4个牛群体MSTN基因第1外显子单核苷酸多态性分析

以肌生成抑制素(MSTN)为候选基因,采用PCR-SSCP技术检测了该基因第一外显子在皖东牛、皖南牛、和牛和西门塔尔牛4个群体中的多态性。通过SNP检测,发现MSTN基因外显子1的267碱基发生A→G的同义突变,在所检测牛群中存在3种基因型(AA、GG、AG),A等位基因为优势基因。该位点在4个牛群体中均处于中度多态。卡方检验表明皖东牛、皖南牛和和牛处于哈代-温伯格平衡状态(P0.05),西门塔尔牛处于哈代-温伯格不平衡状态(P0.05)。     

贵州小香羊MSTN基因内含子2和外显子3的多态性

为贵州小香羊选育及进一步研究MSTN基因与贵州小香羊生长性状的相关性提供理论依据,采用PCR-RFLP方法对67只贵州小香羊MSTN基因内含子2和外显子3进行了多态性分析。结果表明,所扩增内含子2中存在Bsp1286I酶切多态位点,杂合型(AB)为优势基因型,无纯合野生型(AA)和纯合突变型(BB);所扩增内含子2和外显子3中存在BstBI酶切多态位点,杂合型(CD)为优势基因型,纯合野生型(CC)和纯合突变型(DD)为非优势基因型,D等位基因为优势基因,且含有2个TatI正常酶切位点,但不存在多态性,不存在BsmFI酶切位点。     

黔北麻羊MSTN基因的多态性分析

为给黔北麻羊品种遗传资源的保护及进一步选育提供科学依据,利用BsmAI、MspI、EcoRI、MvaI、XmnI、MnII等6种限制性内切酶对黔北麻羊MSTN基因部分内含子1、2和外显子2进行PCR-RFLP多态性分析。结果表明:在扩增的MSTN基因1 241bp序列中含有BsmAI、EcoRI、MvaI和MnII 4个酶切位点,但均不具有多态性;未发现MspI和XmnI酶切位点。     

伊拉肉兔和美系獭兔MSTN基因多态性研究

为了探索伊拉肉兔和美系獭兔MSTN基因多态性,以期为家兔分子选育提供理论依据。试验分别选取了伊拉肉兔与美系獭兔70只,其中公母各35只,采用PCR扩增MSTN基因部分片段并测序,结果：① 共发现了4个SNP位点,分别位于MSTN基因序列外显子Ⅰ的111bp处,内含子Ⅰ的234bp处,外显子Ⅱ的338bp处和内含子Ⅱ的34bp处;外显子Ⅲ中则未发现多态位点;内含子多态位点首次发现。② MSTN基因外显子Ⅰ的SNP位点发生C—T的转换,有CC、CT和TT 3种基因型,CC为优势基因型,且基因型频率分布在伊拉肉兔群体中不符合hardy-weinberg平衡外（P <0.05）。③ 内含子Ⅰ的SNP位点发生了G-A的转换,有GG、GA和AA 3种基因型;外显子Ⅱ的SNP位点处T-A的颠换,有TT、TA和AA 3种基因型;内含子Ⅱ的SNP位点处发生T-C的转换,有TT、TC和CC 3种基因型。这3个SNP位点基因型频率在伊拉肉兔和美系獭兔群体中均符合hardy-weinberg平衡（P >0.05）。④ 4个SNP位点在伊拉肉兔和美系獭兔群体中均表现为中度多态（0.25相似文献   

中国5个牛种leptin基因外显子3的多态性分析

利用改进的DNA提取方法和PCR-RFLP技术,对南阳牛、秦川牛、西镇牛、鲁西牛(地方黄牛品种)和荷斯坦奶牛等5个牛品种的263头个体lep tin基因外显子3多态性进行了分析。结果表明,牛lep tin基因外显子3长度为330 bp,存在H aeⅢ和Ap aⅠ限制性内切酶的酶切位点,但在这2个酶切位点上无多态性,2种酶酶切片段长度均为70 bp和260 bp。说明牛lep tin基因外显子3在H aeⅢ和Ap aⅠ2个酶切位点上具有保守性。     

牦牛MSTN基因第2外显子的遗传变异分析

研究采用PCR-SSCP方法分析了牦牛MSTN基因第2外显子遗传变异特征.结果表明:在第2外显子以及80bp的部分第1内含子和102bp的部分第2内含子,共556bp的区域中存在5处点突变,表现AA、BB、AB、AC 4种基因型,由A、B和C 3个复等位基因控制.各基因型频率分别为0.884 0、0.001 4、0.106 0和0.008 6.序列分析表明等位基因B在位于第2外显子411bp处发生A→G突变,导致编码的第235位氨基酸由组氨酸突变为精氨酸,其余4处突变位于等位基因C上,即位于第1内含子31bp处的G→A突变和65bp处的核苷酸缺失以及第2内含子529bp处的A→G突变,还有一处是位于第2外显子第121bp处的T→C沉默突变.     

牦牛MSTN基因内含子2多态性及与生长性状的相关性

采用PCR-SSCP技术对大通牦牛、甘南牦牛和天祝白牦牛(共277头)肌肉抑制素基因(MSTN)内含子2的部分序列进行了多态性研究,分析该基因与牦牛生长性状的相关性.结果表明,牦牛MSTN基因内含子2存在2个等位基因和3种基因型.在该基因座上,甘南牦牛、天祝白牦牛呈Hardy-Weinberg平衡状态,大通牦牛呈不平衡...     

海门山羊3个基因位点遗传多态性与其生长性状的关系

[目的]研究海门山羊群体3个基因位点遗传多态性与生长性状的关系,为提高海门山羊的生长性能以及培育快长型海门山羊新品系提供参考。[方法]采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对海门山羊群体3个基因位点进行分析,并进行相关统计分析。[结果]在海门山羊群体中,海门山羊MSTN基因内含子Ⅱ、GH基因外显子Ⅰ和GH基因外显子Ⅱ均检测到2种基因型。这些位点不同的基因型对海门山羊的相关生长性状有着不同的影响。[结论]该研究结果对通过标记辅助选择提高海门山羊体重等生长性状具有重要意义。     

海门山羊3个基因位点遗传多态性与其生长性状的关系

[目的]研究海门山羊群体3个基因位点遗传多态性与生长性状的关系,为提高海门山羊的生长性能以及培育快长型海门山羊新品系提供参考。[方法]采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术对不海门山羊群体3个基因位点进行分析,并进行相关统计分析。[结果]结果表明,在海门山羊群体中,海门山羊MSTN基因内含子Ⅱ、GH基因外显子Ⅰ和GH基因外显子Ⅱ均检测到2种基因型。这些位点不同的基因型对海门山羊的相关生长性状有着不同的影响。[结论]该研究结果对通过标记辅助选择提高海门山羊体重等生长性状具有重要意义。     

山羊MSTN基因EcoRV酶切多态性分析

采用限制性内切核酸酶EcoRV对山羊MSTN基因的676 bp扩增产物进行了PCR-RFLP多态性分析,检测到3种基因型,其酶切位点分别由2种共显性基因控制;对该片段的纯合型(AA、BB)分别测序发现,BB型在3783位的T→C。首次试验证实山羊MSTN内含子2(676 bp)区域存在多态性。     

朗德鹅MSTN基因外显子3多态性的研究

肌抑制素基因(MSTN)属于转化生长因子-β超家族成员,其主要功能是负向调控肌细胞生长发育。为检测朗德鹅MSTN外显子3多态性,采用PCR-SSCP的方法,对肌生成抑制基因外显子3进行了分析;结果发现,该片段存在PCR-SSCP多态性;对具DNA多态性的片段测序分析发现:MSTN基因外显子3第1 023处发生了单碱基的改变(A→G)。通过研究MSTN基因的多态性,为朗德鹅的选种和选育提供实验基础和理论依据。     

贵州黑山羊和黔北麻羊MSTN基因DraI酶切多态性分析

以贵州黑山羊和黔北麻羊为材料,根据山羊MSTN基因序列(GenBank登录号:EF588035)设计1对引物,用PCR-RFLP法对该序列进行多态性分析。结果表明:PCR扩增片段207 bp处存在TTTTA的插入,导致出现1个DraI酶切多态性位点,黑山羊纯合野生型(AA)为优势基因型,杂合型(AB)和纯合突变型(BB)为非优势基因型,A等位基因为优势基因;黔北麻羊纯合野生型(CC)为优势基因型,杂合型(CD)和纯合突变型(DD)为非优势基因型,C等位基因为优势基因。     

海子水牛MSTN基因多样性与系统分化研究

针对牛肌肉生长抑制素基因(MSTN)编码区设计引物,以PCR扩增及测序的方法,检测了19头海子水牛样本的MSTN基因多样性,并对其系统分化进行研究。结果显示:海子水牛群体内MSTN基因编码区含1 128个碱基对,所检样本中存在3个核苷酸多态位点,但仅含有2种基因单型。说明海子水牛MSTN基因分化水平较低。     

我国主要地方山羊品种MSTN基因的MnlⅠ酶切多态性分析

采用限制性内切核酸酶MnlⅠ对山羊MSTN基因的379bp扩增产物进行了PCR-RFLP多态性分析,检测到3种基因型,其酶切位点分别由2种共显性基因控制;对该片段的纯合型分别克隆测序发现,BB型在第277位由G→A。证实山羊MSTN内含子二、外显子三(379bp)区域存在多态性。     

马MxA基因第12外显子多态性检测

MxA蛋白是Ⅰ型干扰素（IFNα／β）所诱导产生的蛋白之一,属于大分子（70～80kD）GTP酶,能抵抗各种RNA病毒和部分DNA病毒。MxA蛋白结构与其抗病毒活性有直接的关系。有报道表明,MxA蛋白活性部位的一个氨基酸序列的变换,会导致其抗病毒活性的改变。MxA基因多态性分析是研究马MxA蛋白基因抗病毒作用和寻找马MxA蛋白抗性基因的基础。     

马MxA基因第12外显子多态性检测研究

[目的]建立检测马MxA基因第12外显子多态性的快速、准确方法。[方法]采用错配聚合酶链反应（mismatchPCR）对马MxA基因第12外显子进行扩增,对PCR产物进行限制性片段长度多态性分析（RFLP）,鉴定MxA基因cDNA第1790位核苷酸点突变,并对PCR产物进行核苷酸序列分析。[结果]马MxA基因第12外显子区域存在AA、AB、BB3个基因型;位于cDNA序列第l790位点的碱基发生变异（由汕c）,引起了MxA蛋白编码区第562氨基酸由色氨酸变成半胱氨酸的变异;使用mismatchPCR—RFLP法所得PCR产物特异性序列,与RFLP分析结果相符。[结论]采用mismatch PCR—RFLP对马MxA基因12外显子的多态性进行检测操作简单,结果准确。     

马MxA基因第12外显子多态性检测(英文)

[Objective] The study aimed to establish a fast and accurate method to detect the polymorphism of the 12th exon of equine MxA gene. [Method] The 12th exon of MxA gene was amplified by mismatch PCR and the products were analyzed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) to determine the point mutation at the 1 790 nt of MxA cDNA. The sequence of the PCR products was also analyzed. [Result] There were three genotypes (AA, AB and BB) in the 12th exon of equine MxA gene; the 2 081 nt of MxA cDNA mutated from G to C, correspondingly changing the 562th amino acid of the coding region of MxA protein from tryptophan to cysteine; the specific sequence of the PCR products amplified by mismatch PCR-RFLP was consistent with the analysis results of RFLP. [Conclusion] The mismatch PCR-RFLP was an easy method with accurate results to detect the polymorphism of the 12th exon of equine MxA gene.     

马MxA基因第13外显子的多态性研究(英文)

[Objective] To investigate the polymorphism of the thirteenth exon of MxA gene in 4 species of horse. [Method] The thirteenth exon of MxA gene fragments were amplified from genomic DNA of Sanhe horse, Xinihe horse, Wushen horse and Baerhu horse with the primers designed according to the MxA sequence announced in GenBank; the polymorphism of MxA gene was detected by PCR-SSCP and the products were sequenced. [Result] The polymorphism of the thirteenth exon of MxA gene appeared only in Wushen horse, the 2 081 nt of which mutated from guanine (G) to adenine (A) and the corresponding amino acid of which changed from glutamate (Glu) to alanine (Ala). [Conclusion] The study provided a basis for exploring the antiviral effect of MxA protein.