南瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析

 应用RAPD技术对70份南瓜种质进行遗传多样性分析, 从100条随机引物中筛选出21条引物, 共扩增出168条带, 其中157条为多态带, 比率为93.5%。系统聚类分析将70份南瓜种质分为3大类: 中国南瓜、美洲南瓜、印度南瓜, 与传统分类学的结果相符。同时在3大类群内又将种质进行细分,第1类分为3组, 第2类分为6组, 第3类分为5组, 其结果与地域来源和形态特征有一定的相关性。主成分分析与系统聚类分析结果基本一致, 但系统聚类分析在揭示密切相关的个体间的关系上能提供更丰富的信息。     

番茄种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术,对63份番茄种质资源进行了遗传多样性研究。结果表明:从180个RAPD引物当中,筛选出22条稳定性好、多态性强的RAPD引物,共扩增出多态性带207条,多态性条带比率为86.96%,63份番茄栽培品种或品系间的相似系数介于0.28～0.99之间,说明RAPD能很好的对番茄野生种、近缘野生种和栽培种进行多态性分析。采用UPGMA进行聚类分析,得到与生物学分类地位基本一致的结果。     

马尾松种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用18条RAPD引物对35份马尾松种质资源进行了DNA扩增试验,共产生153条RAPD标记条带,其中多态性带137条,多态性百分率为89.5%,平均每个引物检测到的条带数为8.5条。结合聚类分析,进行马尾松种质资源遗传多样性研究,结果表明RAPD可以准确分析研究马尾松种质资源遗传多样性。     

雷州半岛菠萝蜜种质遗传多样性的RAPD分析

 用RAPD标记方法对我国雷州半岛的65份菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus Lam. ) 实生种质资源DNA的遗传多样性进行了检测, 16个引物共检测到78条带, 其中69条具多态性(占88.4% ) 。聚类分析表明, 65份菠萝蜜材料在遗传距离0.26处可分为3大类。供试种质虽具有丰富的形态性状变异, 但在DNA水平上平均相似性系数为0.7341。干、湿胞类型及引自马来西亚的种质均不能独立聚类。对菠萝蜜品种的干、湿胞分类法及菠萝蜜品种的引种区域进行了讨论。     

黄伞种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术对9个黄伞菌株进行遗传多样性分析.结果表明:RAPD技术是准确评估黄伞遗传多样性的有效方法.50条RAPD引物中筛选出8条多态性引物,共检测出226条带,其中多态性条带143条,多态率为63％.菌株之间遗传相似系数(GS)变幅范围为0.6181～0.9306,平均GS值为0.746,表明黄伞遗传变异较丰富.聚类分析结果表明,在相似系数0.763处可将9个黄伞菌株划分为4类.     

燕山板栗种质资源遗传多样性的RAPD分析

为研究燕山板栗的遗传多样性,采用随机扩增多态DNA(randomamplifiedpolymorphicDNA,RAPD)技术对36份燕山板栗种质进行了分析。分析了燕山板栗的遗传丰富度,并对包括36个燕山板栗品种和8份外来板栗品种在内的44份板栗种质进行聚类分析。结果表明,RAPD能有效地区分品种间的差异,用16个随机引物经PCR扩增共得到132个片段,其中有83个多态性片段,占62.9%;不同遗传位点之间遗传多样度最大可达0.444,最小值为0.096,平均多样度为0.187;UPGMA法聚类,将44份板栗种质聚成4个大的类群,36份燕山板栗可分为3个大的类群,外来种质聚为一类。燕山板栗明显不同于外来品种。在RAPD图谱中,找到了19个品种(类型)的特异性标记和标记组合,可作为品种(类型)分子鉴别的依据。     

中国茶组植物种质资源遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD技术分析了中国茶组植物23个种质资源的遗传多样性。筛选的11个随机引物扩增出135条RAPD谱带, 其中有多态带123条, 平均多态性为91.11%。聚类分析表明, 广南茶与大苞茶之间的遗传距离最小(0.1378) , 汝城白毛茶与厚轴茶之间的遗传距离最大(0.8995) , 应用UPGMA聚类分析法构建了DNA分子系统树图, 并据此讨论了茶组植物的分类。     

豆瓣菜种质资源遗传多样性的RAPD和ISSR分析

以8个豆瓣菜的品种为试材，用筛选出的79个RAPD引物和34个ISSR引物对这8个品种的基因组DNA进行扩增，分别扩增出361条和179条谱带，每个引物扩增出的带在3～10条之间，平均每个引物扩增出约5条带。根据所得的条带进行聚类分析，两种标记产生的聚类图存在一些差异，但它们都可以较好地将8个品种按亲缘关系的远近划分为3个不同的类群。Mantel测试得出相关系数r=0．58155，表明RAPD和ISSR两种分子标记技术的相关度很低。     

杧果种质遗传多样性的RAPD分析

对杧果不同生态型、不同胚性、不同果形与果色的38份品种和1个近缘种—扁桃进行了RAPD分析,19个引物在39份种质中共扩增出223条带,其中多态性带为196条,多态性带的百分率为87.89%,表明品种间存在着广泛的遗传基础。利用UPGMA进行聚类分析,在相似性系数0.755的水平上将38个品种分成3组,该结果与传统上以胚型为依据进行品种类群划分比较吻合。发现了多个与胚性密切相关和1个与果皮颜色密切相关的RAPD标记,并就部分品种的系谱关系、胚性和果皮颜色的遗传进行了探讨。     

辣椒种质遗传多样性的RAPD分析

采用11个RAPD随机引物对37份辣椒材料进行PCR扩增。共扩增出51条谱带,其中多态性条带36条,多态性检测率占70.6%,不同引物扩增的条带在3~7条不等。结果表明:通过聚类分析37份辣椒种质供分为5个类群,每类群的种质亲缘关系较近,但遗传关系与地域距离并无明显的相关性。     

适于南瓜遗传多样性分析的RAPD引物筛选

采用CTAB法提取南瓜DNA基因组,优化的RAPD反应体系,对RAPD随机引物进行了筛选,从260条引物中筛选出多态性好、稳定性高的引物26条作为南瓜RAPD分析引物,为进一步进行南瓜遗传多样性分析提供依据.     

芥菜种质资源的RAPD和ISSR分析

利用RAPD和ISSR标记对28份芥菜种质资源进行遗传多样性分析,20个RAPD引物共扩增出162条清晰的谱带,其中140条显示多态性,平均每个引物扩增出7.0条多态性谱带.18个ISSR引物共扩增出143条清晰的谱带,其中多态性谱带124条,平均每个引物扩增出6.9条多态性谱带.基于RAPD和ISSR两种标记,利用UPGMA分别构建了28份芥菜资源的聚类树状图.结果表明,RAPD和ISSR分别聚类以及两种标记混合聚类均将28份芥菜种质分为3类:第Ⅰ类群中包括了15份种质;第Ⅱ类群中包括了9份种质;第Ⅲ类群中包括了4份种质.     

冬瓜和节瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD分子标记技术对41份冬瓜和节瓜种质资源进行遗传多样性分析。从455条随机引物中筛选出23条能产生稳定多态性扩增谱带的引物用于RAPD分析,共产生143条扩增谱带,其中多态性谱带81条,多态性检测率为56.6%,表明冬瓜和节瓜种质资源在分子水平上具有丰富的遗传多样性。用NTSYSpc软件处理RAPD数据,41份材料间的遗传相似系数在0.60～0.99之间。聚类分析结果可将供试材料分为6大类群9个亚类,主坐标分析可将供试材料分为6大类群10个亚类。两种分类方法的结果基本一致。     

洋葱RAPD遗传多样性分析

 利用RAPD技术对41份洋葱种质资源的遗传多样性进行了分析。从100个随机引物中筛选出7个引物, 共扩增出64个位点, 其中多态性位点34个(53113% ) 。材料间遗传相似系数变化范围为0.694～1.000。在遗传相似系数为0.926水平上, 聚类分析结果可将供试材料分为9类, 聚类结果与形态学特征有一定对应关系。     

马铃薯新型栽培种资源遗传多样性的RAPD分析

 对马铃薯17份新型栽培种和7份普通栽培种材料进行了RAPD分析，14条随机引物共扩增 出170个位点，其中130个位点表现为多态性，占75.26％，表明新型栽培种材料具有广泛的遗传基础。利用UPGMA法进行聚类分析，24份材料被分成4个组，新型栽培种与普通栽培种分别划为不同的组。     

30份莲种质资源的RAPD遗传多样性分析

采用RAPD分子标记技术对30份莲(Nelumbo nueifera Gaertn.)种质资源的遗传多样性进行鉴定.筛选出14对有效引物进行PCR扩增,共产生2 146条带,其中有1 516条为多态性条带,各对引物的平均多态性条带为108.29条,扩增条带的多态率达70.64％.对所得到的30份莲种质资源的RAPD图谱...     

广东猕猴桃种质资源RAPD聚类分析

为了探讨广东省和平县猕猴桃栽培品种和野生种之间的亲缘关系和类群聚合,试验采用优化后的猕猴桃RAPD分子标记方法,对源自广东省和平县的21个猕猴桃品种(引进和野生)进行分子多态性比较和聚类分析.结果表明:猕猴桃种间的相似性系数为65%～90%,依据不同的相似性系数水平把21个种及品种分为不同的类群、所聚类群与传统的形态学分类有一定的差异;猕猴桃野生种与栽培品种之间有较大的差异,但中华猕猴桃和美味猕猴桃2个种内的各个栽培品种在聚类上互有交叉.黄毛猕猴桃品种与毛花猕猴桃、京梨猕猴桃、阔叶猕猴桃等野生种之间差异小,亲缘关系较接近,推测可能起源于同一个祖先种.广东和平县猕猴桃属植物类型丰富,具有较高的遗传多样性.