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相似文献
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1.
测定了四川7个地方山羊品种(类群)43个个体的mtDNA控制区全序列,结果表明:山羊mtDNA控制区全序列长度为1212bp或1213bp,A+T含量(59.9%)明显高于G+c含量(40.1%)。共检测到74个变异位点,序列均为中性突变,核苷酸多样度为1.686%,这些差异共定义了27种单倍型,单倍型多样度为0.966,遗传多样性较为丰富,品种(类群)间存在不同程度的遗传分化。7个地方山羊品种(类群)间的遗传距离变异范围为0.0017~0.0306。用MEGA软件的NJ法构建单倍型序列的系统发育无根树,结果表明四川地方山羊品种(类群)有两个母系来源,但是否就对应于角笋骨羊(Capra aegagrus)和捻角山羊(Capra falconeri)两个野生祖先,还有待于进一步研究。  相似文献   

2.
北京鸭Ⅱ型干扰素基因分子克隆与序列分析   总被引:9,自引:0,他引:9  
应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,从伴刀豆球蛋白A(ConA)刺激培养的北京鸭脾淋巴细胞提取的总RNA中扩增得到北京鸭Ⅱ型干扰素(IFN-γ)基因(DuIFN-γ2)。序列分析表明,DuIFN-γ2基因长度与报道的鸭IFN-γ基因(AF087134)长度一致,为497个核苷酸,共编码145个氨基酸的成熟蛋白,推测其分子量约17ku。两者核苷酸水平的同源性为99.6%,有2个位置发生非同义变异,其氨基酸序列的同源性为98.6%;与其他禽类同源性为67.0%-68.0%,与人的同源性为34.4%。  相似文献   

3.
以传染性法氏囊病病毒(IBDV)浙江分离株(ZJ2000)基因组RNA为模板,采用Long-accurate RT-PCR(LA-PCR)一步法扩增并克隆了IBDV ZJ2000株基因组A节段全长cDNA。序列测定结果表明,克隆的A节段全长共3259个核苷酸,包括5'、3'端的非编码区(NCRs)和2个部分重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2),与参比的血清1型毒株核苷酸序列的同源性高达95.2%-99.2%。二级结构预测表明,在5'-NCRs存在1个大型的茎环发夹结构。ORF2编码145个氨基酸的VP5,与参比毒株的同源性高达98.6%-100%。ORF1编码1012个氨基酸的VP2/VP4/VP3,在氨基酸水平上VP2、VP3、VP4与参比毒株的同源性分别达到94.9%-98.8、96.1%-98.5%、97.1%-99.2%。ZJ2000共有14-38氨基酸的替代,其中特有氨基酸6个,变异大多数集中在VP2高变区,突变率达2.9%-11%。第2个小亲水区内280位氨基酸由S替代了N、290位M替代了L。这2个突变可能与IBDV的抗原性有关。VP2-VP4剪切位点附近511和540位氨基酸的变异可能使ZJ2000株的毒力增强。分子系统进化树分析表明,ZJ2000与欧洲Cu-1株、P2株、CEF94株和中国Harbin株的有关最近,而与欧洲、香港、日本的超强毒株和美国的变异株相对较远。  相似文献   

4.
23株猪瘟病毒E2基因主要抗原编码区序列差异分析   总被引:12,自引:0,他引:12  
用RT-PCR及测序获得了17株猪瘟病毒(HCV)215bp的E2基因主要抗原编码区序列,经DNAStar软件对获得的17株HCV及已发表的6株HCV毒株序列进行了比较和分析,并构建了HCV遗传发生树。结果,这23株与石门株的序列相比,所有毒株的碱基变化随机地分布于整个序列,无缺失和插入,其中变化较大的区域位于序列的3’端。23株HCV E2基因主要抗原编码区核苷酸及氨基酸同源性分别74.1%-100%、79.7%-100%,其中4株20世纪70-80年代分离毒株的核苷酸及氨基酸同源性分别为76.3%-86.2%、81.1%-87.8%,10株20世纪90年代分离毒株的核苷酸及氨基酸同源性分别为75.4%-100%、79.7%-100%。所绘制的遗传发生树分为2个组群(group),每个组群分为2个亚组群(subgroup),14株猪瘟(HC)流行毒株在2个组群中均有分布,20世纪70-80年代分离的3株(75%)在组群2,20世纪90年代分离的5株(50%)在组群1。  相似文献   

5.
中草药添加剂对乌肉鸡生长性能及代谢的影响   总被引:7,自引:0,他引:7  
将陈皮、苍术、芒硝等组成的复方中草药添加剂按1.75%、2.25%、2.75%的水平添加到川牧乌肉鸡基础饲料中配制成试验饲粮1、试验饲粮2、试验饲粮3,进行为期30d的饲养试验和4d的代谢试验,结果表明:试验组与对照组相比,成活率提高5.1%-10.3%,日增重(ADG)提高22.2%-43.1%,采食提高13.5%-18.8%,料重比下降13.5%-18.8%,干物质代谢率(DMR)提高0.43%-4.77%,有机物代谢率(OMR)提高1.68%-5.47%。表观氮沉留率(ANR)提高7.63%-17.51%,其中试验组3效果最好。试验组3与对照组相比,DMR、OMR、ANR的差异显著(P<0.05),ADG的差异极显著(P<0.01)。  相似文献   

6.
利用RT-PCR及序列测定对猪瘟病毒石门株不同代次毒株E2基因主要抗原编码区及同一代次不同年代主要抗原编码区序列进行了分析,结果所有毒株E2基因主要抗原编码区序列呈现较高的同源性,石门株不同代次毒株E2基因主要抗原编码区核苷酸及氨基酸同源性分别为97.7%-100%,97.3%-100%;同一代次不同年代主要抗原编码区序列核苷酸及氨基酸同源性均为98.6%-100%。只有3个代次毒株发生较小的变异,核苷酸及氨基酸呈现1-3个碱基或氨基酸的变异,其他代次的毒株序列完全一致。初步证实了猪瘟病毒分子结构的遗传稳定性,说明猪瘟病毒的变异可能更多的与种群病毒的优势选择有关。  相似文献   

7.
鸭mtDNA控制区遗传变异与进化研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
利用DNA测序技术测定了我国6个家鸭品种31个个体线粒体DNA控制区多变序列。序列分析结果显示:A、T、C、G碱基的平均含量分别为0.313、0.201、0.355和0.130;检测到6个变异位点,约占分析位点总数的1.80%;检测到两种变异类型:颠换和转换,没有插入缺失类型;确定了9种单倍型,其中单倍型A1为本研究中6个地方鸭种的共享单倍型;本研究系统发育树结果支持我国家鸭起源于绿头野鸭(Anas platyryhynchos)和斑嘴鸭(Anas peocilorhycha)的“二元论”,  相似文献   

8.
分别用CIDR(孕酮阴道栓)+PMSG(处理1)和CIDR+PMSG+LH(处理2)两种处理方法对山羊进行同期发情处理。结果发现,两种处理均以撤栓后第1d发情率最高。撒栓后0-24h和24h-48h的发情率,处理1和处理2(61.4%,13.6%和48%,20%)之间差异不显著;撤栓后48h-72h的发情率,处理1(4.59,6)显著低于处理2(24%)(P〈0.05);撤栓后0~72h发情率,两种处理(79.5%,92%)无显著差异(P〉0.05)。从手术时对卵巢的观察可以看出,有大卵泡或排卵的发情羊,处理1为91.2%,处理2为100%,二者无显著差异;排卵的发情羊,处理1为(58.8%)显著低于处理2为(91.2%)(P〈0.05)。  相似文献   

9.
麦洼牦牛的RAPD分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
用60个10碱基的随机引物对麦洼牦牛的基因组DNA进行了PCR扩增。有7个引物扩增出了清晰且具多态性的条带,条带总数为34,其中有25条为可变条带,表现出多态性,多态频率为74%。根据Shannon公式计算出的7个引物扩增带频率的群体遗传多样性指数分别为:1.7955(OPA10)、0.6726(OPA13)、0.5433(OPB07)、0.0739(OPB10)、0.9919(OPA04)、1.4015(OPC06)、1.4514(OPK12),平均为:0.99,其平均百分比差异均值(MAPD)为40.41%。  相似文献   

10.
据商务部网站消息,越南腰果协会(Vietnam Cashew Association)代理主席在最近一次召开的新闻发布会上称,按照预期目标,2008年越南腰果出口额要达到10亿美元。2008年1—8月,越南已经出口腰果10.9万t,价值5.97亿美元。估计在余下的4个月时间里,越南还将出口腰果16万t。  相似文献   

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