山东省牡丹核心种质的构建策略研究

牡丹是我国十大传统名花之一,栽培品种丰富.以山东省菏泽市332个牡丹品种为材料,通过对其22个数量及质量性状的调查研究,采用按花型分组的方案,选取5个总体取样比例及4个组内取样策略,共组成20种不同的取样策略进行比较,以获得最佳核心种质.研究表明:当总体取样比例由15%增至25%时,表型保留比例上升不明显,因此选择15%作为总体取样比例.组内最佳取样策略为S策略.在332个牡丹品种中选出50个,再加入10个优良性状突出品种和珍稀品种,最终构建的山东省牡丹核心种质的品种为60个.     

基于果实相关性状的桃品种初级核心种质取样策略研究

以国家种质资源圃(北京)编目的558份桃品种的18个形态学和农艺学性状为基本数据,研究了桃品种初级核心种质构建的取样策略,包括总体取样比例的确定及取样方案的选择,以获得最佳的初级核心种质。本试验共设10%～90%9个总体取样比例;取样方案研究包括分组原则和组内取样比例的确定。结果表明,桃初级核心种质的适宜总体取样比例为10%;按品种类群分组结合多样性比例取样为构建桃初级核心种质的最佳取样方案;利用此取样策略从558份桃品种中提取56份作为核心样本,对其代表性进行检测表明所构建的初级核心种质能够很好地代表桃原始种质的遗传多样性。     

利用表型性状构建新疆野杏种质资源核心种质

【目的】以135份新疆野杏株系为试材,根据叶片、果实、果核和果仁等器官35个表型性状的遗传多样性,研究新疆野杏核心种质构建的方法。【方法】采用逐步聚类法,以25%的取样比例为例,通过3种取样策略、2种遗传距离和4种系统聚类方法相互组合构建了24个核心种质。并以筛选出的最佳构建策略进一步比较8种不同取样比例(15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%和50%)对构建核心种质的影响,以此来选择最适取样比例。通过对原种质、保留种质和核心种质的表型遗传多样性和变异程度,及各种质不同数量性状间的t检验来评价核心种质的代表性;并用主成分分析法对核心种质进行确认。【结果】构建新疆野杏核心种质时,2种遗传距离中欧氏距离优于马氏距离,4种聚类方法中离差平方和法优于另外3种,3种取样策略中优先取样策略较适宜新疆野杏核心种质的构建,而偏离度取样策略和随机取样策略则不适宜;25%是最适宜的取样比例;对核心种质的评价和确认表明,所构建的33份野杏核心种质资源可以很好地代表原种质,较好的保留了原种质的遗传多样性和变异。【结论】取样比例为25%时,采用优先取样策略,根据欧氏距离和离差平方和法进行逐步聚类构建的核心种质最有代表性,是构建新疆野杏核心种质的较好方法,并得到了33份代表种质,为野杏资源的有效保存奠定了基础。     

基于表型性状的甜瓜核心种质构建

【目的】以国家西瓜甜瓜种质资源中期库中的1 200份甜瓜种质为材料,根据19个表型性状的遗传变异,构建甜瓜核心种质。【方法】原始种质按照地理来源分为22组,各组种质根据表型数据分别进行聚类,按照不同比例(10%、15%、20%、25%和30%)取样,构建候选核心种质。通过比较候选样本的遗传多样性指数、表型保留比例、表型频率方差、变异系数等4个检验指标,最终确定甜瓜核心种质,并对其代表性进行评价。【结果】通过比较不同的取样比例,初步获得5个候选样本,其中采用15%的取样比例构建的核心种质包含189份甜瓜种质,其4个检验指标均达到最佳水平,确定为最终的核心种质。此核心种质各性状的特征值和表型频率分布与原始种质基本一致。【结论】研究所构建的甜瓜核心种质具有较好的代表性和遗传多样性,可作为原始种质代表性样本。     

基于EST-SSR标记与果实品质性状的贵州野生刺梨核心种质构建

采用10对EST-SSR引物和9个果实品质性状指标对收集的220份野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt)资源的遗传多样性进行分析,结果表明:10对EST-SSR引物共扩增出多态性条带27条,多态百分率为76.67%;9个品质性状中平均单果质量、可滴定酸、固酸比、维生素C和类黄酮含量的变异系数达到20%以上;说明该220份贵州野生刺梨种质资源遗传变异丰富,遗传多样性分布范围较广,适于进行核心种质的构建研究。进一步将9个品质性状指标进行6级分类,并处理为9个品质标记共产生54条多态带,与EST-SSR标记一起,采用Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,同时采用位点优先取样策略进行核心种质构建,以表型保留比例、均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率、变异系数变化率、多态性位点百分率、Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数等对核心种质进行评价,并利用主坐标分析法对核心种质进行确认。结果表明:构建的32份核心种质在分子水平,表型水平及地区分布上都能够代表原种质的遗传多样性。     

基于形态数据的大白菜核心种质构建方法的研究

 以国家蔬菜种质资源中期库收集保存的1 651份大白菜种质为试材,按照大白菜分类系统和生态型,采用分层分组法,将所有种质分为6组。基于43个形态性状的数据,比较了4种组内取样比例法、6种总体取样规模和2种取样方法在构建大白菜核心种质中的作用和效果。结果表明：组内以多样性比例法更能使各组的取样份数或比例趋于平衡,并较好地保持原始收集品的变异度。当总体取样规模为15%时,多样性比例法所构建的核心种质的遗传多样性指数达到最大,表型保留比例亦能达到98％左右;而当总体取样规模增加到20%以上时,虽然表型保留比例接近100％,但核心种质遗传多样性指数迅速降低。因此,认为15%总体取样规模较为合适。在一定的组内取样比例法和总体取样规模下,聚类取样构建的核心种质的遗传多样性指数（I）、表型保留比例（RPR）和变异系数（CV）均比随机取样的高。根据获得的优化方案最终在表型水平建立了包含248份种质的中国大白菜核心种质。     

国家果树种质南京桃资源圃初级核心种质构建

 利用国家果树种质南京桃资源圃中保存的630份资源的60个描述项信息,通过比较分组、逐步聚类和随机3类取样方法,以及取样比例的筛选,进行了初级核心种质构建研究。结果显示：逐步聚类取样方法优于分组取样和完全随机取样方法;逐步聚类取样方法的最适取样比例为15%;不同聚类模型间存在差异,聚类后的取样方法间也存在差异;欧式距离和内平方距离法逐步聚类后优先选取高均偏种质的方法更适宜桃初级核心种质的构建。通过缺失表型添加,构建的初级核心种质包括99份资源,占原始库的15.7%,具100%表型保留比例。经多样性指数、表型方差、变异系数检验,以及数量性状的均值和极差符合率检验,初级核心种质具有良好的代表性。     

猕猴桃种质资源表型性状遗传多样性分析

以66份猕猴桃种质资源为材料，对其枝条、叶片和果实的19项表型性状进行观测和描述，采用因子分析和聚类分析对表型性状分布频率、变异系数等进行研究。结果表明：10个描述型性状平均变异类型为4.9个，最丰富为果形（9个）；9个数量性状中果柄长度的变异系数最大，为41.04%，果实纵径的变异系数最小，为12.14%。Q型聚类分析将66份猕猴桃资源分成4个组群，组群内的种质资源以1年生枝颜色、单果质量和果形指数等聚类。     

小白菜种质资源苗期表型性状的多样性分析

以50份小白菜种质为研究对象,利用12个数量性状和8个质量性状分析资源遗传多样性。结果表明:苗期12个数量性状的变异系数为20.69%~71.68%,平均值为34.30%,其中单株重的变异系数最大,叶宽的变异系数最小。经主成分分析,将20个性状综合为4个主要成分,其累计贡献率达80.092%,以植株大小和产量相关的性状贡献率最高,达到57.257%。聚类分析将50份材料划分为3个类群。     

195份大蒜种质资源在南方地区的农艺性状综合评价

为筛选出适宜南方地区生长种植、外观优良且高产的大蒜资源,本试验以195份国内外大蒜种质资源为材料,系统调查了大蒜11个农艺数量性状在湖南长沙的表型,并进行了遗传多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析综合评价。结果表明：195份大蒜种质资源在南方地区表现出丰富的遗传多样性,变异系数分布范围为15.94%～45.87%,其中单头鳞茎质量在大蒜资源中变异程度最大。相关性分析结果表明：11个数量性状之间几乎都存在极显著或显著相关关系,其中与鳞茎性状具有相关性的植株农艺性状为株高、叶长、单株叶片数、地上假茎高和地上假茎粗,且都呈极显著正相关;主成分分析中前2个主成分的累计贡献率达到65.96%,包含的要素信息量可以基本反映11个数量性状的主要信息;通过聚类分析,195份国内外大蒜种质资源可分为4个类群,第Ⅰ类群和第Ⅳ类群的性状指标均较为优异,初步筛选出适宜南方地区生长的优质资源13份,为南方地区大蒜种质资源鉴定评价和优质新品种选育提供了参考。     

Construction and evaluation of a primary core collection of apricot germplasm in China

As the origin center of apricots, China has the richest apricot germplasm resources. The establishment of core collections is very important for a better evaluation and utilization of apricot germplasm. In this study, 1501 apricot accessions from the initial collections in China were used to sample and establish a primary core collection. Data of 18 traits including both quantitative and qualitative were collected and used to design sampling strategy. The overall sampling strategy includes principles for grouping, sampling proportion within group and sampling method from each group. Three sampling proportions 5%, 10% and 15% were used in the study. Our results suggest that 10% was the best entire sampling ratio for primary core collection of apricots. With 10% entire sampling ratio, the optimal sampling strategy was to group samples based on their growing regions, in combination with logarithmic sampling proportion within each group. Using this sampling strategy, we have established a primary core collection with 150 accessions, and the primary core collection can well represent the genetic diversities of the entire collection. The genetic diversity of the apricot primary core collection was further analyzed using Simple Sequence Repeats (SSRs) molecular marker technique. A total of 22 polymorphic specific primers were developed and 196 alleles were detected. The average number of alleles in each locus was 8.9, suggesting that there were very rich genetic variances among the prime core collection. This also confirms that our primary core collection is a good representation of the genetic diversities of the whole collections at DNA level.     

基于SSR标记和表型性状构建苦瓜核心种质的研究

利用苦瓜21个SSR标记和9个表型性状数据,对地理来源多样的184份苦瓜种质资源进行核心种质构建.结合基因型数据的M策略抽样法和表型数据的随机抽样法,共抽取出34份苦瓜种质资源作为核心种质.34份苦瓜核心种质保留了原始种质93.46％的等位基因和大部分地理来源.对核心种质的SSR基因型代表性进行评价,核心种质和原始种质...     

整合农艺性状和分子标记数据构建新疆野苹果核心种质

AIM: To explore the effect of traditional Chinese medicine Qiliqiangxin on cardiomyocyte apoptosis after myocardial infarction (MI) in a rat model. METHODS: MI was induced in rats by ligation of the anterior descending coronary artery. The survivors were randomly divided into 3 groups: sham operation group, MI group and Qiliqiangxin treatment group (4 g穔g^-1穌^-1). After 28 days, the infarction size was measured. Apoptotic index (AI) was determined by TUNEL. The expression of Fas was detected by the method of immunohistochemistry in non-infarcted zones (NIZ), and the expression of xanthine oxidase (XO) and caspase-3 in myocardial tissue from NIZ was detected by Western blotting. In addition, XO activity, and O₂ ^-? and OH? scavenging activity of myocardial tissues in the NIZ were measured by colorimetry. RESULTS: Compared with MI group, AI and the expression of Fas and caspase-3 in the NIZ were significantly depressed in Qiliqiangxin treatment group. Moreover, the activity of XO was significantly decreased while O₂ ^-? and OH穝cavenging activity was significantly increased in Qiliqiangxin treatment group. Ventricular remodeling was attenuated. No significant difference in infarct size and XO expression level between Qiliqiangxin treatment group and MI group was observed. CONCLUSION: Qiliqiangxin may inhibit apoptosis of cardiomyocytes in the NIZ of rats by reducing reactive oxygen species and depressing the expression of Fas and caspase-3.     

建兰种质资源遗传多样性分析及核心种质构建

研究记录了311份建兰(Cymbidium ensifolium)种质资源的萼片、花瓣、唇瓣颜色以及叶艺、瓣型和唇瓣斑点等质量性状的表型特征,并对其进行赋值和统计分析;利用22对SSR荧光引物对311份建兰种质资源进行PCR扩增,分析其遗传多样性;利用Structure软件分析建兰种质资源的群体结构,采用主成分分析和聚...     

基于SSR 标记构建平菇栽培品种核心样本方法的探讨

 为了探讨基于DNA分子标记构建平菇栽培品种核心样本的方法,基于48个平菇栽培菌株的11个SSR位点,根据遗传距离进行UPGMA聚类,采用位点优先取样策略,结合表型性状,在不同SSR等位基因保留比例（100%、95%、90%、85%、80%）水平上构建核心样本,进而确定取样量。采用稀有等位基因保留比例以及对Nei’s基因多样度和Shannon’s信息指数进行t检验,评价核心样本的代表性,并且根据表型保留比例以及极差、均值和标准差的符合率对核心样本的代表性作进一步确认。结果表明：采用位点优先取样策略,在等位基因保留比例为95%的水平上构建的核心样本能够以最小的样本量最大限度地代表原种质的遗传多样性。