应用参考家系信息构建猪12号染色体部分微位星位点遗传图 …

为了提高猪１２号染色体遗传图的精度,选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系,采取了两胎共１５４头个体的血样,全血裂解法提取ＤＮＡ后,对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染色体上３个微卫星位点（ＳＷ１５５３,ＳＷ８７４,ＳＷ１３５０）的基因型,应用ＣＲＩＭＡＰ程序进行了统计分析,得到的３位点间的最佳排离为：ＳＷ１５５３－ＳＷ１３５０－ＳＷ８７５。其中在两     

含6x小黑麦血缘的抗病小麦新材料的选育及醇溶蛋白分析

３ 个６ｘ 小黑麦品种和２ 个普通小麦品种杂交回交,选育出ＮＲ９８９２ 等１１ 个系群２１６ 个株系,其中大部份抗条锈病或（ 和） 白粉病。应用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳（ＡＰＡＧＥ） 分析了ＮＲ９８９２ 系群的６４ 个株系及其亲本Ｃｕｒｒｅｎｃｙ、小偃６ 号和川育１２ 号的醇溶蛋白。结果表明：１７－１９ ％ 的株系含有黑麦１ＲＳ所特有的Ｇｌｄ１Ｂ３ 位点,５７－８１ ％ 的株系在Ｇ１ｉ－ ２ 位点发生了普通小麦与６ｘ 小黑麦遗传物质重组;６４ 个株系中出现了１ 种亲本类型,３ 种重组类型和３ 种突变重组类型,突变率１７－１９％ 。文中还讨论了６ｘ 小黑麦向普通小麦导入有用遗传物质的育种方法。     

猪二价染色体上双色引物原位标记技术初探

人性成熟的猪睾丸中获得比有丝分裂中期明显要长的二价体，采用红、绿两种颜色的报告分子（Ｄｉｇ－１１－ｄＵＴＰ和ｉｏ－１６－ｄＵＴＰ）来标记不同染色体ＤＮＡ的特 目的序列，得到了标记信号。由此探索了一种在猪二价染色体上能同时检测两种不同 列的绰物原位标记（ＰＲＩＮＳ）技术。讨论了影响双色和ＰＲＩＮＳ技术的几个因素。     

尿激酶原基因cDNA在BHK21细胞中的表达

将人尿激酶原（Ｐｒｏ－ＵＫ）基因ｃＤＮＡ分别插入到真核表达载体ｐｃＤＮＡ３的ＣＭＶ启动子和ｐＳＶ２－ｎｅｏ的ＳＶ４０启动子下游,构建了重组表达质粒ｐｃＤＮＡ３－ＵＫ和ｐＳＶ２－ＵＫ,分别将这两种表达质粒以脂质体载体法转染ＢＨＫ２１细胞。ＥＬＩＳＡ检测结果表明,ｐｃＤＮＡ３－ＵＫ和ｐＳＶ２－ＵＫ在哺乳动物细胞中能够表达,７２ｈ表达量分别为２８．７ｎｇ／ｍｌ和１３．５ｎｇ／ｍｌ。     

猪MHCⅠ类基因区基因组DNA的RFLP初步分析

用４种限制性内切酶ＥｃｏＲＩ，ＢａｍＨＩ，ＨｉｂｄⅢ和ＲｓｔＩ对纯种二花脸猪和梅山猪白细胞基因组ＤＮＡ进行内急酶消化和电泳，经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ ｂｌｏｔ将ＤＮＡ转移到ＮＣ膜上，将来源于猪ＭＨＣ的Ⅰ类基因猪移植抗原基因片段克隆ＰＤ１－ＡＤＮＡ（４．３ｋｄ）用ｄｉｇｏｘｉｇｅｎｉｎ标记作为ＤＮＡ探针，进行分子杂交反应，比较了不同品系和个体间的限制性酶切片段长度多态性（ＲＦＬＰ），结果表明：（１）经各种     

罗布麻基因文库的构建

本文从罗布麻（Ａｐｏｃｙｎｕｍｖｅｎｅｔｕｍ）幼苗中提取了大分子量ＤＮＡ，经Ｓａｕ３Ａ部分酶解，从琼脂糖凝胶中回收１２－２２ｋｂ的＂目的＂ＤＮＡ片段，用ＢａｍＨＩ／ＥｃｏＲＩ双酶切入ＥＭＢＬ３ＤＮＡ制备克隆载体。＂目的＂ＤＮＡ片段与载体连接，体外包装，所得重组子数为３．７４×１０６ｐｆｕ，达到了建库要求的理论值。以番茄１，５－二磷酸核酮糖羧化酶／加氧酶（Ｒｕｂｉｓｃｏ）小亚基基因（ｒｂｃＳ）的ｃＤＮＡ为探针，用噬菌斑原位杂交法，斑点杂交法，从基因文库中选出４个含罗布麻ｒｂｃＳ基因的阳性克隆。     

猪12号染色体几个微卫星标记与部分生产性状的关系研究

众多的微卫星位点及其丰富的多态性是微卫星在各领域广泛应用的基础。在定位ＱＴＬ方面 ,现在通过建立猪资源家系 ,人们已把一些与繁殖、生长、胴体和肉质等方面有关的数量性状位点定位在某些微卫星附近。例如 ,3号染色体上微卫星ＳＷ2 4 2 7-ＳＷ2 51区域与猪的日增重、4号染色体上Ｓ0 1 0 1 -Ｓ0 1 0 7区域与背膘、腹脂、7号染色体上Ｓ0 0 64-Ｓ0 0 66区域与胴体组成和初生重有着很大的关联[1] 。 1 2号染色体为最短的中部着丝粒染色体 ,因与猪生产性状紧密相关的生长激素 (ＧＨ)基因位于其上而倍受重视[2 ,3] 。虽然目前对ＧＨ基因研究得…     

用非放射性原位杂交技术定位家猪PGD和HSL基因

用地高辛为标记物,以随机引物法标记猪ＰＧＤ ｃＤＮＡ和ＨＳＬ ｃＤＮＡ探针,经与半微量全血培养法制备的染色体进行原位杂交后,将猪ＰＧＤ和ＨＳＬ基因分别定位在猪６号染色体６ｑ＾２５和６ｃｅｎ－６ｑ＾２１区域。     

组织型纤溶酶原激活剂cDNA真核表达质粒的构建与鉴定

将组织型纤溶酶原激活剂基因ｃＤＮＡ经多次亚克隆插入到真核表达载体ｐＳＶＬ的ＳＶ４０启动子和ｐｃＤＮＡ３的ＣＭＶ启动子下游,构建了重组表达质粒ｐＳＶＬ－ｔＰＡ和ｐｃＤＮＡ３－ｔＰＡ。经酶切和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交鉴定,ｔ－ＰＡ基因的插向正确,可用于哺乳动物细胞和个体表达系统中表达。     

多小穗小麦品系10一A及其改良系的谷蛋白分析

应用十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳（ＳＤＳ－ＰＡＧＥ）分析了多小穗小麦品系１０－Ａ以及来源于三交组合１０－Ａ／８８－１６４３／川育１２号的５６个稳定品系的谷蛋白。结果表明,１０－Ａ、８８－１６４３和川育１２号的谷蛋白带纹各不相同,能彼此区分。在这５６个后代品系中,高分子量谷蛋白带纹出现了与８８－１６４３、川育１２号一致的类型以及４种三亲本间的重组类型,没有出现１０－Ａ的谱带类型和突变类型。在这些品系中,有８个品系含优质亚基组合２,７＋８,５＋１０（占１４．３％）,１１个品系含优质亚基组合１,７＋８,５＋１０（占１９．６％）。     

家猪1号染色体微卫星标记与背膘厚的相关性

为了定位家猪背膘厚在1号染色体上的数量性状位点（QTL），检测和分析了一个复杂家猪系1号染色体上8个微卫星位点的基因型及其与背膘厚的相关性，结果表明，S0113与背膘厚的相关极显著，SW974与背膘厚的相关程度也达到极显著水准，说明两上相邻的标记区域可能存在显著影响背膘厚的大效基因，其余6个微卫星标记位点与背膘厚的相关均不显著。     

微卫星标记与鹿苑鸡体重的相关性初探

利用29对微卫星标记对鹿苑鸡基因组进行扫描,共发现124个等位基因,各座位等位基因数2～10个。通过统计软件SPSS,对29对微卫星标记与鹿苑鸡12周龄体重相关性进行了分析。结果表明：位于8号和3号染色体上的3对微卫星标记ADL278、LEI166、MCW222与鹿苑鸡12周龄体重呈显著相关。位于8号染色体ADL278座位上,基因型为CC个体的12周龄体重显著高于其他基因型个体。位于3号染色体的LEI166座位上发现3个等位基因,但仅检测到5种基因型,基因型AA缺失;在检测到的5种基因型中,基因型为AB个体的12周龄体重显著高于基因型为BB、BC、CC个体;AC个体的12周龄体重与其他基因型个体无显著差异。MCW222座位亦位于3号染色体,在该座位上,基因型为BC个体的12周龄体重显著高于基因型为AA、AB、AC、CC个体;基因型为BB个体与其他基因型个体12周龄体重差异不显著。     

微卫星标记与仙居鸡体重的相关性

利用29个微卫星标记的多态性分析仙居鸡12周龄体重与微卫星标记的相关性。试验结果表明:位于3号染色体和连锁群E27C36W25W26上的2个微卫星标记MCW222、MCW165与仙居鸡12周龄体重显著相关。     

RFLP揭示的籼粳基因组多态性

采用28个RFLP籼粳特异性探针和6个SSR籼粳特异性标记对水稻不同品种进行了籼粳基因组多态性分析，结果表明，这些标记分布在水稻12条染色体上，能对水稻品种进行籼粳稻分子分类。由于水稻基因组序列图的完成和释放，使得这些籼粳特异性标记揭示的基因组多态性可以在基因组序列水平上进行分析和验证。本研究以RZ906探针和RM405为例分析了籼粳特异性其及序列分子生物学基础。     

猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)定位

 【目的】检测定位猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状位点。【方法】以3个品种(大白猪、长白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头试验猪组成资源群体,在猪10号染色体上共选取13个微卫星标记,采用基于线性混合模型方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测。通过似然比检验,利用置换法确定显著性阈值。【结果】()13个标记在群体中绝大多数的微卫星属于中度多态的遗传标记,所有微卫星标记在3个品种中的平均等位基因数为3.1754,平均杂合度为0.5215,平均多态信息含量为0.5999,平均香浓指数为1.3222。(2)达到了染色体极显著水平的3个QTL(P＜0.01),分别是影响着红细胞压积(HCT)、血红蛋白含量(HGB)和平均红细胞体积(MCV),影响血小板总数(PLT)的QTL也达到染色体显著水平(P＜0.05)。【结论】定位的4个影响猪血常规的QTL集中在10号染色体81—136cM区域,临近的标记分别为SW249、SWR136、S0070和SW1894。     

超级杂交稻两优培九产量杂种优势标记与QTL分析

【目的】对超级杂交稻两优培九影响产量及其构成因素性状的杂种优势位点进行定位,在此基础上探讨亲本培矮64S和9311的遗传差异与水稻产量性状的杂种优势间的关系,以探明水稻产量杂种优势的分子预测途径。【方法】应用经单粒传法获得后续世代的219个培矮64S×9311 F8重组自交系（RILs）株系材料与亲本培矮64S回交,并选用151个分布于水稻基因组12条染色体上的SSR多态性标记,构建回交群体RILs BCF1;构建基因组总长为1 617.7 cM、标记间平均距离10.93 cM和含151个分子标记的遗传图谱;采用分子标记技术和自由度不等的单向分组方差两组法、三组法分析,用SAS软件ANOVA分析、混合线性模型复合区间作图等方法,对回交RILs BCF1群体的产量性状及其构成因素的F1表型值进行相关分析、优势预测与QTL定位。【结果】本回交杂种群体RILs BCF1具备多种基因型,遗传变异丰富,性状平均值均显著高于亲本群体重组自交系RILs F8,共筛选到影响RILs BCF1群体产量及其构成因素性状杂种优势的阳性、增效位点74个;其中,三组法所筛选的阳性、增效位点数高于两组法,用这些阳性、增效位点所预测的遗传距离与产量F1性状值的相关性也显著提高;三组法所筛选产量性状的增效位点与两组法所筛选的增效位点完全一致;连锁紧密的位点有成簇分布的现象,每穗空粒数、每穗实粒数、结实率有6个杂种优势位点相同,并与3个产量杂种优势位点重叠,且均处在第7染色体上;通过逐步回归建立了对4个产量性状进行预测的回归方程模型;筛选到28个杂合型的特异性标记,它们与产量性状的表型值显著相关,使用特异性标记可使遗传距离与产量F1性状值的相关系数由全部标记的0.335提高到0.617;定位到3个与产量杂种优势相关的QTL和3个影响每穗实粒数杂种优势的QTL。其中,在第7染色体上影响每穗实粒数和产量杂种优势的QTL QGpp7和QHy7与影响每穗实粒数和产量杂种优势的增效位点的结果相符。【结论】通过增加筛选产量杂种优势阳性位点或增效位点数量、筛选影响杂种优势特异性分子标记的方法,可显著提高分子标记遗传距离与产量F1性状值的相关性,有效提高用分子标记遗传距离对杂种优势预测效率。定位了3个影响产量杂种优势的QTL及3个影响每穗总粒数杂种优势的QTL,分别在第2、3、7、11和12染色体上,其中,影响产量杂种优势的数量性状位点QHy7,贡献率为7.48%,可用于杂种优势的预测和杂交组合的选配。定位于第3染色体RM293-RM468的表型贡献率为14.9%的抽穗期QTL可用于早熟高产水稻的选育。     

秋稻品种Aus373广亲和基因的RFLP分析

利用Ａｕｓ３７３／ＩＲ３６／／Ｂａｌｉｌａ和Ａｕｓ３７３／ＩＲ３６／／秋光２个三交Ｆ１群体对秋稻品种Ａｕｓ３７３的广亲和性进行了遗传分析，发现这两个群体内不同个体的小穗育性有着明显的分离，呈单峰连续分布。小穗育性的高低与稃尖色之间存在连锁关系。用Ａｕｓ３７３／ＩＲ３６／／Ｂａｌｉｌａ群体构建第６染色体的ＲＦＬＰ框架图，并对亲和性基因进行了定位。在第６染色体上发现有２个来自Ａｕｓ３７３区段对小穗育性有直接贡献，其联合效应可以解释总变异的３８．４％。其中位于Ｇ２００和Ｃ基因之间的可能就是Ｓｎ５，位于Ｇ１２２和Ｇ３２９之间的可能是另一个亲和性基因。     

春小麦空间诱变SP_2的SSR标记变异分析

为了考察空间搭载对小麦的诱变效果,以实践八号育种卫星搭载的小麦品系为试材,对SP2的DNA分子标记突变频率进行分析。结果表明:12对SSR引物共扩增出3种突变类型:扩增片段增多、扩增片段减少和扩增片段长度有差异。出现的单一突变类型居多,在同一品系的个体上同时出现多类型突变的情况很少。突变频率在供试的品系之间以及SSR染色体位点都存在差异。该研究又以7个EST-SSR标记对上述SP2个体的扩增结果显示,与一般的SSR位点相比,EST-SSR标记检测到的突变类型单一,仅有"扩增片段增多"一种类型,且突变频率普遍较低,大部分基因位点无突变发生。表明空间搭载对小麦基因组产生的诱变主要发生在重复序列区,基因表达区相对较少。     

不同筛选方法的低密度SNP集合填充准确性比较

【目的】尝试通过在华西牛参考群高密度标记芯片位点中,使用两种标记筛选方法挑选具有代表性的且密度梯度不同的SNP位点集合,后利用基因组填充策略在相同填充参数下将低密度芯片数据填充至高密度继而进行后续基因组研究,从而达到降低华西牛基因型分型成本的目的。研究分别比较了不同标记集合填充准确性和填充一致性的差异,阐述了标记筛选方法、标记密度、最小等位基因频率和参考群体数量等4个因素对填充结果的影响,为华西牛低密度SNP填充芯片设计提供参考。【方法】将质控后剩余的1 233头华西牛群体随机分为参考群(986头)和验证群(247头)。使用等间距法(equidistance,EQ)和高MAF法(high MAF,HM)两种标记筛选方法分别从华西牛参考群体的Illumina Bovine HD芯片位点集合中筛选出16种不同密度的SNP集合,共生成32种不同SNP梯度密度集合。随后在验证群体中利用Beagle(v5.1)软件将各低密度集合填充至770 k密度水平,计算填充准确性和填充一致性并对填充性能影响因素进行分析。【结果】32种低密度SNP集合的标记数量在100—16 000之间,窗口最大为24 17...     

The gene for familial polyposis coli maps to the long arm of chromosome 5

The inherited genetic defect in adenomatous polyposis has been localized to a small region on the long arm of chromosome 5. Sixteen DNA marker loci were used to construct a linkage map of the chromosome. When five kindreds segregating a gene for adenomatous polyposis coli were characterized with a number of the markers, significant linkage was found between one marker and the disease gene. Linkage analysis determined the location of the defective gene within a primary genetic map of chromosome 5.