断奶前马驹与母马粪便菌群多样性分析

试验旨在探究断奶前马驹和母马粪便菌群多样性,为丰富此阶段马驹肠道菌群多样性提供依据。选取5匹5岁（2胎）、平均体重（453.34±54.23）kg、健康的纯血马母马,以及母马所生的5匹马驹,出生日期相近（±5 d）,平均体重（185.65±9.54）kg,3公2母。母马和马驹在相同环境下饲养,母马日粮组成及营养水平相同,马驹除哺乳外采食的粗饲料和精料补充料相同。马驹6月龄断奶,在断奶前1周用灭菌收粪袋采集母马和马驹的粪便样品。结果显示,母马粪便中菌群α多样性Chao1和ACE指数显著高于马驹（P < 0.05）,分别比马驹高18.94%和15.62%;母马与马驹共有的菌种数为1 399个,母马与马驹特有的菌种数分别为150和68个;在门水平,母马与马驹粪便中排在前十的菌分别是厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门、广古菌门、疣微菌门、螺旋体菌门、Unidentified_Bacteria、纤维杆菌门和无壁菌门,母马粪便中厚壁菌门丰度显著高于马驹（P < 0.05）;拟杆菌门母马比马驹高33.93%,差异不显著（P > 0.05）。由此可见,母马粪便菌群多样性显著高于断奶前马驹;母马与断奶前马驹粪便主要菌是厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门,母马粪便中厚壁菌门和拟杆菌门丰度均高于断奶前马驹。     

不同谷物淀粉对断奶马驹盲肠菌群多样性的影响

本试验旨在研究不同谷物淀粉对断奶马驹盲肠菌群多样性的影响,为研究不同谷物淀粉调控肠道菌群的生物学作用提供理论依据.选取18匹5月龄断奶哈萨克马驹,按照平均体重[(112.36±7.50)kg]相近的原则随机分为3组,每组6匹.在相同的粗饲料条件下,以谷物淀粉摄入量相同为原则,按照每头马驹每千克体重补喂谷物淀粉2 g(干...     

运用454焦磷酸测序技术对断奶前后仔猪肠道菌群的分析

本研究旨在运用454焦磷酸测序技术分析断奶前后仔猪肠道菌群的变化。随机选取胎次和出生时间相近的、体重差异不显著的健康"杜×长×大"外三元新生仔猪12头用于试验。整个试验期间由母猪按常规哺乳直到断奶(25日龄),母猪饲粮不含有抗生素,仔猪于12日龄开始饲喂教槽料。于25日龄(断奶前)和32日龄(断奶后)分别随机挑选3头仔猪进行心脏放血屠宰,无菌采集盲肠内容物,运用454焦磷酸测序技术分析断奶前后仔猪盲肠内容物中菌群结构的变化。结果表明:与断奶前仔猪相比,断奶后仔猪腹泻率显著增加(P<0.05);肠道中菌群多样性增加;肠道中拟杆菌门(Bacteroidetes)含量变化不显著(P>0.05),厚壁菌门(Firmicutes)含量显著增加了63.95%(P<0.05),梭杆菌门(Fusobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)含量分别显著减少了100.00%和70.54%(P<0.05)。对厚壁菌门含量进行深入分析发现,在纲的水平,与断奶前仔猪相比,断奶后仔猪肠道中梭菌纲(Clostridia)和芽孢杆菌纲(Bacilli)含量有减少的趋势(P>0.05),而Negativicutes纲、Erysipelotrichia纲和未知厚壁菌纲含量有增加的趋势(P>0.05)。从门到属的水平,断奶前后仔猪肠道菌群相对丰度不同,有些菌是断奶前仔猪肠道特有的,如嗜胆菌属(Bilophila)、具核梭杆菌属(Fusobacterium nucleatum)、黄杆菌属(Flavobacteriaceae)等,有些菌是断奶后仔猪肠道特有的,如费克蓝姆菌属(Facklamia)、八叠球菌属(Sarcina)等。由此可见,断奶后仔猪肠道菌群多样性和菌群结构发生了改变。     

早期断奶对藏西北白绒山羊小肠微生物组成及屏障基因表达的影响

本试验旨在研究早期断奶对藏西北白绒山羊羔羊小肠屏障基因表达量及回肠微生物群的影响,为提高牧区山羊高效健康养殖提供理论依据。选用18只体况良好、生长健康,初生重为（2.25±0.18）kg的雌性藏西北白绒山羊羔羊,随机分为2组,羔羊分别于28日龄（D28）和60日龄（D60）实施早期断奶,所有羔羊在断奶后饲喂相同的固体颗粒料至75日龄。结果表明：D28组羔羊小肠黏膜损伤较小,回肠绒毛高度、隐窝深度、肌层厚度与D60组相比无显著差异,D28组十二指肠绒毛高度高于D60组（P<0.01）,D28组空肠绒毛宽度高于D60组（P<0.01）,2组羔羊十二指肠、空肠、回肠绒毛高度与隐窝深度比值均无显著差异。小肠上皮的促凋亡（Bax、Caspase-8）和紧密连接蛋白（ZO-1、Claudin-1）基因表达无显著差异,而D28组羔羊显著降低了回肠上皮INF-γ、TNF-α等促炎因子基因的表达量。16S rRNA基因测序发现,D28组回肠中Clostridium＿XlVa相对丰度上升、Bifidobacteriaceae丰度降低（P<0.05）。综上,在高海拔极端条件下,对藏西北白绒...     

不同孵化方式对仔鸡盲肠菌群多样性的影响

为了探究孵化方式是否会影响仔鸡盲肠菌群的多样性,本研究将种蛋随机分为两组,分别采用孵化机孵化(J组)和母鸡孵化(M组)两种方式进行孵化.采集出壳前1 d、出壳后7 d和14 d的仔鸡盲肠内容物,基于高通量测序分析菌群多样性的差异.结果显示:出壳前1d的仔鸡盲肠内均未检出菌群.出壳后7d和14d的仔鸡盲肠在门水平上,两个...     

大熊猫肠道菌群年龄演替规律分析

本研究旨在探究不同年龄段大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)肠道菌群多样性、结构及功能的演替规律。于秦岭大熊猫研究中心采集16只不同年龄段大熊猫的新鲜粪便,基于16S rDNA高通量测序技术及层次聚类方法分为5个年龄组进行分析。结果表明,不同年龄段大熊猫共有优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes, 60.44%)和变形菌门(Proteobacteria, 38.69%),且随年龄增长,厚壁菌门的相对丰度逐渐增加,变形菌门的相对丰度逐渐降低;共有优势菌属为埃希菌属-志贺菌属(Escherichia-Shigella,57.35%)和狭义梭菌属1(Clostridium＿sensu＿stricto＿1,15.17%),且性别差异对大熊猫肠道菌群结构影响不大。不同年龄段大熊猫的肠道菌群Alpha多样性存在显著差异(P<0.05),呈现随年龄增长先增加后降低的趋势,在18～22岁达最高;Beta多样性结果表明,组间差异大于组内差异,不同分组对样品差异的解释具有可信度。13～14岁成年大熊猫特有的优势菌属——魏斯菌属(Weissella,9.975%)为肠道益生菌,34...     

壳聚糖对断奶仔猪肠道菌群的影响

日粮中添加不同水平壳聚糖对断奶仔猪肠道总需氧菌、乳酸菌和大肠杆菌数的影响.试验选择180头(杜×大×长)三元杂交断奶仔猪,随机分为5个日粮处理组,每处理6个重复,每重复6头猪,试验期28 d.基础日粮中分别添加0、100、500、1000和2000 mg/kg壳聚糖.各日龄阶段壳聚糖添加组盲肠和结肠内的总需氧菌均低于对照组;乳酸菌数均高于对照组,但从回归分析结果看,与壳聚糖添加量都没有明显的剂量依赖关系.各日龄阶段壳聚糖日粮组盲肠和结肠内大肠杆菌数均低于对照组.盲肠内大肠杆菌数在14d时各组间差异趋于显著,在28 d时随壳聚糖添加剂量的增加呈显著的二次曲线降低变化.结果表明:添加壳聚糖能够有效抑制结肠内大肠杆菌数,从而在一定程度上改善断奶仔猪的肠道微生态环境.     

饲粮中添加花生秧对伊拉兔肠道菌群的影响

本试验旨在研究饲粮中添加花生秧对伊拉兔肠道菌群的影响。选取(35±2)日龄、健康状况良好、体重相近的120只生长期伊拉兔(公母各占1/2),随机分为6组,每组4个重复,每个重复5只伊拉兔。6组试验兔分别用花生秧添加量为0(对照组)、10.0%、12.5%、15.0%、17.5%和20.0%的颗粒饲料进行饲喂。预试期7d,正试期42d。饲喂试验结束后,应用高通量测序技术对试验兔盲肠微生物的16SrDNAV3~V4区进行生物信息学分析。结果显示:在门水平上,与对照组相比,15.0%、17.5%和20.0%添加组盲肠内容物中Candidatus Saccharibacteria的比例显著减少(P<0.05),17.5%、20.0%添加组盲肠内容物中放线菌门(Actinobacteria)的比例显著减少(P<0.05)。在属水平上,与对照组相比,17.5%、20.0%添加组盲肠内容物中Ⅳ型梭菌属(Clostridium Ⅳ)的比例显著增加(P<0.05)。由此可见,饲粮中添加花生秧后可影响伊拉兔盲肠微生物群落的平衡,改变一些具有重要代谢功能的细菌的比例。     

类志贺邻单胞菌感染对鲟鱼肠道菌群多样性的影响

采用人工肌肉注射类志贺邻单胞菌(Pseudomonas shigella)后,以针对细菌16S rRNA基因高通量测序技术进行感染鲟鱼肠道菌群组成和多样性分析,结果显示:感染组鲟鱼肠道菌群多样性指数(Chaol、ACE、observed_species、 Shannon和Simpson)均显著低于对照组(P<0.05);感染组和对照组鲟鱼肠道优势菌群均为梭杆菌门(Fusobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteriodia)和厚壁菌门(Firmicute),但感染组鲟鱼肠道拟杆菌门细菌丰度显著小于对照组(P<0.05),而变形菌门(特别是邻单胞菌属)细菌丰度显著大于对照组(P<0.05)。结果表明,类志贺邻单胞菌感染能导致鲟鱼肠道菌群物种多样性和丰度显著变化,为鲟鱼细菌性疾病防控提供了科学依据。     

补喂鞣花酸对哺乳中后期纯血马马驹粪便菌群多样性的影响

【目的】试验旨在研究补喂不同水平的鞣花酸对马驹粪便细菌多样性的影响,通过探究粪便菌群的变化,以期为哺乳马驹胃肠道菌群多样性和肠道健康等提供参考依据。【方法】选择出生日期相近、体重为(143.33±16.10)kg的3月龄纯血马马驹15匹,随机分为3组,每组5匹,分别为对照组、试验Ⅰ组、试验Ⅱ组。在相同的饲养条件下,对照组马驹不做任何处理,试验Ⅰ和Ⅱ组马驹每天分别补喂15和30 mg/kg BW鞣花酸,进行为期60 d的饲养试验。试验第60天晨饲前于直肠采集马驹粪便样品,测定粪便菌群多样性。【结果】OTUs结果显示,试验各组共有OTUs 789个,试验Ⅰ组特有的OTUs为182个;各试验组与对照组之间Alpha多样性差异不显著(P>0.05),但试验Ⅰ组Shannon、Chao1及ACE指数有提高的趋势;菌群丰度结果表明,各试验组与对照组前十的优势菌种类相同,以厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和疣微菌门为主,且丰度占总数92.94%以上,各组之间门、科和属水平菌群丰度差异均不显著(P>0.05);LefSe分析结果表明,试验Ⅰ组有差异菌9种,试验Ⅱ组有2种;预测前十的功能有全局与...     

糖萜素对早期断奶仔猪肠道菌群的影响

试验探讨糖萜素对早期断奶仔猪肠道茵群的影响。选用21日龄左右健康且体质量基本一致的杜×长×大三元杂交猪进行饲喂试验，随机分为5组，每组3个重复，每重复8头猪，自由采食和饮水。试验设计为对照组（1组）；试验2组和试验3组在每千克基础日粮中加入250和500mg糖萜素；试验4组在每千克基础日粮中加入250mg糖萜素＋4mg黄霉素及试验5组基础日粮＋4mg黄霉素。试验结果表明，盲肠中大肠杆菌，试验2、3、4和5组分别比对照组降低4．73％、6．27％、11．98％和1．67％，说明无论是糖萜素和黄霉素单独使用还是二者联合使用，均对盲肠中的大肠杆菌生长有一定的抑制作用，尤其是糖萜素与黄霉素联合使用组和添加500mg／kg糖萜素组效果较好；结肠和直肠中大肠杆菌，各试验组与对照组差异不显著（P〉0．05），其中以500mg／kg糖萜素组大肠杆菌含量最低。添加500mg／kg糖萜素组能显著促进盲肠中双歧杆菌增殖（P〈0．05），并显著高于糖萜素与黄霉素联合使用组和黄霉素单独使用组（P〈0．05），但对结肠和直肠中双歧杆菌增殖不明显（P〉0．05）；糖萜素的不同添加水平对各肠段乳酸杆菌增殖效果不明显（P〉0．05），但在盲肠中各试验组不同程度提高了乳酸杆菌增殖，糖萜素与黄霉素联合使用组对于盲肠中乳酸杆菌的影响大于添加500mg／kg糖萜素组及黄霉素单独使用组。结肠和直肠中乳酸杆菌试验各组差异不显著（P〉0．05），随着糖萜素添加量的增加，乳酸杆菌的含量也增加。     

益生菌对断奶仔猪肠道形态和菌群的影响

本文通过论述益生菌的生理作用来探讨益生菌对缓解断奶仔猪断奶应激的影响,得出益生菌可以有效地改善仔猪断奶应激引起的肠道结构和功能变化。     

仔猪断奶期间腹泻冢肠道酶肠道菌群的变化

仔猪在生长过程中 ,必须经过断奶关。断奶对仔猪是一种应激反应 ,这种应激引起猪体各种病理生理反应 ,可导致断奶仔猪腹泻 ,严重时死亡。断奶后腹泻发生的严重程度与多种因素有关 ,包括断奶日龄、断奶体重、饲料、环境、应激等。1　断奶日龄有关仔猪多大日龄断奶最宜 ,国内外进行了大量的试验研究 ,旨在寻找一个既能提高仔猪存活率 ,又能提高其增重和生产性能、健康状况 ;既能减少仔猪腹泻的发生 ,又能缩短母猪的哺乳期、增加年产窝数、提高经济效益的合适的仔猪断奶日龄。在传统的养猪生产中 ,仔猪常在 45～ 6 0日龄断奶。为使哺乳母猪尽早…     

莱芜仔猪肠道菌群组成初步分析

猪的肠道菌群组成与种类及健康状态密切相关,研究健康、品种优良的猪的肠道菌群组成对于养猪业的发展具有积极意义。本研究采用16SrRNA高通量测序方法对10日龄莱芜哺乳仔猪腹泻仔猪的粪便进行测序分析。结果显示,健康仔猪共有优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes）,共有优势菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）;腹泻仔猪共有优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidetes）,共有优势菌属为乳杆菌属（Lactobacillus）。此外,两组比较,Lactobacillus、Escherichia-Shigella、Prevotella＿9、Fusobacterium、Prevotellaceae属在腹泻仔猪组丰度水平高,而Acinetobacter、Jeotgalibaca、Treponema＿2、Psychrobacter属在健康仔猪组丰度水平高。本研究结果为莱芜猪肠道菌群多样性研究提供基础数据,并为后期调节肠道菌群、促进猪的健康成长提供参考依据。     

基于高通量测序分析健康比格犬肠道菌群结构

为研究健康幼龄比格犬肠道菌群结构,并进一步开展犬的肠道菌群调整试验奠定基础,本试验收集15只3月龄健康比格犬粪便,通过16S rRNA基因组测序分析肠道菌群在门、纲、目、科、属水平上的相对丰度。结果显示,比格犬肠道菌群在门水平上有6个门,相对丰度为厚壁菌门50.63%、梭杆菌门21.23%、拟杆菌门19.88%、放线菌门5.38%、变形菌门2.86%和脱铁杆菌门0.01%;在纲水平上主要有9个纲,相对丰度为梭杆菌纲29.42%、梭菌纲21.23%、拟杆菌纲19.88%、丹毒菌纲16.75%、杆菌纲4.45%、棒状杆菌纲3.89%、β-变形菌纲1.83%、放线菌纲1.49%和γ-变形杆菌纲1.01%;在目水平上主要有9个目,相对丰度为梭菌目29.42%、梭杆菌目21.23%、拟杆菌目19.88%、丹毒丝菌目16.75%、乳杆菌目4.39%、红蝽杆菌目3.89%、伯克氏菌目1.83%、双歧杆菌目1.48%和肠杆菌目0.90%;在科水平上主要有19个科,其中相对丰度前10位的分别是梭杆菌科21.23%、丹毒丝菌科16.75%、瘤胃球菌科11.99%、帕拉普氏菌科8.36%、韦荣氏球菌科7.0...     

马齿苋多糖对断奶大鼠肠道菌群影响的研究

本研究旨在探究马齿苋多糖(POP)对断奶大鼠肠道菌群结构变化的影响。30只断奶SD大鼠[(21±1)日龄]随机分为3组,每组10只。试验动物均饲喂相同的基础饲粮,POP低剂量组(LD组)和POP高剂量组(HD组)分别补充100和200 mg/kg BW剂量的POP (溶于2mL生理盐水),对照组(Con组)补充2 mL生理盐水,每日1次,连续28 d。试验结束后,对大鼠粪便菌群16S rRNA的V3～V4区进行扩增后,Illumina MiSeq高通量测序和QIIME分析α多样性和β多样性,RDP和NCBI-16S数据库进行物种注释。结果表明:3组共有4 725个相同的操作分类单位(OTUs),Con组有140个特征OTUs,LD组有367个特征OTUs,HD组有174个特征OTUs。各组动物肠道菌群有相似的α多样性,组间β多样性有显著差异(P0.05)。与Con组相比,HD组的双歧杆菌属、LD组的乳酸杆菌目相对丰度显著增加(P0.05)。Con组大鼠的未分类紫单胞菌属、阿洛-普雷沃氏菌属为优势菌群,且核苷酸代谢、维生素代谢、碳水化合物的生物合成与代谢和脂质代谢能力减弱。综上所述,POP可改变断奶大鼠肠道菌群的结构,扶植益生菌如乳酸杆菌目、双歧杆菌属的定植及影响机体代谢功能,是一种潜在的幼龄动物膳食添加剂。     

枸芪多糖对育肥猪肠道菌群多样性及组成的影响北大核心CSCD

本试验旨在研究枸芪多糖对育肥猪肠道菌群多样性及组成的影响。选用180头80日龄的健康育肥猪,随机分为2组,每组6个重复,每个重复15头猪。对照组饲喂基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加1‰的枸芪多糖,试验期为3个月。采集育肥猪盲肠内容物,提取样本中细菌基因组DNA,进行16S rDNA基因高通量测序。结果显示:1)试验组肠道菌群的Ace指数、Chao指数和Shannon指数均显著高于对照组(P<0.05)。2)在门水平上2组的两大优势菌均为拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),对照组梭杆菌门(Fusobacteria)及梭杆菌属(Fusobacterium)的相对丰度显著高于试验组(P<0.05),互养菌门(Synergistetes)及互养菌属(Synergistes)的相对丰度显著低于试验组(P<0.05)。3) 2组在属水平上的优势菌均为拟杆菌属(Bacteroides),试验组巨单胞菌属(Megamonas)和螺杆菌属(Helicobacter)的相对丰度显著低于对照组(P<0.05)。由此得出,饲粮中添加枸芪多糖可提高育肥猪肠道菌群的丰富度和多样性,通过促进有益菌厚壁菌门、互养菌门与抑制有害菌变形菌门、梭杆菌属和螺杆菌属的增殖优化肠道菌群平衡,建立更健康的肠道菌群结构。     

中药添加剂对断奶仔猪肠道菌群的影响

试验选取28日龄体重相近的杜长大断奶仔猪72头,随机分成4个组,每组3个重复,每个重复6头,公母各半进行为期28天的饲养试验。4个处理组分别为,对照组:基础日粮,中药I组:基础日粮+1%复方中药I,中药II组:基础日粮+1%复方中药II;抗生素组:在基础日粮中添加抗生素。结果表明,与对照组相比,中药组和抗生素组仔猪回肠和盲肠段大肠杆菌数较低(P<0.01),空肠段乳酸菌数量较高(P<0.05),回肠段双歧杆菌数量较高(P<0.05),空肠和盲肠段梭菌数量较低(P<0.01),中药组和抗生素组在相应肠段对肠道菌群的影响无显著差异(P>0.05)。可见,本研究所用的两种复方中药可促进乳酸菌和双歧杆菌等益生菌的增殖,抑制大肠杆菌和梭菌等有害菌的增殖,进而改善断奶仔猪肠道微生态环境。     

甘露寡糖对断奶仔猪肠道菌群的影响

大量研究表明,甘露寡糖在动物体内可促进肠道有益菌的增殖,减少肠道病原菌,提高肠道黏膜的完整性,调节动物免疫反应,从而提高动物的生产性能。试验旨在研究甘露寡糖对断奶仔猪肠道菌群的影响,为甘露寡糖在仔猪饲料中的科学应用提供理论依据。1.材料与方法1.1试验动物与分组选取健康的28日龄断奶[杜×(大×长)]三元杂交仔猪96头,按体重相近、公母各半的原则分为4个组,每组3个重复,每个重复8头仔猪。各组初始体重无明显差异,平均体重为(7.46±0.38)kg。1.2试验饲粮及试验设计用的酵母甘露寡糖由北京奥特奇生物公司提供。试验用的基础日粮参照…