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为了解甘孜州藏猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,分析其相似性和遗传进化关系。本试验用反转录套式聚合酶链反应(RT-nPCR)方法对采集于2018—2019年甘孜藏族自治州藏猪主要养殖区域4个县10个藏猪养殖场的229份藏猪粪便样本进行核酸检测,并对全部阳性样本进行ORF2基因部分片段扩增测序,遗传进化分析。结果显示:猪粪便HEV核酸阳性率为16.59%(38/229,95%CI=12.00%~22.10%),猪场HEV阳性率为70%(7/10,95%CI=34.8%~93.3%);38个ORF2基因片段彼此之间核苷酸序列相似性为76.1%~100.0%,推导的氨基酸序列相似性为79.6%~100.0%,系统进化树分析显示所有阳性毒株均为基因4型,且与人源HEV毒株亲缘关系近。结果表明甘孜州藏猪中存在一定程度的HEV感染,与人源HEV毒株遗传关系近,相关部门采取防控措施以降低HEV感染的公共卫生风险。 相似文献
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西藏部分地区藏猪戊型肝炎病毒血清流行病学调查 总被引:1,自引:0,他引:1
为了解西藏地区藏猪戊型肝炎流行情况,在拉萨、林芝、昌都、日喀则和山南等5个市,采集305份藏猪血清,利用酶联免疫吸附(ELISA)法进行戊型肝炎病毒血清抗体检测,并用SPSS 21.0方法进行不同性别、不同区域间的显著性差异分析。结果显示:从305份藏猪血清中检测到81份抗体阳性,总抗体阳性率为26.6%(81/305);拉萨市和林芝市的抗体阳性率最高,达32.8%(20/61),其次为昌都市、日喀则市和山南市,阳性率分别为29.5%(18/61)、26.2%(16/61)、11.5%(7/61);山南市阳性率与其他4个市相比差异显著(P0.05),公猪和母猪的抗体阳性率分别为23.3%(35/150)和29.7%(46/155),无显著差异(P0.05)。结果表明,西藏地区藏猪群中存在不同程度的猪戊型肝炎病毒感染。鉴于当地存在食用生或半生猪肉和猪肝的习俗,建议加强宣传,倡导健康饮食,同时加强高发区疫病防治,降低人类感染风险。 相似文献
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本文探讨鸡西地区猪戊型肝炎病毒检测结果及分析其序列特征.为确定本地区猪戊型肝炎病毒基因型提供可靠依据。方法:在鸡西地区采集600份猪粪便样本作为本次研究对象.经PCR后检测HEV—RNA阳性率及分析序列,记录结果并给予统计学分析后得出结论。结果:600份猪粪便样本中106份经检测为HEV—RNA阳性(阳性率17.67%),494份阴性(阴性率82.33%),阳性样本序列与基因IV型相似度最高,对比结果具有统计学意义(P〈0.05)。结论:养殖工作者及防疫工作者应提高警惕,将预防及干预猪戊型肝炎病毒感染作为工作重点.采取多种有效措施降低猪感染戊型肝炎病毒的几率.阻断人畜共患疾病传播途径,保障人们饮食健康。 相似文献
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应用1对乙型肝炎病毒(HBV)S基因保守区的引物,采用PCR方法从屠宰猪肝、血清中检测到了HBV,序列分析表明,扩增片段与已发表的HBVS基因的同源性高达98%~100%。电镜负染色样品观察结果表明,在HBV表面抗原ELISA检测强阳性反应的血清样品中存在有形态、大小与人HBV Dane颗粒和小球状颗粒相似的病毒粒子。针对戊型肝炎病毒(HEV)()RF2/ORF3重叠区设计了简并引物,采用巢式RT-PCR对屠宰猪肝和血清样品进行了检测。结果表明,部分屠宰猪肝中存在HEV。 相似文献
5.
戊型肝炎病毒研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
戊型肝炎(hepatitis E,HE)是由戊型肝炎病毒(hepatitis Evirus,HEV)引起的一种经肠道传播的非甲-非乙型肝炎(ET-NANBH)。戊型肝炎是一种人兽共患病,已成为我国的一个重要公共卫生问题。猪、牛、羊、鸡、狗等动物可能作为戊型肝炎的贮存宿主,在人类病毒性肝炎流行病学中具有重要的地位。本文从戊肝的病原学、基因型、病毒分子生物学、诊断方法、感染动物、流行病学等多方面探讨戊型肝炎的危害及研究现状。 相似文献
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70年代末,发现一种类似甲型肝炎的非甲非乙肝炎.1990年Reyes等首先应用分子克隆技术获得该病毒的基因克隆.1998年在东京召开的国际会议上,正式将此型肝炎及相关病毒分别命名为戊型肝炎(hepatitis E,HE)和戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV). 相似文献
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《中国兽医学报》2017,(1):54-59
为了了解吉林地区HEV分子背景和流行特征,对2013年采自吉林地区养殖场的毒株编号为Ch-S-1的Ⅳ型戊型肝炎病毒(HEV)的全基因序列进行了分析。通过提取病毒RNA,采用RT-PCR方法分段扩增HEV全长基因,两端采用RACE法扩增,经过序列测定和拼接,利用ClusterX1.81、MEGA3.0、Phylop win 3.0软件分析基因序列。最终得到了HEV Ch-S-1全长基因组(GenBank登录号EF077630,7 261bp),其中ORF1、ORF2和ORF3分别编码1 706,674,114个氨基酸。与人源及猪源各基因型HEV相比,Ch-S-1与基因Ⅰ~Ⅲ型的ORF1片段同源性在78.8%~86.9%之间,而与基因Ⅳ型的ORF1片段同源性在93.7%~97.6%。Ch-S-1与基因Ⅰ~Ⅲ型的ORF2片段同源性在87.5%~92.4%之间,而与基因Ⅳ型的ORF2片段同源性在95.9~98.2%。Ch-S-1与基因Ⅰ~Ⅲ型的ORF3片段同源性在75.2%~84.0%之间,而与基因Ⅳ型的ORF3片段同源性在97.5%~99.2%。结果表明:HEV Ch-S-1全序列的基因结构特征与HEVⅣ型基本一致。 相似文献
8.
旨在调查四川地区藏猪捷申病毒(porcine teschovirus,PTV)的流行及分子特征和遗传演化。用RT-PCR法对2017-2018年采自四川省甘孜藏族自治州康定市14个藏猪场96份粪便样品进行检测,并对全基因组进行序列分析和基因分型。PCR检测结果表明,PTV核酸阳性率为20.8%(20/96,95% CI=13.2%~30.3%),14个规模藏猪场中PTV猪场阳性率为57.1%(8/14,95% CI=28.9%~82.3%),并从2份阳性样本中获得了2条近似全长的PTV全基因组序列,分别命名为SWU-E5-2018和SWU-ZG2-2018,核苷酸序列相似性为83.1%。通过VP1序列分析发现2条序列的血清型分别为3型和6型。通过基因重组分析发现SWU-E5-2018存在重组现象,重组区域位于衣壳蛋白基因P1的552-3 082 nt处。为了进一步研究2条PTV序列的演化过程,以贝叶斯进化分析软件进行分歧时间估算,结果表明,SWU-E5-2018的分歧时间约为2010年,SWU-ZG2-2018的分歧时间约为2011年。本研究首次对藏猪源PTV进行了初步调查,结果表明藏猪中存在一定程度的PTV感染,为深入研究藏猪源PTV遗传变异及其生物学特性提供了参考依据。 相似文献
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在工业化国家,戊型肝炎病毒(HEV)的传播途径还是未知的,但许多研究结果表明,HEV可能是一种由猪引起的动物传染病。本试验旨在研究HEV在野猪中的患病率及野猪和家猪、人的HEV序列间的遗传关系。试验选取法国东南部的285头野猪,利用Real-time RT—PCR技术检测到有7头野猪(占2.5%)存在HEV RNA表达,其中5头野猪的HEV序列属于3f型,相互之间的核苷酸同源性为89%~100%,与从法国南部HEV患者身上提取的HEV同源性较近。因此,法国东南部野猪可能是人戊型肝炎的传染源。 相似文献
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戊型肝炎病毒是一种RNA病毒,主要引起急性传染性肝炎,该病毒不仅可以感染人,而且有多种动物可以作为其自然宿主。文章从病原学、流行病学、检测方法及其疫苗的研制几个方面对其进行了综述。 相似文献
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Woo-Jung Park Byung-Joo Park Hee-Seop Ahn Joong-Bok Lee Seung-Yong Park Chang-Seon Song Sang-Won Lee Han-Sang Yoo In-Soo Choi 《Journal of veterinary science (Suw?n-si, Korea)》2016,17(1):1-11
Hepatitis E outbreaks are a serious public health concern in developing countries. The disease causes acute infections, primarily in young adults. The mortality rate is approximately 2%; however, it can exceed 20% in pregnant women in some regions in India. The causative agent, hepatitis E virus (HEV), has been isolated from several animal species, including pigs. HEV genotypes 3 and 4 have been isolated from both humans and animals, and are recognized as zoonotic pathogens. Seroprevalence studies in animals and humans indirectly suggest that HEV infections occur worldwide. The virus is primarily transmitted to humans via undercooked animal meats in developed countries. Moreover, transfusion- and transplantation-mediated HEV infections have recently been reported. This review summarizes the general characteristics of hepatitis E, HEV infection status in animals and humans, the zoonotic transmission modes of HEV, and HEV vaccine development status. 相似文献
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E亚群禽白血病病毒(ALV-E)是指存在于鸡染色体中的内源性逆转录病毒基因组DNA或片段。具有转录活性的ALV-E既会对鸡的生产性能(体重和产蛋率)产生负面影响,又能从抗体水平干扰对外源性ALV的鉴别诊断。为对黑龙江省某鸡场内一禽白血病病毒RT-PCR阳性病料进行病毒分离鉴定及分析其基因组特征和遗传进化情况,通过分子生物学、病毒形态学及全基因组序列测定方法对病毒培养物进行鉴定和分析,结果显示,该分离株可在CEF细胞盲传至第9代,电镜下可观察到近似球形、直径约为80 nm,并具有囊膜和纤突结构的病毒粒子,将其命名为HLJE2020株。序列分析结果显示,其全基因组序列中的gag和pol基因相对保守,LTR和env基因与ALV-E同属一个进化分支,而gp85基因则与ALV-E和ALV-B均具有较高相似性,遗传进化分析显示在ALV-E和ALV-B间出现一个单独的分支,结合RDPv.4和SimPlot软件分析结果,推测该毒株gp85基因可能存在E亚群AF229株与B亚群SDAU09C1株的重组现象。本研究为了解禽白血病病毒基因组遗传演化情况提供数据资料,并为ALV的防控提供参考和依据。 相似文献
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Berto A Mesquita JR Hakze-van der Honing R Nascimento MS van der Poel WH 《Zoonoses and public health》2012,59(7):477-481
This study represents the primary hepatitis E virus (HEV) surveillance in domestic pigs in Portugal, five pig farms were investigated in 5 different Portuguese regions, ten faecal samples were collected at four different stages of the production. All faecal samples were tested for hepatitis E virus by real-time RT-PCR. At least one sample from each farms of all age groups tested positive for HEV. The prevalence in the pig herds varied from 10% to 30% and the mean prevalence was 32% in weaners, 20% in growers, 32% in fatteners and 4% in adult dry sows. Phylogenetic analysis of the detected HEV sequences indicated that the circulating virus strains belong under the genotype 3. 相似文献
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T. Kantala P. M. Kinnunen S. Oristo P. Jokelainen O. Vapalahti L. Maunula 《Zoonoses and public health》2017,64(3):232-238
We investigated hepatitis E virus (HEV) infections in Finnish veterinarians engaged in different practice specialties and evaluated the effect of different background factors on HEV exposure by examining total HEV antibodies in samples collected from the participants of the 2009 National Veterinary Congress in Helsinki, Finland. Finnish veterinarians commonly have total HEV antibodies with seroprevalence of 10.2%. Of the non‐veterinarians, 5.8% were seropositive. Increasing age was associated with HEV seropositivity, and, surprisingly, the highest HEV seroprevalence (17.8%) among veterinarians was detected among small animal practitioners. Although no positive correlation between swine contacts and HEV seropositivity was found, 22.7% of veterinarians who had had needle stick by a needle that had previously been injected into a pig versus 9.0% of those who had not were seropositive, even though the finding was statistically non‐significant (P = 0.07). Our results suggest that, although contact with swine is a known risk factor for HEV infection, the sources of HEV infections are probably numerous, including travelling abroad and possibly also other reservoirs of HEV than pigs. 相似文献
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