利用RAPD、ISSR标记分析白芨种质资源遗传多样性的研究

旨在分析不同地区野生驯化白芨居群间亲缘关系,为白芨资源保护和利用提供支撑。利用RAPD和ISSR标记技术从分子层面鉴别源于湖南、湖北、贵州、云南、江西等地的12个白芨资源遗传多样性差异,并通过UPGMA对该差异性进行了聚类分析。结果表明,在36条供试RAPD引物中有13条扩增带型清晰、多态性高,15条供试ISSR引物中有2条扩增带型清晰、多态性高,共获得40条多态性条带;通过UPGMA聚类分析表明,12份供试白芨种质资源间具有较高的遗传多样性,遗传距离最大可达0.975,供试材料总体上可分为两个支系,湖南、江西为一个支系,湖北、贵州和云南为一个支系。利用ISSR和RAPD标记可以从分子水平上揭示白芨的种质资源遗传多样性,同时,研究还发现ISSR标记能比RAPD标记扩增出更多的多态条带和获得更高的多态比率,且分析不受时间和地点限制,结果更稳定、可靠。本研究结果显示白芨居群间遗传差异性与地理距离呈现一定的相关性,对研究白芨物种的演化及遗传多样性提供了相关数据和理论支持。     

云南野生大蜜蜂(Apis dorsata)群体遗传多样性的微卫星分析

为了阐明大蜜蜂的群体遗传特征,评价云南地区大蜜蜂的遗传多样性,本研究利用14对微卫星引物对采自云南省的35群野生大蜜蜂进行了群体遗传变异检测和遗传多样性分析。在大蜜蜂群体中共检测到51个等位基因,平均等位基因数为3.642 9,平均有效等位基因数2.809 2,平均期望杂合度为0.573 0,平均多态信息含量为0.524 3。根据Nei’s遗传距离用UPGMA方法对35群大蜜蜂进行亲缘关系分析,结果聚为A,B,C,D共4个支系。结果表明云南大蜜蜂群体遗传多样性相对贫乏,分化程度较低。     

太湖秀丽白虾遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对取自4个湖区（东太湖、南太湖、西太湖、北太湖）的各20尾太湖秀丽白虾进行了遗传多样性分析。筛选的17个随机引物共检测到85个位点（200-1500bp）。各群体的多态位点比例为32.94%-38.82%,遗传多态度为0.2134-0.2518,群体间最大遗传距离为0.0545,最小遗传距离为0.0094。用UPGMA对4个群体进行聚类分析,构建聚类分析图。结果表明,太湖秀丽白虾的遗传多样性较丰富,不同湖区的群体没有明显的遗传分化。     

3种不同颜色果实的南方红豆杉RAPD多样性分析

本研究采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,比较了在安徽宣城发现的黄色、金黄色果实红豆杉和普通红色果实红豆杉的遗传多样性。通过提取3种样品DNA,对20个10 bp随机RAPD引物进行PCR扩增,共获得97个条带,其中18个引物扩增的多态性条带有74条,占76.29%;普通红色果实豆杉DNA多态性百分率最大,为30.93%,而黄色果实红豆杉DNA多态性百分率最小,为17.53%。黄色果实红豆杉和金黄色果实红豆杉之间的遗传相似系数为0.546 4,黄色果实红豆杉和普通红色果实红豆杉之间遗传相似系数为0.515 5,金黄色果实红豆杉和普通红色果实豆杉之间的遗传相似系数为0.412 4。研究结果初步表明,黄色果实红豆杉和金黄色果实红豆杉之间亲缘关系较近,遗传差异性小,金黄色果实红豆杉和普通红色豆杉之间亲缘关系较远,遗传差异性较大。本研究结果可为了解红豆杉的遗传变异状况,黄色果实红豆杉资源的开发、利用和保护提供分子生物学依据。     

金鱼品系的遗传多样性分析及亲缘关系初探

采用RAPD技术对草金（Grass goldfish）、红龙睛（Red dragoneye goldfish）、鹤顶红（Red-head wen goldfish）、水泡（Blisters-eye goldfish）、黑寿（White-head oval goldfish）等5个金鱼代表品种的遗传多样性及其亲缘关系进行研究。用14个引物在5个金鱼群体中共检测出116个位点,其中多态性位点27个。金鱼群体总的DNA多态位点百分率为23.3%。结果表明,5种金鱼群体间的遗传相似性指数均在0.8759~0.818之间,存在一定的差异,但未达到显著水平,群体间遗传多样性差异不明显。群体间遗传相似性度最小的为草金和黑寿（0.8759）,其遗传距离最大（0.1241）,说明这2种群体亲缘关系最远;鹤顶红与黑寿的遗传相似性度最大（0.9182）,其遗传距离最小（0.0818）,可推断两者的亲缘关系较近。UPGMA法和NJ法的聚类分析显示,草金和红龙睛,鹤顶红和黑寿有较近的亲缘关系,这与传统金鱼品种演化关系的观点一致。研究金鱼遗传多样性对保护金鱼的种质资源有重要意义。     

基于SSR标记的贵州野生白三叶遗传多样性分析

采用SSR分子标记技术,对贵州22份野生白三叶(Trifolium repens)样品遗传多样性及亲缘关系进行了研究.结果表明,利用20对SSR引物共扩增出202条带,其中169条带具有多态性,多态性位点达83％;根据SSR标记的多态性计算不同采样地野生白三叶样品之间的遗传距离(GD),22份样品之间遗传距离介于0.140 6～0.630 4之间,说明样品间遗传差异较大;聚类分析结果,当相似系数为0.64时,22份白三叶被分成3类:第1类只有W14,表明W14与其余材料的亲缘关系较远;第2类包括W2、W4、W8、W18居群,表明这4个居群相似性较大,遗传距离较近;第3类包括17个居群,居群间有着复杂的遗传关系.研究结果表明,22份贵州野生白三叶的遗传多样性十分丰富.     

龙眼种质资源的RAPD分析

利用RAPD技术对龙眼的95份种质资源和一份荔枝种质资源进行研究。从200条随机引物中筛选出18条多态性引物,共扩增出197条带,DNA扩增带的多态性为100%,这表明96份材料的遗传多样性和遗传资源的丰富性。利用SPSS13.0统计软件对RAPD表型数据矩阵进行分析。根据欧氏距离（ED）法计算各样品间的遗传距离,采用UPGMA（类平均法）,进行分析,建立亲缘关系聚类树状图。结果表明,RAPD标记能在分子水平揭示龙眼的遗传背景与亲缘关系     

麦冬遗传多样性的RAPD分析及分子指纹图谱构建

以福建莆田、泉州、福安等地及浙江崇寿、湖北襄樊、四川三台等地34个自然居群的麦冬类植物为试材,以80 条 10 碱基随机引物进行RAPD 分析,研究百合科植物麦冬及山麦冬不同自然居群间的遗传多样性。试验筛选出15条有效引物,共扩增获得 1566条DNA多态性带,通过聚类分析,构建DNA 分子系统树图,确定了其居群及种间亲缘关系。结果表明,不同自然种群间麦冬类植物遗传差异明显,具有丰富的遗传多样性,其中野生资源比栽培类型遗传多样性更大;不同自然居群间遗传差异与地理分布联系并不紧密,而与形态差异联系较密切。     

粤西龙眼遗传多样性的RAPD分析

为了保护和利用粤西野生和栽培龙眼种质资源,通过RAPD技术对粤西野生和栽培共5个龙眼品种的遗传多样性进行分析。结果表明：从100个10 bp长的随机引物中筛选出14个重复性好、稳定性高的有效引物,共扩增出70条带,其中多态性带42条,占总扩增条带的60%。聚类分析结果表明：5个龙眼品种间的遗传差异性不大,但野生龙眼与其他4个龙眼品种的遗传距离相对较大,平均为0.07375,在系统树上单独聚为一支,其余4个品种聚为另一支,说明野生龙眼与栽培品种之间的亲缘关系相对较远。‘双孖木’与‘大乌圆’的遗传距离最小,仅为0.01236,在系统树上构成姊妹类群,推测二者具有共同起源或为近缘品种。     

福建省致病疫霉菌SRAP遗传多样性分析

为了解福建省致病疫霉菌的群体遗传结构,为该病原菌的遗传进化提供理论依据,笔者应用SRAP分子标记技术对福建省致病疫霉菌的群体遗传多样性,及不同地区菌株间的关系进行比较分析。利用10个菌株从110对引物组合中筛选出多态性引物10对,对分离自福建省10个不同市（县）的62个致病疫霉菌菌株DNA进行PCR扩增,共产生92条谱带,其中多态性标记90条,多态检测率为97.8%。利用NTSYpc Version2.1软件对供试菌株间的遗传距离进行聚类分析并构建系统树状图。以遗传距离0.57为阈值,可将供试62个菌株划分为4个遗传聚类组,SRAP分组与菌株的地理来源、寄主均无明显相关性。聚类分析结果表明,福建省不同地区的致病疫霉菌整体亲缘关系相近,但各菌株间存在遗传差异。     

千瓣莲品种资源的RAPD分析

¹School of Life Science, Northwest A & F University, Yangling 712100; ²Wuhan Institute of Vegetable Science, Wuhan 430065     

Genetic diversity of wild and cultivated soybeans growing in China revealed by RAPD analysis

To evaluate the genetic diversity and to clarify the genetic relationships of wild and cultivated soybeans growing in China, 21 wild soybean accessions and 27 cultivated soybean landraces were analysed by using the random amplified polymorphic DNA method. The data show that wild soybean has a higher genetic variation than cultivated soybean, indicating that genetic variation has been reduced by domestication of wild soybean. Based on Nei's genetic similarity coefficient, all the accessions were classified into two major clusters, corresponding to wild and cultivated varieties of soybean. Furthermore, within each species, the accessions tend to form sub‐clusters that are in agreement with their geographical origins, demonstrating that an extensive geographical genetic differentiation exists in both species. For cultivated soybean, the varieties from the same geographical region but with different seasonal types were found to have closer genetic relationships than varieties from different geographical regions but with the same seasonal type. This result indicates that geographical differentiation plays a key role in the genetic differentiation of both wild and cultivated soybeans. Cultivated soybean varieties with different seasonal types in a region might have been established mainly from the local genotypes.     

四倍体与二倍体紫薇光合特性研究

为了解四倍体紫薇和二倍体紫薇光合生理特性的差异,培育优质林木,采用英国PP-Systems公司产CIRAS-1型便携式光合系统测定人工诱变培育的四倍体紫薇品种和二倍体紫薇品种的各项光合生理参数及其变化规律。结果表明：四倍体和二倍体紫薇的叶片净光合速率日变化都呈单峰型曲线,但峰值出现的时间不同。两个紫薇品种的净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)和水分利用率(WUE)差异显著,蒸腾速率(Tr)、表观量子效率(AQY)和羧化效率(CE)差异不显著。光饱和点(LSP)为二倍体紫薇[1445μmol/(m2?s)]<四倍体紫薇[1670μmol/(m2?s)],光补偿点(LCP)为二倍体紫薇[12.23μmol/(m2?s)]<四倍体紫薇[42.2μmol/(m2?s)];CO2饱和点(CSP)为二倍体紫薇[1200μmol/mol]<四倍体紫薇[1427.5μmol/mol],CO2补偿点(CCP)为二倍体紫薇[32.24μmol/mol]<四倍体紫薇[35.71μmol/mol]。四倍体紫薇单位叶面积叶绿素含量显著高于二倍体紫薇(P<0.05)。     

Isozyme variation in Ethiopian tetraploid wheat (Triticum turgidum) landrace agrotypes of different seed color groups

Summary Ethiopian landraces of tetraploid wheat can be grouped according to their seed colors in three major groups: brown, purple and white seeded. Seeds with different colours are used for different purposes, and the three seed colour groups are treated separately in breeding programs. The genetic variation between and within these groups was studied by isozyme analyses at six highly polymorphic loci in sixty landrace agrotypes. The mean number of alleles per locus was 1.95. The mean allele frequencies showed significant variation both within and between the seed colour groups. The brown and white seeded types had very high genetic identity and the genetic identity values between the brown and purple and the purple and white groups were only slightly smaller. The average coefficient of gene differentiation between the seed colour types was very low. Only about 5% of the total genetic variation was due to differences between the seed colour groups. This indicates that agrotypes of different seed colours can not be treated as genetically separate and distinct groups.     

Phenotypic and genotypic analysis of a commercial cultivar and wild populations of Anemone coronaria

Seven wild populations of Anemonecoronaria were assessed for 11 phenotypic traits, most of them having economic value for the flower industry. The wild populations were sampled to represent the diversity in habitats, climates, rock and soil types, terrains, and elevations in Israel. AFLP analysis was carried out on 12 individuals from each of six out of the seven wild populations and for six individuals from the commercial cultivar ‘Mona-Lisa’. It was found that the Dorot population, which is located in the area bordering the semi-arid zone at the very end of the species distribution, exhibits extreme and different phenotypes with relatively low variability compared withthe other wild populations. The other six wild populations, that grow in more favorable geographic and climatic conditions exhibit phenotypes with larger plants, larger numbers of flowers and less dissected leaves. These populations were less uniform than that of Dorot. Genetic characterization by AFLP markers revealed a total of 165 bands. The wild populations exhibit wide variation within-population, with about 80% polymorphic bands and average gene diversity between pairs of about 30%. The Dorot population has the lowest genetic variation and the Megido population the highest. Thus, the phenotypic variation reflects the genetic variation. The cultivar ‘Mona-Lisa’, as expected, has much lower genetic variation. The Dorot population and the ‘Mona-Lisa’ cultivar were found to have the largest genetic distances from the other wild populations, and the highest genetic variation between themselves. Phenetic analysis yielded a dendrogram describing the genetic relatedness of these populations. This revised version was published online in August 2006 with corrections to the Cover Date.     

利用新型分子标记EST-SSR鉴定湖北省内的主栽黑杨品种

EST-SSR标记是基于表达序列标签(expressed sequence tags,EST)数据信息,并结合SSR标记特点开发出的一种新型分子标记.本文利用12对EST.SSR标记对湖北省内目前主要栽培的8个黑杨品种进行分子鉴定,同时对不同EST.SSR位点进行相关遗传参数分析.品种鉴定结果表明,仅需4对EST-SSR引物即可将8个亲缘关系较近的黑杨品种完全区别开来.遗传多样性分析显示,多态位点百分比为58.3%,平均有效等位基因数为2.09个,平均Shannon信息指数0.61,平均杂合度为0.35.这些结果表明,杨树EST-SSR标记完全可以应用于品种鉴定及群体遗传多样性分析.     

楸树EST-SSR标记开发及种质资源的遗传多样性分析

利用转录组数据开发SSR标记是一种经济高效的DNA分子标记开发策略。本研究利用高通量测序技术开发楸树(Catalpa bungei)EST-SSR标记,了解其在转录组序列中的分布类型,并利用41对多态性较好的引物对来自安徽(AH)、河南(HN)、湖北(HB)和山东(SD)的4个楸树居群的48个无性系的遗传多样性进行分析。结果表明:在大于1kb的14634条序列中,共鉴定出3999个SSR位点,580条序列包含2个及以上位点;单核苷酸重复(1957,48.94%)是最常见的SSR类型,其次是二核苷酸重复(1164,29.11%),三核苷酸重复(834,20.86%),四核苷酸重复(41,1.03%)和五核苷酸重复(3,0.08%);共扩增出243个等位基因,每个位点的等位基因数为3~13个,平均为4.85个,观测杂合度为0.14?1.00,平均为0.63,期望杂合度为0.42?0.84,平均为0.67,大部分位点偏离哈迪-温伯格平衡;AH和HN居群在有效等位基因数和期望杂合度的数值较高,表明其遗传多样性较丰富;分子方差分析(AMOVA)表明,遗传变异主要发生在居群内。本研究为楸树及同属其他树种种质资源鉴定、遗传多样性提供依据,且在指导楸树良种选育等方面具有重要的意义。     

36个水稻骨干系的基因组分析及其遗传育种学意义 Ⅱ利用不同方法对稻种分类的研究

选取３６个栽培稻、普通野生稻骨干系进行了ＲＦＬＰ聚类，并对分子标记法、程氏指数法和杂交亲和力法进行了比较分类。结果表明，三种分类方法对水稻材料的分类是基本一致的。采用不同方法进行整理分类，有利于对水稻材料的深刻理解与认识。通过ＲＦＬＰ聚类树状图、籼粳倾向性图及基因型的综合分析，明确了中国普通野生稻可分偏粳型和原始普野型，国外普通野生稻包括偏籼型与原始普野型。中国原始普野型相对倾粳，国外原始普野型相对倾籼，它们是遗传分化显著不同的两种类型。     

部分蔷薇（Rosa multiflora）属植物的RAPD分析

蔷薇作为园林观赏植物,在中国城市绿化中应用较为广泛,但目前应用的蔷薇品种较为混杂,尚无系统研究。本研究采用RAPD技术对部分蔷薇属植物进行亲缘关系的分析,旨在进一步明确蔷薇种、品种,为引种育种以及材料选择提供参考。对蔷薇属植物的2个种、1个变种、20个品种进行了RAPD分析,16个引物对供试蔷薇材料PCR扩增获得175条谱带,其中多态性条带151条（86.3%）表现出丰富的遗传多态性。且不同花色系蔷薇属植物间的遗传多态性不同,白色系75.16%,粉红色系73.46%,黄色系37.50%。利用UPGMA法构建树状聚类图,蔷薇属植物的2个种、1个变种、20个品种在阈值为0.667处被分划为两大类群,这两大类群间的遗传距离较近,黄蔷薇与黄刺枚单独被划分为一个类群,与上述两类群间的遗传距离较远。聚类结果显示出了蔷薇的演化趋势：白色、单瓣是蔷薇较为原始的一个性状,花径大、重瓣性高是现代蔷薇栽培品种的性状,而部分粉红色半重瓣蔷薇则是从野生种到现代栽培品种的中间过渡类型。     

中国不同地理来源籼稻地方品种的亲缘关系研究

利用61对SSR引物对原产于中国14个省的440份籼稻地方品种进行了SSR分析,并对各省、经度和纬度间的籼稻地方品种进行了遗传距离和聚类分析。结果表明,籼稻地方品种遗传距离变异范围在各省份间为0.0707~0.4076;经度间为0.0680~0.3032;纬度间为0.0385~0.2696。相邻的省份、经度、纬度的籼稻地方品种基本归为同一类群,遗传距离和亲缘关系较近,而地理位置相隔较远的省份、经度、纬度的籼稻地方品种基本归为不同类群,遗传距离和亲缘关系较远,说明籼稻地方品种的亲缘关系与地理位置有着密切的相关性。但按经度和纬度划分较按省份划分的品种间遗传距离更具有规律性。