高原超细型细毛羊经济性状的微卫星标记研究

利用3对微卫星引物对70只中国美利奴高原型超细类群个体进行DNA多态性分析,结果表明：3个微卫星座位具有高度多态性,多态信息含量平均为0.739 1,有效等位基因数4.441 9.3个微卫星标记与经济性状间的相关分析表明,微卫星MCM218的160 bp等位基因和BMC1009的288 bp等位基因与中国美利奴高原型超细群体绵羊羊毛细度有极显著的相关性,相关系数分别为-0.956 1和-0.849 1.微卫星BMS1248的145 bp的等位基因与中国美利奴高原型超细型绵羊周岁体重有显著的相关性.相关系数为0.952 3.这一结论初步说明,微卫星MCM218的160 bp等位基因和BMC1009的288 bp的等位基因与中国美利奴高原型超细群体周岁绵羊羊毛细度存在一定程度的连锁,微卫星BMS1248的145 bp的等位基因与中国美利奴高山型超细型绵羊周岁体重也存在一定的连锁关系,为进一步分析细毛羊主要经济性状的连锁标记以及克隆相关基因打下基础.     

兴安细毛羊羊毛纤维直径与经济性状的相关性分析

兴安盟在实施内蒙古细毛羊三期科技攻关项目时，笔者对兴安细毛羊的羊毛纤维直径与细毛羊的主要经济性状的相关性进行了研究。     

甘肃高山细毛羊KRT-IF35基因的多态性及其与羊毛性状的关系

以370只甘肃高山细毛羊为研究对象,利用PCR-SSCP技术,选取KRT-IF35基因作为候选基因,分析遗传多态性,并利用SPSS软件下的GLM程序分析KRT-IF35基因与产毛量性状的关系.结果表明:在甘肃高山细毛羊个体中,KRT-IF35基因存在3种基因型AA、AB、BB.进一步测序结果表明,甘肃高山细毛羊KRT-IF35基因在CDS区第154碱基处发生C→T的突变,导致了氨基酸从脯氨酸变为亮氨酸.χ2检验表明甘肃高山群体在该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),多态信息含量(PIC)为0.306 4,属于中度多态(0.5>PIC>0.25).关联分析表明:甘肃高山细毛羊KRT35基因AA基因型标记的羊毛细度为19.89μm±0.13μm,AB基因型标记的羊毛细度为20.56μ±0.25 μm,AA基因型与AB基因型间差异达到了显著水平(P<0.05);AA基因型标记的羊毛纤维直径变异系数为(21.48±0.16)%,AB基因型标记的羊毛纤维直径变异系数为(22.27±0.34)%,AA基因型与AB基因型间差异达到了显著水平(P<0.05);AA基因型标记的羊毛纤维伸长率为(53.74±0.37)%,BB基因型标记的羊毛为(51.73±0.98)%,AA基因型与BB基因型间差异达到了显著水平(P<0.05);因此KRT-IF35 C154→T SNP位点可能作为一个羊毛细度、羊毛纤维直径变异系数、伸长率选择的DNA标记.     

湖羊产羔性状的微卫星标记与可能生产力的关联性分析

选择位于绵羊第6号染色体上与多胎基因（Fec^B）紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55标记以及位于第4号染色体上的OarHH35标记对湖羊的产羔性状进行研究,结果显示：湖羊的5个微卫星座位都达到了高度多态水平（PIC〉0．5）,5个微卫星座位可以用于湖羊产羔性状的遗传多样性的评估。方差分析结果表明：5个基因座中OarAE101、BM143各基因型产羔数生产力之间存在极显著差异（P〈0．01）,OarHH35各基因型产羔数可能生产力之间存在显著差异（0.01〈P〈0．05）,BM1329、OarHH55各基因型产羔数可能生产力之间差异不显著（P〉0．05）。在OarAE101标记中107／113的产羔数最小二乘平均值为最大,与基因型103／113、107／107、101／111、113／113、107／111和103／103之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与101／101和103／107之间产羔数最小二乘平均值差异显著（O．01〈P〈0．05）,与115／115和111／111之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在OarHH35标记中139／139的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型139／141、139／127、137／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与127／127、125／125和139／125之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。在BM143标记中118／118的产羔数可能生产力最小二乘平均值为最大,与基因型118／106、118／110、106／104和112／114之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异不显著（P〉0．05）,但与118／116和102／106之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异显著（0.01〈P〈0．05）,与102／104、112／102和116／112之间产羔数可能生产力最小二乘平均值差异极显著（P〈0．01）。研究将在今后湖羊品种的标记辅助选择和分子育种中具有重要的应用价值。     

微卫星标记与绵羊部分毛用性状关系的分析

在绵羊1、6号染色体上选取BM6506、BM1824等5个微卫星基因座对待测绵羊群体部分毛用性状的表型数据资料按基因型分组进行方差分析和多重比较。结果表明,OarJMP8可对羊毛自然长度性状进行标记;BM6438和BM6506可对羊毛细度进行标记;在绵羊6号染色体上的OarJMP8附近存在控制羊毛自然长度的QTLs;在绵羊第1号染色体的BM6438和BM6506区域存在控制羊毛细度的QTLs。     

绵羊微卫星标记与部分毛用性状的关系研究

根据GenBank在绵羊1、6号染色体上选取了14个微卫星基因座，对被测绵羊群体所有的表型数据资料按基因型分组进行方差分析和多重比较，得出结论：ILSTS004、OarAE101、OarJMP8和BM1434个微卫星标记可以对羊毛自然长度性状进行标记；BM1824，BM6438和BM6506可以对羊毛细度进行标记。在绵羊6号染色体上的OarAE101、BM143和OarJMP83个位点之间或附近存在控制羊毛自然长度的QTLs；在绵羊第1号染色体的BM1824，BM6438和BM6506区域可能存在控制羊毛细度的QTLs。     

利用24个微卫星进行猪数量性状座位定位及其遗传效应分析

以 3头英系大白公猪与 7头梅山母猪杂交产生的三代资源家系用来检测猪重要经济性状的数量性状座位(QTL) ,2 0 0 0年下半年随机选留 140头F2代个体 ,进行屠宰测定 ,记录了包括生长、胴体组成等 43个性状 ;从已定位于家猪 3、4和 7号染色体上的遗传标记中选用 2 4个微卫星标记对所有个体进行基因型检测。采用最小二乘回归区间定位法进行QTL检测 ,通过置换实验来确定显著性阈值。在所研究的 32个生长和胴体性状中 ,3条染色体总共 16个QTL达到染色体显著水平 (P <0 0 5 ) ,其中 4个达到染色体极显著性水平 (P <0 0 1) ;同时在 4号和 7号染色体上还检测到了影响器官重性状的 3个QTL ,达到了染色体显著水平 (P <0 0 5 )。在某些QTL座位 ,其有利等位基因来源于具有较低性状平均值的品种。 2QTL模型分析下 ,在 4号染色体上检测到影响板油重的 2个QTL ,并且它们的效应方向相反。     

湖羊产羔性状的微卫星标记与其产羔数的关联性分析

选用位于绵羊第6号染色体上与多胎基因(FecB)紧密连锁的微卫星O arAE101、BM 1329、BM 143和O arH H 55以及位于第4号染色体上的O arH H 35标记对湖羊的产羔性状进行研究。结果发现湖羊的5个微卫星位点都达到了高度多态水平(PIC>0.5),这5个微卫星位点可以用于湖羊产羔性状的遗传多样性的评估。方差分析结果表明:5个位点中O arAE101、BM 143各基因型产羔数之间存在极显著差异(P<0.01),BM 1329、O arH H 35各基因型产羔数之间存在显著差异(P<0.05),O arH H 55、BM 1329各基因型产羔数之间差异不显著(P>0.05),本研究对今后湖羊品种的标记辅助选择和分子育种具有重要的应用价值。     

微卫星标记与猪部分肉质性状相关分析

选取位于猪1、4、6号染色体上的15个微卫星座位,以湘黄猪、湘黄×长白×大白(黄长大)、大白×大围子(大围)、大围子等猪群为研究材料,进行了微卫星标记与部分肉质性状的相关性研究。微卫星座位的群体遗传学特性分析表明,各座位等位基因数在2～8个之间,平均等位基因数为5.33个;杂合度在0.504～0.839之间,平均杂合度为0.756;多态信息含量在0.375～0.808之间,平均多态信息含量为0.705。微卫星座位基因型间方差分析结果表明,微卫星ESTMS1与失水率呈极显著相关,SW1841与失水率呈显著相关;ESTMS1与熟肉率呈显著相关;SW286与水分呈显著相关;ESTMS1与粗蛋白质呈极显著相关,SW752与粗蛋白质呈显著相关;SW1311、SW1462与肌内脂肪呈极显著相关,SW871与肌内脂肪呈显著相关。其他微卫星座位未达到显著水平。     

细毛羊KRT26基因多态性及其与羊毛细度的关联性分析

本研究旨在揭示影响绵羊重要经济性状的功能基因的分子遗传特征及其与细毛羊群体的遗传关系,为高效选育绵羊品种经济性状及其种质资源的保护与利用提供分子遗传学依据。试验利用PCR-SSCP、DNA测序和生物信息学对289个细毛羊的KRT26基因进行遗传变异分析及其与细毛羊羊毛细度的关联性分析。结果表明,KRT26基因在该细毛羊群体中存在AA、AB、BB 3种基因型,其基因型频率分别为0.221、0.426和0.353,A、B等位基因频率分别为0.434、0.566,细毛羊群体的多态信息含量为0.371,呈中度多态水平,且处于Hardy-Weinberg非平衡状态(P0.05)。经过BioEdit软件比对序列和Chromas软件分析测序结果显示,KRT26基因发现5处碱基突变:83bp(G/C)、86bp(T/C)、112bp(C/T)、140bp(G/A)和247bp(C/T),并通过氨基酸序列的比对结果表明,2处发生了氨基酸的替代,即Val/Ile和Asn/Lys。KRT26基因在细毛羊群体中AA基因型个体极显著高于AB和BB基因型(P0.01)。因此,KRT26基因可能作为羊毛细度性状的一个新的分子标记。     

中国美利奴羊（新疆型）产毛性状的相关及通径分析

利用998只中国美利奴羊（新疆型）周岁资料，应用通径分析方法研究了中国美利奴羊（新疆型）羊毛长度、剪毛后体重、毛弯曲分、毛油汗分和羊毛纤维直径对产毛量的影响程度，结果表明：这5个性状与产毛量的表型相关系数分别为0.5552、0.7048、-0.0759、-0.0917和-0.0105；对产毛量的直接通径系数分别为0.2103、0.6447、-0.0105、0.0324和0.1141。可见，剪毛后体重是影响中国美利奴羊（新疆型）产毛量的主要因素。     

凉山半细毛羊微卫星标记与体重性状的相关关系的研究

在绵羊1、2、3、9号染色体上选取了22个微卫星基因座,对实验绵羊群体所有的表型资料按基因型分组进行方差分析和多重比较。结果表明:5个微卫星基因座对体重影响显著。标记BMS835的基因型AD(182/190)、BMS1126的基因型DG(107/113)、BMS1636的基因型AC(124/128)、OARCP79的基因型EF(109/111)和BMC1009的基因型DE(292/284)为体重的有利基因型。     

8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中的遗传多样性研究

利用8个微卫星位点对甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系进行遗传检测,计算了等位基因频率、有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量。结果表明,位点BM3501的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最高（Ne=7.30,H=0.866,PIC=0.848）;位点BM3413的有效等位基因数、群体杂合度和多态信息含量都最低（Ne=2.33,H=0.573,PIC=0.478）;8个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中多态性丰富,除位点BM3413表现为中度多态外,其余位点均表现为高度多态。因此,甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传杂合度较高,遗传多样性丰富,选择余地较大;8个微卫星位点可用于甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传多样性评估,并可用于对其羊毛性状和肉用性状的进一步研究。     

甘肃高山细毛羊优质毛品系15个微卫星位点的遗传多样性分析

研究对甘肃高山细毛羊优质毛品系的15个微卫星位点进行了遗传多样性检测.计算了各位点的等位基因频率(P)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne).结果表明:15个微卫星位点中有1个未检测到多态,其余14个均表现出高度多态性.多态性标记在该群体中的平均等位基因数为10个,平均多态信息含量PIC=0.83,平均杂舍度H=0.85,平均有效等位基因数Ne=7.1.说明甘肃高山细毛羊优质毛品系的遗传多样性丰富,遗传变异程度较高,基因一致度较差,变异性较大,具有较大的选择潜力.这14个位点可以作为有效的遗传标记,用于甘肃高山细毛羊优质毛品系遗传多样性分析及其与各生产性状的相关性研究.     

微卫星标记与固始鸡及部分外来鸡种体型性状及屠体性状的相关分析

选择与鸡体型参数和屠体性状紧密相关的10个微卫星位点,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法分析其与固始鸡5个系和4个非固始鸡品系共9个群体体型性状及屠体性状相关关系。结果表明:检测到4个标记(MCW0295、MCW0006、MCW0185、ADL0192)与5个性状(体重、胸宽、胸深、胫长、体斜长)存在显著相关,在各个群体中,标记MCW0295与体重相关比较显著,标记ADL0192与体斜长相关。在固始鸡群体中,标记MCW0006和MCW0185与体型性状各个性状相关比较显著。检测到3个标记分别与3个屠体性状存在不同程度的相关:在固始鸡原种、父母代中,标记MCW0295与胸肌率相关。在固始鸡原种和商品代中,标记MCW0006与全净膛率相关。在艾维茵鸡中,MCW0294与腿肌率相关。说明这些标记位点可能是控制特定性状的主效基因,或与控制性状的主效基因连锁。     

凉山半细毛羊初生重QTL的研究

选取凉山半细毛羊7个父系半同胞家系,利用绵羊1号染色体上11个微卫星标记,通过聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）对凉山半细毛羊初生重QTL进行了研究。QTL分析的结果表明,在其中一个家系B3K5055中,1号染色体微卫星标记ILSTS004与CSSM004之间检测到影响初生重的QTL,其LOD值为3.338,位于置信区间95%（2.73）和99%（3.49）之间。     

滩羊二毛期羊毛性状分析及其相关性研究

本试验旨在探究滩羊二毛期羊毛性状及其相关性,采集出生当天(初生期)及30～40日龄(二毛期)的滩羊样本各511个,其中公羊260只,母羊251只,分别测定初生期和二毛期羊毛的侧部毛长和侧部弯曲数;并分析了二毛期两型毛和绒毛的平均纤维直径(MFD)、平均纤维曲率(MFC)、毛纤维直径变异系数(CVFD)和毛纤维直径标准差(FDSD),对羊毛性状进行描述性统计及相关性分析。结果显示:初生期滩羊羊毛侧部弯曲数和初生期侧部毛长呈极显著中等正相关(r=0.410,P<0.001);初生期侧部弯曲数和二毛期侧部弯曲数间存在极显著中等正相关(r=0.618,P<0.001);两型毛FDSD与CVFD间呈极显著强正相关(r=0.796,P<0.001),绒毛FDSD与CVFD间极显著强正相关(r=0.942,P<0.001);两型毛MFD与FDSD呈极显著中等正相关(r=0.511,P<0.001),绒毛MFD与FDSD呈极显著中等正相关(r=0.660,P<0.001);绒毛MFD与CVFD呈极显著中等正相关(r=0.410,P<0.001),两型毛MFD与CVFD呈显著弱负相关(r=―0.106,P<0.05);绒毛MFD和MFC间呈极显著中等负相关(r=―0.497,P<0.001),两型毛MFD和MFC间呈弱正相关,相关性不显著(r=0.011,P>0.05)。本试验首次大规模检测了滩羊二毛期羊毛的性状指标,确定了各指标间的相关关系,为滩羊裘皮性状的选育提供数据支撑。     

中国美利奴羊(新疆军垦型)品系间羊毛理化性能及性状相关分析

为研究中国美利奴羊(新疆军垦型)品系间的毛品质特点,以超细毛品系、A品系、B品系、毛用多胎品系和肉用多胎品系为试验对象,测定毛纤维的主要理化性能,分析各品系羊的毛纤维特点,并作相关分析。结果表明,A品系羊毛自然长度最长;超细毛品系羊毛纤维直径显著低于其它品系(P＜0.05),其羊毛卷曲度显著高于其它品系(P＜0.05);B品系污毛量最高,肉用多胎品系污毛量显著低于其它品系(P＜0.05)。毛用多胎品系净毛率最高,但各品系间净毛率差异不显著(P＞0.05)。相关分析结果表明,羊毛细度与卷曲度呈极显著负相关(P＜0.01),细度与污毛量呈显著正相关(P＜0.05);卷曲度与污毛量呈显著负相关(P＜0.05),卷曲度与自然长度呈极显著负相关(P<0.01);污毛量与自然长度呈极显著正相关(P＜0.01);自然长度与净毛率呈显著正相关(P＜0.05)。说明各品系羊的毛品质特点与培育目标一致,其中,超细毛品系羊毛综合品质优良。