铁皮石斛热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及生物信息学分析

[目的]鉴定铁皮石斛热激转录因子(Hsf)基因家族成员,并进行生物信息学分析,为深入研究该家族在铁皮石斛热应激响应中的调控机制提供理论参考.[方法]以拟南芥和水稻Hsf蛋白氨基酸序列为参考序列,在铁皮石斛蛋白数据中搜索其同源蛋白序列,利用SMART和Pfam数据库鉴定出其Hsf基因家族成员.利用生物信息学方法对铁皮石斛Hsf基因家族组成、基因结构、启动子区顺式作用元件及其编码蛋白结构域和进化关系等进行分析.[结果]共鉴定获得23个铁皮石斛Hsf基因家族成员,编码氨基酸数量为132~514个,平均343个,多数属于酸性蛋白和亲水性蛋白,可分为HsfA、HsfB和HsfC组,其中HsfA组成员13个、HsfB组成员9个、HsfC组成员1个.除DoHsfA3仅包含motif 1和motif 2外,其他HsfA组蛋白均含有motif 1~motif 5,HsfB和HsfC组蛋白均缺少motif 5.铁皮石斛Hsf蛋白缺少A9、B3、B5和C1亚类成员,与同属于单子叶兰科植物的小兰屿蝴蝶兰Hsf蛋白亲缘关系最近.HsfA组成员包含完整的HSF功能域和卷曲螺旋(CC)功能域,HsfB和HsfC组成员缺少或含不完整的CC功能域.DoHsfA1A蛋白具有保守的丝氨酸—苯丙氨酸—缬氨酸—精氨酸—谷氨酰胺序列.铁皮石斛Hsf基因启动子区含有大量激素响应、胁迫响应和生长相关元件.[结论]铁皮石斛Hsf基因家族成员进化较保守,其生物学功能存在明显物种特异性,进化关系较复杂,推测其在不同的非生物胁迫和植物激素信号途径中发挥潜在"节点"作用.     

水稻幼苗响应褐飞虱和稻瘿蚊的转录组分析

【目的】筛选出同时响应褐飞虱和稻瘿蚊取食的基因,揭示水稻幼苗应对2种害虫时基因表达层面的差异,为后续挖掘广谱抗虫基因和解析水稻抗虫机制打下理论基础。【方法】以水稻品种9311为供试植物,分别对15日龄的水稻幼苗进行褐飞虱和稻瘿蚊接虫处理,观测幼苗表型,并通过转录组测序技术分别对褐飞虱接入后24 h和稻瘿蚊接入后7 d的水稻幼苗进行转录组测序。以水稻日本晴基因组作为参考基因组进行对比,利用FPKM法计算基因表达量,设定参数（|log₂ FC|>1且P<0.05）筛选差异表达基因。结合基因差异表达分析和功能富集分析,研究水稻响应2种害虫的机制异同点。【结果】鉴定出响应褐飞虱取食的差异表达基因3963个,响应稻瘿蚊取食的差异表达基因1206个,有251个差异表达基因同时响应2种害虫,其中108个具有相同表达模式,143个具有相反表达模式。GO功能注释分析表明,褐飞虱取食显著影响植物体内细胞壁合成和缺水响应,而稻瘿蚊取食则对植物光合作用的影响更显著,具有相同表达模式的差异表达基因主要富集在光合作用、水杨酸合成、茉莉酸信号转导和伤害响应等生物学功能,而具有相反表达模式的差异表达基因仅富集在乙醛酸循环。KEGG信号通路富集分析表明,褐飞虱和稻瘿蚊取食均显著影响植物体内次生代谢物的合成,相同表达模式的差异表达基因富集到MAPK信号通路、植物激素信号转导通路及光合作用等6个通路,而相反表达模式的差异表达基因没有富集的通路。【结论】水稻应对褐飞虱和稻瘿蚊的基因表达调控存在相同点和不同之处,共响应2种害虫的调控通路可能在水稻抗虫过程中发挥重要作用。     

我国不同产地小麦籽粒有害金属含量分析

为了解我国不同小麦产地有害金属对小麦质量安全的影响,采用电感耦合等离子体质谱法(ICP-MS)对全国74个小麦产地的88份小麦样品中Pb、Cd、Hg、As和Cr 5种有害金属含量进行测定分析。结果表明,小麦五大重金属除As含量未超标外,其他重金属含量均存在不同程度超标,其中Pd超标率21.59%,Cd超标率2.27%,Hg超标率15.91%,Cr超标率6.82%。在自然条件下种植的小麦均有可能受到重金属污染,因而应对土壤重金属污染进行防治,规范小麦种植,同时严格把关进入市场的小麦及其加工制品,保障饮食安全。     

草鱼免疫防病技术操作方法

草鱼免疫保证有效抗原和防止抗原流失,是免疫成功的关键;组织免疫服务队伍是持久普及推广免疫防病技术的保证措施。     

短轮伐期定向培育泡桐民用中、小径材的研究

<正> 众所周之,泡桐是我国中部平原地区最有发展前途的树种之一,大力发展泡桐速生丰产林也是解决平原农区民用建筑材紧缺的一个有效方法。近年,豫东农民为取得较高的经济收益,以培育中、小径材为目的,在水肥条件较好的四旁隙地,营造了大量泡桐林。这些由农     

黄淮平原辣椒秋延后“两膜一苫”高产栽培技术

<正>利用大棚内套1m高的中拱棚上覆草苫的“两膜一苫”方式进行辣椒秋延后栽培,可使辣椒的上市期从11月下旬开始一直延后到春节,栽培容易,效益可观。1品种选择秋延后大棚三层覆盖栽培的辣椒品种,要选择对温度、     

冬季暖棚舍饲育肥牛试验

内蒙古呼伦贝尔市岭南地区属半农半牧区，具有充足的农作物秸秆和工业副产品资源。为此，内蒙古呼伦贝尔市农牧局和畜牧站决定在2003年由扎兰屯市畜牧站承担农区肉牛快速育肥项目的试验试点工作。该试验于2003年10月18日-12月18日，为期60d。试验地点选在扎兰屯市以南30km处的某种籽站。     

以产业协会为依托搞好渔业科技入户工作

北京市通州区观赏鱼产业协会成立于2003年4月,有团体会员32个,个人会员106人,4年来,以北京鑫淼观赏鱼养殖中心为龙头,组织全区广大水产养殖户大力发展观赏鱼养殖,初步形成了以观赏鱼为主导产业的渔业产业化格局,至2006年,全区观赏鱼池塘养殖面积8000亩,庭园小池养殖高档观赏鱼发展到4.5万平方米,年生产观赏鱼1.6亿尾,年产值6400万元,有近70个村210户从事观赏鱼养殖,利润均在2000元/亩以上,成品鱼除销往华北、东北、华东、西北等地区外还远销欧美、东南亚等地区。2005年~2006年,通州区以区观赏鱼产业协会为依托,积极开展科技入户工作,促进了全区观赏鱼产业的发展。     

刺嫩芽加工前后营养成份分析

通过对牡丹江林区刺嫩芽原料和加工成的即食刺嫩芽罐头产品进行营养成份检测，获得部分数据，为资源开发及产品加工提供参考。