撒坝猪及长撒二元杂交猪SLA-DQB基因与繁殖性状的相关性分析

<正>猪主要组织相容性复合物(MHC),又称为SLA,即猪白细胞抗原。SLA位于7号染色体的短臂上,与J、C两血型系统连锁在一起,其结构与人的MHC极为相似。猪MHC的Ⅱ类基因位于SLA-D区,它控制着机体的免疫应答与调控,在调节机体的抗病能力方面起到非常重要的作用。有研究表明,具Ⅱ类不同     

撒坝猪SLA-DQA基因多态性与生长性状的相关性分析

应用PCR-RFLPs方法检测撒坝猪SLA-DQA基因突变位点多态性,通过最小二乘分析进行基因型与生长性状表型值的相关分析,结果表明SLA-DQA基因3种基因型在所分析的几个阶段体重和6月龄体尺性状上差异均未达到显著水平,且而在0⁴5日龄日增重和70日龄45日龄日增重和70日龄⁴月龄日增重上AA基因型与AB基因型间的差异达到显著水平,大多数生长性状都以BB型的较高。     

撒坝猪及长撒二元杂猪SLA-DQB基因PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切酶RsaⅠ对云南地方品种撒坝猪及其长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2的273bp扩增产物进行多态性分析,结果在2种猪中均发现B、C、G3种等位基因,在撒坝猪中发现6种基因型:132bp/84bp/30bp/27bp(BB)、246bp/27bp(CC)、132bp/114bp/27bp(GG)、246bp/132bp/84bp/30bp/27bp(BC)、132bp/114bp/84bp/30bp/27bp(BG)、246bp/132bp/114bp/27bp(CG);长撒二元杂猪中发现5种基因型:BB、CC、BC、BG、CG。经χ2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQB基因外显子2在RsaⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传不平衡状态。     

撒坝猪胰岛素样生长因子-Ⅰ基因多态性及其与部分生长性状的关联分析

胰岛素样生长因子-Ⅰ(insulin-like growth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)基因的表达产物对猪肌肉的生长有着重要的调控作用。以IGF-Ⅰ基因作为撒坝猪生长性状的候选基因,运用PCR-RFLP技术对其HhaⅠ位点的多态性进行了检测,并对IGF-Ⅰ基因的多态性与12个阶段体重、日增重和体尺性状的关系进行了分析。结果表明,撒坝猪IGF-Ⅰ基因的多态性较为丰富,产生AA、AB和BB 3种基因型,其基因型频率分别是0.3473、0.5149、0.1378,等位基因A和B的频率分别是0.6048、0.3952,且该基因座位处于Hardy-Weinberg平衡状态,撒坝猪IGF-Ⅰ基因的遗传变异对其生长性状有着显著的影响(P<0.05或P<0.01),其中,不同阶段体重和日增重的增效基因型为AB基因型,180日龄体尺性状的增效基因型多为BB基因型(部分性状表现为AB基因型最高)。结合前人的研究,初步推断IGF-Ⅰ基因可能是影响猪生长性状的一个主效基因或是一个与影响猪生长性状的数量性状座位(quantiative trait locus, QTL)连锁的基因。     

撒坝猪及长撒二元杂交猪SLA-DQA基因PCR-RFLP多态性分析

根据SLA-DQA基因cDNA序列和已报道的引物序列,在猪中成功扩增了一个731bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子.采用限制性内切酶EcoR1对撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQA基因的扩增产物进行多态性分析,结果2个猪种在酶切后出现2个等位基因,3种基因型:654 bp/77 bp(AA)、731 bp(BB)和731 bp/654 bp/77 bp (AB).分析发现,A等位基因在群体中占优势,经X2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂交猪SLA-DQA基因在EcoR1酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态.     

撒坝猪部分生长发育性状的典型相关分析

采用SAS统计分析系统对577头撒坝猪的3个体重性状和5个体尺性状进行了典型相关分析。结果表明,体重与体尺性状的第一、第二典型相关系数达到了显著水平(P<0.01),分别为0.9532和0.3044,占总相关的99.97%。体重性状与体尺性状间的相关主要是由于4月龄体重、6月龄体重与6月龄胸围、6月龄腿围的相关引起的。在达到显著水平的两对典型变量中,体重性状的两个典型变量对6月龄体长、胸围和腿围的预测能力较强,体尺性状的两个典型变量对4月龄体重和6月龄体重的预测能力较强,在实际育种中,选择体尺性状可同时达到提高体重性状之目的。     

撒坝猪部分生长发育性状的典型相关分析

采用SAS统计分析系统对577头撒坝猪的3个体重性状和5个体尺性状进行了典型相关分析.结果表明,体重与体尺性状的第一、第二典型相关系数达到了显著水平(P＜0.01),分别为0.9532和0.3044,占总相关的99.97%.体重性状与体尺性状间的相关主要是由于4月龄体重、6月龄体重与6月龄胸围、6月龄腿围的相关引起的.在达到显著水平的两对典型变量中,体重性状的两个典型变量对6月龄体长、胸围和腿围的预测能力较强,体尺性状的两个典型变量对4月龄体重和6月龄体重的预测能力较强,在实际育种中,选择体尺性状可同时达到提高体重性状之目的.     

撒坝猪专门化母系繁殖性状的相关与通径分析

利用撒坝猪专门化母系 7个世代共 576头母猪的繁殖性能数据 ,对总产仔数 (x1 )、活产仔数 (x2 )、初生窝重 (x3)、 2 0日龄窝重 (x4 )、断奶窝重 (x5)、育成率 (x6 )和断奶仔数 (y) 7个繁殖性状进行了相关和通径分析 ,并在此基础上建立了估计断奶仔数的最优回归方程。结果表明 ,撒坝猪专门化母系的繁殖性能在经过 7个世代的选育后 ,获得了明显提高。各繁殖性状间在表型值上都存在不同程度的相关 ,其中以总产仔数与活产仔数的相关程度最高 (r=0 92 0 1 ) ,其次为 2 0日龄窝重与断奶仔数 (r=0 82 88) ,而初生窝重与育成率间的相关系数最低 (r=0 0 381 )。在所分析的 7个性状中 ,除了总产仔数和活产仔数与育成率间为负相关外 ,其余性状间均为正相关。所建立的估计断奶仔数的多元回归方程为 :y=- 6 1 1 90 +0 6986x2 +0 0 33 7x4 +0 0 0 4 8x5+0 0 71 8x6 。     

MC4R基因遗传变异与猪生长性状的相关性分析

为了揭示猪生长性状分子辅助选择标记在不同群体中的遗传效应,本研究采用PCR-RFLP技术,在杜洛克猪、大白猪、长白猪和豫南黑猪群体中对生长性状相关候选基因MC4R的遗传多样性进行检测,并分析其与猪平均日增重、平均日采食量和料重比的相关性。本研究结果显示:MC4R的D298N变异位点在4个猪群中均存在多态性,其中G等位基因为优势等位基因;性状关联分析结果显示,在杜洛克猪群体中,GG基因型个体的平均日增重显著高于AA基因型(P0.05)、料重比显著低于AA基因型(P0.05);在长白猪群体和大白猪群体中GG基因型个体的平均日增重具有高于AA、AG基因型的趋势,料重比有低于AA、AG基因型,但均未达到显著水平(P0.05)。     

撒坝猪配套系生长胴体性能杂种优势分析

对以云南地方良种撒坝猪为母本的6个杂交组合的生长胴体性能的杂种优势进行分析。结果表明：杂种优势在各组合各性状间普遍存在，各性状间的超高亲优势存在显著性差异，各组合间的超高亲优势差异不显著，超中亲优势在各组合各性状间的差异显著。6个杂交组合中，值得推广应用的组合为杜撒和杜约撒。     

撒坝猪胴体瘦肉率与活体性状间的灰色关联度分析

应用灰色关联度分析法对撒坝猪胴体瘦肉率与几个活体性状间的关系进行了分析。结果表明,瘦肉率与各性状间的关联度大小顺序为:胸围>活膘>体长>体重≥体高>腹围>管围。根据关联度分析原则,以胸围、活膘、体长与瘦肉率关系较为密切,在猪瘦肉型品系选育中应予以足够重视。并提出了该法在种猪个体的综合评比、新品系鉴定和杂交组合的筛选上运用的可能性。     

撒坝猪体尺性状的聚类与主成分分析

本文应用聚类与主成分分析,对４８８头撒坝猪的六月龄体尺性状进行了研究。结果表明,撒坝猪的体尺性状可分为体重、体型、特征三大类,体重与体长、体高、胸围、腹围、活膘等性状间呈显著相关,管围与体高、腿围与活膘呈强正相关,在撒坝猪品系选育中应予以重视。     

猪肉质性状与生长性状的相关性研究

旨在研究杜长大三元杂猪肉质性状与生长性状的相关性。试验选取419头杜长大三元杂商品猪,其中阉公猪209头,母猪210头。所有试验猪在相同环境下统一饲养至150日龄后进行屠宰测定,分析不同日增重(ADG)、日均采食量(ADFI)和饲料转化率(FCR)对肉质性状(肉色、肌内脂肪含量、大理石纹、电导率、水分含量、pH值)的影响及性状间相关性。研究结果表明,杜长大猪肉质性状的变异系数比生长性状高,其中电导率、大理石纹和肌内脂肪含量的变异系数均超过20%,提示该性状具有较大的遗传改良空间;不同生长性状对肉质性状的影响结果表明,高日增重组(ADG>1 000 g)猪的pH值和水分含量均显著高于低日增重组(ADG≤900 g)(P<0.05),而肌内脂肪含量随日增重的增加而下降;高日均采食量组(ADFI>2 400 g)猪的肌内脂肪含量显著高于中、低日均采食量组(2 2000.26、2.4相似文献   

撒坝猪及其配套系氟烷基因检测与遗传效应分析

利用PCR -RFLP技术对云南省楚雄州种猪场 1 0 4头种猪 (包括撒坝纯种 71头 ,加系大约克 1 0头 ,丹系长白 8头 ,美系杜洛克 9头及三元杂大长撒 6头 )进行了氟烷基因检测。发现杂合子猪(Nn) 4头 ,包括 2头大约克 ,2头大长撒 ,未发现阳性猪 (nn) ,其余皆为阴性 (NN)。对大长撒氟烷基因杂合子与同群阴性猪作生长和肉质性状比较 ,显示其杂合子在瘦肉率、日增重和料重比等有优势 ,而肉质性状无明显差异。本文还就氟烷基因对地方母系及其配套系建设的影响作了初步分析     

撒坝猪胴体瘦内活体性状间的灰色关联度分析

应用灰色磁联度分析法对撒坝猪胴体瘦内民几个活体性状间的关系进行了分析。结果表明：瘦内民各性状间的关联度大小顺序为：胸围〉活膘〉体长〉体重≥体高〉腹围〉管围。根据关联度分析原则，以胸围、活膘、体长人率关系较为密切，在猪瘦肉型品系选筛应予以足够重视。并担子同该法在种猪个体的综合评比、新品系鉴定和杂交组合的筛选上运用的可能性。     

高×撒杂交猪与高黎贡山猪和撒坝猪生产性能的比较分析

本研究通过对云南地方猪品种高黎贡山猪和撒坝猪及其杂交组合的生产性能进行研究,以期生产出适应云南气候环境且生产性能好的杂优商品猪。实验选取胎次、出生日期、体重相近的高黎贡山猪、撒坝猪、高×撒杂交猪（高黎贡山猪×撒坝猪）各12头（6♂,6♀）进行饲养,饲养结束后每组随机屠宰6头（3♂,3♀）,对其各项生产性能指标进行测定及比较分析。结果表明：高×撒杂交猪的平均日增重显著高于高黎贡山猪,但低于撒坝猪,且耗料增重比最低;与高黎贡山猪相比,高×撒杂交猪屠宰性能中的宰前活重、胴体重极显著增高,皮厚降低,腰大肌肌纤维直径降低,背最长肌氨基酸中的苏氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、鲜味氨基酸、必需氨基酸极显著增高,脂肪酸中的油酸、花生四烯酸、二十二碳一烯酸、不饱和脂肪酸含量极显著增高,胆固醇含量显著降低;与撒坝猪相比,高×撒杂交猪屠宰性能中的瘦肉率增高,皮率、脂率降低（P<0.05）,肉质性能中的瘦肉率增高、滴水损失降低（P<0.05）,背最长肌氨基酸中的苯丙氨酸极显著增高,脂肪酸中的棕榈酸、十七烷酸、花生四烯酸、二十二烷酸、二十二碳一烯酸含量极显著增高。由此可见,高×撒杂交猪结合了高黎贡山猪和撒...     

撒坝猪SPDEF基因克隆及其生物信息学分析

为明确猪SPDEF基因的遗传特性,试验对不同猪种SPDEF基因的CDS区进行序列扩增、测序、拼接,并对撒坝猪SPDEF基因CDS序列进行生物信息学分析。采用PCR直接测序法测定猪SPDEF基因外显子序列,运用SeqMan进行序列拼接。采用生物信息学软件分析撒坝猪SPDEF基因开放阅读框及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构、功能结构域,并构建系统进化树。结果表明,各猪种SPDEF基因编码区仅在外显子1、2分别检测到1个同义突变(C13971T、C16541T),表明该基因编码区在所检测的猪群中高度保守。生物信息学分析发现,该基因有1个长1 092 bp的完整开放阅读框;SPDEF蛋白中丝氨酸(Ser)含量最高(10.7%),体外理论半衰期为30 h,属于不稳定的亲水性蛋白;该蛋白不存在信号肽及跨膜结构,存在39个潜在的磷酸化位点和1个糖基化位点,亚细胞定位于细胞质;二级结构预测中,参与无规则卷曲的氨基酸最多(55.10%),其次是α-螺旋(28.37%);功能结构域预测发现,该蛋白存在1个ETS功能结构域和1个SAM-PNT功能结构域。系统进化树结果显示,撒坝猪与牛、绵羊和山羊的亲缘关系较近。本研究为进一步分析撒坝猪SPDEF基因的功能奠定了一定的理论基础。     

高坡猪肌肉生长抑制素基因多态性及其与肉质性状的相关性分析

为了探讨肌肉生长抑制素（myostatin,MSTN）基因的多态性对高坡猪肉质性状（水分、粗脂肪、粗蛋白质、粗灰分、眼肌面积、大理石纹、pH、肉色、嫩度、滴水损失、失水率）的影响,试验以MSTN基因作为肉质性状候选基因,以10月龄的50头高坡猪为研究对象,采用PCR扩增产物直接测序的方法对高坡猪MSTN基因3个外显子的单核苷酸多态性（SNP）进行研究,运用SPSS 20.0软件分析MSTN基因SNP与肉质性状的关联性。结果表明,仅在高坡猪MSTN基因第3外显子63 bp处检测到1个C/T突变位点,该突变为同义突变,未引起编码氨基酸的改变。基因型分析发现,仅有3个个体在该位点发生突变,CC基因型为优势基因型,C为优势等位基因,无TT纯合基因型。经χ²适合性检验分析,该SNP在研究群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。群体遗传参数分析发现,C63T标记位点的杂合度（He）相对较低,表明其在高坡猪群体中的变异较小;就多态信息含量（PIC）而言,该位点属于低度多态（PIC<0.25）,说明该遗传标记能够提供少量的遗传信息。将该位点的不同基因型与肉质性状指标进行关联分析表明,所有肉质性状指标在不同基因型间差异均不显著（P>0.05）。综上所述,MSTN基因外显子在高坡猪中存在多态性,但变异较少,相对保守,能否作为高坡猪肉质性状的遗传标记有待于扩大样本数量进一步研究。     

撒坝猪SPDEF基因克隆及其生物信息学分析

为明确猪SPDEF基因的遗传特性,试验对不同猪种SPDEF基因的CDS区进行序列扩增、测序、拼接,并对撒坝猪SPDEF基因CDS序列进行生物信息学分析。采用PCR直接测序法测定猪SPDEF基因外显子序列,运用SeqMan进行序列拼接。采用生物信息学软件分析撒坝猪SPDEF基因开放阅读框及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、磷酸化位点、糖基化位点、二级结构、三级结构、功能结构域,并构建系统进化树。结果表明,各猪种SPDEF基因编码区仅在外显子1、2分别检测到1个同义突变(C13971T、C16541T),表明该基因编码区在所检测的猪群中高度保守。生物信息学分析发现,该基因有1个长1 092 bp的完整开放阅读框;SPDEF蛋白中丝氨酸(Ser)含量最高(10.7%),体外理论半衰期为30 h,属于不稳定的亲水性蛋白;该蛋白不存在信号肽及跨膜结构,存在39个潜在的磷酸化位点和1个糖基化位点,亚细胞定位于细胞质;二级结构预测中,参与无规则卷曲的氨基酸最多(55.10%),其次是α-螺旋(28.37%);功能结构域预测发现,该蛋白存在1个ETS功能结构域和1个SAM-PNT功能结构域。系统进化树结果显示,撒坝猪与牛、绵羊和山羊的亲缘关系较近。本研究为进一步分析撒坝猪SPDEF基因的功能奠定了一定的理论基础。     

撒坝猪与滇南小耳猪杂交性能比较分析

为研究撒坝猪和滇南小耳猪及杂交子代的生产性能,开发具有云南特色的优质猪种,试验选取撒坝猪、滇南小耳猪、滇撒猪、撒滇猪进行屠宰(每种猪各4头,公母各半),对屠宰性能、肉质性能进行比较分析。结果表明:滇撒猪屠宰率、瘦肉率等胴体性能高于撒滇猪;滇撒猪p H值、肉色、大理石纹、猪肉持水能力优于撒滇猪;但滇撒猪不饱和脂肪酸、胆固醇含量及鲜味氨基酸、必需氨基酸总量比撒滇猪低。说明在屠宰性能、肉质性能方面滇撒猪和撒滇猪杂交优势明显,滇撒猪胴体性能优于撒滇猪,撒滇猪肉品风味优于滇撒猪。