RAPD标记对25份柑桔资源及其芽变系的鉴定和多样性分析

利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术,对几份柑橘资源及其芽变系共计25份材料进行了鉴定和遗传多样性分析,从70个引物中筛选出多态性好的10个引物组成单引物和双引物对基因组进行扩增,共扩增出142条谱带,其中多态带72条,共同带70条,平均每个单引物出现多态带6.8条,每对双引物出现多态带1.3条。利用UPGMA法分析发现,这些基因型间的遗传相似系数在0.834～0.966之间,在此基础上,构建了各基因型的遗传关系树状图。结果表明RAPD标记可以准确鉴定出各柑橘资源及其芽变系,这25份柑橘资源代表了25个基因型。较高的遗传相似系数揭示了柑橘资源间狭窄的遗传背景。     

小桐子25个无性系遗传多样性的SRAP分析

为评价25个小桐子无性系的遗传多样性和亲缘关系,采用SRAP标记技术从41对SRAP引物中筛选出31对多态性高、稳定性好的引物,对上述材料的基因组DNA进行研究。结果表明：每对引物组合产生10~28条谱带,其中多态性条带142条,占总带数的25.4%。25个无性系间的相似系数为0.409~ 0.951之间,平均相似系数为0.714。其中,3号与7号的相似系数最大,亲缘关系最近;6号与11号的相似系数最小,亲缘关系最远。UPGMA聚类分析结果显示,供试材料在相似系数为0.72处被划分为5个类群。25个无性系中有7个无性系扩增出了各自的特征谱带,而仅凭各自的这1条特征谱带即可将7个无性系与其他材料区分开,这说明SRAP标记可用于小桐子种质的分子鉴定与群体遗传结构的研究。通过上述研究得出结论：虽然25个无性系的遗传多样性不丰富,但是在分子水平上各有差异。     

贵州桂花种质资源遗传多样性的ISSR分析

通过ISSR分子标记,对贵州不同地区的54份桂花种质进行了遗传多样性研究.选取11条多态性引物用于正式扩增,获得清晰、重复性好的DNA谱带93条,多态位性谱带80条,占总扩增带的86％,平均每个引物扩增8.45条;应用810和830的引物组合,构建了桂花种质的ISSR指纹图谱,可以有效区分所有供试材料;利用NTSYS和POPGENE 32进行数据分析,计算出相似系数与遗传距离,构建了54个样本的聚类树状图;以遗传相似系数0.69为阈值把54份供试桂花材料分为4类,聚类结果与地域及海拔具有一定相关性.因此,ISSR技术能够有效地用于桂花种质资源的鉴别及遗传关系的解析.     

利用SSR引物通用性分析杨柳科树种遗传多样性

利用SSR引物的种间通用性,本研究分别从杨属和柳属中各随机筛选出10对SSR引物,对17个杨树品种和20个柳树品种的遗传关系进行了分析。结果表明,18对引物在杨树品种有扩增,共扩增出155条多态性谱带,多态性比率为93.4%,平均每对引物扩增出8.6条谱带;16对引物对在柳树品种有扩增,共扩增出120条多态性谱带,多态性比率为91.6%,平均每对引物扩增出7.5条谱带。筛选出了14对杨柳树通用引物,14对通用引物可以将37个供试材料分成两大类,一类为杨树树种,一类为柳树树种,与传统的植物学分类相符。     

普通小麦背景中长穗偃麦草[Lophopyrum elongatum（Host）A．Loeve]E染色体组的RGAP特异标记

利用已知植物抗病基因编码氨基酸保守区域NBS—LRR（核苷酸结合位点-富亮氨酸区域）设计了42个简并引物组合，运用抗病基因类似物多态性（resistance gene analog polymorphism，RGAP）分子标记技术，对中国春、中国春-长穗偃麦草双二倍体及其附加系和代换系基因组DNA进行PCR扩增。结果表明，共有38对引物组合获得扩增产物，其中35对在普通小麦中国春、中国春-长穗偃麦草双二倍体中能扩增出多态性，平均每个引物组合扩增出38．5个片段。在普通小麦背景下，共获得275条长穗偃麦草E基因组多态件谱带，占扩增总谱带数的17．44％，揭示出在普通小麦背景下E基因组和普通小麦A、B、D基因组间的高丰度遗传变异。另外，利用RGAP分子标记技术，构建了一套完整的长穗偃麦草1E～7E染色体的特异RGAP标记。为小麦背景中长穗偃麦草外源遗传物质的快速检测提供了新途径。     

野生榆叶梅遗传多样性的AFLP分析

本研究利用AFLP分子标记技术,对野生榆叶梅6个居群进行分析.利用已筛选出的8对引物组合进行扩增,共产生256条谱带,其中206条谱带具有遗传多态性,占总谱带的80.47％;平均每对引物组合扩增产生129条多态条带,平均多态率为50.26％.6个居群观察等位基因数Na平均值为1.502 6,总Na值为1.804 7;有...     

基于RAPD标记的芥蓝种质资源遗传多样性分析

调查了44份芥蓝种质的植物学性状,并利用RAPD分子标记分析了其遗传多样性。结果从150条随机引物中筛选出20个引物,20个引物共扩增出177条谱带,其中多态谱带105条,平均每个引物扩增出8.9条谱带和5.3条多态性谱,多态性比率为59.32%。基于RAPD标记,利用NTSYS-pc2.11构建了聚类树状图谱,遗传距离为0.70时,44份芥蓝资源可聚成六大类群。芥蓝种质存在着一定的遗传多样性,但原产华南而且主要产区也在华南,遗传多样性要小于芸薹属其他蔬菜。     

菠萝17份种质的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对17份菠萝种质进行了基因组DNA多态性分析。从62个ISSR引物中筛选出6个多态性引物用于PCR扩增，共扩增出70条DNA条带，其中多态性条带44条，所占比例为62.86%，平均每个引物扩增的DNA条带的数目为11.67条。6个品种具有特异性的扩增带，可作为种质鉴定的依据。根据ISSR扩增结果建立的UPGMA聚类图，在距离系数约0.1处可把供试的17份菠萝种质分为3大类。同时对供试品种的遗传关系进行了探讨     

应用ISSR分子标记绘制红麻种质资源DNA指纹图谱

以6份红麻种质资源为材料, 对UBC807~UBC80等80个ISSR引物进行筛选, 筛选出多态性好的ISSR引物20个。利用这20个ISSR引物扩增来自国内外84份红麻种质资源, 共获得230条谱带, 平均每个引物扩增出11.5条谱带, 其中多态性谱带185条, 多态性条带比率为80.43%, 表明供试的红麻种质资源遗传多样性较丰富。以供试84份红麻种质资源的ISSR扩增谱带为基础, 建立了供试材料扩增条带指纹数据库的Excel文件。根据指纹图谱唯一性原则, 采用自行开发的DNA指纹数据分析软件, 再从20个多态性好的ISSR引物中遴选出UBC 813、UBC 825、UBC 836、UBC 888和UBC 889引物, 绘制出82个红麻种质资源的DNA指纹图谱, 为红麻种质资源分子身份证的构建奠定了基础。     

红叶桃种质资源的RAPD分析

利用RAPD技术，采用筛选的22个随机引物对9个红叶桃类型的基因组DNA进行扩增，通过扩增位点的谱带的聚类，分析供试红叶桃的系统发育，并运用特殊谱带，建立了红叶桃的分子检索表，提出了重点保存的红叶桃种质有筑波3号、筑波6号和洛格红叶。     

中国江、浙地区栽培大麦遗传资源的RAPD研究

采用随机扩增多态性（RAPD）标记，探讨了我国部分栽培大麦品种的遗传背景。结果表明：200个随机引物中，有30个引物扩增出的产物具有多态性，30个引物共扩增出223条谱带，其中130条谱带具有多态性，每个引物可扩增出2~9条多态性谱带，平均4.19条。67个大麦品种平均表型多样性值0.369，裸麦的表型多样性高于皮麦的表型多样性     

扶芳藤遗传多样性RAPD鉴定及类型划分研究

利用RAPD标记技术对56份扶芳藤、3份大叶黄杨和1份胶东卫矛材料进行遗传多样性分析，筛选出35个引物扩增出205条稳定、清晰、可重复的DNA片段，其中32个引物扩增出100条带具有多态性，其多态性频率48.78%；不同引物及不同位点谱带所揭示的扶芳藤遗传差异较大，其遗传多样性指数分布范围为0.0331~0.8904；根据引物L04和U12扩增的RAPD带型和以遗传距离进行聚类分析结果可明显地区分扶芳藤与大叶黄杨、冬季全部落叶的与冬季不落或部分落叶的扶芳藤类型、从我国收集的扶芳藤资源与从捷克和美国引入的3个品种；同时聚类分析还可区分我国东南沿海地区与其他地区收集扶芳藤资源。     

不同来源黄瓜遗传亲缘关系的RAPD分析

用RAPD技术对黄瓜基因组DNA进行多态性研究，分析了39份黄瓜材料的遗传差异。结果表明，所采用的172条随机引物中，有49条引物扩增谱带清晰且重复性较好，扩增总片段数达378个，单个引物的扩增片段数在4～12之间，片段大小在0．2～3．5kb之间。不同材料间的遗传距离(D)在0．064～0．592之间，并根据遗传距离，按UWPGA法进行了聚类分析。     

基于RAPD技术分析花椰菜种质资源遗传多样性

【研究目的】为了解花椰菜种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为花椰菜育种提供理论基础,本研究采用RAPD技术对37份花椰菜种质资源的遗传多样性进行了分析;【结果】从80条随机引物中筛选出6条随机引物,6条引物扩增获得的总谱带数为38条,多态性谱带数为13条,多态性谱带比例为34.2%,利用随机引物S17对花椰菜的遗传多样性进行分析,发现当遗传距离为0.41时,可将花椰菜种质资源分为4类;【结论】花椰菜的遗传多样性与地理种质资源的地理来源及生育期关系不大,部分不同地区的品种相互交织在一起,这可能是由于地区间的品种互引造成的,有些品种地理近源但亲缘关系较远,有些品种地理远源但亲缘较近。     

Polymorphism and DNA markers for asparagus cultivars identified by random amplified polymorphic DNA

Summary DNA polymorphism among five Asparagus officinalis L. cultivars-Imperial, Snow, Steline, UC-157 and Larac, as detected by random amplified polymorphic DNA (RAPD), is reported. Thirty one decamer primers were tested. and twenty six of them yielded amplification products. Fourteen primers gave products with at least one polymorphic DNA fragment. Among a total of 119 amplified fragments 33 were polymorphic. These RAPD markers enabled the identification of asparagus cultivars. Unique markers for cultivars were: Snow-bands 475 bp, 772 bp, 412 bp, 935 bp and 820 bp amplified by primers D5, OPA-07, OPA-09, OPA-10 and OPA-18, respectively. Steline-bands 645 bp, 680 bp and 997 bp amplified by primers A32, OPA-03 and OPA-09, respectively. A band 903 bp, amplitied by primer OPA-12, is a marker for Imperial, and a band 420 bp, amplified by primer D52, is a marker for Larac. Cultivar UC-157 could be identified by a combination of shared polymorphic bands. The pairwise marker difference between cultivars ranged from 0.08 to 0.17. A phenogram of the genetic relationship based on RAPD fits with the known origin of the cultivars.     

梨种质资源遗传多样性研究中的RAPD技术引物筛选

以梨属44个种和品种为试验材料,利用RAPD技术从50个随机引物中筛选出18个多态性引物,用于梨种质资源遗传多样性研究。结果表明：所选出的多态性引物每个引物扩增出的条带数在4—11之间,扩增出的DNA片段分子量大多在450bp—2000bp之间,共扩增出118个条带,其中样品间相同的条带数有11条,呈现多态性的条带107条,多态百分率达90.8%。     

Genetic diversity and relationships among pea cultivars revealed by RAPDs and AFLPs

In order to obtain an overview of the genetic diversity present within the set of pea cultivars released in Germany, 21 cultivars were analysed at the DNA level by random amplified polymorphic DNAs (RAPDs) and amplified fragment length polymorphisms (AFLPs), as well as for agronomic traits. Yield of grain cultivars ranged from 2.95 to 3.87 t/ha. Based on the screening of 60 RAPD primers and 32 Eco RI + 3/Mse I+3 AFLP primer combinations, 20 RAPD primers and 11 Eco RI + 3/MseI+ 3 primer combinations generating polymorphic and distinct fragments were chosen for estimation of genetic diversity. Twenty RAPD primers amplified a total of 314 scorable bands ranging from about 262 bp to 1996 bp. Of these, 175 fragments (55.7%) were polymorphic. Based on these data, genetic similarity (GS) was estimated between 0.80 (‘Lisa’ vs.‘Grapis’) and 0.94 (‘Bohatyr’ vs. ‘Sponsor’; mean GS = 0.88). Eleven AFLP primer combinations led to the amplification of 949 scorable fragments ranging from 43 to 805 bp and of these, 462 (48.7%) were polymorphic. Genetic similarity based on AFLPs was calculated between 0.85 (‘Lisa’ vs.‘Laser’) and 0.94 (‘Bohatyr’ vs. ‘Sponsor’, mean GS = 0.90). Correlation of genetic similarity estimated on RAPDs and AFLPs was estimated at r = 0.79** using Spearman's rank correlation coefficient and at r = 0.84 by the Mantel test, respectively. UPGMA cluster analysis carried out on these data separately for RAPDs and AFLPs and on the combined data reflected, to some extent, pedigree relationships and cophenetic correlations (r = 0.89 for RAPDs, r = 0.88 for AFLPs, and r = 0.93 RAPDs + AFLPs) indicate a good fit of respective clusters to genetic similarity data. The correlation of cluster analyses to pedigree information and the impact on parental genotype selection is discussed.     

相关序列扩增多态性(SRAP)一种新的分子标记技术

SRAP是一种新的DNA分子标记，具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP是一种基于PCR技术的新的分子标记技术，其利用独特的引物设计对ORFs进行扩增，上游引物长17bp，对外显子进行特异扩增，下游引物长18bp，对内含子区域、启动子区域进行特异扩增，因个体不同以及物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。扩增产物用变性的聚丙烯酰胺凝胶分离，然后用放射自显影检测。本文在阐述SRAP的原理和流程后，详细论述了SRAP标记目前在植物遗传图谱构建、遗传多样性、基因定位、比较基因组学、杂种优势预测等方面的研究进展及应用前景。     

木豆种质资源遗传多样性的分析

为探讨木豆的遗传多样性,应用RAPD技术对15个木豆（Pigeonpea）种质资源进行了分析。从大量的引物中筛选出了27个多态性较高的随机引物,共扩增出176条带,其中多态带为104条（占56.24%）。对这些引物的扩增带谱进行数据转化后,通过SPSS13.0软件对15个木豆种质资源进行聚类分析,根据聚类结果可将15个木豆种质资源分为6大类。同时,对田间种植的15个木豆种质资源进行生物学性状的观察记载。经过比较分析可以看出,从DNA水平上对木豆种质资源的聚类结果与其生态类型以及生物学性状之间具有较高的吻合度。本试验结果为开发利用木豆种质中的有利遗传资源提供了参考资料。