利用微卫星多态性鉴别不同马品种试验

[目的]选取3个马匹品种(柯尔克孜马、俄罗斯速步马、纯血马),对其5个微卫星DNA座位AHT4、ASB2、HMS3、HMS7、LEX3进行多态性分析,利用SPASS分析软件,对3个马品种进行初步鉴别.[方法]以柯尔克孜马、俄罗斯速步马、纯血马为实验对象,分别采集血样10 mL,枸橼酸钠抗凝,实验室中对所选取的5个微卫星DNA座位进行非变性丙烯酰胺电泳(PAGE)检测,用Popgene32分析数据.比较品种间有效等位基因数(Ne)、等位基因频数分布间的差异,辅以各品种特有的基因型条带对三个马品种进行初步鉴别.[结果]对5个微卫星标记的有效等位基因数(Ne)数值进行分析,发现纯血马与俄罗斯速步马、柯尔克孜马与俄罗斯速步马呈显著差异关系(P＜0.05),成为初步鉴别三个马品种的重要依据;对5个微卫星标记进行非变性丙烯酰胺电泳(PAGE)检测,发现ASB2微卫星标记的基因型中,柯尔克孜马有区别于其他两个品种马的基因型:CC、CD、EG、EH基因型,纯血马所特有的基因型为BI、JJ、KK基因型;AHT4微卫星标记的等位基因型中,柯尔克孜马所特有的基因型为DF、EF、GG基因型,纯血马所特有的基因型为BC基因型;HMS3微卫星标记的等位基因型中,纯血马所特有的基因型为CC基因型;HMS7微卫星标记的等位基因型中,纯血马所特有的基因型为AA基因型.[结论]3个马品种的鉴别可以通过筛选出的微卫星位点的有效等位基因数(Ne),以及所选微卫星标记的等位基因,辅以各品种特异的基因型电泳条带,从而达到初步鉴别三个马匹品种的目的.     

福建黄牛的遗传多态性及分类

用8个微卫星标记对福建黄牛的等位基因频率、多态信息含量(PIC)、遗传杂合度(H)和有效等位基因数(E)等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究.结果表明:(1)8个微卫星标记在所检测的福建黄牛群体中都表现出较丰富的多态性,4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因,每个微卫星标记平均检测到7.2个等位基因(3-11);8个微卫星标记的PIC平均为0.6471(0.3942-0.8062),各群体的PIC差异不显著;全部群体的H为0.2930;各群体的E平均为3.37(3.03-3.84).这显示黄牛群体的等位基因频率、PIC、H和E等指标有较好的一致性,说明福建黄牛品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性.(2)根据Ne i氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析的结果显示,4个群体间的遗传变异不大.福建黄牛地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;遗传距离及聚类分析结果表明,这些群体黄牛属于同一个地方品种.     

三种苹果砧木在K+缺乏情况下的生理生长状况分析

K+作为矿质元素中的一种重要的营养元素,参与了苹果树体的许多生理进程并且决定了产量与品质。本试验以苹果砧木平邑甜茶(Malus hupehensis Rehd)、丽江山定子(Malus rockii Rehd)、小金海棠(Malus xiaojinensis Cheng et Jiang)为材料,研究了三种砧木缺钾乏的生理反应,结果显示低钾处理抑制了三种苹果砧木幼苗的生长,降低了幼苗的生长量、光合速率、叶绿素含量,但三种砧木表现不同,小金海棠在K+缺乏相比于其它两种砧木生长较好,具有较高钾利用效率。     

延边黄牛的微卫星遗传变异及DNA指纹分析

检测了8个群体184个个体,共检测到等位基因330个,各微卫星标记位点的多态信息含量(PIC)为0.536 7~0.886 1,同一标记位点在各群体间存在差异.各位点观察杂合度的变动范围为0.2~0.954 5,期望杂合度的变动范围为0.283 1~0.918.在HEL9和HEL51两个微卫星标记中,延边黄牛特有基因型的频率都达到了40%以上,因此,本实验所获得的微卫星DNA指纹数据对延边黄牛的品种鉴别有重要的参考价值.     

一种简易的猪肉和牛肉分子生物学鉴别方法研究

建立了基于微卫星标记鉴别牛、猪肉制品的方法.根据微卫星标记种间特异性的特点,从Genbank中筛选出牛微卫星Sign Ⅰ和猪微卫星标记Sign Ⅱ,并依据各个微卫星标记的侧翼序列设计引物.提取牛、猪肉各48个样品中的DNA作为模板,进行PCR扩增,电泳后得到了各自的目的条带379 bp和585 bp,根据目的条带的出现与否鉴别牛肉和猪肉.该方法进行鉴定灵敏度高,特异性好,而且方法简单,易于操作,结果易于判断.     

梨RAPD扩增产物两种凝胶电泳指纹特点及其序列分析

尽管RAPD技术已经应用于梨种质资源遗传多样性研究,但是尚没有对11个碱基引物的RAPD优化技术在梨品种鉴定方面的深入研究,也缺乏对梨RAPD的PCR产物特点进行分析的报道。鉴于此,该实验首次开展了选用11个碱基引物的RAPD鉴定梨品种上的研究,并对PCR扩增产物的琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳的指纹图谱加以比较分析。结果表明PAGE电泳检测出的谱带的总数量以及多态性谱带的数量均高于前者。两种电泳指纹标记资料进行梨品种聚类的结果存在一定差异。通过对随机挑取的21个片段进行克隆与测序分析,结果发现21个片段都是对应RAPD引物的扩增产物,其中3条为编码蛋白序列,18条为非编码蛋白序列。     

高粱微卫星非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳条件的优化

以高粱抗、感丝黑穗病3号生理小种部分品种(S95062B、7050B、2381R、LR625;622A、622B、矮4)为材料,利用微卫星标记结合非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术进行抗病基因的引物筛选.通过比较各因子对电泳体系的影响,建立了一个高粱微卫星非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的优化体系:电泳时间为92～105 min;银染温度为27.8～29.0 ℃;显色温度为32℃左右.     

微卫星标记预测猪部分经济性状杂种优势的研究

为探明微卫星标记与猪经济性状杂种优势的相关关系,采用聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳,筛选应用6个猪微卫星标记估测了长白公猪×大白母猪(长大)、大白公猪×长白母猪(大长)、大白公猪×长大母猪(大长大)和杜洛克公猪×长大母猪(杜长大)4个不同杂交组合亲本间的遗传距离,分析了它与猪杂交后代经济性状杂种优势率的相关关系.结果表明:亲本间微卫星标记遗传距离与杂交后代日增重、料肉比等生产性状均呈强正相关关系,相关系数分别为0.6276,0.3899,与瘦肉率﹑眼肌面积、后腿比率和熟肉率等胴体性状均呈强负相关关系,相关系数分别为-0.8359,-0.5396,-0.9930和-0.6679,因而可作为预测这些性状杂种优势的指标.     

八棱海棠和湖北海棠的耐盐性分析

通过组织培养获得两个苹果砧木八棱海棠(Malus robusta Rehd.)和湖北海棠[Malus hupehensis(Pamp.)Rehd.]的试管苗,并以不同浓度的NaCl作为盐胁迫因子,加入生根培养基中进行耐盐性试验。结果表明,在盐胁迫的30d内,试管苗的生根率、生根数目均随着盐浓度的升高而降低,试管苗的受害指数随着盐浓度的升高而增大。在4g/L NaCl胁迫下,随着盐胁迫时间的延长,试管苗的受害率和受害指数呈上升趋势。八棱海棠耐盐能力大于湖北海棠。     

黄鳝微卫星标记筛选及其在不同性别表型群体中的遗传多态性

采用FIASCO(Fast isolation by AFLP sequences containing repeats)法进行黄鳝微卫星标记筛选并将其应用于黄鳝性别差异群体的遗传变异分析.黄鳝基因组DNA经酶切、微卫星核心序列探针杂交、T载体连接并转化至DH5a中,构建黄鳝基因组微卫星富集文库.随机挑选75个阳性克隆测序,结果发现其中20个含有微卫星序列,利用软件成功设计了15对微卫星引物,经过黄鳝基因组DNA的PCR扩增及电泳检测,筛选8对多态性微卫星引物并对黄鳝3种不同性别表型群体的基因组DNA进行PCR扫描,结果显示:在8个微卫星座位中,共检测到51个等位基因,平均每个座位的等位基因数为6.375个,等位基因频率分布为0.001 2～0.603 3;黄鳝雌性表型群体、间性表型群体、雄性表型群体的平均遗传杂合度分别为0.637 1、0.696 9、0.734 5;平均多态信息含量分别为0.565 6、0.641 6、0.685 8,表明这些微卫星标记在黄鳝不同性别表型群体的遗传多态性发生了改变,它们可作为黄鳝遗传背景分析的分子标记.