Nuclear mitochondria?

Recognizable mitochondria were detected in the nucleus of a leukemic cell. It is suggested that passage through enlarged nuclear pores, incorporation within a pinched off invagination, or inclusion within the nuclear envelope at telophase may have been responsible for this unusual event.     

动物双歧杆菌AD011细胞壁蛋白的预测和功能分析

[目的]运用生物信息学方法预测动物双歧杆菌AD011锚定于细胞壁的蛋白并进行功能分析,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制提供基础资料。[方法]用Phobius和SignalP 4.0软件对动物双歧杆菌AD011全基因组编码蛋白中细胞壁蛋白进行预测,同时采用COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]动物双歧杆菌AD011基因组1 518个编码蛋白中,11个蛋白含有细胞壁的锚定基序,6个蛋白含有LP×TG基序,1个蛋白含有Lys M基序,1个蛋白含有PG结合区域,2个蛋白含有SLH结构域,1个蛋白含有NLPC_P60结构域。细胞壁蛋白功能分析结果显示,11个细胞壁蛋白中,9个蛋白没有功能注释,2个蛋白(NLP/P60 protein和1,4-beta-N-acetylmuramidase)参与细胞壁和细胞膜的生物合成。[结论]动物双歧杆菌AD011大多数细胞壁蛋白功能未知,还需在以后的研究中进行进一步的功能注释。     

Inhibition of lymphocyte proliferation by a synthetic peptide homologous to retroviral envelope proteins

The retroviral transmembrane envelope protein p15E is immunosuppressive in that it inhibits immune responses of lymphocytes, monocytes, and macrophages. A region of p15E has been conserved among murine and feline retroviruses; a homologous region is also found in the transmembrane envelope proteins of the human retroviruses HTLV-I and HTLV-II and in a putative envelope protein encoded by an endogenous C-type human retroviral DNA. A peptide (CKS-17) was synthesized to correspond to this region of homology and was examined for its effects on lymphocyte proliferation. CKS-17 inhibited the proliferation of an interleukin-2-dependent murine cytotoxic T-cell line as well as alloantigen-stimulated proliferation of murine and human lymphocytes. Four other peptides, representing different regions of virus proteins, were inactive. These results suggest that the immunosuppressive portion of retroviral transmembrane envelope proteins may reside, at least in part, in a-conserved sequence represented by the CKS-17 peptide.     

两歧双歧杆菌PRL2010细胞壁蛋白预测和功能分析

[目的]运用生物信息学方法预测两歧双歧杆菌PRL2010锚定于细胞壁的蛋白和功能分析,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制奠定基础。[方法]用Phobius和Signal P 4.0软件对两歧双歧杆菌PRL2010全基因组编码蛋白中细胞壁蛋白进行预测,同时采用COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]两歧双歧杆菌PRL2010基因组1 706个编码蛋白中,28个蛋白含有细胞壁的锚定结构域。细胞壁蛋白功能分析结果显示,28个细胞壁蛋白中,21个蛋白没有功能注释,7个蛋白有功能注释,其中1个蛋白(exo-alpha-sialidase)参与碳水化合物代谢与转运,2个蛋白(bacteriophage endolysin和cell wall-associated protein)参与细胞壁和细胞膜的生物合成,2个蛋白(hypothetical protein BBPR_0440和Subtilisin family peptidase)参与蛋白质翻译后修饰,1个蛋白(beta-n-acetylhexosaminidase Nag Z)参与细胞内运输、分泌和囊泡运输,1个蛋白(metallophosphoesterase)功能只是预测的。[结论]两歧双歧杆菌PRL2010的大多数细胞壁蛋白功能未知,还需要在以后的研究中进一步分析和注释。     

Membrane Continuity between Plasmalemma and Nuclear Envelope in Spermatogenic Cells of Blasia

Ultrastructural study of liverwort antheridia showed that the spherical nuclei of some late-stage androgonial cells lie close to or appressed to the cell walls. In some cells the outer membrane of the nuclear envelope curves toward the wall and continues without interruption around the cell periphery as the plasmalemma. Subject to its confirmation as a natural occurrence, this evidence appears to support Robertson's concept of cellular organization.     

扩张蛋白(Expansin)研究进展

扩张蛋白是一类细胞壁酶蛋白,能够通过打断细胞壁多聚物之间的氢键诱导酸依赖的细胞壁延展和压力松弛。其由两类多基因家族编码,分别命名为α-expansin、β-expansin,每类扩张蛋白基因家族又有很多的基因成员。扩张蛋白已在不同的种属植物中被鉴定存在,并且大量的扩张蛋白基因被克隆。研究表明:每一个扩张蛋白基因在高度特定的位点和高度特定的细胞类型中表达,其表达在时间、空间上受到严格的调控且受到激素和环境因子的调控。目前认为扩张蛋白几乎参与了植物的整个发育过程:除具有增大细胞的功能外,扩张蛋白在细胞生长、种子萌发、根毛形成、根系生长、叶原基形成、叶子生长发育、果实成熟、器官脱离,以及花粉管生长方面起着重要的作用。就此最新研究进展,作一综合阐述。     

Virus-specific splicing inhibitor in extracts from cells infected with HIV-1

Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1), in contrast with most other retroviruses, encodes trans-regulatory proteins for virus gene expression. It is shown in this study, by means of an in vitro splicing system, that nuclear extracts obtained from cells infected with HIV-1 contain a factor (or factors) that specifically inhibits splicing of a synthetic SP6/HIV pre-messenger RNA (pre-mRNA)-containing donor and acceptor splice sites in the coding region for the envelope protein. It is also shown that the SP6/HIV pre-mRNA is not capable of assembly in a ribonucleoprotein complex, spliceosome, in extracts from infected cells. These findings raise the possibility that specific inhibition of pre-mRNA splicing in the envelope protein coding region by HIV-1 trans-regulatory factors might be one control mechanism for efficient production of structural viral proteins and virion assembly.     

鼠李糖乳杆菌LGG细胞壁蛋白的预测和功能分析

[目的]采用生物信息学方法预测鼠李糖乳杆菌LGG细胞壁蛋白和功能分析。[方法]以鼠李糖乳杆菌LGG基因组编码蛋白序列为研究对象,采用Phobius和Signal P 4.0软件分析该菌株的细胞壁蛋白,同时采用COG功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能分析。[结果]鼠李糖乳杆菌LGG基因组中含有41个细胞壁蛋白,这些蛋白的功能分析结果显示,41个细胞壁蛋白中,25个蛋白没有功能注释,16个有功能注释,主要与细胞壁和细胞膜的生物合成,碳水化合物的代谢与转运,蛋白质的翻译后修饰等功能有关。[结论]该研究从结构和功能上分析鼠李糖乳杆菌细胞壁蛋白,为分析益生菌适应环境的分子特征打下基础。     

变异链球菌UA159细胞壁蛋白的预测和功能分析

[目的]对变异链球菌UA159细胞壁蛋白进行预测和功能分析,为后续研究该菌致病机制奠定基础。[方法]用Phobius和Signal P 4.0软件预测变异链球菌UA159的细胞壁蛋白,并采用COG功能数据库对细胞壁蛋白进行功能注释。[结果]变异链球菌UA159共含有22个细胞壁蛋白,其中含有LPx TG锚定基序的有12个,含有Lys M基序的有3个,含有CW基序的有5个,含有GW基序的有1个,含有PG锚定基序的有1个。功能分析结果显示,22个细胞壁蛋白中有18个蛋白没有具体的功能注释,4个蛋白有具体的功能注释,其中beta-lactamase与防御机制功能有关;exo-beta-D-fructosidase与碳水化合物代谢与转运有关;分子伴侣蛋白ATP-dependent protease Clp E与蛋白质翻译后修饰和蛋白质折叠有关;cell wall-associated protein Wap A与细胞壁和细胞膜的生物合成有关。[结论]变异链球菌UA159全基因组大多数的细胞壁蛋白功能未知,需在以后研究中进行进一步的功能注释。     

Processive movement of MreB-associated cell wall biosynthetic complexes in bacteria

The peptidoglycan cell wall and the actin-like MreB cytoskeleton are major determinants of cell shape in rod-shaped bacteria. The prevailing model postulates that helical, membrane-associated MreB filaments organize elongation-specific peptidoglycan-synthesizing complexes along sidewalls. We used total internal reflection fluorescence microscopy to visualize the dynamic relation between MreB isoforms and cell wall synthesis in live Bacillus subtilis cells. During exponential growth, MreB proteins did not form helical structures. Instead, together with other morphogenetic factors, they assembled into discrete patches that moved processively along peripheral tracks perpendicular to the cell axis. Patch motility was largely powered by cell wall synthesis, and MreB polymers restricted diffusion of patch components in the membrane and oriented patch motion.     

棉花纤维品质改良相关基因研究进展

棉纤维是优良的、使用最为广泛的天然纤维。随着人们生活水平的提高,对天然纯棉织物的需求不断增加,同时对品质的要求也愈来愈高。因此,提高棉纤维产量和品质成为当前棉花遗传育种的重要目标,对棉纤维发育相关基因的克隆与功能研究是实现这一目标的重要基础。棉纤维发育由4个明显但又重叠的时期组成,包括纤维细胞的起始、伸长(初生壁合成)、次生壁合成和脱水成熟。起始是影响纤维细胞数量的重要时期,而纤维长度和强度的决定发生在次生壁合成期和脱水成熟期。棉纤维发育是一个复杂而有序的过程,由大量的基因参与调控。目前,已经有一些在棉纤维发育过程中发挥重要作用的基因被报道,包括各种转录因子、参与激素代谢基因、编码细胞壁蛋白和细胞骨架蛋白基因、活性氧代谢相关基因、以及参与糖和脂类代谢的基因等。文中对已报道的这些与棉花纤维发育相关基因的克隆和功能分析进行了系统总结,以期为棉花纤维发育及品质改良研究提供参考。     

宁夏枸杞果实细胞壁蛋白适宜提取方法研究

【目的】探索适合宁夏枸杞果实细胞壁蛋白提取方法,为后续进行宁夏枸杞蛋白质组学研究提供技术支持。【方法】以宁夏枸杞果实为试验材料,采用六步洗脱法去除胞浆蛋白,然后通过定量和电泳比较氯化钙提取法、氯化锂提取法、氯化钙加氯化锂结合提取法和苯酚提取法对细胞壁蛋白的提取效果,通过双向电泳与液相色谱对所得细胞壁蛋白进行验证。【结果】六步洗脱法可较好地除去胞浆蛋白与其他干扰物质,4种方法对宁夏枸杞果实细胞壁蛋白的提取效果排序为:氯化钙提取法（272μg/g）>苯酚提取法（261μg/g）>氯化钙加氯化锂结合提取法（217μg/g）>氯化锂提取法（176μg/g）。裂解液I[7 mol/L尿素、2 mol/L硫脲、30 g/L 3-[3-（胆酰胺丙基）二甲氨基]丙磺酸内盐（CHAPS）、50 g/L二硫苏糖醇（DTT）]溶解蛋白质效果更优,蛋白质定量浓度更高、电泳条带更多、更清晰。氯化钙提取所得蛋白质样品双向电泳结果较好,蛋白质点数较多、清晰度和分辨率较高;通过液相色谱可看出氯化钙提取的细胞壁蛋白肽段种类多,且大部分相对丰度较高,并含有低丰度蛋白质。所测蛋白质分类中有细胞壁定位的蛋白质。【结论】氯化钙单独提取蛋白质样品的方法是宁夏枸杞果实细胞壁蛋白提取最优方法,所得蛋白质样品已达到进行蛋白质组学研究的标准。     

动物双歧杆菌AD011暴露外表面蛋白的种类和功能分析

[目的]分析动物双歧杆菌AD011暴露外表面蛋白的种类和功能,有助于了解该菌株的各项生理功能以及为探讨该菌与宿主相互作用的分子机制奠定基础。[方法]以动物双歧杆菌AD011基因组序列为研究对象,采用Inmembrane方法和COG功能数据库对预测的外表面蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]AD011菌体暴露外表面蛋白数目为193个,包括11个细胞壁蛋白、20个脂蛋白、暴露外表面的膜蛋白140个、22个细胞外蛋白。AD011外表面蛋白的功能分析结果显示,193个外表面蛋白中,含有较大比例的蛋白没有功能注释(78个),115个蛋白具有COG功能注释。在有功能注释的蛋白中,所占比例较大的是氨基酸转运与代谢(16个),无机离子转运与代谢(14个),细胞壁、细胞膜生物合成(13个),碳水化合物转运与代谢(10个),防御机制(10个)等有关蛋白。[结论]AD011菌体外表面蛋白与营养物质的吸收和转运,细胞壁、细胞膜生物合成,防御机制有关。     

植物细胞壁蛋白质提取方法的改进

以玉米黄化苗的中胚轴为材料,利用盐分级分离细胞壁蛋白质.主要做了2点改进:1)利用超声波破碎植物组织细胞;2)增加苯酚抽提步骤除去可溶性细胞质蛋白、细胞壁蛋白质的回收及脱盐.整个过程不涉及过柱层析和透析步骤,因而缩短了提取时间,提高了细胞壁蛋白质的产率.     

Sequence of the envelope glycoprotein gene of type II human T lymphotropic virus

The sequence of the envelope glycoprotein gene of type II human T lymphotropic virus (HTLV) is presented. The predicted amino acid sequence is similar to that of the corresponding protein of HTLV type I, in that the proteins share the same amino acids at 336 of 488 residues, and 68 of the 152 differences are of a conservative nature. The overall structural similarity of these proteins provides an explanation for the antigenic cross-reactivity observed among diverse members of the HTLV retrovirus family by procedures that assay for the viral envelope glycoprotein, for example, membrane immunofluorescence.     

两歧双歧杆菌PRL2010菌体外表面蛋白的功能分析

[目的]分析两歧双歧杆菌PRL2010菌体外表面蛋白的功能。[方法]以两歧双歧杆菌PRL2010基因组序列为研究对象,采用Perry等人分析革兰氏阳性菌菌体外表面蛋白(PSE蛋白)的Inmembrane方法,同时采用COG功能数据库对预测的外表面蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]PRL2010外表面蛋白包括28个细胞壁蛋白、12个脂蛋白、182个细胞膜蛋白、38个分泌蛋白。PRL2010外表面蛋白的功能分析结果显示,大多数外表面蛋白与细胞壁、细胞膜的生物合成,无机离子转运与代谢,防御机制,碳水化合物转运与代谢,氨基酸转运与代谢等有关。[结论]该研究可为探讨该菌与宿主相互作用的分子机制奠定基础。     

番茄和马铃薯扩展蛋白研究进展

扩展蛋白（expansins）是植物细胞壁中特有的一类蛋白,在植物体内的作用是缓释细胞壁结构网中的张力,使细胞壁变得松弛,在果实的生长发育、株节间生长中起着极为重要的作用,是一个庞大的基因家族。主要介绍了番茄和马铃薯中扩展蛋白的研究进展及扩展蛋白在植物抗逆中的功能,并指出将来马铃薯和番茄扩展蛋白的研究方向。     

植物富含甘氨酸蛋白质(GRP)及其基因研究进展

植物富含甘氨酸蛋白质(GRP)是广泛存在于植物细胞壁上的一种重要结构蛋白,GRP基因的表达具有组织特异性并受发育阶段特异性及多种环境因素的调控.GRP基因的研究为植物基因的表达调控研究提供了一个良好的模式.植物GRP根据其结构主要可分为两大类:一类具有信号肽序列,一类具有RNA结合序列.文章主要介绍GRP序列和结构特征、表达调控、细胞定位及对其功能的预测分析.