鸡MHC-B-F基因外显子3PCR-RFLP-Tas Ⅰ的多态分布

研究利用PCR—RFLP方法检测了MHC-B—F基因外显子3 TasⅠ位点不同基因型在9个鸡品种计235个个体中的分布情况。结果表明MHC—B—F基因外显子3 TasⅠ位点中存在3种基因型，命名为AA、AB、BB。它们在不同品种中的分布各异，AA基因型在杏花鸡、灵山香鸡、丝羽乌骨鸡中的频率显著甚至极显著地高于其它品种（P〈0．05 or P〈0．01），AB基因型在来航鸡与隐性白洛克中的频率相当低（P〈0．05 or P〈0.01），BB基因型在隐性白洛克中的分布频率则极显著地高于其它8个品种（P〈0．01）。     

鸡Nramp1基因多态性与部分免疫指标相关性分析

随机选取同期孵化出雏的中国地方鸡种如皋鸡和引进隐性白羽鸡72只和55只,测定部分免疫性状。利用PCR-SSCP技术检测如皋鸡和隐性白羽鸡Nramp1基因第9外显子的多态性,并对不同基因型与免疫性状进行相关分析。结果表明:如皋鸡与隐性白羽鸡H/L、淋巴细胞转化率和IgM含量均差异显著(P<0.05)。如皋鸡AA型的H/L显著低于BB型和AB型(P<0.05),而AA型的淋巴细胞转化率和IgM含量显著高于BB型(P<0.05)。隐性白羽鸡各基因型对免疫指标的影响与如皋鸡的趋势相同。该研究结果初步显示,如皋鸡的综合免疫性能优于隐性白羽鸡,AA基因型的综合免疫性能优于AB型和BB型。     

鸡pilRNAs分子的克隆及表达规律分析

旨在为禽类piRNAs的遗传特性及发生和消失机理提供基础依据,也为禽类小分子RNA及其结合蛋白的深入研究和实际应用积累基础资料。本研究以鸡作为研究对象,通过构建小RNAs的cDNA文库和TA克隆测序的方法从睾丸组织中获得了19个大小为23～39nt的pilRNAs序列。根据pilRNAs的大小、同源序列和二级结构特征,选择了3个不同序列并采用Q-PCR技术分析了中国地方鸡种如皋鸡和引进隐性白鸡的不同生长阶段不同组织中pilRNAs时空表达规律。结果表明,编码鸡pilRNAs基因序列在染色体和基因组中的分布同其它物种一样分别具有不均匀性和基因间区偏爱性;二级结构预测,发现pilRNAs具有与miRNAs不同的独特的茎-环结构;鸡pilRNAs不仅大量存在于生殖组织,还大量存在于其他组织,表达规律因pilRNAs种类、品种、性别的变化而不同,gga-piR-1在2个品种的公、母鸡所有组织中的表达量均是相对最低,且到12周龄时均趋向一致的水平;而gga-piR-4表达量相对较高;gga-piR-5在如皋公鸡中所检测的全部组织中表达量最高,且在8周龄达到最高峰,在隐性白公鸡中的表达量相对较高,而在如皋母鸡、隐性白母鸡中均呈现中度表达水平。二级结构的独特特征从不同的角度阐明了pilRNAs和miRNAs 2种成熟小RNAs的剪切方式和加工机制的完全不同;鸡pilRNAs的多组织表达表明它可能不仅局限于生殖系的发育和维持,在其他组织中也扮演了重要的角色,不同种类的pilRNAs可能在生命发育过程中参与不同的调控功能。     

8周龄中外鸡种心肌、肝脏组织差异表达基因的初步分析

本文利用mRNA差异显示技术对8周龄中国地方品种丝毛乌骨鸡、引进品种白莱航蛋鸡、白洛克肉鸡进行基因差异表达分析。结果表明：三个品种鸡的心肌、肝脏组织分别检测到18和20条差异表达的基因片段。其中，心肌组织中的差异表达片段在白莱航蛋鸡与白洛克肉鸡之间最多，肝脏组织中的差异表达片段在丝毛乌骨鸡与白洛克肉鸡间最多。实验结果为寻找产蛋、产肉及肉质性状相关的基因提供了遗传学基础信息。     

利用微卫星标记分析江苏三个地方鸡品种的遗传多样性

利用30个微卫星DNA标记对3个江苏地方鸡品种进行遗传多样性分析，通过计算等位基因频率、多态信息含量、平均杂合度、有效等位基因数和遗传距离，评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关。结果表明：江苏的3个品种在30个微卫星上共发现196个等位基因，其中96个等位基因为三个品种共有，47个等位基因为各品种所特有；3个地方鸡品种的平均杂合度：狼山鸡为0．655，鹿苑鸡为0．681，溧阳鸡为0．687；狼山鸡与溧阳鸡的遗传距离较小，而两鸡与鹿苑鸡的遗传距离较远。     

鸡AMPD1基因PCR-SSCP分析与相关性状的研究

5′-磷酸腺苷脱氨酶1(AMPD1)是嘌呤代谢中的一种重要酶类,它的功能是催化AMP(一磷酸腺苷)脱氨,生成肌苷酸(IMP),从而影响肉质风味。试验采用单链构象多态性(PCR-SSCP)技术,以隐性白羽肉鸡、白来航蛋鸡和两个地方品种(北京油鸡、三黄胡须鸡)纯系鸡为试验材料,对AMPD1基因进行SNPs检测和基因类型判别。卡方检验结果表明: 除三黄胡须鸡和隐性白羽肉鸡、北京油鸡和白来航鸡间差异不显著(P>0.05)外,其他各品种间差异极显著(P<0.01)。AMPD1基因多态性与北京油鸡生产和屠体性状(活重、胸肌率、肌苷酸含量等)相关分析结果表明:肌苷酸含量在三种基因型间差异显著(P<0.05)。初步推断AMPD1可能为影响鸡肉中肌苷酸生成的主效基因或与主效基因相连锁。     

应用微卫星标记对12个中国地方乌骨鸡品种遗传多样性的研究

利用27个微卫星DNA标记对12个地方乌骨鸡品种进行遗传多样性分析，通过计算等位基因频率、多态信息含量、杂合度、有效等位基因数和遗传距离，评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关，并根据遗传距离对12个鸡品种进行了聚类分析。结果表明，各乌骨鸡群体的遗传多样性较为丰富，并具有较高的选择潜力。平均杂合度最高的是竹乡鸡，为0．670；最低的是江山乌骨鸡，为0．581。27个微卫星标记中4个为中度多态座位，1个低度多态座位，22个为高度多态座位；LEI0234与LEI0192分别检测到了10．3与12．2个等位基因。以标准遗传距离为准，遗传距离最近的为沐川乌骨鸡与略阳鸡，为0．1002，而乌蒙乌骨鸡与略阳鸡最远，为0．2546。通过UPG—MA法聚类后，略阳鸡、沐川乌骨鸡、兴文乌骨鸡、盐津乌骨鸡、竹乡鸡首先聚为1类，江山乌骨鸡、郧阳白羽乌鸡、余干乌骨鸡聚为1类；金湖乌凤鸡、丝绒乌骨鸡和丝毛乌骨鸡聚为第3类；乌蒙乌骨鸡独为一类。     

Identification of single-nucleotide polymorphisms in 5' end and exons of the PRKAG3 gene in Hubbard White broiler, Leghorn layer, and three Chinese indigenous chicken breeds

5′‐AMP‐activated protein kinase plays an important role in regulating the level of ATP in the presence of metabolic stress. Previous studies revealed that polymorphisms in 5′‐AMP‐activated protein kinase gamma 3 subunit (PRKAG3) gene are associated with meat quality in pigs. In the present study, single‐nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5′‐end and exons of chicken PRKAG3 gene were identified with the method of single‐strand conformation polymorphism in Hubbard ISA White broiler, Leghorn layer, and three Chinese indigenous chicken breeds, Tibet Chicken, Shouguang Chicken and Beijing Yellow Chicken. Two SNPs in the 5′‐end of the gene and 10 SNPs in exons 3, 4, 9 and 11, of which three caused amino acid substitutions, were identified in the PRKAG3 gene of the five chicken breeds. The results will facilitate further study on the association between the mutations of PRKAG3 and chicken meat quality.     

Use of RAPD-PCR for genetic analysis of Nicobari fowl of Andamans

1. The present study was conducted to estimate genetic relatedness among Nicobari fowls (Brown, Black and White) and an exotic bird (White Leghorn) using random amplified polymorphic DNA (RAPD) polymorphism. 2. A total of 25 decamer primers were screened among all the breeds of which 24 primers amplified the genomic DNA, generating 2000 to 200 bp bands. Ten primers generated reproducible and distinct RAPD profiles and were used for further analysis. 3. A total of 94 bands were amplified and 30 polymorphic bands (32%) were produced. The number of polymorphic loci ranged from 1 to 5 with an average of 3.0. 4. Among the native breeds Brown Nicobari showed higher genetic similarity (0.85) than Black Nicobari (0.80) and White Nicobari fowl (0.82). 5. Brown Nicobari showed high genetic similarity with Black Nicobari (0.87 +/- 0.029); least similarity was between White Nicobari and White Leghorn (0.77 +/- 0.028). 6. The RAPD profile of all Nicobari fowls on amplification with the primers PBG5 and PBA12 showed specific bands of molecular size 1050 and 785 bp, respectively. 7. The native breeds showed the least genetic distance with each other while White Leghorn appeared to be most distant from the native breeds.     

鸡NFATc3基因在不同表型肌肉中表达差异的研究

为探讨NFATc3在生长速度差异较大的2个品种鸡生长发育早期不同表型肌肉中的表达规律,利用实时荧光定量PCR技术检测清远麻鸡(慢生型)和隐性白羽鸡(速生型)三种表型肌肉(腓肠肌外侧头、比目鱼肌和趾长伸肌)NFATc3 mRNA在0、1、3、5、7、9周龄时的表达情况。结果发现:2个鸡品种中三种表型肌肉均呈现先下降后上升再下降的趋势,除隐性白羽鸡的腓肠肌外侧头、比目鱼肌外,2个鸡品种中其他表型肌肉的表达量均在2周龄最低;趾长伸肌和比目鱼肌NFATc3 mRNA的表达峰值在清远麻鸡中出现在3周龄,而在隐性白羽鸡中三种表型肌肉的表达峰值均出现在0周龄;总体而言,NFATc3 mRNA在比目鱼肌中的表达量要低于其在趾长伸肌和腓肠肌外侧头中的表达量;品种间比较发现,NFATc3 mRNA在清远麻鸡三种表型肌肉的表达量在3周龄时高于隐性白羽鸡。研究结果提示,鸡肌肉NFATc3表达发育模式具有品种、年龄和表型特异性,并可能与鸡肉品质存在关联。     

利用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用7个微卫星标记对12个贵州地方鸡种及1个引入鸡种的遗传多样性进行了检测，分析了各标记座位上的等位基因及频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量、平均多态信息含量及群体间的亲缘关系。结果表明：13个种群在7个标记座位上的等位基因及频率等均存在一定差异。其中，瑶山鸡的平均基因杂合度最高，引入鸡种隐性白洛克的平均基因杂合度最低，其余鸡种介于其间。平均多态信息含量的分析结果与此类似，说明瑶山鸡的遗传多样性最为丰富。模糊聚类的结果表明，13个鸡种分为2大类群，隐性白洛克独自为1个类群，12个贵州地方鸡种构成1个类群。12个贵州地方鸡种又可进一步分为2个小类群：其中1个小类群由兴义土鸡、矮脚鸡首先聚在一起，然后依次聚上黔东南小香鸡、黔东南小香乌骨鸡构成；高脚鸡、瑶山鸡、威宁鸡、竹乡鸡、竹乡乌骨鸡、黑羽乌蒙乌骨鸡、乌蒙鸡、麻羽乌蒙乌骨鸡则构成另一个小类群。     

3个品种鸡的蛋品质比较研究

随机选取43周龄的拉萨白鸡鸡蛋、藏鸡鸡蛋和白来航鸡鸡蛋各30枚,进行蛋品质测定。结果表明,3个品种鸡的蛋品质存在差异,除蛋比重差异不显著（P〉0.05）外,拉萨白鸡鸡蛋、白来航鸡鸡蛋与藏鸡鸡蛋的蛋重、蛋壳颜色、气室直径、蛋壳百分率、蛋壳强度、蛋黄重量、蛋壳厚度均存在极显著差异（P〈0.01）;拉萨白鸡鸡蛋、藏鸡鸡蛋与白来航鸡鸡蛋的蛋形指数存在极显著差异（P〈0.01）;拉萨白鸡鸡蛋与藏鸡鸡蛋、白来航鸡鸡蛋的蛋白高度、哈氏单位存在极显著差异（P〈0.01）;蛋白重量、蛋黄比色在3个品种鸡的鸡蛋中存在极显著差异（P〈0.01）;拉萨白鸡鸡蛋与藏鸡鸡蛋、白来航鸡鸡蛋的蛋白百分率存在显著差异（P〈0.05）;3个品种鸡的蛋壳重量和蛋黄百分率相互表现出显著或极显著差异（P〈0.05或P〈0.01）;拉萨白鸡鸡蛋、白来航鸡鸡蛋与藏鸡鸡蛋的血肉斑存在显著差异（P〈0.05）。综合来看,拉萨白鸡的蛋品质最佳,具有良好的市场前景,应加大对拉萨白鸡的品种培育力度。     

微卫星DNA标记与肉鸡腹脂率的相关分析

本研究测定了隐性白羽和仙居鸡参考家系F2代个体的腹脂率及26个微卫星标记,将不同基因型与腹脂率进行方差分析和多重比较。试验结果表明:位于4号染色体上的微卫星标记ADL136和10号染色体上的微卫星标记MCW67与腹脂率显著相关。     

用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用20个微卫星座位对贵州12个地方鸡种和隐性白洛克进行遗传分析,得到各品种的等位基因频率、平均杂合度、多态信息含量及品种间的Nei氏标准遗传距离,并进行了聚类分析。结果表明:13个鸡种在各微卫星座位上的遗传杂合度均有差异,平均遗传杂合度为0.6885(贵州地方鸡种为0.6915);平均多态信息含量为0.6297(贵州地方鸡种为0.6326),说明贵州地方鸡种遗传多样性较隐性白洛克丰富。UPGMA聚类分析结果显示,13个鸡种分为2大类群,隐性白洛克独自构成一个类群,12个贵州地方鸡种为另一个类群,12个贵州地方鸡种进一步可分为4个小类群。研究结果对贵州地方鸡种资源的评估、保存和利用具有一定的指导意义。     

Complete nucleotide sequence of mitochondrial DNA in White Leghorn and White Plymouth Rock chickens

Among the chicken breeds, White Leghorn (WL) and White Plymouth Rock (WR) are major breeds and have different history in their establishments. Whole mitochondrial DNA of the breeds were sequenced in order to elucidate the genetic relationship between the breeds. The lengths of the two WL and two WR mitochondrial DNA were found to be 16 788 and 16 785 base pairs, respectively. When the DNA sequences were compared, the similarity was found to be 99.96% (six nucleotide differences). In addition, the present study conformed the existence of an extra nucleotide ‘C’ in NADH dehydrogenase subunit 3 (ND3) of the chicken mitochondrial DNA, which has been consistently observed in Galliformes.     

5个地方山羊品种血液蛋白多态性及分类的研究

为进一步开发和利用山羊，采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对我国5个地方山羊品种的8个血液蛋白位点进行了多态性检测，结果发现Hb、Alb、Tf、Po、Am等5个位点为多态位点，Cp、Es、Sα2等3个位点为单态位点。通过遗传距离的聚类分析将5个山羊品种分成3类：湘东黑山羊和武雪山羊为一类；内蒙古白绒山羊和辽宁盖县白绒山羊为一类；马头山羊单列为一类。此外，对血清蛋白的染色方法进行了改良。     

微卫星DNA标记与鸡肉品质性状的相关分析

本研究测定了隐性白羽和仙居鸡参考家系F2代500羽个体的26个微卫星座位的多态性,分析微卫星标记与鸡肉品质性状之间的相关性,结果发现:位于2号染色体上的标记ADL212分别与pH值和嫩度显著相关;位于3号和5号染色体上的微卫星标记MCW 004和MCW 223与肉色显著相关;与胸肌失水率显著相关的微卫星标记分别为:位于2号染色体的MCW 264和ADL212以及5号染色体的MCW 223和9号染色体的ADL211。     

丝羽乌骨鸡与其它鸡种遗传关系的研究

乌骨鸡是著名的药用品种 ,本文通过测定乌骨鸡和其它三种家鸡的线粒体DNAD -环区部分序列来研究其遗传结构与其它鸡种的异同。在所测的 2 0个DNA序列中共检测到 2 4个变异位点 ,变异率为 4.45 % ,说明乌骨鸡与其它鸡种的差异较小。研究还显示 ,乌骨鸡与白银耳鸡关系最近、与萧山鸡关系次之 ,与仙居鸡距离较远