利用EST-SSR标记构建中国老芒麦品种DNA指纹图谱及种质遗传多样性

本研究利用EST-SSR分子标记,对国内的52份老芒麦(Elymus sibiricus)材料进行遗传多样性的研究,并构建了7个老芒麦品种及栽培材料的DNA指纹图谱。20对EST-SSR引物共产生204个条带,平均每对引物扩增出10.2条带,176(86.27%)条带为多态性条带,表明供试材料具有较高水平的多态性。同时,引物Elw404和Elw195构建的指纹图谱较为容易地将品种和栽培材料与其他材料区别开。分子方差分析(AMOVA)表明,老芒麦地理区域内(73.94%)的遗传变异远高于地理区域间(26.06%)。结构分析将52份材料分为5组,主成分分析(PCoA)结果与之相似。与品种及栽培材料相比,野生材料具有更高的遗传多样性[多态性条带数(NPB)为174,多态性百分比(PPB)为85.29%,香农多样性信息指数(I)为0.296 6,Nei’s基因多样性(H)为0.179 8,观察等位基因数(Na)为1.852 9],可作为重要的遗传资源用于后续的育种工作。本研究结果表明,EST-SSR分子标记可以有效地评价老芒麦种质遗传多样性及进行品种鉴定。研究结果为制定老芒麦种质原位和非原位保护策略提供参考。     

利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱

在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱.筛选出36个RAPD引物,8个SSR引物和12个ISSR随机引物,通过PCR扩增在55个国内外苜蓿品种(系)中获得了182个RAPD多态性位点和丰富的SSR和ISSR多态性位点,构建了55个苜蓿品种(系)的SSR、ISSR和RAPD指纹图谱.结果表明,不同苜蓿品种(系)的SSR多态性有较大差异;苜蓿品种ISSR指纹图谱多态性丰富,稳定性比RAPD强;可以通过2～3个引物鉴别我国主要苜蓿品种和引进品种,SSR和ISSR指纹图谱可以更好地用于苜蓿品种鉴定和遗传多样性分析.     

基于EST-SSR及SRAP标记构建苦荬菜品种(系)DNA指纹图谱

苦荬菜是优良的一年生菊科青饲牧草,为构建苦荬菜品种(系)DNA指纹图谱,筛选出24对EST-SSR引物、32对SRAP引物组合构建指纹图谱。24对EST-SSR多态性引物对收集的14份苦荬菜品种(系)共扩增出270个清晰条带,多态性条带223个, PIC均值0.834,基因多样性指数变幅为0.2464~0.4288,Shannon指数变幅为0.3597~0.6148,可区分品种3~14个;32对SRAP引物检测到多态性条带367个,PIC均值0.826,基因多样性指数变幅为0.2006~0.3898,Shannon指数为0.3167~0.5716,可区分品种2~12个。7个引物在9个品种(系)上能扩增出特征谱带,综合各项遗传多样性指标筛选出IpSSR102、IpSSR80、IpSSR91、Me10+Em5、Me9+Em17,共5个核心引物的40个多态性条带构建苦荬菜品种(系)DNA指纹图谱,每个品种(系)都有一个特异分子身份指纹编码。     

地方鸡种微卫星DNA指纹图谱的建立与应用

品种资源是遗传多样性的载体，是遗传育种的重要基础。我国所拥有的地方鸡种资源在世界上是独一无二的，有的品种还具有独特的基因类型。既有体型较小的茶花鸡、藏鸡，也有体型较大的大骨鸡；既有丝毛乌皮乌肉乌骨具有药用保健功能的丝羽乌骨鸡，也有用于观赏娱乐的斗鸡；     

柱花草DUS测试标准品种DNA指纹图谱构建

为建立柱花草(Stylosanthes spp.)DUS测试标准品种DNA指纹图谱数据库,实现柱花草品种的快速、准确鉴定,利用筛选到的25个SSR标记对15份柱花草DUS测试标准品种进行了遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建。结果表明,25个SSR标记共产生132个等位基因,每个标记可产生3~9个等位基因,平均5.280个;各SSR标记的多态性信息含量为0.393~0.847,平均为0.638。利用这25个SSR标记构建的指纹图谱能有效区分15份柱花草DUS标准品种,并为每份标准品种建立了QR二维码图谱,为SSR标记技术在柱花草DUS测试中的应用提供依据。     

两个家系猪的DNA指纹图谱遗传分析

本文用人源小卫星探针３３．６和３３．１５获得了两个家系猪的ＤＮＡ指纹图谱。通过对Ｆ１和Ｆ２代家系分析，证实ＤＮＡ指纹图带以孟德尔方式遗传。在家系２（探针３３．６）的１个后代中发现了一条新突变带。文中还对这两个探针检测到的位点数进行了估测     

DNA指纹图谱法在动物遗传分析中的应用及操作方法

ＤＮＡ指纹图谱法在动物遗传分析中的应用及操作方法黄晓东，徐士清，王维洪（浙江省农业科学院畜牧兽医研究所）１ＤＮＡ指纹图谱法（ＤＮＡｆｉｎｇｅｒｐｒｉｎｔｉｎｇ）的基本概念在真核生物的染色体基因组中普遍分布着一些高可变区（ＨｙｐｅｒｖａｒｉａｂｌｅＲｅ...     

狗牙根诱变后代生长速度评价及DNA指纹图谱构建

狗牙根(Cynodon dactylon)是一种常见的暖季型草,利用诱变技术处理现有品种进行改良,是快速选育优良新品种的一种途径。本研究以国审品种‘阳江’狗牙根通过⁶⁰Co-γ辐射处理获得的12个诱变后代为材料,进行生长速度评价和基于序列相关的扩增多态性(SRAP)分子标记技术的DNA指纹图谱构建。结果表明,诱变后代间匍匐茎总长度、地上部分干重、匍匐茎数量、地下部分干重等4个指标均存在显著的变异。对这4个指标进行隶属函数分析,对诱变后代的生长速度进行综合评价,认为其生长速度由快到慢依次为M37>M16>M1>M25>M10>M18>M28>M29>M26>‘阳江’>M22>M31>M4。利用12对SRAP引物对12个诱变后代和6个狗牙根主栽品种进行指纹图谱构建,其中7对引物组合可以直接对18份参试材料进行准确鉴定。本研究为进一步国产狗牙根新品种的选育和保护提供了可靠的实验依据。     

苜蓿假盘菌ISSR反应体系优化及指纹图谱构建

以北京苜蓿假盘菌(Pseudopeziza medicaginis (Lib.) Sacc.)菌株为试材,用ISSR-23引物[序列为(AC)8T]研究PCR反应体系的主要成分及退火温度对假盘菌ISSR扩增的影响,以期为苜蓿假盘菌的深入研究奠定基础。结果表明:Primer、Mg²⁺、Taq酶和dNTP浓度对扩增均有影响,以Primer影响最为明显;优化的反应体系为:20μL反应体系中含0.1 ng模板DNA,2.0mmol/L MgCl₂、0.5μmol/L Primer、1U Taq DNA聚合酶、0.2 mmol/LdNTP,2μL 10×PCR Buffer和2.5%去离子甲酰胺;在此基础上,建立6个不同地理来源苜蓿假盘菌菌株的指纹图谱并分析其亲缘关系;对44条ISSR引物进行筛选,22条可产生清晰稳定的多态性条带,其中16条可将6个供试菌株完全分开,建立了苜蓿假盘菌指纹图谱;经聚类分析,在0.55遗传相似水平下,6个供试菌株分为两个遗传谱系,菌株的遗传谱系与其地理来源之间不表现相关性。     

SR92A系黄羽肉鸡与萧山鸡及其杂种后代的DNA指纹分析

本文以EAV(禽内源性反转录病毒片段 )为探针 ,EcoRI为限制性内切酶 ,对萧山鸡、SR92A系及其杂交后代进行了DNA指纹图谱的研究。结果表明 :EAV探针适合于鸡的DNA指纹分析 ,能产生清晰可辩的图谱。平均条带总数为11.384± 0 .84 4 ,两品种间、公母间条带总数均无显著差异。萧山鸡和SR92A系品种内相似系数分别为 0 .5 81、0 .5 11,高于品种间相似系数 (0 .2 31)。杂交后代相似系数为 0 .30 1。     

海南食用槟榔资源筛选研究

本研究对海南10份槟榔干果类型进行品质性状测定及评估检验评分,旨在筛选出不同功能用途的槟榔果类型。结果表明,10份槟榔干果纵径、横径及单果重变异范围较小,而化学成分组成变异范围较大,特别是多酚类物质含量,具有丰富的遗传多样性。采用评估检验法评价不同干果类型,表明椭圆形果综合评分较高,商品指标符合加工优品标准,其次为长椭圆形果、卵形果等,近圆形果和枣形果综合评分较低,不适用于加工干果。但枣形果具有多酚类物质含量高、槟榔碱含量低的特点,是开发保健品和鲜果嚼食的理想材料。     

利用ISSR分子标记构建山东、河北省区鲁桑地方品种核心种质

开展桑树核心种质的研究有利于高效保存和利用桑树种质资源。根据15个ISSR引物扩增的98个ISSR分子标记的聚类结果和树状图,对来自山东、河北省区的46份鲁桑地方品种资源采用逐步聚类随机取样法选择核心种质,比较了样本数不同的4个核心样本群的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei s遗传多样性指数和Shannon s信息指数等参数,最终选择了由11个样本组成的样本群作为核心种质。用统计软件SPSS对初始种质和核心种质群体的观测等位基因数、有效等位基因数、Nei s遗传多样性指数和Shannon s信息指数分别作t检验,可以看出核心种质虽然仅保留了初始种质23.91%的样品,但上述各参数在初始种质中的保有率分别为89.02%、89.03%、95%、102.24%、103.99%、101.26%,表明构建的核心种质能够代表初始种质。     

家畜多位点DNA指纹的研究及应用

本文介绍了ＤＮＡ指纹的概念、遗传特性、分子基础和ＤＮＡ指纹的制备技术。概述了家畜ＤＮＡ指纹的研究概况和成果,研讨了ＤＮＡ指纹在家畜遗传育种中应用的前景和可能性。     

新浦东鸡DNA指纹的随机扩增多态分析

利用随机扩增多态DNA指纹分析技术,由12个随机引物中筛选出3个具有多型的引物对28只新浦东鸡的基因组DNA指纹进行研究.结果表明3个引物共扩增出27条DNA片段,多型条带24条,其多型频率为0.593;其中H05引物扩增出DNA片段7条,其多型频率为0.259,G04引物扩增出DNA片段11条,其多型频率为0.408;V15引物扩增出DNA片段9条,其多型频率为0.333,3个引物扩增的DNA片段长度为489～1940bp.各位点的片段共享度分别是0.856,0.716和0.674;杂合度为0.549,0.695和0.727;平均百分差异为0.144,0.284和0.326;平均百分差异均值为0.251.     

分子标记技术构建DNA指纹图谱在个体识别中的应用

20世纪80年代出现的DNA指纹技术为个体的身份鉴定提供了一个精确的方法,已在法医学、亲子鉴定等方面得到了广泛的应用。而DNA分子标记技术自建立以来,相继被广泛地应用于评估遗传多样性以及个体识别、亲子鉴定等方面。本文综述了利用DNA分子标记技术构建DNA指纹图谱,进行人类或动物个体识别的原理、概念、分析方法、研究进展与存在的问题及其应用前景。     

基于最适取样策略的老芒麦种质指纹图谱构建及遗传多样性分析

利用EST-SSR分子标记,基于最适取样策略构建了 15份老芒麦种质的DNA指纹图谱,并对其遗传多样性进行了评价.结果显示,16对引物扩增出的条带多态信息含量变化范围为0.0457(Ps569)～0.4667(Elw1468s087),表明15份老芒麦材料具有较丰富的遗传多样性.其中,甘南老芒麦种群遗传多样性最丰富(H...     

DNA指纹图与生化指标分析对近交系小鼠遗传检测的比较

采用JL-02多位点探针对来自北京和西安地区的5个BALB/c群、2个BALB/c-nu/nu群、4个C57群、1个CBA/N群和1个DBA/2群近交系小鼠进行了DNA指纹图分析,并与常规生化标记分析法进行了比较.结果显示,DNA指纹图的图带教均为17～22条,具有良好的多态性.生化标记分析中Hbb位点显示异常的BALB/c及BALB/c-nu/nu小鼠与其同群体正常小鼠的DNA指纹图有较大差异,2个体之间的相似系数(F)及共有带率(X)均在0.8以下,完全相同DNA指纹图的概率(P)均在1.3×10-2以下;生化标记分析未见异常的群体内,DNA指纹图基本一致,P＞2.2×10-1.DNA指纹图显示,不同单位的同一品系间存在一定差异,其F及X均在0.8以下,P＜1.1×10-3.不同品系间DNA指纹图的F及X相差较大,均在0.4以下,P=2.7×10-10.BALB/c群与BALB/c-nu/nu群间DNA指纹图的F和X在0.65以下,P=3.8×10-6.同一动物的基因组DNA,经不同次实验所得出的DNA指纹图基本一致.2种方法比较表明,DNA指纹图在动物遗传检测中比生化标记分析有较大的优势,它不但能确切地反映生化标记分析显示的异常动物的遗传变化,而且还检出了生化标记分析未能检出的动物遗传变异,因此更加灵敏.DNA指纹图能反映出动物个体间、群体间及品系间的变异程度、亲缘关系及遗传距离,这是生化标记分析无法比拟的.