新疆梨种质资源亲缘关系的ISSR和RAPD分析

[目的]探讨新疆梨种质资源亲缘关系以及遗传多样性,旨在为供试梨资源的分类提供科学依据.[方法]采用ISSR和RAPD分子标记对48份梨种质资源进行聚类分析和遗传关系研究.[结果]14条ISSR引物共扩增出113条清晰的谱带,其中101条显示多态性,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.19条RAPD引物共扩增出163条清晰的谱带,其中多态性谱带138条,平均每个引物扩增出7.2条多态性谱带.基于ISSR和RAPD两种标记,利用UPGMA分别构建了48份梨资源的聚类树状图.ISSR和RAPD分别聚类以及两种标记混合聚类均将48份梨种质分为3类:第Ⅰ类群中包括1份种质;第Ⅱ类群中包括23份种质;第Ⅲ类群中包括24份种质.[结论]两种标记适合于梨种质资源亲缘关系和遗传多样性分析,可为梨资源的开发利用及新品种的选育提供科学依据.     

石斛的分子生物学鉴定--基于RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了15种石斛属药用植物,选用10个有效引物(10 bp)扩增出99条DNA片段,用于遗传多样性分析、构建UPGMA聚类图.分析结果表明:RAPD方法能有效鉴别所试石斛属植物,其多态位点百分率为84.85%,表现出丰富的遗传多样性.     

石斛的分子生物学鉴定--基于RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了15种石斛属药用植物,选用10个有效引物(10bp)扩增出99条DNA片段,用于遗传多样性分析、构建UPGMA聚类图。分析结果表明：RAPD方法能有效鉴别所试石斛属植物,其多态位点百分率为84．85％,表现出丰富的遗传多样性。     

几种药用西红花与观赏西红花的RAPD分析

[目的]为分析不同种源西红花的遗传多样性和亲缘关系,利用RAPD标记技术对8种西红花基因组DNA的多态性进行分析。[方法]应用22个随机引物对8个西红花品种进行RAPD分析,并根据RAPD的扩增结果,应用NTSYS-pc 2.10e软件进行聚类分析。[结果]从22个随机引物中筛选出18个多态性较高的引物,共扩增出143条DNA条带,其中108条为多态带,占总数的75.5%,平均每个随机引物扩增的DNA带数为7.9条;在遗传相似系数0.62处将8个样品分为2类,一类为药用西红花,另一类为观赏西红花。[结论]RAPD法能有效鉴别药用西红花和观赏西红花,分子聚类结果与地理因素未见确定联系。     

内蒙古地区8种主要蝗虫基因组DNA多态性的RAPD标记研究

[目的]从分子水平上研究内蒙古草原主要蝗虫种类的遗传进化与系统发育关系。[方法]采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对蝗总科4科6属8种蝗虫的80个个体进行扩增,对基因组DNA进行多态性比较。[结果]7条引物共扩增出64条特异性片断,分子量大小为300～2000bp。8种蝗虫间遗传距离在0.2282～0.5896。带型显示,科内属间及属内种间多态性普遍存在。根据Neis遗传距离对结果进行UPGMA法聚类分析,结果表明,属内的种各自先聚为一类,其次是科内的种聚为一类。[结论]该研究可为内蒙古草原主要蝗虫的系统发育及演化研究提供分子生物学依据。     

梨种质资源遗传多样性研究中的RAPD技术引物筛选

[研究目的]RAPD技术已广泛用于种质资源遗传多样性研究,中国梨属植物资源丰富,通过对RAPD多态性引物的筛选,为RAPD技术在梨属种质资源中的应用提供参考;[方法]以梨属44个种和品种为试验材料,通过RAPD扩增技术,筛选RAPD多态性引物;[结果]从50个随机引物中筛选出18个多态性引物,所选出的多态性引物每个引物扩增出的条带数在4～11之间,扩增出的DNA片段分子量大多在450～2000 bp之间,共扩增出118个条带,其中样品间相同的条带数有11条,呈现多态性的条带107条,所选引物的多态百分率达90.8%.[结论]所筛选的18个引物为梨属植物RAPD扩增多态性引物,可广泛用于梨属植物的RAPD扩增技术.     

应用RAPD分析亚麻种质资源遗传多样性研究

[目的]对40份亚麻种质资源进行分类。[方法]通过RAPD技术分析,利用类平均法（UPGMA）进行了聚类分析。[结果]从供试材料中筛选出11条具有多态性的RAPD引物。RAPD引物共扩增到71条清晰的多态性条带,多态性比率为88.8%。对标记结果进行了UPGMA聚类分析,聚类结果表明地理位置相近的品种聚为一类。[结论]为大批量亚麻种质资源的鉴定和分类以及资源的有效利用提供了理论依据。     

基于RAPD标记分析葱属7个栽培品种的遗传多样性

[目的]利用RAPD标记分析葱属7个栽培品种的遗传多样性。[方法]采取改良CTAB法提取植物的总DNA,从68个RAPD引物中筛选出25条具有多态性且扩增稳定的引物用于品种的DNA多态性分析,采用优化后的RAPD的PCR反应体系进行PCR扩增。利用MEGA4软件进行各品种间UPGMA聚类分析。[结果]从25个引物中共扩增出245条DNA带,其中99条为多态性带。根据聚类分析,葱属7个栽培品种可分为2类：汉中冬韭、阜丰1号和豫韭2号为1类;其他4个为1类,其中怀化大蒜和南宁大蒜、连葱6号和杭州分葱各为1小类;7个品种的相似系数范围为80．2％～99．8％。该聚类结果与依据表型特征的传统分类的结果一致。[结论]该研究为准确地进行葱属植物种质资源的鉴定、筛选和利用提供了科学依据。     

李RAPD扩增片段的不同电泳检测及其序列特征分析

[目的]为更好地将随机扩增多态（RAPD）技术应用于李品种资源鉴定及遗传基础的研究提供理论依据。[方法]以16个李品种为材料,分别使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）对RAPD的PCR扩增产物进行电泳检测,并对检测效果进行比较。[结果]PAGE电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量均高于琼脂糖凝胶。根据2种电泳系统获得的标记信息构建了2张树状聚类图,2张聚类图的聚类情况基本一致。通过对随机挑选的23个片段进行克隆与测序,结果发现23个片段都是对应引物的RAPD扩增产物。其中有4条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可以扩增编码蛋白的基因片段。[结论]RAPD不仅能扩增基因组上的非蛋白编码序列,而且还可以扩增编码蛋白的基因片段,是能够较全面反映基因组序列信息理想的DNA标记技术。     

薹菜种质资源的RAPD和ISSR分析

【目的】对29份薹菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis Makino var.tai-tsai Hort) 种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为薹菜的种质资源保护和利用奠定基础。【方法】利用优化的RAPD和ISSR标记体系,对采自山东、江苏和北京的29份薹菜品种进行DNA多态性分析,并采用类平均法对29份薹菜品种的RAPD和ISSR扩增结果进行聚类分析。【结果】从273条RAPD引物中筛选的33个RAPD引物,共扩增出了336条清晰的谱带,其中293条显示多态性,平均每个引物扩增出10.2条多态性谱带,多态性比率为87.2%。利用RAPD标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.63～0.79。从100条ISSR引物中筛选的45个ISSR引物,共扩增出了522条清晰的谱带,其中414条显示多态性,平均每个引物扩增出9.2条多态性谱带,多态性比率为79.3%;利用ISSR标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.70～0.86。【结论】基于RAPD和ISSR标记构建的29份薹菜品种的聚类树状图虽有一定差异,但总体趋势一致,1、20、21号薹菜与其他品种的遗传距离相对较远。     

淫羊藿植物DNA指纹图谱的构建

[目的]建立淫羊藿植物的DNA指纹图谱。[方法]对来自贵州、四川等的17种淫羊藿植物进行RAPD标记研究。[结果]从80个引物q-筛选出13个谱带清晰、多态性好的引物,共扩增得到263条谱带,多态性条带259条,多态性百分率为98．5％,建立了17种淫羊藿植物的DNA指纹图谱。[结论]每个物种均有各自特异的共有谱带、特有谱带、缺失谱带,这些谱带可用于淫羊藿的物种鉴定。     

观赏植物"孩儿莲"及其近缘植物的RAPD分析

[目的]了解八角属植物披针叶八角种内的遗传多样性和亲缘关系。[方法]以＂孩儿莲＂等13个植物类型为试验材料,以木莲、白玉兰、香樟为外类群对照进行RAPD分析。[结果]从35条随机引物中,筛选出多态性强、带型清晰、重复性好的随机引物20条,13个供试植物类型共扩增出154条DNA谱带,其中共有条带47条。利用NTSYSpc2.10e软件进行数据处理和分析,相似系数的变异在66.2%～90.3%。用UPGMA法进行聚类分析,可将13个供试植物类型划分为3个类群。[结论]＂孩儿莲＂等13个供试植物有较近的亲缘关系,其遗传差异与地理因素之间未见确定联系。     

7种芸香科植物的RAPD分析

[目的]构建芸香科植物7个种12个材料的聚类分析树状图,为芸香科植物系统学的研究提供分子水平上的证据。[方法]以芸香科植物7个种12个材料为研究对象,利用RAPD技术对其亲缘关系进行分析。[结果]在建立适合芸香科植物PCR-RAPD反应体系的基础上,从21条随机引物(10 mer)中筛选出10个,对所有供试材料进行扩增,共获得10张DNA指纹图谱,85条DNA谱带,其中84条为多态带,多态性谱带比例为98.82%。[结论]建立了基于RAPD的芸香科植物亲缘关系树状图,该结果与经典的芸香科植物的起源、分类基本一致。     

圆鼻巨蜥遗传多样性的RAPD分析

[目的]采用RAPD技术对圆鼻巨蜥（Varanus salvator）进行遗传多样性分析。[方法]用20个随机引物对圆鼻巨蜥36个个体的基因组DNA进行PCR扩增。[结果]有10对引物能扩出清晰稳定的条带,共扩增出2952条DNA片段,平均每个个体扩增出82个条带,其中47条具多态性,多态性位点比为57.32%,36个个体间遗传距离为0.035 9~0.335 9,平均遗传距离为0.135 92。Nei s基因多样性指数H=0.181 9,Shannon s多样性指数I=0.263 0,表明圆鼻巨蜥具有较高的遗传多样性。[结论]采用UPGMA法构建了36个个体相互关系的分子聚类图,发现没有形成明显的种群分化。     

Genetic Diversity in Wild Populations of Poacynum hendersonii from Inland Arid Regions of Northwest China

[Objective] Study on the genetic diversity in wild populations of Poacynum hendersonii.[Method] Random amplified polymorphic DNA(RAPD)technique was employed to analyze the genetic diversity in five wild populations of P.hendersonii sampled from Xinjiang,Gansu and Qinghai provinces.[Result] Totally 165 clear and repeatable bands were generated in RAPD reaction by using 20 primers screened from 80 primers,of which 110 were polymorphic,accounting for 66.67%.At species level,Nei's gene diversity index(H),Shannon's information index(I)and genetic differentiation coefficient(Gst)were 0.220 5,0.304 7 and 0.908 2,respectively.P.hendersonii germplasm resources share a high level of genetic diversity,and genetic differentiation mainly exists among the populations.Results from genetic distances and cluster analysis showed that relationships among P.hendersonii populations were to some extent related with their geographical and climatic characters.[Conclusion] This study suggests that the conservation of P.hendersonii should focus on the protection of many populations,particularly the Qinghai population.     

中国西北内陆干旱区大叶白麻野生居群遗传多样性研究(英文)

[Objective] Study on the genetic diversity in wild populations of Poacynum hendersonii.[Method] Random amplified polymorphic DNA(RAPD)technique was employed to analyze the genetic diversity in five wild populations of P.hendersonii sampled from Xinjiang,Gansu and Qinghai provinces.[Result] Totally 165 clear and repeatable bands were generated in RAPD reaction by using 20 primers screened from 80 primers,of which 110 were polymorphic,accounting for 66.67%.At species level,Nei's gene diversity index(H),Shannon's information index(I)and genetic differentiation coefficient(Gst)were 0.220 5,0.304 7 and 0.908 2,respectively.P.hendersonii germplasm resources share a high level of genetic diversity,and genetic differentiation mainly exists among the populations.Results from genetic distances and cluster analysis showed that relationships among P.hendersonii populations were to some extent related with their geographical and climatic characters.[Conclusion] This study suggests that the conservation of P.hendersonii should focus on the protection of many populations,particularly the Qinghai population.     

中国西北内陆干旱区大叶白麻野生居群遗传多样性研究

[目的]研究大叶白麻野生居群的遗传多样性。[方法]采用RAPD技术对分布于新疆、甘肃和青海的5个大叶白麻野生居群的遗传多样性水平进行检测。[结果]经筛选的20条引物共扩增出165条清晰、重复性好的DNA条带,其中多态性条带为110条,多态位点百分率(PPB)为66.67%。居群间Nei′s多样性指数为0.2205,Shannon’s信息指数为0.3047,遗传分化系数(Gst)为0.9082。大叶白麻具有较高的遗传多样性水平,遗传分化主要发生在居群间。聚类分析显示居群间的相似度与分布区的地理和气候特征相关。[结论]在利用大叶白麻资源的同时,应根据各居群的品质和遗传特征,对这些居群尤其是青海居群加以保护。     

克氏原螯虾4个地理群体遗传差异的RAPD分析

[目的]对克氏原螯虾4个地理群体的遗传多样性状况进行调查,为克氏原螯虾遗传育种、资源保护和利用提供一定的理论依据。[方法]应用RAPD技术对怀远县（HY）、盱眙县（XY）、潜江市（QJ）、升金湖（SJH）4个地理群体的克氏原螯虾各30个个体进行了遗传多样性分析。[结果]在优化的反应条件下,所挑选的上海生工200个随机引物中,共有20个引物扩增出清晰稳定的片段。遗传距离显示克氏原螯虾群体间有一定遗传分化,其中怀远群体和潜江群体之间的遗传距离最大（0.3333）,潜江群体和升金湖群体之间的遗传距离最小（0.2203）。怀远群体内的遗传相似系数最高（0.9187）,盱眙最低（0.8900）。[结论]淮河水系的怀远群体和盱眙群体聚为一支,长江水系的潜江群体和升金湖群体聚为一支。     

RAPD技术在志贺菌及沙门菌鉴别中的应用

以鸡鲍氏志贺菌、鸡白痢沙门菌和痢疾志贺菌为研究对象,分别提取基因组DNA,利用6条随机引物以随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对其基因组DNA进行了分析.结果表明,4条随机引物能较好地在这3种菌中检测到多态性分子标记.共扩增出了59个DNA片段,其中3个菌株共有的谱带有7条,而显示多态性的片段有52条,占88.1%.引物P6的扩增图谱可用于3株细菌的鉴别.在对3株细菌扩增中发现,鸡鲍氏志贺菌与人痢疾志贺菌的扩增条带相同率达67%,但各有自己的特征性谱带.鸡沙门菌与志贺菌的扩增谱带相差甚远.     

利用RAPD标签分析3种鲤科鱼群体的遗传变异

[目的]利用RAPD技术对草鱼、鲢鱼和鲫鱼群体遗传变异进行初步研究。[方法]用20种10 bp长的随机引物对草鱼、鲢鱼和鲫鱼进行RAPD-PCR扩增,从20种引物扩增出来的DNA条带中筛选条带清晰的6种引物,分析这3种鱼的遗传变异。[结果]结果表明:草鱼与鲢鱼的RAPD指纹图谱带型差别不明显,草鱼与鲢鱼、鲫鱼品种间的带纹相似系数分别为0.375和0.416,遗传距离分别为0.625和0.584;鲢鱼与鲫鱼品种间带纹相似系数为0.366,遗传距离为0.634。[结论]RAPD是一种非常灵敏的种间鉴定技术,特别是对鱼种类的鉴定有重要意义。