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为了解海南油茶(Camellia oleifera)种质资源的遗传多样性,本研究采用SRAP技术分析了25份油茶材料的亲缘关系和遗传多样性。结果表明,筛选的16对多态性较高的引物组合,共扩增得到500条清晰稳定的条带,其中多态性条带465个,多态性条带百分比(PPB)为93.00%,Nei’s遗传一致度范围为0.510 0~0.868 0,遗传距离范围为0.141 6~0.673 3。遗传多样性参数等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)和总遗传多样性(Ht)分别为1.930 0、1.546 8、0.319 5、0.479 0和0.319 5,表明25份油茶种质资源遗传多样性丰富。聚类结果将25份油茶材料分为三大类,未严格按照地理区域划分,说明其遗传背景复杂,一定程度上反映出了目前海南油茶资源的混乱现状。SRAP标记可以反映油茶种质资源间的遗传关系,本研究结果对油茶引种、育种、种质资源保存以及新品种开发等方面具有指导作用,可为海南油茶资源分类鉴定提供参考。 相似文献
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为了研究发酵条件对诺丽内生真菌M2抑菌性的影响,笔者采用传统方法和ITS rDNA测序方法相结合,将本实验室筛选出的抑菌效果突出的诺丽内生真菌M2初步鉴定为棘孢曲霉(Aspergillus aculeatus),在NCBI数据库中登录号为MK560191。通过单因素试验和正交设计对内生真菌M2进行发酵优化,筛选出最优发酵条件:(1)内生真菌M2优化后的培养基方案为200 g土豆煮沸30 min浸出液、葡萄糖20 g、硝酸钠5 g、磷酸二氢钾0.2 g、七水合硫酸镁0.2 g、1 000 mL双蒸水;(2)发酵条件为150 mL锥形瓶装液50 mL、温度25 ℃、培养基初始pH8、转速170 r·min?1。 相似文献
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本研究采用高通量Illumina转录组测序技术对‘万海4号’(WH4)、‘博白大果’(BBDG)、‘长林40’(CL40)、‘岑软’(CR)和‘红花油茶’(HH)五个不同种质的油茶进行转录组测序并进行差异比较分析。结果表明,WH4、BBDG、CL40、CR以及HH通过组装分别获得了71 852、111 693、75 436、15 899和96 205个Unigenes,将所有Unigenes与公共数据库(Nr, Swiss-Prot, KOG, KEGG)进行相似性比对并注释,五种油茶注释基因所占百分比依次为65.51%、46.41%、60.57%、91.94%、54.98%;KEGG富集分析表明WH4、BBDG、CL40和HH中基因丰度最高的都是核糖体途径,而CR中基因丰度最高的是碳代谢途径;GO富集分析显示,WH4、BBDG、CL40、CR和HH基因分布结果一致。结合KEGG、GO和KOG富集分析,绘制出了油茶三萜皂苷生物合成途径通路图,筛选出该途径中的关键酶及相关基因,并对其进行了差异分析。该研究结果完善了油茶三萜皂苷生物合成途径相关基因的表达特征,可为油茶三萜皂苷的生物合成提供... 相似文献
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为了探知槟榔(Areca catechu L.)果实发育过程及挖掘其主要次生代谢产物生物合成途径相关的关键酶基因,本研究以3个不同时期的槟榔果皮和种子为研究材料,利用高通量测序技术测序,组装共获得78320条unigenes,其中35 399条unigenes在NR、Swiss-Prot、KOG、KEGG四大数据库得到注释。在错误发现率FDR<0.05、差异倍数FC (Fold Change)≥2的条件下,G140和S140的差异表达基因共有21 065个,其中上调的有11 811个,下调的有9 254个;G110和S140次之,共有20 613个unigenes,其中上调的有8 314个,下调的有12 299。KEGG分析中共有570个DEGs被注释到次生代谢标准生物合成通路。其中,有149个DEGs被注释到苯丙烷生物合成途径,分别有37个DEGs被注释到莨菪烷类、哌啶和哌啶生物碱生物合成和异喹啉生物碱生物合成途径。RT-qPCR结果表明转录组数据真实可靠。本研究初步筛选了与槟榔主要次生代谢物生物合成相关的关键酶基因,为槟榔基因功能鉴定、次生代谢途径解析及调控机制的研究提供理论... 相似文献
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为探究PEG-6000诱导的干旱胁迫对海南油茶幼苗的生理特性,以10%、20%、30%的PEG-6000溶液来处理油茶幼苗,并对其生长情况、叶片相对含水量、光合色素、渗透调节物质、抗氧化酶和次生代谢产物进行测定,以揭示海南油茶对干旱的生理生化响应机制。结果表明,在PEG-6000胁迫下,油茶生长受到抑制,叶片相对含水量减少,光合色素含量和SOD酶活性呈现出先上升后下降变化趋势,MDA、POD、CAT、渗透调节物质、总黄酮和总多酚呈现上升变化趋势,表明海南油茶具有较强的抗旱能力,在轻中度干旱胁迫下能够通过调节自身的生理代谢来减轻干旱胁迫带来的伤害。本研究从植物光合参数、生理特性和次生代谢产物的角度研究了PEG-6000诱导的干旱胁迫对油茶幼苗的影响,为海南油茶在抗旱栽培和推广种植提供一定的理论依据。 相似文献
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为研究越南油茶(Camellia vietnamensis T. C. Huang ex Hu)中环阿屯醇合酶(cycloartenol synthase,CAS)基因的分子作用机制,本研究采用同源克隆的方法克隆得到环阿屯醇合酶基因全长并命名为CvCAS,对其进行生物信息学分析及表达模式研究。结果表明,CvCAS全长2 411 bp,包括一个2 277 bp完整的开放阅读框,编码758个氨基酸,与茶(Camellia sinensis)、中华猕猴桃(Actinidia chinensis var. chinensis),刺楸(Kalopanax septemlobus)和人参(Panax ginseng)的CAS蛋白序列相似度均在85%以上,系统发育树分析显示CvCAS与茶(Camellia sinensis)和向日葵(Helianthus annuus)的CAS蛋白序列聚为一支。预测其蛋白分子质量为86.6 kD,理论等电点为6.20,无跨膜螺旋区,属于不稳定亲水性蛋白。序列比对分析表明,CvCAS具有氧化鲨烯环化酶(OSCs)超家族典型结构位点(DCTAE),三萜合成酶高度保守结构... 相似文献