圈养高山兀鹫肠道微生物分离、鉴定与抗生素耐药性分析

高山兀鹫(Gyps himalayensis)是国家Ⅱ级保护鸟类,被世界自然保护联盟(IUCN)列入濒危物种红色名录。本试验对圈养高山兀鹫粪便细菌进行分离与培养、16S rRNA基因扩增与测序、细菌耐药性测试。经鉴定,分离出的菌株隶属于2门、8属、9种,分别是弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)、太平洋芽孢杆菌(Bacillus pacificus)、粪肠球菌(Enterococcus faecalis)、蜂房哈夫尼亚菌(Hafnia alvei)、豪氏变形杆菌(Proteus hauseri)、普通变形杆菌(Proteus vulgaris)、腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)、运动肉杆菌(Carnobacterium mobile)、福氏志贺氏菌(Shigella flexneri)。这9种菌株对3到11种不等的抗生素表现出耐药性。其中,运动肉杆菌、粪肠球菌和普通变形杆菌可耐受大多数的抗生素。福氏志贺氏菌可耐受的抗生素种类较少。本研究为圈养高山兀鹫的肠道微生物及其抗生素耐药性提供了相关数据,进一步为高山兀鹫的保护性人工养殖提供参考。     

中华鳖肠道及其养殖水体菌群比较

为了解养殖水体环境对中华鳖的影响,通过平板计数及细菌的分离鉴定,对健康鳖肠道、患病鳖肠道以及其养殖水体中菌群的数量、种类等进行比较分析。研究显示,病鳖肠道菌群总量(1.21×105)~(4.9×107)cfu·g-1,明显高于健康鳖的(3.2×104)~(7.13×105)cfu·g-1,且菌群种类较健康鳖多样;健康鳖肠道优势菌为肠球菌与柠檬酸杆菌,患病鳖肠道优势菌为柠檬酸杆菌、芽孢杆菌、气单胞菌;养殖水体中分离到的细菌均在病鳖肠道内分离到,从一定程度上反映了养殖环境对其肠道菌群的重要影响。     

鸡肠道乳酸菌的分离及其对肠道菌群的影响

从肉鸡肠黏膜上分离得到6株菌,均为G+菌,生理生化鉴定表明,S2为嗜酸乳杆菌,S4为德氏乳杆菌乳亚种,S6为德氏乳杆菌德氏亚种,S1,S3和S5为粪肠球菌。在肉鸡雏苗中投喂添加由S2,S4,S6制备的微生态制剂和土霉素,检测好氧性异养菌、鸡伤寒沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和乳酸菌的数量。结果表明,在投喂冻干菌粉后,在30 d后乳酸菌数量达到稳定并在肠道内定殖。同时,由于乳酸菌的抑制作用,肠道中的鸡伤寒沙门氏菌数量下降最明显。乳酸菌对鸡肠道的好氧性异养菌没任何影响。乳酸菌对鸡肠道菌群的影响与抗生素具有相近的效果。     

褐菖鲉肠道菌群初步分析

采用稀释定量方法,分别用TCBS、EMB、卵黄甘露醇高盐琼脂、肠道菌计数培养基、BBL、亚硫酸盐—多粘菌素—磺胺嘧啶、乳杆菌选择性培养基、厌氧琼脂8种培养基,分离并计数褐菖鲉(Sebastiscus marmoratus)肠道菌群的数量,挑选优势菌株进行细菌生化鉴定,初步分析褐菖鲉肠道正常菌群的分布情况。结果显示,褐菖鲉肠道厌氧菌的数量远远大于好氧菌,并以兼性厌氧菌为主。好氧菌中大肠菌群居多,弧菌不多见;厌氧菌中多见双歧杆菌。葡萄球菌数量稀少,未检测到产气荚膜梭菌。     

人工饲养大熊猫消化道正常菌群分离与鉴定研究

对陕西省珍稀野生动物抢救饲养研究中心的6只大熊猫肠道正常菌群的种类进行分离鉴定研究,结果鉴定出12种细菌,并对其进行了生化试验和致病性性试验,致病性性试验发现四联消化链球菌、鼠李糖乳杆菌、短乳杆菌、耐久肠球菌、两歧双歧杆菌对小白鼠无致病性,而面包杆菌、奇异菌及多黏芽孢杆菌可致小白鼠死亡。     

鸡肠道枯草芽孢杆菌的分离鉴定及生物特性研究

为研究和开发动物新型微生态制剂,最大程度的提高经济效益,改变抗生素滥用、药物残留等现状,从健康鸡肠道中分离出1株芽孢杆菌,并命名为W,且对其进行形态观察、生化试验鉴定和16S rRNA序列分析及同源性比较。结果表明,本菌株与Bacillus subtilis strain CICC 10023(GU980947.1)的同源性达99.5%,最终确定该菌株为枯草芽孢杆菌,对该菌株进行药敏试验和安全性试验。结果表明,该菌对青霉素、杆菌肽耐药,对小鼠无致病性。     

大熊猫肠道菌群的研究进展

大熊猫是我国特有的濒危珍惜物种,有国宝和活化石之称。肠道菌群对大熊猫的消化、疾病等有重要影响,随着分子生物学和生物信息学的快速发展,对大熊猫肠道菌群结构和功能有了更深层次的认识。本文综述大熊猫肠道菌群结构及其部分生物学特性研究进展,为大熊猫保护提供参考。     

锦鲤肠道不同部位菌群组成结构及多样性分析

【目的】研究锦鲤（Cyprinus carpio var.koi）肠道的菌群组成结构及多样性,为深入研究锦鲤肠道菌群的功能及肠道不同部位的生理功能的分化提供参考。【方法】收集锦鲤前肠、中肠和后肠的肠道细菌,通过传统培养技术,采用细菌微量生化鉴定管对肠道细菌进行各项生理生化指标的测定;分别提取3个肠段的肠道菌群基因组DNA,进一步采用16S rDNA高通量测序技术,分析3个肠段的菌群组成和生物多样性。【结果】前肠、中肠和后肠样本测序后分别得到48659、47013和47819条有效序列,按97%相似性水平划分OTU后,分别得到1555、1294和1423个OUTs。α多样性分析结果显示,后肠菌群样本的Shannon指数、Chao1指数最高。在门水平上,前肠、中肠和后肠丰度最高的5个菌门均是变形菌门（Proteobacteria）、梭杆菌门（Fusobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、厚壁菌门（Firmicutes）和黏胶球形菌门（Lentisphaerae）,推测这些菌门是锦鲤肠道的核心细菌类群,但各菌门在不同部位的相对丰度有差异。构建的物种丰度热图显示相对丰度最高的前10类菌属相同,但某些菌属在肠道不同部位的相对丰度有较大差异,如代尔夫特菌属（Delft）、弓形菌属（Toxoplasma）。UniFrac分析显示中肠和后肠的肠道菌群聚为一支,表明这2个部位菌群组成结构相似度较高。【结论】锦鲤肠道不同部位具有独特的菌群结构,可能会影响肠道不同部位功能的分化。     

健康朱鹗消化道正常菌群的分离与鉴定

【目的】了解健康朱鹮消化道正常菌群,为进一步研制适用于朱鹮的微生态制剂奠定基础性。【方法】无菌采集健康朱鹮的新鲜粪便,分离、培养、鉴定其细菌。以小白鼠和小鸡为试验动物,对分离、鉴定出的细菌进行毒性试验,确定分离的细菌对动物是否有致病性。【结果】从朱鹮粪便中分离得到22株细菌,分别为蜡状芽孢杆菌、环状芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、泛酸芽孢杆菌、两歧双歧杆菌、最小双歧杆菌、口乳杆菌、短乳杆菌、面包乳杆菌、马里乳杆菌、瑞士乳杆菌、嗜酸乳杆菌、丙酸丙酸杆菌、粪肠球菌、类肠膜明串球菌、少酸链球菌、肠膜链球菌、乳链球菌、克雷伯菌属、柠檬酸菌属、变形菌属和粪拟杆菌。其中,环状芽孢杆菌和泛酸芽孢杆菌可致小白鼠和小鸡死亡;短乳杆菌可致小白鼠死亡,但对小鸡无致病性;其他菌株对小白鼠和小鸡无致病性。【结论】分离鉴定出的朱鹮消化道22株细菌,其中适合制作微生态制剂的细菌有两歧双歧杆菌、最小双歧杆菌、口乳杆菌、面包乳杆菌、马里乳杆菌和嗜酸乳杆菌。     

健康家兔肠道中乳酸菌的分离鉴定

本试验选用MRS、MRS+10%家兔硬粪浸出液和MRS+10%泡菜汁3种选择培养基,对健康家兔肠道的乳酸菌群分别进行需氧和厌氧培养,根据可培养细菌菌落特征、染色特性、显微镜形态观测,共分离出7株乳酸菌株,其中需氧菌2株,厌氧菌5株。结合生化试验初步鉴定,需氧菌株分别为乳酸乳球菌和短乳杆菌,厌氧菌株分别为嗜酸乳杆菌,嗜粪乳杆菌,肠乳杆菌,乳酸乳杆菌和弯曲乳杆菌。本实验为弄清健康家兔肠道的有益菌群,以便下一步制作更易于在畜禽的肠道中定植存活的复合动物微生态制剂做准备。     

新疆家蚕肠道菌群多样性分析

家蚕肠道菌群与蚕体对营养物质的消化吸收及健康密切相关.通过饲喂苏优一号家蚕3种不同处理的桑叶,探讨不同处理桑叶饲喂对家蚕肠道菌群的影响及可能的作用机制,为新疆蚕区家蚕肠道微生物种类组成及多样性差异提供一定的理论依据.以正常饲喂组、含沙桑叶组、高湿桑叶组等3种处理方式,饲喂5龄幼虫,采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法...     

黑眉锦蛇肠道菌群结构分析

采用PCR–DGGE和Q–PCR技术,分析黑眉锦蛇空肠、回肠和直肠中菌群的结构。结果显示:黑眉锦蛇空肠、回肠和直肠中菌群的多样性指数分别为2.84、3.14、2.69,均匀度分别为0.78、0.86、0.74,丰富度分别为17.20、23.40、14.80,且各肠段中均以厚壁菌门细菌和拟杆菌门细菌居多,总菌和厚壁菌门细菌、拟杆菌门细菌的丰度分别达10~(8.07)、10~(6.82)和10~(6.30) CFU/g以上,梭菌属细菌、乳酸菌属细菌和Akkermansia细菌的丰度均达10~(5.05)CFU/g以上,且其丰度均随肠道沿头部向尾部的方向呈先增加后降低的趋势,直肠中的丰度低于空肠中的;肠球菌属细菌和肠杆菌科细菌的丰度均在10~(6.11) CFU/g以上,其在直肠中的丰度高于空肠中的。结果表明:黑眉锦蛇肠道中拟杆菌门细菌和厚壁菌门细菌为优势菌群;菌群的丰度随肠道沿头部向尾部的方向呈先增加后降低的趋势;益生菌在直肠中的丰度低于在空肠中的,有害菌在直肠中的丰度高于在空肠中的。     

獭兔肠道菌群的研究进展

獭兔是一种皮肉类兼用的重要经济动物,在规模化养殖中,其易出现腹泻等消化道疾病,给獭兔养殖带来巨大经济损失。肠道菌群对獭兔的免疫、消化等有重要影响。文章主要就獭兔道菌群结构及抗生素、微生态制剂等对獭兔肠道菌群影响进行概述。     

辣椒碱对动物肠道功能和肠道菌群的影响及其缓解肠道炎症的研究进展

辣椒碱(CAP)是一种从辣椒中分离出来的生物碱,作为香料被广泛使用。已有研究结果表明,辣椒碱具有多效性,如抗炎、抗氧化和抗癌症等作用,但其影响动物肠道功能和肠道菌群组成方面的研究相对较少。本文综述了辣椒碱对动物肠道功能和肠道菌群的调节作用,并阐述其在缓解动物肠炎发生和发展方面的作用机制,为辣椒碱在维持肠道稳态方面的应用提供理论基础。     

双歧杆菌对正常小白鼠免疫调节及肠道菌群的影响

应用动物实验方法,研究婴儿双歧杆菌和长双歧杆菌对正常小白鼠免疫功能的调节作用以及对肠道菌群的影响。结果发现,两株菌对正常小白鼠体重、脾/体重和肾/体重比无显著性影响;对肝/体重比有增加趋势;能显著增加血液中IgA,IgG,C3,C4,IL-2,IL-6和IL-8的含量(P<0.05),婴儿双歧杆菌效果优于长双歧杆菌;婴儿双歧杆菌可极显著增加IgM的含量(P<0.01)。两株菌均可显著增加双歧杆菌(P<0.05)和乳杆菌的数量,显著降低肠杆菌的数量(P<0.05)。实验结果表明,两株菌对正常BALB/C小白鼠的免疫功能具有一定的正相调节作用,并具有良好调节肠道菌群能力,婴儿双歧杆菌效果优于长双歧杆菌。     

博落回对小鼠肠道菌群及血液生化指标的影响

试验研究了博落回全草粉对小鼠肠道菌群和血液指标的影响。将昆明雄性小鼠随机分为对照组和4个试验组,试验组小鼠分别口服不同浓度的博落回全草粉(0.05、0.1、0.2、0.5 g·kg-1)0.2 mL·只-1·d-1,对照组给予生理盐水0.2 mL,测定小鼠肠道菌群数、血液生化指标等。结果表明,博落回能显著降低小鼠肠道中大肠杆菌数量(P0.05);博落回0.1、0.2 g·kg-1组血清中总蛋白、球蛋白的含量高于对照组(P0.05),博落回组血清尿素氮和IL-6含量均不同程度的低于对照组,以添加博落回0.1 g·kg-1组最低。试验结果表明,博落回能够降低肠道中大肠杆菌的数量,提高动物机体的免疫水平,保护动物健康。     

肠道菌群与仔猪腹泻的相互关系

综述了仔猪肠道菌群的分布、肠道菌群的作用、其与动物的生产性能、仔猪的腹泻关系及调控措施等。     

桑粒肩天牛幼虫肠道菌群的种类及分布

对47头野外采集的桑粒肩天牛幼虫肠道进行定性与定量检测,发现了13种菌群。其中葡萄球菌属在前中肠、中中肠、后中肠和后肠中的分离率为100%,是常住菌群。链球菌属、肠杆菌属、埃希氏菌属、志贺氏菌属和芽孢杆菌属在上述4个肠段都能分离到,但分离率较低。而其他菌群只能在某些肠道分离到,为过路菌群。各个肠段菌群菌量分布不同,即后中肠<中中肠<前中肠<后肠。葡萄球菌属菌量在各肠段分布同总的菌群菌量一致。可见葡萄球菌属在桑粒肩天牛生长发育过程中起了积极的作用。     

盐酸林可霉素对小鼠肠道菌群的影响

[目的]研究不同剂量盐酸林可霉素对小鼠肠道菌群的影响,为正确使用盐酸林可霉素提供参考资料。[方法]分别以80和120mg/d剂量的盐酸林可霉素,连续灌胃小鼠5和7 d,分别于停药后第1、3、7、10和15天检测小鼠直肠球菌、杆菌、乳酸菌及双歧杆菌数;[结果]各盐酸林可霉素给药组皆可造成小鼠肠道菌群失调。[结论]低剂量灌胃盐酸林可霉素可用于制备小鼠肠道菌群失调模型,高剂量给药可对小鼠机体造成损害。     

赤眼鳟肠道菌群结构及其潜在功能研究

为确定赤眼鳟肠道菌群结构和潜在功能,本实验采用16S rRNA测序技术分析健康的赤眼鳟肠道微生物群落结构和潜在功能。结果表明,赤眼鳟肠道菌群在门、属、种水平上的优势菌分别是放线菌门（Actinobacteri）、厚壁菌门（Firmicutes）等,绿丝菌属（Chloronema）、醋酸杆菌属（Cetobacterium）等和索氏鲸杆菌（Somerae）、邻单胞菌（Shigelloides）等;KEGG通路L1、L2、L3水平最富集的分别是新陈代谢（73.09%）、碳水化合物代谢（11.26%）和萜类和类固醇的生物合成（1.99%）。赤眼鳟肠道菌群与其他鱼类有共性也有个性,为赤眼鳟的健康养殖提供参考。