法被广泛用来研究生物体内代谢机制。为了阐明山羊体内氨基酸的代谢机制,本文通过构建代谢网络解析山羊氨基酸代谢机制,并通过网络分析发现关键代谢基因。研究首先使用山羊氨基酸代谢基因重新构建山羊氨基酸代谢网络,其次采用Cytoscape软件对该网络进行可视化,并利用R语言中的igraph程序包对氨基酸代谢网络的聚类系数、接近中心度、网络直径及密度等网络参数进行计算和分析。结果发现,山羊氨基酸代谢网络直径为13,密度为0.03,说明该代谢网络的拓扑结构表现出直径较大、密度较小、整个氨基酸代谢网络较复杂等特征。在该代谢网络中,发现10个相互没有联系的子网络模块,根据子网络的基因个数由多到少及其各自的主要功能将它们分别定义为谷胱甘肽转移酶模块、甲基转移酶模块、硒复合代谢模块、赖氨酸降解模块等。山羊氨基酸代谢网络的结构特点与氨基酸的生理功能是相辅相成的,这是山羊长期进化适应环境的结果。此外,本文从网络拓扑结构的角度确定13个对维持整个山羊氨基酸代谢网络具有重要意义...     

内蒙古绒山羊4个群体遗传多样性分析

选用30个微卫星座位,对内蒙古绒山羊4个种群(阿尔巴斯、二狼山、乌珠穆沁、阿拉善)的176份样本进行遗传多样性检测,结果表明,内蒙古绒山羊4个群体均具有丰富的遗传多态性.4个种群的期望杂合度(He)、平均多态信息含量(PIC)和平均有效等位基因数(Ne)分别为0.735 4～0.783 2、0.623 6～0.639 1、2.57～4.92;阿尔巴斯绒山羊与二狼山绒山羊遗传距离较近;阿拉善绒山羊与乌珠穆沁绒山羊遗传距离则较近.此研究为开展内蒙古绒山羊种质特性研究及资源保护和利用提供了科学依据.     

蛋白质组学技术的应用研究

蛋白质组学是探索细胞内蛋白质之间的相互作用及其变化规律的学科,近年来它被广泛应用于生命科学的各个领域,蛋白质组学还提供了一套在整体、动态水平上研究蛋白质的工具,大规模蛋白质组学技术的建立又极大地推动了蛋白质组学的研究进展。这些技术不但可以进行蛋白质的提取和分离,还可以进行目的蛋白的鉴定和分析。作者简述了蛋白质组学技术在疾病、皮肤、毛囊发育周期等方面的研究成果,以期为深入在绒毛用羊领域的研究提供借鉴。     

动物遗传育种课程体系的改革与实践

动物遗传育种系列课程是动物科学专业重要专业基础课。文章结合精品课程建设、资源共享课建设以及国家教学团队建设的要求,着重介绍了该课程体系在教学内容、网络教学资源、实践环节等方面的改革与实践,以期形成完整的课程教学体系,提升教学效果,提高教学质量。     

不同品种山羊Hoxc9基因的克隆及序列比较分析

[目的]分析不同山羊品种Hoxc9基因序列及其推导氨基酸的差异性,为探索Hoxc9基因在山羊毛囊生长发育中的作用机制及研究绒山羊绒毛分子调控机理奠定基础.[方法]根据GenBank上已发表的Hoxc9基因序列设计3对引物,利用PCR扩增安哥拉山羊、萨能奶山羊、藏山羊、波尔山羊4个山羊品种的Hoxc9基因序列,然后与前期研究获得的绒山羊Hoxc9基因序列进行对比分析.[结果]利用设计的3对引物均能克隆获得安哥拉山羊、波尔山羊、萨能山羊和藏山羊的Hoxc9基因,与绒山羊Hoxc9基因比较,其5'UTR序列同源性为99.2%~100.0%,3'UTR序列同源性为99.0%~100.0%,cDNA序列同源性为99.5%~100.0%,内含子序列同源性为99.2%~99.7%,推导氨基酸序列同源性为98.8%~100.0%.Hoxc9蛋白质序列比较分析发现,安哥拉山羊和波尔山羊氨基酸的变异未造成Hoxc9蛋白质功能位点改变,但其二级结构有4处不同.[结论]不同山羊品种Hoxc9基因序列的同源性比较高,但也存在差异性.     

影响稻谷脂肪酸值测定的因素

脂肪酸值是稻谷储存品质的判定指标之一,测定脂肪酸值时样品的粉碎细度,测定环境的温、湿度,滴定终点的判断等,都会影响测定结果的准确性。     

影响内蒙古三河牛泌乳曲线参数的非遗传因素

为了解三河牛泌乳曲线形状及其影响因素,试验对三河牛的486个泌乳期记录,应用Wood模型进行泌乳曲线拟合,结果显示,Wood模型能够较好拟合三河牛泌乳曲线,平均拟合优度R2为0.93±0.004。应用方差分析进一步研究场效应、产犊年度、产犊季节及胎次对Wood模型各参数的影响情况,结果表明,场效应对参数c、tmax、per、Y305影响差异极显著;不同产犊年度间,参数b表现为差异显著(P0.05),参数c、ymax、Y305表现为差异极显著(P0.01);各产犊季节间,参数a、b、c、Y305均表现为差异极显著(P0.01),参数per表现为差异显著(P0.05);胎次对参数a、ymax、Y305影响差异极显著(P0.01);其它参数与效应间均表现为差异不显著(P0.05)。     

绒山羊绒毛品质遗传研究进展

绒毛品质不仅影响绒山羊养殖的经济效益,还影响绒毛纺织品的质量。近年来,随着产绒量的提高,绒毛品质有下降趋势,为了提高生产效益,在生产过程中提高绒毛品质势在必行。绒毛品质是绒山羊育种中重要的选择参数,而控制绒毛品质的主要性状是数量性状,通过数量遗传学和分子遗传学寻找控制数量性状的主效基因,从而研究其生长机理和控制绒毛生长的基因的表达机制。作者综述了近年来有关绒毛品质的研究成果,其中包括通过表型选择来提高绒毛品质,且找到控制绒毛品质性状的HOX、BMP、KAP基因和色素基因等,还有寻找控制目标性状相应的QTL和对不同序列的SNPs进行GWAS分析,通过基因型的选择来提高绒毛品质,这些研究为提高绒毛品质奠定了理论基础,也为今后研究绒毛品质的遗传因素提供借鉴。