特种及濒危家畜品种遗传资源保存利用的对策

保存和维持家畜遗传多样性是畜牧业生产的重要内容和目标，我们不仅要定义出濒危家畜品种的标准，而且要对其特殊症状予以观察和了解，同时，应对家畜遗传多样性保存的动机和方法进行探讨，遗传资源的原位（ｓｉｔｕ）及移位（ｅｘ－ｓｉｔｕ）保存是一项综合的技术体系，其中生物技术发挥着重要作用，最后，介绍德国现已形成的家畜遗传资源保存的基本观点。     

定量免疫电泳技术对黄牛品种间遗传差异的研究

 本文用定量免疫电泳技术对4个黄牛品种间的遗传差异作了免疫遗传学研究。结果表明,所研究的4个品种间的遗传相似度分别为:文山牛—昭通牛为0.922,文山牛—黑白花牛为0.917,文山牛—莫瑞灰牛为0.742,昭通牛—黑白花牛为0.795,昭通牛—莫瑞灰牛为0.603,黑白花牛—莫瑞灰牛为0.818基于上述遗传相似度,本文还作了4个品种亲缘关系的聚类分析。     

定量免疫电泳技术对黄牛品种间遗传差异的研究

本文用定量免疫电泳技术对4个黄牛品种间的遗传差异作了免疫遗传学研究。结果表明,所研究的4个品种间的遗传相似度分别为:文山牛—昭通牛为0.922,文山牛—黑白花牛为0.917,文山牛—莫瑞灰牛为0.742,昭通牛—黑白花牛为0.795,昭通牛—莫瑞灰牛为0.603,黑白花牛—莫瑞灰牛为0.818基于上述遗传相似度,本文还作了4个品种亲缘关系的聚类分析。     

中国地方猪种遗传特性保存决策支持系统

对畜禽遗传资源保存决策过程作简要分析后，提出了系统保种的数学模型，主要包括畜禽品种保护等级划分模型和畜禽品种遗传特性分配保存模型，并以此为核心建立了中国地方猪种遗传特性保存决策支持系统（ＣＦ—ＤＳＳ），描述了构成ＣＦ—ＤＳＳ的数据库管理子系统、模型库管理子系统和人机交互子系统的特点及研制方法．决策支持系统在畜禽遗传资源保护管理的应用研究中，ＣＦ—ＤＳＳ尚属首例，它的使用将对我国地方猪种遗传特性保存决策科学化起到积极的推动作用．     

Genetic diversity and population structure of indigenous chicken breeds in South China

A total of 587 individuals from 12 indigenous chicken breeds from South China and two commercial breeds were genotyped for 26 microsatellites to investigate the genetic diversity and population structure. All microsatellites were found to be polymorphic. The number of alleles per locus ranged from 5 to 36, with an average of 12.10 ± 7.00 (SE). All breeds, except White Recessive Rock, had high allelic polymorphism (>0.5). Higher genetic diversity was revealed in the indigenous chicken breeds rather than in the commercial breeds. Potential introgression from the commercial breeds into the indigenous chickens was also detected. The population structure of these indigenous chicken breeds could be explained by their geographical distribution, which suggested the presence of independent history of breed formation. Data generated in this study will provide valuable information to the conservation for indigenous chicken breeds in future.     

Analysis of the Genetic Diversity and Origin of Some Chinese Domestic Duck Breeds

Twelve fluorescence-labeled microsatellite markers were used to analyze the genetic diversity of 12 domestic duck breeds and 2 wild duck breeds to determine the relationship and origin of Chinese domestic duck breeds. Gene frequency, effective number of alleles （Ne）, expected heterozygosity （He）, polymorphism information contents （PIC）, inbreeding coefficient in population （Fis）, standard genetic distance （Ds）, and genetic distance （DA） were calculated by FSTAT and distance and phylogenetic analysis after the dates which were output from the Microsatellite-Toolkit software. Genetic distances between 12 domestic duck breeds and 2 wild duck breeds were analyzed by variance analysis. Unweighted pair group method with arithmetic mean （UPGMA） and phylogenetic trees used for cluster analysis were structured. The results indicated that 11 loci had medium- or high-level genetic diversity among the 12 loci, which could be efficiently used in the detection of the genetic parameters of each population. The values of He were 0.5414 to 0.7343, those of PIC proved similar, and those of Fis were 0.1101 to 0.3381 among all populations. All breeds were clustered into three groups by UPGMA phylogenetic trees. Banzui duck was clustered into a separate group. Differences of the DA were analysed by t-test. The results showed that difference in DA between the 12 domestic duck breeds and Lvtou duck and the Banzui duck were very significant （P〈0.01）, indicating that these 12 domestic duck breeds originated from Lvtou wild duck, but not Banzui duck.     

我国地方黄牛遗传资源保护方法的思考

我国的黄牛遗传资源在世界遗传资源重新受到重视的大背景下仍在快速流失.本文系统介绍了我国目前黄牛品种资源的现状及保护利用方法,提出了我国黄牛品种资源保护的一些思路.     

中国长江中下游地区鹅种种群动态分析*

 通过资源调查摸清我国长江中下游地区6个鹅品种的保存现状，同时结合微卫星标记对种群结构和动态进行了检测。结果显示，6个鹅品种均处于正常保种状态； 群体平均杂合度最高的是太湖鹅（0.690），最低的是武冈铜鹅（0.567），各鹅种的平均杂合度为0.640。用UPGMA法进行聚类分析，将6个鹅品种聚为3类，四川白鹅、武冈铜鹅、道州灰鹅、酃县白鹅聚为第1类；溆浦鹅为第2类；太湖鹅为第3类。根据资源调查及分子研究结果提出了保种意见。     

应用微卫星DNA标记进行边鸡群体遗传多样性分析

目前,微卫星DNA标记已被广泛应用于动物遗传育种研究中,可有效地进行群体遗传多样性分析,并可估算群体间的遗传距离。为了从分子水平上揭示边鸡群体的遗传结构及系统地位,利用鸡基因组中均位于常染色体上的5个微卫星DNA标记,检测了边鸡群体的遗传多样性,并以大骨鸡做了比较分析;同时,初步探讨了边鸡在国内几个地方鸡种中的系统地位。结果表明,5个微卫星位点共检测到38个等位基因,其中ADL0146位点的等位基因数最少(5个),而ADL0136和ADL0185两个位点的等位基因数最多(9个),平均等位基因数为7.6个.边鸡群体在5个微卫星位点的平均多态信息含量、平均基因杂合度(h)和平均有效等位基因数(Ne)分别为0.667 1、0.745 7和4.044 3,边鸡群体内比大骨鸡群体有更丰富的遗传多样性;聚类分析结果显示,边鸡与大骨鸡亲缘关系最近,而与鲁西斗鸡亲缘关系相对较远。该系统聚类结果与这些地方鸡种的系统分化与选育历史是基本一致的。     

梅花鹿微卫星标记与行为性状的关联分析

对扬州市动物园和扬州平山堂养殖场梅花鹿遗传变异以及行为性状进行研究,旨在为梅花鹿及其它动物品种分子标记和行为性状研究提供参考.采用筛选的14对微卫星引物,通过计算基因频率、平均杂合度、多态信息量、有效等位基因数目等,评估其遗传变异.根据微卫星位点信息,结合行为数据观察,利用SPSS 11.5分析程序,将位点信息与行为性状进行相关分析.结果表明,动物园梅花鹿群体14对微卫星位点的平均期望杂合度为0.441,观察杂合度为0.354,平均多态信息量为0.332,各位点基因分化系数平均为0.231.平山堂梅花鹿群体平均期望杂合度为0.372,观察杂合度为0.300,平均多态信息量为0.303,各位点基因分化系数平均为0.149.微卫星位点和梅花鹿行为性状的最小二乘分析表明,TGLA53和BM4107位点对修饰行为有显著影响;2AL2位点对观望行为有显著影响;2AL13和Mber14位点对卧息行为有极显著影响;BM6506位点对反刍和其他行为有显著影响;BL42位点对取食和卧息行为有显著影响.不同基因型个体均值的多重比较表明,对于动物园群体,在TGLA53、BM4107、2AL2、2AL13及BM6506位点,不同基因型之间在行为性状上差异显著(P＜0.05).对于平山堂养殖场群体,在TGLA53,CEH-5、2AL10、BM4107、Mb33、Mber710及BM3628位点,各基因型之间在一些行为性状上亦存在显著差异(P＜0.05).微卫星标记是评估梅花鹿遗传多样性较好的方法,微卫星位点和行为性状存在一定的相关性,但有待于进一步分析验证.     

利用荧光多重PCR技术分析8个兔品种遗传多样性

[目的]揭示8个兔品种的遗传多样性。[方法]采用荧光-多重PCR技术,筛选出多态性较好的18对微卫星引物,对苏系长毛兔、皖系长毛兔、美系獭兔、新西兰白兔、福建黄兔、闽西南黑兔、九疑山兔和比利时兔进行遗传多样性检测。[结果]8个兔品种在18个微卫星座位上的基因频率存在一定的差异;8个兔品种的平均多态信息含量为0.418 5～0.548 9。福建黄兔的平均多态信息含量最高,为0.548 9;苏系长毛兔的平均多态信息含量最低,为0.418 5。平均遗传杂合度也出现了类似的结果,说明福建黄兔的遗传多样性最丰富。根据各品种之间的遗传距离,将8个兔品种分为3大类:苏系长毛兔、皖系长毛兔、美系獭兔、九疑山兔和闽西南黑兔聚为第1类群,新西兰白兔和福建黄兔聚为第2类群,比利时兔为第3类群。[结论]该研究可为家兔种质资源的有效保护和合理利用提供理论依据。     

中国地方鸡种资源不同保种方法的分子检测

采用13对高度多态的微卫星标记对我国7个受国家重点保护的地方鸡种的原地保护和异地保存两种活体保种方法的保种效果进行了检测，计算了各品种的遗传杂合度和多态信息含量，比较了各品种在不同保种方法之间的遗传参数。结果表明：7个品种在两种保种方法中都有高度多态性，但异地保存的品种的多态性较原地保护的品种的多态性要多；虽然两种方法的保种效果较好，但是原地保护和异地保存之间在同一品种内的遗传变异并不相同。     

中国地方鸡种资源不同保种方法的分子检测*

 采用13对高度多态的微卫星标记对我国7个受国家重点保护的地方鸡种的原地保护和异地保存两种活体保种方法的保种效果进行了检测,计算了各品种的遗传杂合度和多态信息含量,比较了各品种在不同保种方法之间的遗传参数。结果表明:7个品种在两种保种方法中都有高度多态性,但异地保存的品种的多态性较原地保护的品种的多态性要多;虽然两种方法的保种效果较好,但是原地保护和异地保存之间在同一品种内的遗传变异并不相同。     

中国地方猪种遗传资源系统保存模型与方案

面对中国地方猪种遗传资源保存要以活体保种为主要形式，且面临经济特性选育提高，以及品种数量多的三大特点，为突破以Ｗｒｉｇｈｔ有效含量为核心的保种理论关于避免选择等条件的限制，提出了变无目标的随机保种为有目标保种，变避免选择的静态保种为利用选择的动态保种，变各品种互不联系的孤立保种为特性统一分配联合保种的多目标规划数学模型，该模型有两个目标，一是使特性安排在表现最突出的品种中保存，二是使品种选择特性之间遗传正相关大，负相关小。最后给出了中国猪种质特性的系统保存方案。     

雷州山羊和隆林山羊遗传多样性的微卫星分析

为了调查中国热带、亚热带主要山羊品种的遗传资源现状,应用14对微卫星引物,检测了隆林山羊和雷州山羊不同分布地区的群体遗传多样性水平。隆林山羊(柳州)、隆林山羊(百棚)、雷州山羊(徐闻)、雷州山羊(海南)各群体平均多态信息含量(PIC)分别为0.645、0.600、0.483、0.518;平均杂合度(H)分别为0.281、0.421、0.121、0.157;平均等位基因数(k)分别为5.17、4.93、4.64、4.5,3组数据综合说明两个山羊品种遗传多样性相对匮乏,群体遗传变异较低;NJ法聚类显示,隆林山羊两个群体聚为一类,再与雷州山羊(徐闻)聚在一起,最后为雷州山羊(海南),这与两个品种的来源及地理分布基本一致。研究结果为中国热带、亚热带山羊品种资源开发利用提供了基础资料和科学数据。     

中国地方蛋鸭品种动态保种状态的研究

通过调查我国11个地方蛋鸭品种的保存现状,发现文登黑鸭已经濒临灭绝,其他10个蛋鸭品种均处于正常保种状态。筛选28个多态性较好的微卫星标记检测了我国10个地方蛋鸭品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离(Ds)。结果表明,10个蛋鸭品种中,平均杂合度范围是0.514～0.617,杂合度均较高,最高的是三穗鸭(0.617),最低的是金定鸭(0.514);多态信息含量最高是三穗鸭(0.535),最低的是金定鸭(0.435);遗传距离用UPGMA法进行聚类分析,将10个蛋鸭品种聚为3类。根据调查结果及遗传多样性检测数据,分析了10个地方蛋鸭品种的保存状态,并提出保护建议。     

Analysis of genetic distribution and population genetic structure of the MyoD gene in 10 pig breeds

Restriction fragment length polymorphism (RFLP) data was applied to analyze the distribution of the MyoD gene in 10 pig breeds and pig breed crosses. The population genetic information about genetic distribution, variation, and heterozygosity of the MyoD gene in different breed populations were analyzed. Based on the allele frequency, genetic distance and evolution distance among each breed populations were calculated and Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean (UPGMA) phylogenetic tree was gained based on the evolution distances between populations. The results indicated that the distribution of the MyoD genotype kept in Hardy-Weinberg equilibrium in most tested groups but not in Duroc (D) and Duroc6(Landrance × Yorkshire) (DLY) population. Generally, the genetic diversity of the MyoD gene was abundant and these tested breed populations had high genetic variations. The evolution of the MyoD gene was under natural selection pressure. On the phylogenetic tree, 10 pig breeds were divided into 4 clusters. The first cluster consisted of four breeds developed from Landrace. The second cluster was two indigenous Chinese pig breeds. The third cluster was three breeds developed from Duroc. The fourth cluster was a Tibetan pig breed. The constitution of the topology of the phylogenetic tree was consistent with the breeding history of each pig breed. From this experiment, we can conclude that some RFLP data obtained from functional gene can be used in the genetic deviation research between some closely related species or between different populations in certain species. __________ Translated from Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica, 2007, 38(1): 1–7 [译自: 畜牧兽医学报]     

应用多性状动物模型评估蛋鸡蛋形指数遗传参数

以动物模型结合平均信息约束最大似然算法(AIREML)分析蛋鸡蛋形指数遗传力、重复力和遗传相关系数,剖析蛋形指数遗传参数动态变化规律。试验素材来自白莱航鸡与绿壳蛋鸡分离群体,包括亲代、F_1代和F_2代,总计2 326只母鸡。每一世代32~60周龄,期间每4周测量1次蛋品质,共采集蛋形指数数据19825条。以WOMBAT软件估计遗传方差、永久环境方差和残差。结果表明:品种、世代和周龄,对蛋形指数有重要影响,将其列入固定效应;蛋形指数性状并非正态分布,应用平方根反正弦进行数据转换,但转换前后遗传参数估计值差异不显著(P0.05);蛋形指数遗传力为0.31~0.47,遗传方差随周龄增加而增加,至48周龄达到极大值,之后小幅回落;重复力为0.47~0.61,永久环境方差基本稳定在同一水平;不同周龄蛋形指数遗传相关系数为0.91~0.99,永久环境相关系数为0.61~0.92,相邻周龄遗传相关系数较高。蛋形指数重复力较高、周龄之间遗传相关系数接近于1,以个体选择可以有效获取遗传参数。     

贵州畜禽种质资源库及信息库建设研究

通过采集、分装、冻存18种贵州地方畜禽血样,初步建立了畜禽血液库;提取贵州省地方畜禽品种的基因组DNA构建了DNA库;通过信息化处理,搭建并整合了包括遗传特性、品种信息等在内的交互式访问数据信息库,旨在为贵州畜禽种质资源的保存、利用与创新提供保障,为科研教学单位提供基础资料,同时为推进贵州畜禽种质资源信息化发展奠定基础.     

Analysis of Genetic Diversity and Relationships of Seven Chinese Indigenous Pig Breeds and Three Exotic Pig Breeds Using the DNA Differential Display Technique

The genetic diversity and relationships of seven Chinese indigenous pig breeds （Meishan, Erhualian, Hezuo, Bamei, Qingping, Tongcheng, and Huainan） and three exotic pig breeds （Large White, Landrace, and Duroc） were analyzed using the DNA differential display technique by means of eight primer combinations. A total of 123 reproducible bands were used to calculate mean Nei＇s gene diversity, and mean Shannon＇s information index for each pig population. Based on these the Nei＇s standard genetic identity and distance were estimated, which was used to construct a dendrogram tree for the 10 pig breeds. The experimental results obtained and the method used in this study for evaluating the genetic diversity and relationships of pigs were also discussed.