鸡微卫星DNA标记与其生长性状的相关分析

测定了固始鸡与安卡鸡杂交后自交F2代500多个个体的0,2,4,6,8,10,12周龄体重,检测10个微卫星DNA标记,对标记基因型生长性状值进行方差分析和多重比较。结果表明:对于2,8,12周龄体重,MCW166各基因型间有显著差异(P<0.05);6周龄体重,MCW166各基因型间有极显著差异(P<0.01);对于2周龄体重,ADL169各基因型间有极显著差异(P<0.01),4,6,8周龄体重,ADL169各基因型间有显著差异(P<0.05)。     

鸡F2群体的屠宰性状与微卫星DNA标记相关性研究

利用25个微卫星标记,对以隐性白羽鸡和仙居鸡为亲本建立的F2资源群体500只鸡进行遗传检测,并测定各个体的活体重、屠体重、胸肌重、腿肌重和腹脂重,采用方差分析法对标记与性状进行连锁分析.结果表明:各位点平均等位基因数为5,平均杂合度为0.701 2,平均多态信息含量为0.646 8.方差分析显示:MCW0095、ABR0322、ADL289、MCW004、ADL166、MCW104和MCW67对活体重、屠体重有显著影响(P＜0.05或0.01);ADL211、MCW004和ADL0301对胸肌重有显著影响(P＜0.05或0.01);MCW004、ADL0301和MCW67对腿肌重有极显著影响(P＜0.01).表明这些标记与性状间可能存在连锁关系.     

鸡F2群体的屠宰性状与微卫星DNA标记相关性研究

利用25个微卫星标记,对以隐性白羽鸡和仙居鸡为亲本建立的F2资源群体500只鸡进行遗传检测,并测定各个体的活体重、屠体重、胸肌重、腿肌重和腹脂重,采用方差分析法对标记与性状进行连锁分析.结果表明:各位点平均等位基因数为5,平均杂合度为0.701 2,平均多态信息含量为0.646 8.方差分析显示:MCW0095、ABR0322、ADL289、MCW004、ADL166、MCW104和MCW67对活体重、屠体重有显著影响(P＜0.05或0.01);ADL211、MCW004和ADL0301对胸肌重有显著影响(P＜0.05或0.01);MCW004、ADL0301和MCW67对腿肌重有极显著影响(P＜0.01).表明这些标记与性状间可能存在连锁关系.     

微卫星DNA标记与边鸡生长性状关系的研究

利用 5种鸡基因组的微卫星DNA标记 ,对边鸡共 97只个体进行标记基因型与生长性状的最小二乘分析。结果表明 :有 2个标记位点ADL0 14 6和ADL0 176分别显著影响边鸡的部分生长性状。在ADL0 14 6位点 ,基因型为 14 9 -14 9个体的体重、龙骨长最小二乘均值显著大于基因型为 14 5 - 14 9、14 5 - 160和 14 9 -160个体所对应的性状 (P <0 .0 5 ) ;基因型为 14 9 -14 9个体的胫长最小二乘均值显著小于基因型为 14 5 - 14 9、14 5 - 160和 14 9 -160个体所对应的性状 (P <0 .0 5 )。在ADL0 176位点 ,基因型为 186- 186、186- 192个体的胸宽、骨盆宽最小二乘均值均显著大于基因型为 188- 2 0 2、192 - 2 0 8和 2 0 8 -2 2 2个体所对应的性状 (P <0 .0 5 )。     

哲罗鲑微卫星标记与重要生长性状的相关性分析

采用10对微卫星荧光标记分析哲罗鲑Hucho taimen同池养殖群体的遗传多样性,通过SPSS13.0的GLM模型筛选出与生长性状(体质量、体长、体高和体宽)相关的微卫星标记。结果显示,10个微卫星位点的平均有效等位基因个数为2.301 4;多态信息含量0.366 6~0.557 6;观测杂合度范围0.652 2~0.989 1,均大于期望杂合度;Fis值为负数,存在杂合子过剩现象。基因座BJT4、BJT6、BJT8、BJT12、BJT18、BJT19、BJTH4和BJTH19均与体质量和体长性状极显著相关(P0.01),BJT6、BJTH6和BJTH17均与体高和体宽性状极显著相关(P0.01),发现存在"一因多效"和"多因一效"现象。不同基因型的多重比较表明,BJT12、BJT18和BJTH4基因座的AA基因型、BJT4基因座的BB基因型、BJT6基因座的AB基因型与体质量、体长呈正相关,BJTH6和BJTH17基因座的AB基因型与体高、体宽呈正相关。研究结果为哲罗鲑的分子标记辅助育种提供依据,同时也为下一步构建哲罗鲑的遗传连锁图谱提供基础数据。     

微卫星分子标记技术在鱼类遗传连锁图谱构建中的应用

分子遗传标记是建立遗传连锁图谱的基础 ,也是探索动物遗传的分子机理及克隆未知基因的基础。未来将是以基因组为基础的生命科学 ,而分子遗传标记是进行基因组研究的向导和路标。微卫星(Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ)是指以少数几个核苷酸 (一般为 2～ 4ｂｐ)为单位多次串联重复的ＤＮＡ序列。微卫星具有十分丰富的多态性[1] ,杂合度最高可达 1 0 0 % ,每代变异超过 2 % [2 ] 。微卫星分析可以提供分辨率达一个碱基对差异的信息[3 ] ,且等位基因的条带易于识别和解释 ,能够比当前所有的分子标记带来更多的信息量[4 ] 和信息质量 ,非常适用…     

微卫星分子标记技术在鱼类遗传连锁图谱构建中的应用

分子遗传标记是建立遗传连锁图谱的基础 ,也是探索动物遗传的分子机理及克隆未知基因的基础。未来将是以基因组为基础的生命科学 ,而分子遗传标记是进行基因组研究的向导和路标。微卫星(Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ)是指以少数几个核苷酸 (一般为 2～ 4ｂｐ)为单位多次串联重复的ＤＮＡ序列。微卫星具有十分丰富的多态性[1] ,杂合度最高可达 1 0 0 % ,每代变异超过 2 % [2 ] 。微卫星分析可以提供分辨率达一个碱基对差异的信息[3 ] ,且等位基因的条带易于识别和解释 ,能够比当前所有的分子标记带来更多的信息量[4 ] 和信息质量 ,非常适用…     

鸡微卫星DNA标记与屠宰性状的关系

利用25个微卫星标记,对以隐性白羽鸡和仙居鸡为亲本建立的F2群体500只鸡进行遗传检测,并测定各个体的活重、屠体重、屠体率、胸肌率、腿肌率和腹脂率,采用方差分析法对微卫星DNA标记与屠宰性状进行相关性分析。研究结果表明,各位点平均等位基因数为5,平均杂合度为0.701 2,平均多态信息含量为0.646 8。方差分析结果显示:MCW 0095、ABR0322、ADL289、MCW 4、ADL166、MCW 104和MCW 67对活重、屠体重有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01);MCW 104对屠体率有极显著影响(P<0.01);ABR0322、ADL166和MCW 67对胸肌率差异显著或极显著(P<0.05或P<0.01);MCW 0223和ADL166对腿肌率有显著或极显著影响(P<0.05或P<0.01);ADL136和MCW 67对腹脂率有显著影响(P<0.05)。其他标记对性状的影响未达到显著水平。     

绒山羊经济性状遗传标记与QTLs的连锁分析

 以陕西省甘泉白绒山羊场4个已知在标记位点(即运铁蛋白、前白蛋白-3、酯酶D及亮氨酸氨肽酶)为杂合子的4个公羊随机交配产生的80只后代(2.5岁以上)家系资料为研究对象,其产绒量和体重取决于羊场生产记录,目的是寻找与绒山羊产绒量和体重的数量性状位点(QTL)相连锁的标记基...     

微卫星DNA标记与猪肉质性状的相关分析

测定了长蓝参考家系F2代个体的肉色、大理石纹、pH值和系水力4个肉质性状，同时测定了6号染色体的23个微卫星DNA标记，将不同基因型与4个肉质性状进行方差分析与多重比较．结果表明：肉色与大理石纹、pH值、系水力间的相关系数分别为—0．322、0．419、0．468，pH值和系水力间的相关系数最高，为0．737，差异极显著；MN006座位与影响pH值性状的QTL连锁，加性效应为0．108，MN004座位与影响大理石纹性状的QTL连锁，加性效应为0．125．     

鸡 72 周龄产蛋性状与鸡冠性状典型相关分析

【目的】探究鸡冠性状和 72 周龄产蛋性状间的相关关系。【方法】以东乡绿壳蛋鸡和单冠白莱航 鸡为亲本构建的资源群体 F2 代为素材,测定鸡冠性状和 72 周龄部分产蛋性状。【结果】9 个变量中共有 24 对 相关性达到极显著水平。鸡冠性状中,冠重和冠面积间相关性最大,相关系数达到 0.846（P ＜ 0.01）;72 周龄 产蛋性状中,产蛋数和蛋重相关性最大,相关系数为 0.139（P ＜ 0.01）;两组性状中,冠长和 72 周龄蛋重间 相关性最大,相关系数为 0.118（P ＜ 0.01）。典型相关分析中,鸡冠性状和 72 周龄产蛋性状第一典型相关系 数为 0.203,达到极显著水平。【结论】两组性状间的相关性主要由冠高、冠面积、72 周龄产蛋数、72 周龄蛋 重和 72 周龄蛋壳强度间的显著相关引起。     

白耳黄鸡三叉冠性状分析

【目的】对白耳黄鸡三叉冠性状进行分析,以期寻找与三叉冠性状相关的候选单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms, SNP）位点。【方法】60 只白耳黄鸡用于杂交试验,120 只白耳黄鸡用于受精率试验。对 82 只白耳黄鸡采集血样抽提 DNA,用 Illumina 鸡 60 k 芯片进行基因型分型,利用 PLINK 1.90 对分型结果进行质控后,采用 GEMMA 软件对 SNP 与性状进行全基因组关联分析（Genome-wide Association Analysis, GWAS）,寻找与白耳黄鸡三叉冠性状显著相关的 SNP 位点。【结果】白耳黄鸡三叉冠呈现常染色体遗传,其种蛋受精率与单冠的白耳黄鸡差异不显著。由 82 只白耳黄鸡群体得到 55 023 个有效 SNP,群体内不存在明显的群体分层。与三叉冠相关的 SNP 位点有 10 个,分别位于第 1、2、3、4、5、12、14 号染色体上,邻近或座落于 SPRY2、NDFIP2、ITGA9、EMC2、TMEM17、EHBP1、SCAF8、TIAM2、HTT、STON2、PRKCD、RBBP6、TNRC6A、MAPK8IP3 基因上。【结论】通过 GWAS 分析发现 10 个 SNP 位点可能与白耳黄鸡三叉冠性状相关。研究结果将为白耳黄鸡的育种提供候选分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。     

鲁山牛腿山羊体尺性状与微卫星标记的相关分析

根据比较基因组学和相关文献资料,选择与山羊和牛生长性状相关的6个微卫星基因座(BM6444,MAF70,BM315,BMS1678,BM1818和BMC1206)作为分子标记,研究了牛腿山羊的群体遗传变异,并分析了体尺性状与6个微卫星标记之间的关系.结果表明:6个微卫星标记在牛腿山羊群体中的多态信息含量(PIC)分别为0.887,0.863,0.773,0.840,0.888和0.791,遗传杂合度(He)分别为0.904,0.883,0.808,0.864,0.904和0.824,有效等位基因数(Ne)分别为9.62,8.05,5.02,6.96,9.68和5.46.6个微卫星标记与体尺性状的最小二乘分析结果表明:BM6444基因座165bp和145bp等位基因对体质量、体高、体长、胸围和胸深有正效应,而154bp和137bp等位基因对体高、胸围和胸深性状有负效应;MAF70基因座180bp和159bp等位基因对体质量性状有正效应,159bp和144bp等位基因对体高、胸围和胸深有负效应;BM315基因座140bp等位基因对体高有正效应,而136bp等位基因对胸深有负效应;BM1818基因座298bp和27...     

鸡冠类型对白羽丝毛乌骨鸡体尺性状的影响

对44只55周龄单、复冠白羽丝毛乌骨鸡种公鸡的体尺进行测定,结果表明:单冠乌鸡的体重、体斜长、胸骨长、胫长、胫围、骨盆宽等6个性状间存在显著正相关;复冠乌鸡的体重与胫长、胸宽,胸宽与骨盆宽间存在显著正相关,其余均为不显著正相关,且单冠乌鸡的体尺均大于复冠乌鸡。     

宁都黄鸡 GH 基因 SNP 与鸡冠性状的关联分析

【目的】研究宁都黄鸡 GH 基因（Growth hormone,GH）5''- 侧翼和内含子 1 区域单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）与鸡冠性状的关联性,以期筛选地方鸡种鸡冠性状的早期选育分子标记。【方法】以 499 只宁都黄鸡公鸡为研究对象,测定 7 个不同周龄的冠高、冠长、冠厚、肉垂长、肉垂厚以及冠齿数指标,利用 SAS（Statistical analysis system）分析 GH 基因部分序列 SNP 与鸡冠性状的关联性。【结果】 有 13 个 SNP 与 冠 高 性 状 指 标 显 著 关 联（P < 0.05）, 即 C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中 A1270769G 与 7 个周龄冠高指标均显著关联;G1272611A 与 5 个周龄冠高指标显著关联;有 10 个 SNP 与冠长性状显著关联（P < 0.05）,即 C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中 C1271211T 与 6 个周龄冠长指标显著关联,G1272611A 与 5 个周龄冠长指标显著关联。G1272611A 位点与 5 个连续周龄冠长或冠高性状指标均显著关联,该位点在该群体中对应 GG 和 GA 2 种基因型,GG 基因型个体的 5 个连续周龄冠高或冠长均显著高于 GA 基因型个体。【结论】G1272611A 位点可作为宁都黄鸡冠高和冠长性状选育重要候选分子标记。     

甘肃高山细毛羊优质毛品系微卫星标记与经济性状的相关性分析

利用15个微卫星位点对甘肃高山细毛羊优质毛品系153只母羊的个体基因型进行检测,并用SPSS13.0程序下的GLM对具有多态性的14个微卫星位点与羊毛及体重的关系进行方差分析和多重比较。结果发现7个微卫星位点与甘肃高山细毛羊优质毛品系羊毛及体重存在显著或极显著相关,同时在这些位点上找到了对经济性状有利的基因型,为集成甘肃高山细毛羊优质毛品系的早期分子标记辅助选择育种技术提供了依据。     

洪山鸡提纯选育效果的微卫星分子标记分析

利用8个微卫星座位对洪山鸡的提纯选育效果进行分析,分别计算了群体有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量、遗传相似系数和近交系数等相关参数.结果表明:在零世代基础群和五世代洪山鸡群体中共检测到129个等位基因,片段长度在120～300 bp之间;2个世代的遗传多样性指标大多表现为高度多态,零世代基础群和五世代平均多态信息含量分别为0.861 4和0.649 9,平均观察杂合度分别为0.490 0和0.343 8,平均期望杂合度分别为0.8662和0.826 5;五世代的群体平均遗传相似系数为0.775 9,较零世代基础群体有显著提高(0.673 0);2个世代间的近交系数均值为0.047 7.     

木薯群体重要农艺性状遗传连锁图谱和QTL分析

木薯是全球三大块根类作物之一,近年来被认为是热带地区重要的生物能源候选作物。木薯块根淀粉含量在28％～35％。生产上木薯大多数种植于瘠薄的土地上,缺乏管理,产量潜力不能够充分发挥,通过分子育种等手段提高品种淀粉生产能力和抗逆性,改良品质,提高木薯的综合利用价值,是木薯产业发展的挑战性课题。