应用盐溶蛋白电泳和SSR分子标记鉴定玉米种子纯度的研究

[目的]建立一种快速、准确、经济的品种鉴定方法,为品种纯度鉴定和新品种保护提供依据。[方法]利用盐溶蛋白PAGE法与SSR分子标记对玉米杂交种先玉335和泽玉11的指纹图谱进行分析。[结果]应用盐溶蛋白PAGE法,可以很好地鉴定玉米种子纯度,可用于大批量检测;选用的10对SSR引物,其中3个多态性好的SSR引物能区分所有材料。[结论]盐溶蛋白PAGE法具有简单、快速、准确、稳定和低成本的特点。在该法为主批量检测种子的基础上,对难以鉴定的品种可采用SSR分子标记法作为辅助手段进行鉴定。     

盐溶蛋白法和SSR标记法检测玉米纯度的比较

利用盐溶蛋白PAGE法和SSR分子标记法对玉米杂交种苏玉20和成单60的指纹图谱进行分析。结果发现,应用盐溶蛋白PAGE法可用于苏玉20纯度鉴定,而在成单60的图谱中未出现明显特征谱带,故不能进行鉴定;SSR分子标记法选用了20对SSR引物,分别在苏玉20及其双亲间得到8对引物显示稳定的多态性,而在成单60及其双亲间得到3对,杂种均表现为父母本互补的带型,可作为纯度鉴定候选引物。综合比较,盐溶蛋白PAGE法简单快速,适合单品种检测,而SSR分子标记法适用范围更广,且准确、高效、经济。     

RAPD法与盐溶蛋白PAGE法鉴定玉米种子纯度的对比试验

以吉林省玉米主推杂交种21个组合为试材，利用RAPD法与盐溶蛋白法（PAGE）进行了鉴定品种与杂交种纯度的对比试验。结果表明：盐溶蛋白法能很好地鉴定出19个组合，且具有简单、快速、准确、稳定和低成本的特点，可用于大批量检测，但因一些种子蛋白质水平差异较小，有4个组合维以鉴定，具有一定的局限性。RAPD分子标记法经过40个引物的重复筛选，仅用4个引物就能鉴定出所有的组合，具有独特的优越性，但因设备条件要求高，成本相对较高，不宜用于大批量。因此，在应用盐溶蛋白法为主批量检测种子的基础上，对难以鉴定的品种可采用RAPD法作为辅助手段进行鉴定。     

玉米SSR与盐溶蛋白指纹图谱分析

利用SSR标记法与盐溶蛋白法对32份玉米自交系和13个杂交种的指纹图谱进行分析，结果表明，盐溶蛋白图谱中共有35条不同的谱带，多态性信息量占74．29％。筛选了50个SSR引物，其中6个多态性好的SSR引物能区分所有供试材料。在32个自交系中共检测到29个等位基因，平均每个引物4．83个，多态性信息量占93．10％。仅用2个引物就检测到10个位点，把13个杂交种分开，并构建了13个杂交种的数字指纹图谱。     

应用SSR标记技术鉴定玉米杂交种的纯度

以利用常规盐溶蛋白电泳技术难以进行纯度鉴定的强盛1号玉米杂交种及相应亲本自交系和6对玉米SSR位点引物为材料,筛选出适合该杂交种纯度鉴定的SSR位点引物,结果表明,bilg 116引物的扩增产物呈现双亲互补的特征谱带,易于区分杂交种和亲本自交系。并通过对单子粒DNA提取等技术环节的改进,建立了一套简单、快速、准确、可靠的种子纯度鉴定方法。     

玉米杂交种SSR标记纯度鉴定方法研究

以常规种子贮藏蛋白质电泳技术难以鉴定纯度的4个玉米杂交种、21个自交系和9对玉米SSR位点引物为材料,运用SSR分子标记技术分别筛选出适合这些不同杂交种纯度鉴定的SSR位点引物,建立了一套仪器设备要求相对较低、程序简单、较为快速地利用SSR标记进行玉米杂交种纯度鉴定的技术规程,并对利用SSR标记进行玉米杂交种纯度鉴定的可行性进行了分析。     

玉米杂交种子纯度的SSR检测与田间鉴定的比较研究

为发展分子标记技术在玉米杂交种子纯度鉴定上的应用,文章对吉林省2005年玉米省级区试的30个品种进行了SSR分子标记的纯度分析,筛选出11时多态性好的引物,并与田间纯度鉴定结果进行了比较.通过相关分析和差异显著性分析表明:SSR鉴定的(平均)纯度与田间纯度鉴定结果较为一致,相关系数达到0.798,而且两者无显著差异,因此,SSR分子标记可以用于玉米田间纯度的鉴定;引物umc1069和引物umc2373所标记的结果能较好的代表田间纯度鉴定的结果.     

豫玉22玉米杂交种子纯度的SSR和SNP分子比较鉴定

为研究豫玉22玉米杂交种子的SSR和SNP两种分子标记纯度鉴定方法,为快速有效鉴定玉米种子纯度提供依据。采用SSR荧光标记法和SNP分子标记的KASP技术对豫玉22玉米杂交种子进行基因组DNA提取、引物筛选、基因型分析、纯度鉴定。豫玉22的SSR特异性引物为umc2007y4和bnlg161k8,纯度鉴定结果为97.92%。SNP特异性引物MaSNP64和MaSNP245纯度鉴定结果是98.44%。SSR和SNP分子标记鉴定豫玉22玉米杂交种子纯度的最佳方法,为拓展玉米杂交种纯度鉴定方法具有指导意义。     

盐溶蛋白电泳和SSR标记鉴定苏玉20种子纯度的比较研究

为建立一套经济、快速、准确鉴定苏玉20纯度的方法,利用盐溶蛋白电泳和SSR标记同时对该品种进行了纯度鉴定,并对2种方法及结果进行了比较分析。研究发现,同一批次种子,2种方法纯度结果基本一致,但盐溶蛋白电泳法纯度结果比SSR分析结果平均高0.78百分点。经综合分析,在实际操作中,建议用SSR标记,利用1~2对引物即可完成苏玉20的纯度鉴定,其结果更真实准确。     

利用SSR技术鉴定苏玉20的纯度

苏玉20是江苏省农业科学院2004年选育成功的高产优质玉米杂交种.以苏玉20玉米杂交种及其亲本为材料,从80对玉米SSR引物中筛选出在苏玉20双亲之间多态性明显、重复性较好的4对引物bnlg1306、phi065、bnlg2291和umc1590用于苏玉20纯度鉴定.这4个SSR标记特异性好,且人为掺杂与田间鉴定均与利用SSR标记鉴定结果高度一致.尤其是,这些引物同时可以用于郑单958的纯度鉴定并可以区分苏玉20和郑单958杂交种.因此,该方法具有准确可靠、实用性强等优点,为生产上杂交种苏玉20纯度的快捷有效鉴定提供了科学依据.     

SSR分子标记技术在玉米杂种优势群划分中的应用

利用SSR分子标记研究了32份玉米自交系的遗传变异,初步进行了杂种优势群划分。从40对SSR引物中筛选出24对扩增产物具有稳定多态性的引物,24对引物在供试材料中共检出165个等位基因变异,每对引物检测到等位基因3～12个,平均6.875个。按UPGMA方法进行的聚类分析结果表明,供试自交系可划分为4个类群,利用SSR标记可以对玉米自交系的遗传变异进行初步分析,并可用于杂种优势群划分。     

应用高分辨率熔解曲线技术分析水稻分子标记基因型

 【目的】验证高分辨熔解曲线（high-resolution melting curve analysis,HRM）技术在水稻分子标记分析中应用的可行性和可靠性,应用该技术对水稻重组自交系（RIL）群体及其亲本进行SSR、InDel和SNP标记基因型分析。【方法】以粳稻品种丽江新团黑谷（LTH）和籼稻品种三黄占2号（SHZ-2）及其衍生的RIL群体为材料,以纯合亲本LTH作为参比基因型,利用HRM技术分析一个G/A转换的SNP标记以及非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）难以分辨的一个SSR标记和一个InDel标记的基因型。【结果】通过加入适量的参比DNA,HRM能够分辨2个纯合亲本及其衍生的纯合体和杂合体RI系的分子标记基因型,并且以加入20%模板量的参比DNA对3种基因型的分辨最好。利用该方法对作图群体的部分RI系进行分子标记基因型分析,结果与变性PAGE的分析结果完全吻合。【结论】验证了HRM应用于水稻SSR、InDel以及SNP标记分析的可行性和可靠性。相对于凝胶电泳分析,HRM具有分辨率高、高效、快速、操作简单、安全等优点,是一种在水稻分子标记分析中很有应用前景的技术。     

利用SSR标记研究爆裂玉米自交系的遗传变异及其与普通玉米的遗传关系

 利用113对多态性SSR引物研究了来源于8个基础材料的26个爆裂玉米自交系的遗传多样性及其与分属6个杂种优势类群的20个普通玉米骨干自交系的种质关系。在26个爆裂玉米自交系间共检测出301条带，平均每个位点的等位基因数为2.66个，多态性信息量为0.068～0.217，平均遗传距离为0.357。利用SSR数据进行聚类分析，将46个供试自交系分为爆裂和普通玉米自交系两大类；26个爆裂玉米自交系分为8个类群，高杂种优势组合的双亲自交系均属于不同类群，而在同一类群自交系间尚未组配出具有高杂种优势的组合；普通玉米自交系的分类结果与以往研究和育种实践相一致，表明SSR标记技术可以用于爆裂玉米自交系间的遗传多样性研究。不同类群爆裂玉米自交系与各类群普通玉米自交系的平均遗传距离为0.549～0.672，应根据两类自交系间的遗传关系对爆裂玉米自交系实施有针对性的分群改良。     

利用SSR标记研究玉米自交系的遗传变异

 利用 SSR标记研究了 2 1个玉米 ( Zea mays L.)自交系的遗传变异 ,初步进行了杂种优势群划分。从 69对 SSR引物中筛选出 43对扩增产物具有稳定多态性的引物。43对引物在供试材料中共检测出 1 2 7个等位基因变异 ,每对引物检测等位基因 2～ 7个 ,平均为 2 .95个 ;平均多态性信息量为 0 .51 1。 2 1个自交系之间的遗传相似系数变化范围为 0 .480～ 0 .768,平均为0 .62 7。 UPGMA聚类分析结果表明 ,供试自交系可分为两个类群。黄早四自成一群 ;其余 2 0个自交系又分为 5个亚群。生产上利用的高产杂交组合的亲本均属于不同的类群 (亚群 ) ,而在类群 (亚群 )内未发现高产组合。研究发现 8对具有较高多态性信息量的引物 ,利用这些引物可以对供试材料进行初步鉴定。研究表明 ,利用 SSR标记可以进行玉米自交系遗传变异分析 ,并用于杂种优势群划分     

36个贵州主要玉米自交系的SSR遗传分析

利用SSR标记分析了36个玉米自交系的遗传多样性,结果表明,多态性、重复性均较好的引物有34对,用此34对SSR引物检测到69个等位基因;SSR位点检测出的平均等位基因3.4个;SSR分子标记将其划分为5组,与系谱分析基本一致.认为,SSR标记系统适合于玉米种质的遗传多样性研究.     

基于SSR标记对65份大白菜自交系的聚类分析

以65份自育的大白菜自交系为试验材料,进行多样性分析和类群划分。利用26对SSR分子标记分析供试材料遗传多样性,并利用SSR分子标记聚类方法进行大白菜自交系的组群划分研究。SSR标记多样性分析表明,平均Nei基因多样性指数为0.541 5,平均Shannon多态性指数为0.913 5,说明供试材料有较高的遗传多样性。SSR分子标记聚类将65份大白菜自交系划分为5个类群。SSR标记聚类结果真实地反映了种质资源内在基因组的多样性,可以将系谱来源相同的材料聚类在同一类群,对于杂种优势预测和亲本选择均有指导意义。     

SSR标记用于玉米自交系类群划分的研究

利用SSR标记研究了 10个玉米自交系的遗传变异 ,初步进行了杂种优势群划分。 10对SSR引物在供试材料中共检测出 4 0个等位基因变异 ,每对引物检测出等位基因 2～ 5个 ,平均检出4个 ,平均多态信息含量值为 0 .6 5,10个自交系间平均遗传相似系数为 0 .2 7。聚类分析结果表明 ,供试自交系可归为两个类群 ,每个类群又分别由两个亚群组成。利用SSR标记可以对玉米自交系的遗传变异进行初步分析 ,并可用于杂种优势群划分。     

四川部分玉米骨干自交系杂种优势群研究

以四川15个玉米骨干自交系及其按Giffing方法4组配的105个杂交组合为供试材料,通过配合力分析和单株产量特殊配合力、RAPD标记、SSR标记的聚类分析,研究供试自交系的配合力表现,杂优类群和杂优模式,并对不同研究方法划分杂优类群的可靠性进行比较。结果表明,单株平均产量及其构成性状GCA综合表现较好的自交系有18-599、7327、698-3、S37、48-2,单株产量SCA较高的组合中,自交系18-599和7327组配的杂交组合较多,其余自交系各自有其突出的优良特点,可根据育种要求加以利用;SSR分析可将供试的15个玉米骨干自交系较为合理地划分为4个类群和4个亚群,并发现杂优类群及其组配方式与单株产量的高低存在紧密的联系;三种聚类方法的分析结果,均能在一定程度上反映供试自交系的遗传特性,并且所划杂优类群具有程度不同的合理性,但无论从系谱关系还是从强优势组合方式来看,SSR分析结果更为准确和可靠。