固始白鹅遗传多样性微卫星标记分析

［目的］对固始白鹅的遗传多样性进行微卫星标记分析。［方法］利用11个微卫星标记对固始白鹅进行遗传检测,筛选出多态性较好的微卫星位点,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法分析这11个微卫星位点在固始白鹅中的遗传变异,计算了微卫星位点的等位基因频率、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数。［结果］8个位点在固始白鹅上有较好的多态性,平均每个座位检测到4.25（3～6）个等位基因,平均杂合度为0.597（0.273～0.695）,平均多态信息含量为0.635（0.530～0.769）,平均有效等位基因数为3.3447（2.3830-4.9840）。［结论］为固始白鹅的保种和选育工作提供参考依据。     

微卫星标记多态性与番鸭体尺性状的关系

采用16个鸭特异性的微卫星标记对该番鸭30个个体进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,检测其等位基因,并分析其与番鸭体尺性状的相关性。结果表明,共检测到72个等位基因,16个座位都呈现出多态性,16个微卫星座位的等位基因数2~7个,平均等位基因数为4-5个。群体平均杂合度和平均多态信息含量分别为0.681和0.644。微卫星座位基因型间方差分析结果表明,微卫星AY493314与胫围呈极显著相关（P<0.01）,微卫星AJ272582与胫围和龙骨长呈显著相关（P<0.05）;微卫星AY493282,APL515883与胫长呈显著相关;AY493255,AY493342与半潜水长呈显著相关;AY493322与胸宽呈显著相关,其余微卫星未达到显著水平。     

鲁山牛腿山羊体尺性状与微卫星标记的相关分析

根据比较基因组学和相关文献资料,选择与山羊和牛生长性状相关的6个微卫星基因座(BM6444,MAF70,BM315,BMS1678,BM1818和BMC1206)作为分子标记,研究了牛腿山羊的群体遗传变异,并分析了体尺性状与6个微卫星标记之间的关系.结果表明:6个微卫星标记在牛腿山羊群体中的多态信息含量(PIC)分别为0.887,0.863,0.773,0.840,0.888和0.791,遗传杂合度(He)分别为0.904,0.883,0.808,0.864,0.904和0.824,有效等位基因数(Ne)分别为9.62,8.05,5.02,6.96,9.68和5.46.6个微卫星标记与体尺性状的最小二乘分析结果表明:BM6444基因座165bp和145bp等位基因对体质量、体高、体长、胸围和胸深有正效应,而154bp和137bp等位基因对体高、胸围和胸深性状有负效应;MAF70基因座180bp和159bp等位基因对体质量性状有正效应,159bp和144bp等位基因对体高、胸围和胸深有负效应;BM315基因座140bp等位基因对体高有正效应,而136bp等位基因对胸深有负效应;BM1818基因座298bp和27...     

夏南牛体尺性状与微卫星DNA的相关分析

试验选择18月龄的夏南牛母牛40头,选用8个微卫星DNA标记,研究了夏南牛群体遗传变异,并分析了体尺性状与8个微卫星标记的关系.结果表明:8个微卫星标记BM2113,BM1824、ETH225、IDVGA2、IDV-GA46、IDVGA55、BM3413和TGLA44等位基因数分别为7,6,6,6,6,4,6争6;多态信息含量分剔为0.764,0.775,0.786,0.701,0.723,0.570,0.759和0.776;杂合度分别为0.801,0.784,0.824,0.744,0.772,0.648,0.802和0.815.8个微卫星标记分别对夏南牛不同体尺性状存在正效应或负效应.

Abstract：

Forty 18-month-old Xianan cows and 8 microsatellite DNA markers(BM2113,BM1824,ETH225,IDVGA2,IDVGA46,IDVGA55,BM3413 and TGLA44)were used to study the population genetic variation Xianan cattle and the relationships between the gene loci and their body size traits.The resuits showed that the these 8 microsatellite markers had 7,6,6,6,6,4,6 and 6 alleles,their(polymorphism information content)PIC was 0.764,0.775,0.786,0.701,0.723,0.570,0.759 and 0.776 and their heterozygosis was 0.801,0.784,0.824,0.744,0.772,0.648,0.802 and 0.815,respectively.The microsatellites were found to be in positive or negative correlation with some body size traits in the population.     

夏南牛体尺性状与微卫星DNA的相关分析

试验选择18月龄的夏南牛母牛40头,选用8个微卫星DNA标记,研究了夏南牛群体遗传变异,并分析了体尺性状与8个微卫星标记的关系.结果表明:8个微卫星标记BM2113、BM1824、ETH225、IDVGA2、IDV-GA46、IDVGA55、BM3413和TGLA44等位基因数分别为7,6,6,6,6,4,6和6;多态信息含量分别为0.764,0.775,0.786,0.701,0.723,0.570,0.759和0.776;杂合度分别为0.801,0.784,0.824,0.744,0.772,0.648,0.802和0.815.8个微卫星标记分别对夏南牛不同体尺性状存在正效应或负效应.     

湖北白鹅选育报告——微卫星标记多态性及其与肉质性状的相关分析

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)方法检测了湖北白鹅基因组DNA微卫星标记的多态性,计算了基因频率、基因平均杂合度、多态信息含量,分析了不同基因型与肌肉水分、脂肪、氨基酸等肉质性状间的相关性.结果表明,所检测的8个微卫星座位的平均等位基因数为2.75个,群体基因的平均杂合度为0.594 5,多态信息含量是0.508 7.在所检测的8个微卫星座位中.ADL166座位AB基因型、MCW0104座位AC基因型、MCW0004座位BB基因型、MCW0120座位AD基因型个体的肌肉水分含量显著或极显著地低于其他基因型个体;ADL210座位BB与BC基因型、MCW0104座位AC基因型、MCW0004座位BB与CC基因型、MCW0120座位BB与DD基因型、MCW0014座位AB与BB基因型个体的肌肉脂肪含量显著或极显著地高于其他基因型个体;ADL210座位AA基因型个体的肌肉氨基酸含量显著高于BC基因型个体,MCW0120座位AC基因型个体肌肉氨基酸含量显著高于DD基因型个体.     

西镇牛微卫星DNA与生长发育性状的关联性分析

【目的】分析12个微卫星DNA与西镇牛长发育性状的关联性,为西镇牛品种资源保护和开发利用提供理论依据。【方法】测定西镇牛的体高、体长、胸围、管围、腰角宽和体质量。利用12对微卫星引物,采用PCR扩增和非变性聚丙稀酰胺凝胶电泳技术,对48头西镇牛母牛进行了遗传多样性检测,并统计分析各位点各种基因型群体与体尺性状之间的效应关系。【结果】12个微卫星位点各基因型与西镇牛生长发育性状具有关联性。IDVGA2、BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILSTS005、BM1824位点与体高,BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILSTS005、ETH10、DAVG44位点与体长,IDVGA2、DVGA55、HEL9、ILST093、IDVGA27、BM1824位点与胸围,IDVGA2、ETH225、DAVG44位点与管围,BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、BM1905、ILSTS005、ILST093、ETH10位点与腰角宽,IDVGA2、BM2113、DVGA55、ETH225、HEL9、ILST093、BM1824位点与体质量具有显著或极显著的效应关系。【结论】筛选出了对西镇牛生长发育性状具有正效应的等位基因45个,具有负效应的等位基因40个,可用于指导西镇牛育种实践。     

快、慢羽固始鸡体尺与繁殖性状间关系的研究

对4 3只5 5周龄的固始鸡快、慢羽公鸡的体尺和精液品质性状的测定和分析表明:成年固始鸡快、慢羽公鸡间的体尺性状差异不显著(P >0 .0 5 )。慢羽公鸡的射精量显著高于快羽公鸡的射精量,而精液pH值、精子计数、死精率及精子畸形率5个性状在快、慢羽固始鸡间的差异不显著(P >0 .0 5 ) ,表明快、慢羽固始鸡基因对公鸡繁殖性状有一定的影响。     

微卫星DNA标记与猪肉质性状的相关分析

测定了长蓝参考家系F2代个体的肉色、大理石纹、pH值和系水力4个肉质性状，同时测定了6号染色体的23个微卫星DNA标记，将不同基因型与4个肉质性状进行方差分析与多重比较．结果表明：肉色与大理石纹、pH值、系水力间的相关系数分别为—0．322、0．419、0．468，pH值和系水力间的相关系数最高，为0．737，差异极显著；MN006座位与影响pH值性状的QTL连锁，加性效应为0．108，MN004座位与影响大理石纹性状的QTL连锁，加性效应为0．125．     

鸡微卫星DNA标记与其生长性状的相关分析

测定了固始鸡与安卡鸡杂交后自交F2代500多个个体的0,2,4,6,8,10,12周龄体重,检测10个微卫星DNA标记,对标记基因型生长性状值进行方差分析和多重比较。结果表明:对于2,8,12周龄体重,MCW166各基因型间有显著差异(P<0.05);6周龄体重,MCW166各基因型间有极显著差异(P<0.01);对于2周龄体重,ADL169各基因型间有极显著差异(P<0.01),4,6,8周龄体重,ADL169各基因型间有显著差异(P<0.05)。     

微卫星标记与商品代固始鸡体型参数和屠体性状的关联性分析

利用最小二乘法拟合线性模型,探索了与鸡体型参数和屠体性状紧密相关的10个微卫星座位与商品代固始鸡体型参数和屠体性状的关系。用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法,分析了这10个微卫星位点在100只商品代固始鸡中的遗传变异,计算了微卫星位点的等位基因频率、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数。结果表明,其中8对微卫星引物表现出多态,平均每个座位检测到3.625个等位基因(3~4个),平均多态信息含量为0.520 3,平均杂合度为0.626 0。通过最小二乘分析,检测到MCW0295、MCW0006、MCW0185、ADL0192位点与体型参数中的5种性状间存在不同程度的关联性;MCW0006、MCW0185、ADL0105位点与商品代固始鸡6个屠体性状中的4个性状显著连锁。MCW0295位点的AC基因型有望作为质量的早期选择辅助标记,MCW0006和MCW0185位点的CC基因型有望作为质量、胸宽、胸深、胫长、体斜长的早期选择辅助标记,ADL0192位点的AB基因型有望作为质量、胸宽的早期选择辅助标记;MCW0006位点的CC基因型有望作为全净膛率的选择辅助标记,MCW0185位点的AD基因型有望作为胸肌率和腿肌率的选择辅助标记,ADL0105位点的CC基因型有望作为腹脂率的选择辅助标记。     

双重抑制PCR技术分离鹅微卫星标记

用双重抑制PCR技术分离11对鹅的特异微卫星引物,应用于浙东白鹅和太湖鹅的基因组PCR扩增。结果表明：11对引物在浙东白鹅和太湖鹅中分别扩增出37和36个清晰条带,20个等位基因为两品种所共有,11对引物中有5对呈中等多态、6对呈高度多态。各位点产生2～6个等位基因,各位点的平均杂合度为0．456～0．772,以G07位点为最高,G06位点为最低;平均多态信息为0．375～0．737,以G07位点为最高,C01、G03和G11位点为最低。浙东白鹅和太湖鹅有效等位基因数分别为2．655和2．558,与实际测得的两品种平均值3．364和3．273较接近。研究结果表明,两品种的等位基因分布较为均匀,与鹅的实际品种特征一致,因此,双重抑制PCR技术适合于鹅的基因组结构研究。     

应用微卫星标记研究中国15个地方白羽鹅品种遗传多样性

利用22个微卫星DNA标记对中国15个地方白羽鹅种进行遗传分析。结果表明：22个微卫星标记中3个为高度多态座位，1个低度多态座位，其余均为中度多态座位。平均杂合度最高的是太湖鹅（0．7105），最低的是皖西白鹅（0．5838）。织金白鹅与溆浦鹅遗传距离最近，为0．0417，而太湖鹅与四川白鹅最远，为0．7259。通过UPGMA法15个地方白羽鹅聚为3大类：织金白鹅、溆浦鹅、闽北白鹅、右江鹅、莲花白鹅、武冈铜鹅、同始鹅、浙东白鹅、籽鹅聚为第一类，广丰白翎鹅、皖西白鹅聚为第二类；酃县白鹅、百籽鹅、太湖鹅、四川白鹅聚为第三类。本研究证明中国地方鹅群体的遗传多性样比较丰富，具有较高的选择潜力。     

淮南麻鸭与固始鹅蛋品物理性状的对比分析

目的:分析淮南麻鸭和固始鹅蛋的蛋品质量性状,为品种资源普查提供素材,了解不同种类水禽蛋品质量的差异。方法:对62个鸭蛋和42个鹅蛋的蛋壳颜色,蛋重,蛋的比重,蛋壳、蛋黄和蛋白各自占总蛋重的比例,蛋不同部位蛋壳厚度、蛋形指数、蛋黄颜色、哈氏单位、蛋内异物等项目进行测定。结果:绝大多数的鸭蛋为白色(占95.16%),少数为青色,鹅蛋均为白色;鸭蛋的平均比重为1.112,鹅蛋的平均比重为1.121;蛋形指数分别为1.486和1.419;蛋壳重占总蛋重的比例分别为11.23%和12.34%;平均蛋壳厚度分别为0.312mm和0.517mm;鸭蛋蛋黄颜色深,鹅蛋浅;哈氏单位分别为86.590和86.071;淮南麻鸭蛋的异物率明显高于固始鹅蛋。     

5个鹅品种微卫星遗传多样分析

选用10个微卫星引物对四川白鹅、豁眼鹅、莱茵鹅、朗德鹅、扬州鹅5个鹅品种进行遗传多样性分析。结果表明:5个鹅品种的10个微卫星座位共检测到272个等位基因,平均基因数为5.4个,5个鹅品种在10个微卫星座位上的基因频率存在一定差异,其平均基因杂合度为0.708 1,平均多态信息含量为0.661 8。其中,扬州鹅平均基因杂合度最高,为0.756 8,遗传多样性最丰富;朗德鹅平均遗传杂合度最低,为0.670 7。     

利用微卫星标记分析湖南4个地方鹅品种遗传多样性

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测了湖南4个地方鹅品种的遗传多样性.利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的DA遗传距离.结果表明,31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析.4个鹅品种中,平均杂合度范围是0.5010 ～ 0.6705,各鹅种的杂合度都较高,最高的是酃县白鹅(0.6705),最低的是武冈铜鹅,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性.对DA遗传距离的计算表明,用UPGMA法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类:道州黑鹅与酃县白鹅聚为第1类;武冈铜鹅自聚为第2类;溆浦鹅自聚为第3类.     

江西4个地方鹅品种遗传多样性的微卫星标记分析

通过选用31个多态性较好的微卫星标记,检测江西4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(P IC)和群体间的遗传距离(DA)。结果表明:31个微卫星位点中有25个微卫星位点在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析;4个鹅品种的杂合度都较高,平均杂合度为0.584 6~0.643 4,其中最高的是广丰白翎鹅(0.643 4),最低的是莲花白鹅,而且杂合度的高低与P IC值的大小表现出较高的一致性。用DA的U PGM A法进行聚类分析,结果4个鹅品种被聚为3类,莲花白鹅与丰城灰鹅聚为第1类,广丰白翎鹅自聚为第2类,兴国灰鹅自聚为第3类。     

基于双单倍体牙鲆挖掘与生长性状连锁的微卫星标记

利用中国水产科学研究院北戴河中心实验站2007年制备的双单倍体牙鲆为材料,根据生长性状表型值分成快速生长组(Fast growth group,FGG)和慢速生长组(Slow growth group,SGG),进行微卫星标记与生长性状的连锁分析.从牙鲆遗传连锁图谱选择40个高多态性的微卫星标记,覆盖了24个连锁群中的...