基于主成分分析的河南省不同地方品种猪肉品质分析

本文研究了河南省不同地方品种猪肉品质,并通过主成分分析建立地方猪肉品质评价模型,为地方猪肉品质评价提供借鉴。试验选择1个三元杂交品种(对照)、2个地方培育品种和3个河南省地方品种共计66头进行屠宰,测定11项肉质指标,采用相关性分析和主成分分析法进行综合评价。结果表明：地方品种猪肉具有肌内脂肪含量高、粗蛋白质含量高、感官品质好的特性,与三元白猪对比,其粗蛋白质含量、L值、肉色评分等肉质指标差异显著,且不同地方品种肉质存在一定差异。通过主成分分析法从11个指标中提取了5个主成分,主成分的累计贡献率达到74.88%,概括为营养因子、感官因子和保水性因子;其中肌内脂肪、24 h大理石纹评分、L_{24 h}值、L_{45 min}值、滴水损失等5个指标为评价猪肉品质的关键指标;根据因子得分和权重构建河南省地方猪肉品质指标评价模型：Y=0.241Y1+0.193Y2+0.129Y3+0.105Y4+0.079Y5,综合评价地方猪F品种(项城猪)得分最高,肉质最好。     

雷州黑羽鸭外貌特征及体型性状的主成分分析

本研究通过对60只雷州黑羽鸭进行外貌特征观察及体尺测量,并应用主成分分析法对其9个主成分进行统计分析,旨在评估雷州黑羽鸭的种质资源并为其选育提供参考.研究表明:雷州黑羽鸭是通体以黑色为基色,结构匀称,体躯狭长、紧凑结实,喙长颈细的小型鸭.其公母鸭在体型上存在较大的差异,且不同体型性状之间呈现不同程度的相关,公鸭以体重与体斜长的相关性最高,母鸭则以胫长与半潜水长的相关性最高.公母鸭的9个体型性状均可简化为4个主成分(累计贡献率分别达80.722％和83.603％).     

11个鸡品种产蛋性能与产区生态的聚类分析

 利用主成分分析和聚类分析对我国11个地方鸡品种的产蛋性能和生态特征的资料进行了多元统计分析。单独对4项产蛋性能指标进行聚类分析表明,我国11个地方鸡种大致可以分为大型鸡和小型鸡两类;多元统计分析10项指标的结果表明,主成分分析选取前3个特征值作为3个主成分（占总信息量的94.99%）。根据各品种的前3个主成分值计算相似系数,并用最短距离法进行聚类分析,表明11个地方鸡品种可划分为高海拔型和低海拔型两类,这说明了生态因子亦是品种分类中的一个重要依据。     

山东省地方品种羊先天性免疫指标主成分聚类分析及与抗病力的相关性

运用化学计量学方法,结合SPSS统计软件对山东省6个地方山羊品种和5个地方绵羊品种的7项先天性免疫指标进行定量定性综合评定,检测指标包括血清IL-1、IL-2、IL-6、IL-18、IFN-γ、NK细胞和血清溶菌酶(LYS)含量。通过对地方山羊和绵羊品种的先天性免疫指标进行主成分分析和聚类分析研究,分析不同地方山羊和绵羊品种非特异性抗病力的差异。主成分分析结果表明,莱芜黑山羊、沂蒙黑山羊、崂山奶山羊以及小尾寒羊、鲁中山地绵羊的7项主要先天性免疫指标水平突出。聚类分析结果表明,地方山羊品种先天免疫水平可划分为3类,莱芜黑山羊和鲁北白山羊为一类,济宁青山羊和沂蒙黑山羊为一类,文登奶山羊和崂山奶山羊为一类;地方绵羊品种也可划分成三类,小尾寒羊为一类,鲁中山地绵羊和洼地绵羊为一类,大尾寒羊和泗水裘皮羊为一类。综合分析表明,山东地区不同地方山羊和绵羊品种间的非特异性抗病力存在差异,其中莱芜黑山羊、沂蒙黑山羊、崂山奶山羊以及小尾寒羊、鲁中山地绵羊非特异性抗病力较强,且部分品种之间先天性免疫指标具有相似性,这可能与山东地区地方山羊和绵羊的育种历程有关。本研究为山东地方山羊和绵羊品种非特异性抗病力评估体系的建立提供了理论依据。     

绍兴鸭体重与体尺性状指标的主成分分析

选取1 260只12周龄绍兴鸭,采用主成分分析法对绍兴鸭体重和体尺性状进行遗传差异的定量分析,探讨体重与体尺性状之间存在的关联性。结果显示:公鸭的体重、体斜长、龙骨长、半潜水长、胸深、骨盆宽、胫长、胫围均显著高于母鸭(P0.05);相关性分析表明,绍兴鸭体重与龙骨长、半潜水长极显著相关(P0.01),且公鸭体重还与体斜长、骨盆宽显著相关(P0.05),与胸宽和胸深极显著相关(P0.01)。从主要成分的特征根和贡献率来看,体重、体斜长、龙骨长、半潜水长和胫长对主成分的贡献率最大,建议今后对绍兴鸭的体型性状进行选育时至少应包括以上5个指标。研究结果为绍兴鸭选育和生产提供了一定的参考。     

我国3个地方品种鸭线粒体DNACOI基因的DNA条形码初步分析

以我国3个地方品种鸭为研究对象,测定线粒体细胞色素氧化酶亚基I（COI）基因部分序列,序列用Clustal X软件对准,用DNAsp软件分析SNP位点。结果表明：3个地方品种鸭线粒体COI基因序列共发现12个突变位点,产生13种单倍型,其中9种单倍型为3个鸭品种所特有;品种平均多态性与核苷酸多态分别为0．68％和2．15％,3个鸭品种均有其特异位点。     

基于主成分分析法建立鸭一般抗病力的评估模型

研究对家鸭(金定鸭、樱桃谷鸭、苏牧麻鸭)、番鸭、半番鸭的白蛋白(X1)、球蛋白(X2)、总蛋白(X3)、IgA(X4)、IgM(X5)、IgG(X6)和AI抗体HI效价(X7)等7个免疫指标进行测定,并对这7个免疫指标进行主成分分析。结果表明:选取前2个特征值作为2个主成分(累计贡献率达到90.70%),基本上反映了原所有免疫指标包含的全部信息;通过建立主成分综合评价模型,比较5个群体主成分综合得分,金定鸭得分最高,其次分别为樱桃谷鸭、番鸭,苏牧麻鸭、半番鸭表现较低。     

中国6个地方鸭品种蛋品质比较

本研究测定了处于产蛋高峰6个地方鸭品种同一天各30枚种蛋的蛋重、壳重、蛋黄重、蛋白重、膜重、蛋黄蛋白比、哈氏单位、蛋壳厚度、蛋黄色泽、蛋形指数、蛋壳强度等11项蛋品质的指标。结果表明：高邮鸭除哈氏单位稍低外，其他10项指标均比其他5个鸭品种高；11项指标主成分分析说明了蛋重是蛋品质的一个重要指标，6个鸭品种分别依特征值排序的结果中，由前到后顺序为：高邮鸭、金定鸭、莆田黑鸭、山麻鸭、攸县麻鸭、连城白鸭。研究结果为进一步开发利用品种资源提供了参考依据。     

我国3个地方品种鸭线粒体DNA COⅠ基因的DNA条形码初步分析

以我国3个地方品种鸭为研究对象,测定线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因部分序列,序列用Clustal X软件对准,用DNAsp软件分析SNP位点。结果表明:3个地方品种鸭线粒体COⅠ基因序列共发现12个突变位点,产生13种单倍型,其中9种单倍型为3个鸭品种所特有;品种平均多态性与核苷酸多态分别为0.68%和2.15%,3个鸭品种均有其特异位点。     

家蚕品种若干性状的主成分分析

本试验对家蚕47个品种的10项数量性状进行了主成分分析,结果表明:选取前 3个特征根所确定的综合指标作为主成分是适宜的,每一主成分具有一定的家蚕生物学意义。通过主成分值的计算,选出了数个经济性状优良的品种。把主成分分析运用于评价亲本育种价值方面,为合理选择杂交亲本提供参考。     

秦川牛主要体尺、体重与剩余采食量主成分分析

为揭示秦川牛的生长发育规律,选择30头成年秦川牛进行主要体尺、体重和剩余采食量统计分析,选择累计贡献率达81.06%的5个主成分进行分析。结果显示:秦川牛之间采食量差异不显著(P0.05),其中剩余采食量、胸深和胸围变异幅度较大,选育潜力大;体重与体高、平均日增重呈极显著正相关(P0.01),体高、腹围与平均日增重呈极显著正相关(P0.01),剩余采食量与采食量呈极显著正相关(P0.01);从主成分的特征值与累计贡献率来看,第1主成分反映体型外貌特征,第2主成分主要反映后驱特征,第3主成分主要反映采食特征。本研究为阐明秦川牛体尺体重和剩余采食量之间的关系,为秦川牛的选种选育提供参考依据。     

黄牛体尺的聚类与主成分分析

本研究选取５６头蒙古牛，测定了体高、体斜长、胸围、管围、十字部高、头长、头宽、尻宽和体重等９个体量地各性状间的关系进行了聚类及主成分分析。结果表明，蒙古牛的体量指标可分为高（长）度类、围度类和特征类三大类，体高和管围间有显著相关关系，这些结果对蒙古牛选种具有重要参考价值。     

德南牛体尺体重相关性及主成分分析

[目的]为了研究德南牛生长发育状况。[方法]采用SPSS23.0软件对对河南省南阳市某德南牛某养殖场中的321头德南牛成年母牛,体尺指标进行相关性分析,选择5个生长性状进行相关性和主成分分析。[结果] 德南牛体高、体斜长、胸围、管围、十字部高、具有极显著相关（P＜0.01）;从主成分的特征向量和贡献率来看,主成分1反映了德南牛的整体外貌结构信息,第2主成分反映了尻部特征。本研究为阐明德南牛的体型外貌特征和选育思路提供了依据。     

凉山猪体尺与活体重间的线性回归分析

为了给凉山猪保种及开发利用提供一些基础数据,本试验选取乐山市马边县民主乡的68头凉山猪作为代表,进行了凉山猪体尺与活体重间的线性回归分析.结果表明:凉山黑猪的体型较小,平均体重为86.5 kg;在凉山猪处于放牧饲养状态时,可采用测量凉山猪胸围的方式估计其体重,通过公式估测的体重拟合值精度较高.     

荷斯坦奶牛外貌性状的主成分分析

随机选取荷斯坦奶牛180头,其中1-3胎各60头,进行奶牛外貌性状体高(x1)、胸宽(x2)、体深(x3)、尻角度(x4)、尻宽(x5)、后肢侧视(x6)、蹄角度(x7)的主成分分析。结果显示,主成分F1~F6的贡献率分别为30.68%、15.67%、14.24%、12.11%、11.18%和9.50%,累计贡献率达93.46%;F1的信息量表达式为F1=0.510 9x1+0.294 6x2+0.448 8x3-0.195 4x4+0.524 3x5-0.012 5x6+0.370 9x7,余类推;F1可视为体躯容积因子,F3、F4可视为耐用因子。主成分(外貌性状的线性组合)可在尽量保持遗传信息的基础上简化复杂的外貌性状间的相关关系。     

基于主成分分析法建立鸭肉质的评估模型

对金定鸭、樱桃谷鸭、苏牧麻鸭和番鸭的失水率(X1)、剪切力(X2)、pH值(X3)、肉色(X4)、粗脂肪((X5)、多不饱和脂肪酸(PUFA,X6)、必需脂肪酸/(EFA,X7)、肌原纤维直径(X8)等8个肉质指标进行了测定,运用主成分分析对肉品质指标进行分析,并建立了主成分综合评价模型(y=-0.301zx1+0.367zx2-0.033zx3-0.223zx4-0.342zx5+0.250zx6+0.249zx7+0.267zx8).结果表明,选取前2个特征值作为2个主成分(累计贡献率达到85.15％),基本上反映了原所有肉质指标包含的全部信息;番鸭主成分综合得分最高,其次分别为金定鸭、苏牧麻鸭,樱桃谷鸭表现较低,结果与预期完全吻合.     

Composition of the whole body and component fractions in mature ewes from seven breeds

In a sheep production system, effects of body composition on nutrient requirements for maintenance, tissue deposition and lean meat production may be important. Composition of body fractions differing in expected metabolic activity was measured for 12 nonpregnant, nonlactating, 3- to 4-yr-old ewes from each of seven breeds representing diverse body size and performance characteristics. Half the ewes in each breed had ad libitum access to feed and half were fed at maintenance levels for an average of 41 d. Ewes were slaughtered after a 72-h fast. Empty bodies were divided into visceral organs and blood (ORB); gastrointestinal tract and internal fat (GIF); head, hooves and pelt (HHP); and carcass (CAR). Water, fat, ash and the remaining fat-free dry organic matter (FFDOM) contents were determined for each fraction. Mean empty body weight (EBW) was 60.8 kg and mean composition was 47.6% water, 34.1% fat, 14.8% FFDOM and 3.5% ash. Among breeds, larger mature size generally was associated with a higher percentage of fat and a lower percentage of water (P less than .01), in agreement with carcass composition. Ewes with ad libitum access to feed had more fat and less water in their EBW than did those fed at maintenance levels, especially in the GIF fraction. Distribution of EBW averaged 58.1%, CAR, 19.0%, GIF, 15.4% HHP and 7.5% ORB. The larger, faster growing breeds had the highest proportion of the EBW and of each chemical component located in the carcass. The smaller, more prolific breeds had the highest percentages of EBW in the ORB and GIF fractions. Effects of these large genetic differences in body composition and tissue distribution on production efficiency need to be evaluated.     

Genetic diversity of mtDNA D-loop sequences in four native Chinese chicken breeds

1. To explore the genetic diversity of Chinese indigenous chicken breeds, a 585 bp fragment of the mitochondrial DNA (mtDNA) region was sequenced in 102 birds from the Xichuan black-bone chicken, Yunyang black-bone chicken and Lushi chicken. In addition, 30 mtDNA D-loop sequences of Silkie fowls were downloaded from NCBI. The mtDNA D-loop sequence polymorphism and maternal origin of 4 chicken breeds were analysed in this study.

2. The results showed that a total of 33 mutation sites and 28 haplotypes were detected in the 4 chicken breeds. The haplotype diversity and nucleotide diversity of these 4 native breeds were 0.916 ± 0.014 and 0.012 ± 0.002, respectively. Three clusters were formed in 4 Chinese native chickens and 12 reference breeds. Both the Xichuan black-bone chicken and Yunyang black-bone chicken were grouped into one cluster. Four haplogroups (A, B, C and E) emerged in the median-joining network in these breeds.

3. It was concluded that these 4 Chinese chicken breeds had high genetic diversity. The phylogenetic tree and median network profiles showed that Chinese native chickens and its neighbouring countries had at least two maternal origins, one from Yunnan, China and another from Southeast Asia or its surrounding area.     

大理剑川县青花鸡养殖状况调查及体尺性状分析

为了加速青花鸡这一地方品种的遗传育种进程,并为申报该品种进入畜禽资源库提供一定理论依据,随机选取剑川县300日龄健康青花鸡120只,公母各半,对其体重、体尺进行测量分析。结果表明:公、母鸡体尺之间相关性存在差异。母鸡体斜长、髋骨宽存在极显著相关(P0.01),胸深和胫长、胸角与髋骨宽相关性显著(P0.05)。而公鸡仅有胫长和体斜长相关性显著(P0.05),其他体尺指标相关性较小。青花鸡的体重、体尺作为表型性状较一些鸡品种有一定的优势,为入选畜禽资源库提供了良好的基础数据。