利用ISSR标记分析兴安落叶松种源的遗传多样性

利用ISSR标记对17个兴安落叶松种源170个个体遗传多样性进行了分析。通过10个ISSR引物扩增,共检测到95个位点,各种源多态位点百分率在25.26%~44.21%之间,多态位点百分率最高的为鹤北种源,最低的为绰尔种源。根据种源间的遗传距离,构建了兴安落叶松17个种源的遗传聚类图。同时,结合遗传距离和地理距离对兴安落叶松进行了种源区划。     

不同种源印楝遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对印楝进行遗传多样性分析,用9条引物进行扩增,共检测出81条清晰的位点,其中79条具有多态性,多态位点百分率为97．53％,Nei＇s基因多样性指数为0．3803,Shannon信息指数为0．5537,表明印楝遗传多样性很丰富。种源间遗传分化系数为0．4702,Shannon’s居群分化系数为0．4677,表明印楝种源内的遗传分化大于种源间的分化。聚类分析将13个种源分为2大类,来自缅甸的11个种源聚成一类,来自澳大利亚和印度的种源聚成另外一类。结果表明,ISSR分子标记技术适合于印楝的遗传多样性分析。     

不同种源红松遗传多样性的研究

利用ISSR分子标记技术,对露水河红松种子园内7个无性系种源92个个体的遗传多样性进行了分析.通过14个ISSR引物的扩增,共检测到100个位点,多态位点58个.7个种源的多态位点百分比、Shnnon基因多样性指数、Nei基因多样性指数和有效等位基因指数所体现的遗传多样性变化规律一致,永华种源最低,西林河种源最高,依次为:西林河种源＞宏伟种源＞联营种源＞丽林种源＞东升种源＞寒月种源＞永华种源.对7个种源进行遗传聚类分析,以0.025遗传距离划分,可以将7个种源分为3个种源区.红松种源的遗传距离和地理距离相关性不明显.     

毛竹种源遗传多样性的AFLP和ISSR分析

运用AFLP和ISSR分子标记对17个毛竹种源的遗传多样性进行分析,结果如下：①通过Mantel检测,AFLP和ISSR标记得到的遗传相似性矩阵呈显著相关（r=0．925,P=0．005）,说明2种分子标记均适合用于毛竹种源遗传多样性的分析;②17个毛竹种源间的亲缘关系较近,但仍存在着一定的遗传变异,它们之间的遗传距离变化范围为0．020-0．182,通过聚类分析（UPGMA）将17个毛竹种源分成6个组,发现陈存及等根据产量等指标确立的4个毛竹优良种源位于不同的组,表明不同种源间存在性状差异。     

不同榉树种源遗传多样性的ISSR分析

应用ISSR(Inter S imp le Sequence Repeat)分子标记技术对云南邱北、易门、龙庆、双柏和浙江平湖5个种源(每种源19个样本)的榉树进行了遗传多样性的研究。由其18条ISSR引物扩增得到216个清晰的条带,其中多态性条带215个,多态性条带百分率(PPB)为99.54%。POPGENE软件分析结果表明,邱北种群的遗传多样性水平最高(PPB=88.43%,HE=0.260 5,HO=0.401 4),其次是易门种群,龙庆、双柏、平湖3个种群的遗传多样性水平相差较小。Ne i’s遗传多样性的分析表明,5个榉树种源在其总的遗传变异中有80.28%的存在于群体内,群体间的遗传变异仅占总变异的19.72%。由UPGMA聚类分析可知,易门和龙庆种群的亲缘关系最近,先聚合在一起,然后依次与邱北、双柏聚类,最后与亲缘关系最远的平湖种群聚合。其研究结果对榉树资源的遗传多样性保护具有指导作用。     

乳源木莲种源遗传多样性和遗传分化

乳源木莲(Manglietia yuyuanensis Law)属木兰科(Magnolinaceae)木莲属(Manglietia Blume)常绿大乔木,是近年来发掘推出的优良乡土速生用材和生态造林树种,自然分布于东北部、湖南南部、江西南部、安徽南部、浙江和福建等地,生于海拔700～1 200m的阔叶林中,其生长迅速,适应性和抗寒性强,树干通直圆满,木材结构细,纹理直,耐腐性较好,易加工,是优良的建筑、家具和胶合板用材.     

云南核桃品种遗传多样性的RAPD和ISSR标记研究

利用RAPD和ISSR分子标记技术对11份云南核桃(Juglans silillata Dode)品种进行了遗传多样性研究。研究结果表明,筛选出的8条RAPD和8条ISSR引物分别产生86和102条扩增带,其中多态性条带分别为53和62条,分别占总数的61.63%和60.78%。用POPGENE对两种标记方法的遗传多样性进行计算,有效等位基因数分别为1.3552和1.3707,基因多样性为0.2110和0.2143,Shannon信息指数为0.318 8和0.3216。以Nei氏遗传距离矩阵按UPGMA方法聚类分析结果RAPD和ISSR标记的遗传距离分别为0.0355~0.4113和0.1423~0.4011,平均值各为0.2288和0.2338,以上数据表明分析品种具有比较丰富的遗传变异,同时也说明尽管Mantel相关性检测两种标记方法相关性较低(r=0.543 9,P<0.05),但都可以有效地揭示核桃品种的遗传多样性状况。     

杉木种源遗传参数的估计与应用

对６年生幼林按随机区组模型估计了一组生长性状的遗传力，结果：ｈ＾２Ｈ＞ｈ＾２Ｄ＞ｈ＾２Ｖ＞ｈ＾２Ｋ＞ｈ＾２ＣＢ。种源的遗传力大于子代的遗传力，因此，种源选择提高了选择效果。各性状的遗传相关较表型相关更为密切。     

珙桐天然种群遗传多样性的ISSR标记分析

利用ISSR分子标记分析来自11个天然珙桐种群的遗传多样性。从100条引物中筛选出5条引物能扩增出稳定、清晰且具多态性的条带,共扩增出77个条带。其中74个为多态,多态条带百分率(PPB)为96.10%;各种群PPB值为37.66%～63.64%,平均为54.07%。种内Shannon多样性指数(HSP)为0.4849,种群内Shannon多样性指数(HPOP)为0.1886～0.3274,平均为0.2774。这表明珙桐在物种和种群水平上均维持较高的遗传多样性。分子方差分析显示,种群间与种群内遗传变异分别占总遗传变异的46.22%,53.78%,种群间呈高度遗传分化。种群间遗传距离与对应的地理距离呈显著正相关(r=0.546,P<0.01)。UPGMA法聚类分析将11个珙桐种群分为3组。研究结果为珙桐遗传资源保护策略制定提供有价值的种群遗传学信息。     

金银花ISSR分子标记及遗传多样性分析

以湖南、山东、河南的22个金银花主要栽培品种为材料,利用ISSR分子标记对22个金银花品种进行了遗传多样性分析.结果表明:从100条ISSR引物中筛选出10条能够扩增出清晰、稳定条带的引物;这10条引物对22个金银花品种基因组DNA扩增,共扩增出108条带,其中多态性条带96条,多态性条带比率为88.89%;22个金银花品种间的遗传相似性系数范围在0.41~1.00,平均遗传相似性系数为0.68.利用U PGM A进行系统聚类分析,22个供试金银花品种划分为2大类,第1类为忍冬种群,第2类为灰毡毛忍冬种群,每一大类又分为北方种群与南方种群.而且主成分分析结果支持以上的聚类分析结果.可见,利用ISSR标记可有效地分析金银花种质资源的遗传多样性,为金银花品种鉴别、分类、种质资源的有效利用提供理论依据.     

杉木种源遗传参数的估计与应用

对６年生幼林按随机区组模型估计了一组生长性状的遗传力，结果：ｈ２Ｈ＞ｈ２ｃｓ＞ｈ２Ｄ＞ｈ２ｖ＞ｈ２ｋ＞ｈ２ＣＢ．种源的遗传力大于子代的遗传力，因此，种源选择提高了选择效果。各性状的遗传相关较表型相关更为密切。     

刚竹属14个品种遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记手段,研究刚竹属部分竹子品种的遗传多样性。实验从50条ISSR引物中筛选出10条重复性好、条带清晰的引物进行PCR扩增。通过对75条谱带进行相似系数的聚类分析,结果同形态学分类结果基本吻合;运用特殊谱带,建立竹子品种的分子检索表,说明ISSR标记能够揭示材料间较高的遗传多样性。     

侧柏种源遗传多样性分析

应用AFLP技术对17省市的18个侧柏种源进行遗传多样性分析。选用的8个引物共扩增出多态性带1613条,占92.91%;平均有效等位基因数1.1993,平均Nei's基因多样性指数0.1239,Shannon's信息指数0.1949,揭示侧柏具有丰富的遗传多样性,其中中部种源遗传多样性低于南、北部种源。AMOVA分析表明侧柏种源遗传分化大,74.86%的遗传变异主要存在种源内,11.12%存在区域间,14.02%存在于区域内种源间,其分布的间断性、地理隔离以及低水平基因流(Nm=1.4372)是导致其种源间分化的主要因素。应用Nei(1972)遗传距离进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析,结果显示纬度相近的种源聚在一起,把18个种源划分为北部、中部、南部和山东4个种源区。Mantel检验也证实种源间的遗传距离与地理距离呈正相关。     

利用SRAP标记分析东部白松种源的遗传多样性

采用8对SRAP引物对加拿大19个种源的东部白松进行分析,获得97个扩增位点,多态性位点57个,平均多态性水平58.8%;每对引物产生等位基因7～22个,条带分布在100～1 000 bp。19个种源相似系数为71%～95%,根据不同种源的遗传相似系数,利用UPGMA法进行聚类分析,遗传相似系数69%为阈值,将19个东部白松种源分为4个群体。4个群的Nei指数为0.1557,Shanonn指数为0.2426,其中平均等位基因数为1.5876,有效等位基因数为1.2603;全部种源的基因多样性平均值为0.1840,群内基因多样性平均值为0.0340,基因分化系数为0.8152,群体间基因流为0.1132。     

三尖杉种源遗传多样性

应用ISSR分子标记对我国三尖杉主要分布区16个地理种源的遗传多样性和遗传分化进行分析.结果表明,三尖杉具有丰富的遗传多样性,总的种源基因多样性为0.337 7.研究发现,不同种源的遗传多样性差异较大,遗传多样性较高的种源主要来自三尖杉自然分布区的东部和偏中东部地区.由于小种群效应, 以及缺乏有效的基因流和生境的片断化,三尖杉种源间的遗传分化较大,25.9%的遗传变异存在于种源间,而74.1%的遗传变异来自于种源内.聚类结果显示,来自东部和偏中东部、遗传多样性较高的种源聚成一支.该区域和边缘分布区种源间遗传多样性的差异在很大程度上可能归因于长叶和短叶2种类型三尖杉种源间的差异.研究还表明,种源间的遗传距离与其地理距离相关不显著.     

红花石蒜遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对14个居群的红花石蒜进行遗传多样性研究,结果表明:POPGEN32分析显示红花石蒜物种的遗传多样性很高,多态位点百分率为92.31%,Shannon指数(H)为0.459 7,Ne i指数(I)为0.302 5;居群水平的遗传多样性较低,多态位点百分率平均为49.65%,Shannon指数(H)平均为0.262 0,Ne i指数(I)平均为0.176 3;居群间的遗传分化系数(Gst)为0.503 5,基因流(Nm)为0.698 3。AMOVA分子变异分析显示:居群间遗传分化程度高,46.12%的变异发生在居群内,53.88%的变异发生于居群间。生境的片段化使居群间的基因流受阻,可能是居群间高遗传分化和居群水平低遗传多样性的主要原因。     

4个滇牡丹天然居群遗传多样性的 ISSR 分析

以云南省香格里拉县4个滇牡丹天然居群为研究对象,采用ISSR分子标记技术,对98份材料进行遗传多样性分析,用多态性高、稳定性强的10条引物进行扩增,共获得96条扩增产物,其中多态性条带有82条,多态性百分比为85.42％;滇牡丹总体基因多样性为0.3438, Shannon 指数为0.5009;通过Nei’ s和聚类分析,居群间的遗传分化系数为0.7973,居群间的遗传变异占总遗传变异的79.73％,而居群内的遗传变异只有20.27％,表明滇牡丹居群间的遗传分化较大,遗传变异主要存在于居群间。因此,滇牡丹虽然为分布区狭窄的特有种,但是与一些典型稀有和濒危的物种相比,遗传多样性并不低,滇牡丹的分布区域和种群数量呈现狭窄化、缩小化的趋势,主要原因是受人为过度采挖,生境受到破坏所致。     

ISSR标记对樟子松遗传变异的分析及种源区划的研究

Inter Simple Sequence Repeat （ISSR） was used to detect genetic variation among nine provenances, including 135 individuals. A total of 108 loci were amplified using 10 random primers. The differentiation of the percentage of polymorphic bands （PPB） among different provenances was evident, ranging from 27% to 54%. of which Honghuaerji provenance had the highest PPB and Kalunshan provenance had the lowest PPB. Shannon＇s Information index （1） at species level was 0.1581 and Nei＇s gene diversity （h） was 0.2393. Coefficient of gene differentiation （Gsr） calculated by Popgene was 0.3965, these results indicated that majority of genetic variation （60.35%） was found within provenances. According to dendrogram among pinus sylvestriv provenances, nine provenances were divided into two provenance areas. namely Daxing＇an and Xiaoxing＇an Mountains provenance area and Hulunbeier provenance area.     

基于ISSR分子标记技术的土沉香遗传多样性分析

为更有效地保护和利用土沉香（Aquilaria sinensis）遗传多样性,以广西、海南和云南13个土沉香居群的147个家系为材料,采用简单序列重复区间（Inter-Simple Sequence Repeat,ISSR）分子标记技术和POPGEN 32软件对土沉香进行多态性分析和遗传多样性比较,采用NTSYS软件进行聚类分析,采用Mantle检验分析遗传距离与地理距离的相关性。结果表明,筛选出的34条引物共获得291个扩增位点数,其中多态性位点数230个,多态性位点百分率均值为78.97%。Nei’s基因多样性指数均值为0.226 1,香农信息指数均值为0.332 0,遗传分化系数均值为0.265 0,基因流均值为1.387 1,表明13个土沉香居群具有较高的遗传多样性和极高的遗传分化水平。海南屯昌与海南澄迈居群间的遗传距离最小、遗传一致度最大,海南乐东与广西浦北居群间的遗传距离最大、遗传一致度最小。以遗传距离0.90为阈值,可将13个土沉香居群划分为3大类;遗传距离与地理距离的解释率为3.1%,表现为不相关。