1个改进的DNA分子量标准物--pT13/Hind Ⅲ Marker

在对某些基因进行克隆操作的过程中已经发现,重组质粒pT1和pT2等量混合,经Hind Ⅲ酶切后的电泳条带分布均匀,比较适合作为质粒DNA酶切鉴定的分子量标准物(Marker),并将其命名为pT12/Hind Ⅲ Marker[1].     

1个新的DNA分子量标准物

在基因重组过程中 ,DNA酶切后各片段分子量大小的鉴定是最普遍的检测步图 1　 p T12 Hind 酶切结果1.λDNA/ Hind Marker;2 .DL150 0 0 Marker;3.p T12 / Hind 骤之一。目前 ,市购的 DNA分子量标准物 ( Marker)各有其优缺点 ,如 λDNA/Hind Marker分子量范围较大 ,但 4 3 61     

CpG寡脱氧核苷酸长链DNA的克隆及重组质粒载体的构建

为构建长链CpG ODN DNA,将合成的含有CpG的GTCGTT核心序列以TT间隔开后重复3次,并在3′端添加polyG结构,而后在其两翼人为添加Xba Ⅰ的黏性末端(简称为A链)后合成与其互补的互补链(简称为B链),通过退火形成CpG ODN DNA单体,以DNA连接酶将CpG单体连接为多聚体后再以A链和B链作为引物,利用SOE-PCR技术对poly CpG ODN DNA进行长链扩增,分别将600～700 bp片段克隆到pMD-18T载体中,并获得相应的重组子pUC44、pUC26及pUC30.序列分析结果表明:3个重组子与理论上产生的含有10,11,13个CTAGATCGT(CG)TTTTGT(CG)TTTTGT(CG)TTGAGGGGGGAT拷贝长链CpG ODN DNA标准序列的同源性分别为97.4%、97.9%和97.1%.     

用DNA免疫研制鸡白细胞介素2单克隆抗体

构建鸡白细胞介素2(鸡IL-2)的真核重组质粒pcDNA-IL-2和原核重组质粒pET-IL-2,以重组质粒pcDNA-IL-2免疫BALB/c小鼠,取免疫小鼠的脾细胞和骨髓瘤细胞SP2/0进行融合,以重组质粒pET-IL-2在大肠杆菌BL21(DE_3)中诱导表达的蛋白作为筛选抗原,通过间接ELISA法对杂交瘤进行筛选,经亚克隆后共获得3株针对鸡IL-2的特异性单克隆抗体,并对这3株单克隆抗体的特性进行了鉴定。     

线粒体DNA缺失质粒pMDD-Z的构建及鉴定

分别以pEGFP-Mito和pAN4质粒为模板,扩增出MTS-EGFP和EcoRⅠ基因片段,利用快速体外基因重组技术-重组PCR,将两者连接得到MTS-EGFP-EcoRⅠ片段,构建克隆载体pTRE2hyg-EE,经AgeⅠ和NotⅠ双酶切得到MTS-EGFP-EcoRⅠ融合基因产物,连接克隆于真核表达质粒pEGFP-Mito后获得pMDD-Z质粒。琼脂糖凝胶电泳结果显示,MTSEGFP和EcoRⅠ基因片段大小分别是831 bp和860 bp。测序结果显示,插入pTRE2hyg--EE克隆载体中的MTS-EGFPEcoRⅠ片段大小1 672 bp,且基因序列正确,没发生点突变。琼脂糖凝胶电泳结果显示,pMDD-Z质粒的双酶切产物分别为1 587 bp的插入片段和4 024 bp的载体片段。测序结果显示,pMDD-Z质粒中含1 659 bp的开放阅读框,编码553个氨基酸,从N端至C端,分别为线粒体信号导肽、绿色荧光蛋白和限制性内切酶EcoRⅠ,且未发生移码突变。     

铜绿假单胞菌oprH基因DNA疫苗的构建与检测

研究旨在构建铜绿假单胞菌oprH基因的DNA疫苗。试验根据GenBank中已发表的铜绿假单胞菌的oprH基因序列,设计合成了一对特异性引物,利用PCR技术由铜绿假单胞菌基因组DNA中扩增获得该目的基因,进行胶回收纯化并与T载体进行连接,经双酶切和PCR鉴定后将重组质粒进行酶切回收目的基因片段,并将其亚克隆于真核表达载体pCAGGS-HA中,以双酶切和PCR方法进行鉴定。结果显示：PCR成功扩增出约600 bp的oprH基因,连接T载体后的重组质粒经双酶切和PCR鉴定,均可获得大小正确的目的基因片段。真核重组载体鉴定结果显示,oprH基因成功克隆于真核表达载体pCAGGS-HA中。研究表明,试验成功构建了oprH基因的DNA疫苗,为进一步研究其免疫效果及铜绿假单胞菌新型疫苗的研制提供参考。     

麝致病性沙门氏菌的质粒DNA分析

本文采用LysisTriton法对15株麝致病性沙门氏菌进行质粒抽提,并用HindⅢ、EcoRⅠ及BamHⅠ3种内切酶对质粒进行单酶切分析,结果表明:质粒得率为93.3%,15株麝致病性沙门氏菌菌株具有相同或相似的质粒图谱和酶切图谱。质粒DNA分析为四川养麝场致病性沙门氏菌的分子流行病学分析提供了科学依据。     

地高辛标记PPV—DNA—C及PUP重组质粒探针的比较研究

应用分子克隆技术制备的猪细小病毒复制型ＤＮＡ的ＰｓｔⅠ／ＨｉｎｄⅢ双酶切片段Ｃ及被克隆到ＰＵＣ１９中的Ｃ片段形成的重组质粒ＰＵＰ利用非放射性的地高辛标记后制备两种探针。分别对不同来源的猪细小病毒ＤＮＡ及ＰＵＰ重组质粒于硝酸纤维素膜上打点杂交，免疫呈色后均为阳性反应，而对照的猪瘟病毒、乙型脑炎病毒、伪狂犬病毒、ＰＫ－１５细胞的核酸均为阴性反应。通过对已知量的ＰＰＶ－ＤＮＡ检测发现Ｃ探针及ＰＵＰ探针的最低检出限量分别为４０ｐｇＤＮＡ和４ｐｇＤＮＡ。重组质粒ＰＵＰ探针比双酶切后的Ｃ片段探针敏感１０倍     

猪繁殖与呼吸综合征DNA重组质粒对猪的免疫效应

猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)灭活疫苗、表达GP5蛋白的DNA重组质粒分别与表达IL-2和IL-4的重组质粒(pcDNA-IL-2和pcDNA-IL-4)联合免疫健康仔猪,经3次免疫后人工感染PRRSV HB-2株,检测仔猪体液免疫以及攻毒保护性反应。研究结果显示,重组质粒pCI-GP5可诱导免疫猪产生抗GP5抗体,最高ELISA抗体效价可达1∶285。攻毒后组织中PRRSV核酸的检出率下降30.3%,与对照组相比,差异显著(P<0.05),表明表达PRRSV GP5的DNA重组质粒pCI-GP5可诱导一定的免疫效力。pcDNA-IL-2与pCI-GP5联合免疫后,病毒血症的出现频率减少38.9%,PRRSV阳性组织检出率下降28.8%,与对照组差异显著(P<0.05);pcDNA-IL-4与pCI-GP5联合免疫后,最高ELISA抗体效价可达1∶320,病毒血症的出现频率下降38.9%,PRRSV阳性组织检出率减少34.8%,与对照组相比差异极显著(P<0.01)。本研究表明,PRRS DNA重组质粒pCI-GP5对猪的免疫保护力是稳定的,真核表达的细胞因子pcDNA-IL-2与pcDNA-IL-4能够显著增强pCI-GP5的免疫保护力。     

内蒙古白绒山羊Hairless基因实时荧光定量PCR标准质粒和标准曲线的构建

根据GenBank中绵羊、牛的Hairless和β-actin基因编码区保守序列,设计特异性引物,提取皮肤组织总RNA,经反转录RT-PCR扩增,产物回收纯化后与pGM-T载体连接,转化大肠杆菌感受态细胞Top10,质粒提取后经酶切、PCR和测序鉴定,获得阳性Hairless、β-actin重组质粒;将阳性重组质粒按103～107拷贝/反应梯度稀释作为模板,进行实时荧光定量PCR,系统软件自动生成标准曲线及回归方程。结果显示,产物熔解曲线峰值单一,说明引物特异性高,且无引物二聚体;Hairless和β-actin基因标准曲线相关系数分别为r2=0.998、r2=0.999,说明线性关系好。重复性试验结果显示,所构建的重组质粒9次同条件扩增Ct值具有良好的重现性,且变异率小于6%（107拷贝/反应除外）,说明标准曲线重复性好。试验成功构建了目的基因Hairless、内参基因β-actin的标准质粒和标准曲线,为实时荧光定量PCR检测绒山羊Hairless基因的mRNA表达水平奠定基础。     

实时荧光定量PCR检测PrP基因表达标准品质粒和标准曲线的构建

对金黄地鼠P rP基因序列进行分析,选择其高度保守区域设计引物,对金黄地鼠各组织提取mRNA,经RT-PCR扩增,产物纯化后与pGEM-T-easy连接,转化大肠杆菌DH5α,筛选后得到重组标准品质粒,对重组标准品质粒进行酶切、PCR和测序鉴定,表明P rP基因保守区段已经成功克隆。将107~102拷贝/反应的重组标准品质粒进行荧光定量PCR,10次重复C t值平均分别为17.50±0.5、21.38±0.2、25.29±0.7、29.12±0.7、31.34±0.4、33.89±0.1,系统自动分析软件显示C t值与标准品浓度的对数之间存在良好的线性关系,回归系数为0.998。对动力学曲线分析表明,在该反应体系和反应条件下,该标准曲线的灵敏度为102拷贝/反应。荧光PCR P rP基因表达检测标准品质粒和标准曲线的建立,为检测P rP基因的组织特异性表达和动物传染性海绵状脑病发生的分子机理奠定了基础。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪圆环病毒2型基因重组质粒实时荧光定量PCR标准曲线的构建

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ORF7和猪圆环病毒2型(PCV2)ORF1的核苷酸序列设计特异性引物,经RT-PCR/PCR扩增,分别扩增出大小为308 bp和417 bp的部分基因片段。用T4连接酶将目的片段与pGEM-Teasy载体系统连接,并转化到大肠杆菌DH-5α株感受态细胞。提取的质粒经PCR、酶切和测序鉴定,证实为PRRSV和PCV2的阳性重组质粒。将重组标准质粒10倍系列稀释后作为模板,通过实时荧光定量PCR方法(Real-time PCR),建立了PRRSV、PCV2的标准曲线及其直线回归方程,并确定其最佳读板温度。该方法具有线性关系好、特异性强、敏感性高、重复性好等特点,为分析PRRSV和PCV2共感染猪体内病毒的绝对含量提供了必要的技术平台。     

长链CpG寡脱氧核苷酸DNA重组质粒对禽流感灭活疫苗免疫应答的影响

为明确导入长链CpG寡脱氧核苷酸3个DNA重组质粒对禽流感H5亚型灭活疫苗的免疫应答的影响,将21日龄试验雏鸡随机分为6组,即健康对照组(A组)、疫苗对照组(B组)、空载体对照组(C组)、pUC26免疫促进组(D组)、pUC30免疫促进组(E组)及pUC44免疫促进组(F组),对6组雏鸡在首免后1～8周(WPI)检测其HI抗体水平并在1、4及8 WPI测定脾脏、法氏囊及胸腺免疫器官指数.研究结果表明:在2WPI,D(P<0.01)、F(P<0.01)及E组(P<0.05)HI抗体水平极显著或显著高于C组;在3WPI,F组HI抗体水平分别显著高于B(P<0.05)、C(P<0.05)及E组(P<0.05);在5WPI,F(P<0.01)和D(P<0.05)组HI抗体水平极显著或显著高于C组;在6 WPI,F组HI抗体水平显著高于C组(P<0.05);在8 WPI,F组HI抗体水平极显著高于B(P<0.01)或C组(P<0.01).在4WPI,A组胸腺指数极显著或显著高于C(P<0.05)及D组(P<0.01),E组胸腺指数显著高于D组(P<0.05);在8WPI,E组脾脏指数显著高于A组(P<0.05).     

回收DNA片断及纯化质粒DNA方法的研究

本研究建立了一种用聚乙二醇(PEG)溶液从琼脂糖凝胶电泳中直接回收DNA片段和纯化质粒 DNA的方法。此方法简便、快速、经济,DNA回收率可达70%-85%以上。     

用于DNA疫苗的质粒大规模纯化研究进展

DNA疫苗就是把外源基因克隆到真核质粒表达载体上,然后将重组的质粒DNA直接注射到动物体内,使外源基因在活体内表达.     

我国建成世界最大玉米标准DNA指纹库

记者日前从北京市农林科学院玉米研究中心获悉,该中心的玉米标准DNA指纹库,包括14000多个玉米品种,已成为世界上最大的玉米标准DNA指纹库。     

内蒙古白绒山羊Hairless基因实时荧光定量PCR标准质粒和标准曲线的构建

根据GenBank中绵羊、牛的Hairless和β-actin基因编码区保守序列,设计特异性引物,提取皮肤组织总RNA,经反转录RT-PCR扩增,产物回收纯化后与pGM-T载体连接,转化大肠杆菌感受态细胞Top10,质粒提取后经酶切、PCR和测序鉴定,获得阳性Hairless、β-actin重组质粒;将阳性重组质粒按10³～10⁷拷贝/反应梯度稀释作为模板,进行实时荧光定量PCR,系统软件自动生成标准曲线及回归方程。结果显示,产物熔解曲线峰值单一,说明引物特异性高,且无引物二聚体;Hairless和β-actin基因标准曲线相关系数分别为r²=0.998、r²=0.999,说明线性关系好。重复性试验结果显示,所构建的重组质粒9次同条件扩增Ct值具有良好的重现性,且变异率小于6%(10⁷拷贝/反应除外),说明标准曲线重复性好。试验成功构建了目的基因Hairless、内参基因β-actin的标准质粒和标准曲线,为实时荧光定量PCR检测绒山羊Hairless基因的mRNA表达水平奠定基础。     

MDCC—MSB1培养基上清液中DNA活性的定性研究

将 Ｍ Ｄ Ｃ Ｃ Ｍ Ｓ Ｂ１ ４８ 小时培养物 １０００ｒ／ｍ ｉｎ 离心的上清液分别用 Ｒ Ｎ Ａ 酶、 Ｄ Ｎ Ａ 酶和蛋白酶 Ｋ 处理后,进行体外试验。结果表明,只有 Ｄ Ｎ Ａ 酶处理后的上清液失去了体外抑制 Ｍ Ｄ Ｖ“８１４”增殖的作用。将该上清液 １００００ｒ／ｍ ｉｎ 离心所得的沉淀分别用上述酶处理后进行体内试验。结果表明,只有 Ｄ Ｎ Ａ 酶处理的样品失去了体内促进 Ｍ Ｄ Ｖ 京１ 株致瘤的作用。同时,电泳分析结果证明,该上清液中确实存在 Ｄ Ｎ Ａ。     

用于构建双价禽流感DNA疫苗的双目的基因表达质粒的构建及鉴定

为探索构建禽流感双价或多价DNA疫苗的可行性,本研究以本实验室前期研制的禽流感DNA疫苗p CAGGopti HA5为基础[其中含有禽流感病毒(AIV)A/Goose/Guang Dong/1/96(H5N1)的HA基因],将增强型绿色荧光蛋白(eGFP)报告基因作为第二个目的基因,利用双启动子启动、内部核糖体进入位点(IRES)介导以及通过蛋白Linker编码序列连接融合表达两个目的基因的形式,构建了双启动子重组表达质粒pH5-eGFP、IRES介导的重组表达质粒pHIE以及融合表达重组质粒pH6E。并采用脂质体介导将这3种重组质粒分别转染293T细胞,通过间接免疫荧光试验和western blot方法检测HA和eGFP这两种目的蛋白的瞬时表达情况。结果显示,这3种重组质粒均能够正确表达AIV的HA蛋白和eGFP。其中pH5-eGFP表达出两个独立的目的蛋白,而且互相不影响各自的表达和细胞定位;pH6E则以融合形式表达两种目的蛋白,由于HA蛋白具有膜定位信号,所以融合蛋白主要定位于细胞膜上。本研究结果表明,双启动子表达质粒和双目的蛋白融合表达质粒适合用于构建AIV以及其他相关病原的双价DNA疫苗。