全基因组选择在猪育种中的应用

全基因组选择(Genomic selection,GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能够更加准确地早期预测估计育种值,降低近交系数,大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪60kSNP芯片的商业化,全基因组选择已经成为猪育种研究领域的新热点。本文综述了全基因组选择的分析方法、计算方法和影响因素,并阐述了全基因组选择在猪育种中的应用情况和发展趋势。     

全基因组选择在猪育种中的研究进展

目前,随着分子生物学技术和遗传学的不断发展,动物育种方法从传统的数量评估方法,逐渐向全基因组选择法评估育种值转变。全基因组选择是动物育种的一次革命,利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能大大缩短育种间隔,提高遗传进展,已然成为动物育种研究的热点。该文主要对全基因组选择在动物育种中的应用及展望做一个简述。     

基因组选择技术及其在猪育种中的应用探讨

基因组选择(Genomic Selection,GS)技术是利用覆盖全基因组与性状相连锁的标记信息,通过标记效应的求解和加和,得到个体基因组估计育种值(GEBV),从而达到对畜禽个体进行准确选择的目的。该技术率先在奶牛育种中得到广泛应用。在猪育种中,以杜洛克猪为代表,基因组选择技术的应用可以达到早期选择和提高选择准确性的效果,然而对于母系猪(以繁殖性状选择为主),并没有经济有效的利用方案。本文首先对基因组选择应用过程中关键问题进行讨论;其次简要介绍了基因组选择技术在父系猪中的应用情况;最后围绕我国母系猪育种的现状,探讨基因组选择技术在母系猪中如何应用。     

全基因组选择在家禽育种中的应用

随着分子标记检测技术不断发展,分子育种进入了全基因组选择时代。全基因组选择相对于传统育种手段,具有育种值估计准确率高、有效提高育种工作效率等优点,与牛和猪比较,全基因组选择在家禽育种方面的研究和应用相对较少。本文回顾了分子标记、传统育种和分子育种发展历程,展示了家禽分子标记检测技术的最新进展,总结了全基因组选择的计算方法以及存在问题。在此基础上,结合具体案例介绍了家禽全基因组选择研究和应用的最新进展。相信随着测序成本降低和统计方法的改良和研发,未来全基因组选择方法有望在家禽育种工作中得到广泛应用并发挥重要作用。     

全基因组选择及其在奶牛育种中应用进展

全基因组选择是指基于基因组育种值（GEBV）的选择方法,指通过检测覆盖全基因组的分子标记,利用基因组水平的遗传信息对个体进行遗传评估,以期获得更高的育种值估计准确度。由于可显著缩短世代间隔,全基因组选择作为一项育种新技术在奶牛育种中具有广阔的应用前景,目前已经成为各国的研究热点。不同国家的试验结果表明,奶牛育种中基于GEBV的遗传评估可靠性在20%~67%之间,如果代替常规后裔测定体系,可节省92%的育种成本。本文综述了全基因组选择的基本原理及其在各国奶牛育种中的应用现状和所面临的问题。     

全基因组选择在猪育种上的研究进展

全基因组选择(Genomic selection,GS),即全基因组范围内的标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)。因其具有可缩短世代间隔,提高年遗传进展;早期选择准确率高;同时还能提高低遗传力、难以测量性状选择效率等诸多优点,目前已成为动物遗传育种领域的研究热点。文内围绕"什么是GS"、"为什么选用GS"以及"影响GS的因素"这3个方面全方位诠释了GS。重点阐述了GS在猪育种中的应用现状,并结合GS在奶牛上的成功应用,简述了GS在猪育种上的展望。     

全基因组选择及其在动物育种中的应用

随着遗传学的迅速发展,全基因组选择作为一种新型选择方法成为研究人员研究的热点,文章讲述了全基因组学的原理、选择的方法、选择的影响因素及优势,展望了全基因组选择在动物育种中的应用。     

基因组选择技术在家禽育种中的应用

基因组选择是动物育种领域的一项前沿的选种技术,在家禽育种中的研究和应用正在积极开展。文章综述了基因组选择的基本原理、鸡DNA分型的方法、目前基因组选择在国内外家禽育种企业中的应用情况,以及基因组选择在家禽育种产业化应用所面临的成本、算法、人才等挑战。尽管基因组选择在家禽育种中存在这些挑战,但是随着基因组选择的模型和算法完善以及基因型测定技术成本的日趋下降,基因组选择必将在家禽育种中得到广泛应用,从而加速品种培育进程。     

全基因组选择在绵羊育种中的运用

本文以全基因组选择在绵羊育种中的运用为主要内容,结合当下全基因组选择需求为主要依据,从畜禽性状受一个及多个基因控制、间接法育种、直接法育种、参开群规模和结构这几方面分析,其目的在于提升全基因组在绵羊育种中价值,旨在为相关研究提供参考资料。     

人工授精和基因组技术在猪育种中的应用

猪肉在人类膳食中占据着重要的地位,每年的消费量占肉类总数的40%多。所以如何提高猪肉品质是猪肉生产中的重要问题。本文主要介绍了人工授精技术与基因组技术在猪育种中的应用,为猪的生产、养殖提供理论参考。     

全基因组关联分析在猪育种中的研究进展

全基因组关联分析(genome-wide association studies, GWAS)是一种利用大规模群体的DNA样本进行全基因组高密度基因型分型,探究与目标性状相关联的遗传变异的研究方法。GWAS在揭示猪重要经济性状的变异规律和推动基因组选择在猪育种中的实际应用等方面有着重要作用。本综述主要围绕GWAS的基本原理、GWAS的分析方法、GWAS在猪育种方面取得研究进展和其未来展望进行综述,以期为利用GWAS进行猪重要经济性状遗传基础的研究提供参考。     

猪基因组选择育种研究进展

全基因组选择是指利用覆盖整个基因组的高密度SNP计算个体的基因组估计育种值(Genomic Estimated Breeding Value,GEBV).利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,可以通过早期选择缩短世代间隔,提高GEBV的准确性,降低近交系数从而提高种猪的遗传进展.近年来,随着基因分型成本下降,全基...     

基因组选择与猪育种

随着高通量基因芯片和测序技术的快速发展,促使个体SNP基因型的判型成本快速下降,基因组范围的高密度SNP标记数据已经在家畜群体内使用。传统的LEMAS、LD-MAS或G—MAS预测育种值的能力是有限的,这是因为传统的MAS只使用很少的被证明是有效标记,而这些标记只解释复杂性状很小比例的遗传变异（10％～20％）。为了克服传统MAS的缺陷,Meuwissen等（2001）建议了一种新的、不同的方法,这种方法被叫做基因组选择（GS）。     

基因组选择与猪育种

<正>随着高通量基因芯片和测序技术的快速发展,促使个体SNP基因型的判型成本快速下降,基因组范围的高密度SNP标记数据已经在家畜群体内使用。传统的LE-MAS、LD-MAS或G-MAS预测育种值的能力是有限     

基因组选择技术在奶牛育种规划中的应用

奶牛育种规划是奶牛育种领域最重要,也是最复杂的问题之一,文章简要介绍了关于奶牛育种规划的概念、基本内容和工作流程,另外还介绍了目前最流行的基因组选择技术在奶牛育种体系中的应用情况。随着基因组技术的不断发展,如何在奶牛育种规划中应用基因组选择技术以及如何提高基因组选择准确性(rmg)已经成为学者最关心的问题。传统后裔测定育种规划(CPTP)和基因组选择育种规划(GBP)在世代间隔、育种成本投入以及遗传选择准确性方面有明显的差异,尽管GBP在育种投入方面与CPTP相比有非常明显的优势,但是由于rmg[基因组育种值(GEBV)与育种值真值之间的相关]值偏小,在青年公牛选育方面还需要谨慎对待。影响rmg的因素主要有4个,其中标记与数量性状基因座(QTL)之间的连锁不平衡程度(LD)和参考群体规模可以在模拟计算和育种实践中通过技术手段和育种投入加以控制并改善。文章旨在利用基因组选择技术彻底改变目前传统的奶牛育种体系的架构,极大程度地丰富奶牛育种规划的设计方案,并提高奶牛育种规划的育种效果和经济效益。     

全基因组关联分析及其在猪育种中的研究进展

近年来,随着高通量单核苷酸芯片和基因分型技术的不断发展,利用全基因组关联分析猪的性状成为可能。全基因组关联分析是一种新兴的遗传分析方法,能有效进行复杂疾病和性状的研究。国内外相关研究人员针对猪性状进行全基因组关联分析,积累了大量的单核苷酸多态性(SNP)标记、候选基因以及数量性状位点,为猪分子育种提供基础。该文主要对全基因组关联分析的基本原理、分析方法以及对猪性状的研究进展进行综述。     

整合生物学先验信息的全基因组选择方法及其在家畜育种中的应用进展

相较于传统的育种方法,全基因组选择（genomic selection,GS）通过对拟留种的个体进行早期选择和增加选择的准确性进而加快育种的遗传进展。通过改进GS方法无法再缩短育种的世代间隔,因而如何提高GS的准确性以获得额外的遗传进展一直是GS研究的核心问题。当前,各种组学技术不断成熟,从公开的资料或前期的研究积累获取生物学先验信息已比较容易。因而,如何在GS模型中整合已知的先验信息进而提高GS的准确性以获得额外的遗传进展成为当前育种研究的热点问题。本文对生物学先验信息的类型以及整合先验信息的GS方法进行综述,探讨了这些方法在家畜育种中的应用和前景,以期为家畜育种中开展整合生物学先验信息的GS研究提供借鉴与参考。     

基因组选择在羊育种中的应用研究进展

基因组选择(genomic selection,GS)已经作为新一代畜禽遗传评估方法应用于奶牛育种中,并取得了显著成效。随着羊参考基因组的不断完善,以及不同密度SNP芯片的推出和商业化推广,新西兰、澳大利亚、法国等相继将基因组选择应用到羊育种中,揭开了羊育种的新时代。本研究总结了国内外羊基因组选择的研究现状、影响因素、优势以及存在问题和展望,以期为中国羊开展基因组选择育种提供参考。     

全基因组选择育种技术在我国黄羽肉鸡产业中的初步实践

全基因组选择育种技术是当前在畜牧领域刚刚兴起的一种先进的育种手段,相较于传统的常规育种,基因组育种在利用系谱和表型数据的基础上增加了个体基因型数据,这大大增加了选种的准确性。国际家禽育种领域的领军企业,如:海兰、科宝、安伟杰等知名家禽育种公司现已全部应用该项技术。而在我国,基因组育种尚处于起步、尝试阶段,本文主要通过实际的企业案例来向大家展示基因组育种技术在黄羽肉鸡产业中的初步应用效果以及对该项先进技术在家禽育种领域广阔应用空间的展望。