基于NC-SVM的酵母蛋白功能预测研究

蛋白质功能的预测是当前生物信息技术的一个重要研究方向,它广泛应用于分析新发现蛋白质的功能及人工合成的蛋白质功能。利用酵母蛋白相互作用数据,首先针对传统的基于支持向量机和基于邻近投票法的功能预测法分析了它们各自的优劣性,然后研究出结合2种预测方法的优势的NC-SVM法对酵母蛋白的功能进行预测,采用科学的评价方法,通过反复试验并对结果进行分析,发现这种新方法的预测结果优于单独使用前2种,而且具有一定的稳定性。     

差异蛋白质组学在植物研究中的应用

差异蛋白质组学是蛋白质组学的研究策略之一,主要目标是研究有意义的因素引起的蛋白质组成的变化以发现有差异的蛋白质。介绍了差异蛋白质组学应用于植物研究中的基本方法和新兴技术。植物样品制备方法主要为TCA/丙酮法和植物组织分级提取法。2-DE仍是目前主要的分离方法,多维液相色谱等新型分离模式可以弥补2-DE的不足,新型质谱和蛋白质芯片技术的应用可大大提高差异蛋白质的鉴定速度。差异蛋白质组学目前在植物生理、植物组织器官和亚细胞、植物突变体、植物遗传多样性等多方面研究中都有应用。     

小麦淀粉、蛋白质特性与面条品质关系的研究进展

面条是我国主要的面制品之一,了解小麦籽粒淀粉、蛋白质特性与面条品质关系,以期对面条小麦品质的研究及新品种的选育提供科学的参考.综述了小麦籽粒淀粉、蛋白质特性对面条品质的影响及国内外研究现状,主要包括以下几个方面:面条种类、小麦淀粉、α-淀粉酶、小麦籽粒蛋白质和小麦籽粒硬度对面条品质的影响以及生物技术在面条品质改良中的应用.     

农作物抗虫蛋白质工程及其应用

综述了杀虫晶体蛋白、蛋白酶抑制剂和植物凝集素在农作物抗虫上的研究与应用进展。     

花生种子人工老化过程中发芽率和蛋白质的变化

利用双向ＳＤＳ－ＰＡＧＥ分析了粤油７９和油７３花生种子人工老化过程中发芽率和蛋白质的变化，结果表明，种子老化８ｄ后，种胚内出现了一种蛋白质或多肽（ｐ１６．２，ＭＷ１０ＫＤ），并且该蛋白质或多肽随种子老化程度的加深其含量逐渐增加，而对照不存在这种物质，表明随着种子活力的丧失，蛋白质的含量增加。     

植物生长调节剂对水稻氮素累积和转运及籽粒蛋白质含量的影响

采用盆栽试验探讨了新型植物生长调节剂不同配方对水稻氮代谢、籽粒和糙米蛋白氮含量、籽粒蛋白质产量的影响，并筛选出效果显著的一种新型植物生长调节剂配方。结果表明，水稻籽粒灌浆期间功能叶、茎鞘的全氮、蛋白氮含量随着生育期的延长呈减少趋势，其减少量以喷施植物生长调节剂不同配方处理高于对照，水稻糙米的全氮、蛋白氮含量以喷施植物生长调节剂不同配方处理高于对照，其中PGRF4处理最高，PGRF2处理次之，籽粒蛋白质产量以PGRF3处理为最高，比对照增产17．90％，其次为PGRF2处理，比对照增产15．93％。     

适于分析小麦高分子量麦谷蛋白亚基的SDS─PAGE方法

参照Ｂ．Ｊ．Ｓｍｉｒｂ（１９８４）介绍的蛋白质ＳＤＳ—ＰＡＧＥ方法，调整了凝胶浓度、交联度及催化剂用量，提出了完善的样品制备程序，并研究了温度对凝胶配比及电泳时间的影响。在大量小麦整粒ＳＤＳ—ＰＡＧＥ实验的基础上，又对半粒无胚籽粒电泳进行了细致的研究，摸荣出了一套适合于小麦整粒与半粒的高分子量（ＨＭＷ）麦谷蛋白亚基ＳＤＳ—ＰＡＧＥ方法。通过对５０７１份整粒种质资源和１６００余份半粒杂交后代的分析，结果表明，该法成功率高，结果准确，具有操作简便、快速、分辨率好，制成干板不扩散易保存等优点。认为是一套适合我国仪器设备和药剂等实验条件的ＨＭＷ谷蛋白电泳方法。是品质鉴定和后代品质筛选的可靠手段。     

适于分析小麦高分子量麦谷蛋白亚基的SDS─PAGE方法

参照Ｂ．Ｊ．Ｓｍｉｒｂ（１９８４）介绍的蛋白质ＳＤＳ—ＰＡＧＥ方法，调整了凝胶浓度、交联度及催化剂用量，提出了完善的样品制备程序，并研究了温度对凝胶配比及电泳时间的影响。在大量小麦整粒ＳＤＳ—ＰＡＧＥ实验的基础上，又对半粒无胚籽粒电泳进行了细致的研究，摸荣出了一套适合于小麦整粒与半粒的高分子量（ＨＭＷ）麦谷蛋白亚基ＳＤＳ—ＰＡＧＥ方法。通过对５０７１份整粒种质资源和１６００余份半粒杂交后代的分析，结果表明，该法成功率高，结果准确，具有操作简便、快速、分辨率好，制成干板不扩散易保存等优点。认为是一套适合我国仪器设备和药剂等实验条件的ＨＭＷ谷蛋白电泳方法。是品质鉴定和后代品质筛选的可靠手段。     

春小麦麦谷蛋白优质亚基的引进与应用研究

利用矮败小麦和八倍体小偃麦亚远缘杂交。进行了异源种质资源整合,从而丰富春小麦遗传基因多样性,平衡蛋白质氨基酸组成。改善春小麦加工品质,培育优质专用型春小麦新品种。筛选出含1Axl、1Bx7＋lBy8、1DxS＋lDyl0集于一体的材料3份;含IAxl、1Bxl7＋lByl8、IDx5＋lDyl0集于一体的材料4份。2009年审定了两个含优质亚基的春小麦新品种晋眷15号和晋春16号。     

青杨双向电泳实验体系的建立

用改良丙酮沉淀法、三氯乙酸（TCA）-丙酮沉淀法和酚抽法抽提青杨Populuscathayana的蛋白质,分别获得了437,603和721个蛋白斑点,以酚抽法提取的分离纯化方法效果最佳,不仅能很好地提取蛋白,而且能有效去除样品中的盐分。通过比较,分析了双向电泳不同条件对电泳结果的影响,确立了300μg·IPG胶条^-1的最佳上样量、90000V·h的聚焦时间以及20min平衡时间的双向电泳条件。研究还比较了氯化钠胁迫前后双向电泳图谱差异,发现有46个蛋白点存在差异,其中10个下调,36个上调（4个新诱导表达）。     

农杆菌介导的外源基因在本氏烟中瞬时表达体系优化研究

为提高外源蛋白的表达量及稳定性,期望通过RNA、蛋白水平的研究,制定一套高效的外源蛋白表达体系。通过共表达沉默抑制子、添加定位信号、沉默自噬关键基因atg5,分析各处理对植物外源蛋白表达的影响。结果表明：共表达植物病毒沉默抑制子p25或HC-Pro抑制mRNA降解速率,提高外源蛋白表达水平;外源蛋白增加内质网定位信号,可提高蛋白的持续表达能力;瞬时沉默自噬途径关键基因atg5,有利于外源蛋白的积累。外源蛋白表达过程中对易降解的外源蛋白,通过添加定位信号并结合使用沉默抑制子、自噬途径缺陷植株,可作为提高外源蛋白表达量及稳定性的新策略。     

Advances on Plant Pathogenic Mycotoxin Binding Proteins

Toxin-binding protein is one of the key subjects in plant pathogenic mycotoxin research. In this paper, new advances in toxin-binding proteins of 10 kinds of plant pathogenic mycotoxins belonging to Helminthosporium ,Alternaria ,Fusicoccum ,Verticillium were reviewed, especially the techniques and methods of toxin-binding proteins of HS-toxin, HV-toxin, HMT-toxin, HC-toxin. It was proposed that the isotope-labeling technique and immunological chemistry technique should be combined together in research of toxin-binding protein, which will be significant to study the molecular recognition mechanism between host and pathogenic fungus.     

利用雄性不育系培育玉米新品种

利用雄性不育系培育玉米杂交种可以提高制种质量和节约种子生产成本。苏玉26号和盛玉366是利用雄性不育系培育的玉米新品种,蛋白质含量分别为10.35%,10.25%,赖氨酸含量均为0.27%,抗玉米主要病虫害,2010年分别经江苏省和山西省农作物品种审定委员会审定通过。     

6种模式生物热休克蛋白70家族的进化分析

[目的]研究柄海鞘和其他5个物种的热休克蛋白70家族的系统发育关系。[方法]通过在Ensembl中下载与筛选,获得柄海鞘和其他5种生物的热休克蛋白70家族的氨基酸序列,对其进行系统发育树和基因结构分析,并阐明其系统发育关系。[结果]经过筛选,共获得了来自线虫、果蝇、柄海鞘、斑马鱼、家鸡和人类6种生物的热休克蛋白70家族的33个氨基酸序列,其中25个具有明确的基因结构。系统发育分析表明,系统发育树并未完全按照来源物种聚类;6种生物热休克蛋白70的氨基酸序列相当保守,但其内含子插入位点并不整齐,表明热休克蛋白70家族是一个多基因、多结构的家族。[结论]这6个物种均发生了基因复制事件,新产生的基因仅仅是冗余的存在,还是具有新的功能,仍需作进一步的研究。     

宽体金线蛭抗凝物质的提取与纯化

采用丙酮三氯乙酸法、凝胶过滤层析、阴离子交换层析、Sep-pak C18柱宽体金线蛭中抗凝物质进行分离与纯化,并且进行SDS-PAGE凝胶电泳。结果表明：SDS-PAGE电泳为单一条带,并且提取的物质具有抗凝活性,测序结果表明得到一种新的抗凝物质。     

Avena magna: An Important New Tetraploid Species of Oats

Avena magna is a new tetraploid species morphologically similar to the hexaploid A. sterilis, having a high concentration of protein, large caryopses, and outstanding resistance to crown rust. One genome in A. magna appears homologous to the As genome present in hexaploid, tetraploid, and one group of diploid species. Avena magna is a possible ancestor of cultivated oats.     

高蛋白高产大豆新品种黑农35的选育及大豆矮化育种等问题

1970年利用当地优良推广品种黑农16（获全国科学大会奖）和日本高产高蛋白品种十胜长叶杂交,经多代选育鉴定育成黑农35,1990年经黑龙江省农作物品种审定委员会审定推广。1992年已累计推广近700万亩,并已大量出口。选育高蛋白高产大豆品种,在选择亲本时要选择高产性状突出、综合性状好的亲本,同时亲本之一蛋白质含量应较高,这样易于成功。为了提高大豆产量,必须选育秆强不倒的品种,可利用有限结荚习性品种和无限结荚习性品种杂交;利用有限结荚习性品种之间进行杂交;用钴60等射线处理有限结荚习性的大豆;利用农家品种中的矮秆材料。对大豆后代材料可用不同肥水条件进行鉴定,同时用北育南繁、温室加代等措施来缩短育种年限。在大豆育种中要利用和保存好中间材料。     

淡色库蚊肌动蛋白全长基因的克隆及生物信息学分析

为阐明肌动蛋白抗药性相关机制及研制新型卫生杀虫剂奠定基础,根据库蚊抗性与敏感品系差异表达的EST片段,设计特异扩增引物,运用RACE技术从淡色库蚊抗性品系中扩增出该抗性相关基因的全长cDNA序列,分析其生物信息学特性。结果表明,获得淡色库蚊肌动蛋白基因cDNA全长1 708bp序列,其编码377个氨基酸;该基因编码的蛋白为膜蛋白,具有27个跨膜螺旋、1个信号肽切割位点、27个磷酸化位点。