湖北省稻瘟病重发区病菌群体遗传多样性的研究（英文）

基于rep-Pot2-PCR指纹技术,对湖北省稻瘟病重发区病菌群体DNA指纹图谱进行了分析,结果表明,湖北省稻瘟病菌群体具有较丰富的遗传结构,在73%的指纹相似性水平上可将204菌株划分成112个不同的单元型和14个遗传谱系;14个谱系中没有出现绝对的优势谱系;不同年份稻瘟病菌群体遗传结构存在差异,但未发生明显的演化。DNA指纹分析的遗传谱系与生理小种(致病类型)之间呈复杂对应关系。     

重庆稻瘟病菌群体遗传多样性分析

采用rep-PCR指纹技术,对73个重庆稻瘟病菌菌株进行了DNA指纹扩增。结果表明,菌株间显示了DNA指纹的多态性,供试菌株分别扩增出2~17条DNA带。经UPGMA聚类分析,在0.80遗传相似水平下,供试菌株分为12个遗传谱系,其中谱系L7,L9,L12为优势谱系。重庆稻瘟病菌的群体结构呈现多样性和复杂性,菌株的遗传谱系与原寄主品种和地理分布之间均表现出较明显的相关性。     

贵州稻瘟病菌群体的遗传多样性初步研究

采用Rep—PCR分子指纹技术对2003～2005年采自贵州省内的稻瘟病菌Magnaporth grisea菌株进行DNA指纹分析,结果显示,200个供试菌株分别扩增到2～15条DNA带,经UPGMA聚类分析,在0．774遗传相似水平下,供试菌株划分为19个遗传谱系,141个单元型。优势谱系为GZL7和GZL6,分别拥有49个和26个单元型,其菌株分别占42％和20．5％。研究显示,贵州稻瘟病菌的群体结构呈现多样性和复杂性,同时揭示菌株的遗传谱系与品种和生理环境有明显的相关性。     

重庆稻瘟病菌遗传谱系与生理小种的关系研究

采用rep-PCR分子指纹技术对重庆地区的稻瘟病菌进行了DNA指纹分析.结果显示70个供试菌株分别扩增到2～15条DNA带.经UPGMA聚类分析,在0.80遗传相似水平下,供试菌株划分为9个遗传谱系.结合传统的植病学方法,洲定了分布于各个遗传谱系中的40个稻瘟病菌菌株的生理小种类型.40个菌株共分为5群,15个小种,其中ZA,ZB群占优势,ZA1,ZA3,ZB1为优势小种.结果还发现菌株遗传谱系与生理小种间并不存在确定的一一对应关系.同一遗传谱系可由多个不同的生理小种组成,而同一生理小种亦可分属于几个不同的谱系.     

重庆稻瘟病菌不同菌株DNA指纹图谱分析

采用rep-PCR指纹技术对70个不同来源的稻瘟病菌菌株的DNA指纹图谱进行了测定.菌株间显示了DNA图谱的多态性,供试菌株分别扩增出2～15条DNA带.经聚类分析,在0.80遗传相似水平下,供试菌株分为9个遗传谱系,其中第3,6,9为优势谱系.菌株的遗传谱系与菌株的原寄主和原采集地之间均表现出较明显的相关性.     

不同年度重庆稻瘟病菌群体遗传结构与致病型的变化

采用rep-PCR分子指纹技术对2006-2007年重庆地区的稻瘟病菌进行了遗传结构分析。结果表明,供试菌株分别扩增到2~17条DNA带。经UPGMA聚类分析,在0.80遗传相似水平下,73个供试菌株划分为12个遗传谱系。结合传统的植病学方法,测定了分布于各个遗传谱系中的66个稻瘟病菌菌株的致病型。66个菌株分属为ZA、ZB、ZC、ZF、ZG共5群22个致病型,其中ZA、ZB群占优势,ZA11、ZB11为优势致病型。与2002年重庆稻瘟病菌70个菌株的遗传谱系和致病型进行对比发现,不同年度间重庆稻瘟病菌的谱系和致病型存在一定的动态变化,近年来呈现出更为复杂多变的遗传多样性。     

重庆稻瘟病菌遗传谱系与生理小种的关系研究

采用rep-PCR分子指纹技术对重庆地区的稻瘟病菌进行了DNA指纹分析。结果显示70个供试菌株分别扩增到2－15条DNA带。经UPGMA聚类分析,在0．80遗传相似水平下,供试菌株划分为9个遗传谱系,结合传统的植病学方法,测定了分布于各个遗传谱系中的40个稻瘟病菌菌株的生理小种类型,40个菌株共分为5群,15个小种,其中ZA,ZB群占优势,ZA1,ZA3,ZB1为优势小种。结果还发现菌株遗传谱系与生理小种间并不存在确定的一一对应关系。同一遗传谱系可由多个不同的生理小种组成,而 同一生理小种亦可分属于几个不同的谱系。     

辽宁省稻瘟病菌遗传宗谱与致病型的关系

为明确辽宁省稻瘟病菌遗传宗谱与致病型之间的对应关系,采用rep-PCR(repetitive element-based PCR)分子指纹技术,对2014年采自辽宁省8个稻区的93株稻瘟病菌进行了DNA指纹分析。结果表明:供试菌株分别扩增到3~14条DNA带,大小在0.4kb至23kb之间,绝大多数集中在2~5kb。经UPGMA聚类分析,在75%遗传相似水平下,供试93个菌株划分为17个遗传谱系,其中1,4和11为优势宗谱,分别包含13、15和27个菌株,依次占菌株总数的13.98%、16.13%和27.96%,表明了辽宁省稻瘟病菌群体遗传结构的多样性和复杂性。利用中国1套7个鉴别品种,对供试93个菌株进行生理小种鉴定,划分为6群27个小种,其中ZA、ZB群为优势群,ZA1、ZB1为优势小种。对比聚类分析和生理小种鉴定结果可知,菌株遗传宗谱与生理小种间未见存在简单的一一对应关系。同一遗传宗谱可由多个不同的生理小种组成,而同一生理小种中的菌株亦可分属于几个不同的谱系。稻瘟病菌遗传宗谱与致病型间存在复杂的关系,两者之间不存在简单的对应关系。     

宁夏稻瘟病菌群体遗传结构研究

采用Pot2-rep-PCR指纹识别技术对宁夏稻瘟病菌的群体结构进行分析。根据每个菌株的指纹型将2002至2005年在9个地区采集的406个稻瘟病菌单孢菌株鉴定为65个单元型,其中,单元型NXH7包含176个菌株,占总菌株数的43.3%,在所有年份、地区和大多数水稻品种上出现,是宁夏稻瘟病菌中最广泛适应的单元型。对稻瘟病菌群体的时空变化分析发现,不同年份、不同地区的稻瘟病菌亚群体间遗传分化不明显(地区间Gst=0.0832,年份间Gst=0.0509),遗传结构相似;不同水稻品种上的亚群体遗传分化明显(Gst=0.2823)。提示寄主的选择作用是宁夏稻瘟病菌群体演化的主要力量。宁夏稻瘟病菌菌株间有较高的相似性,总体相似性大于62%,DNA指纹没有任何清晰的系谱结构,没有任何聚类组被大于60%的bootstrap值支持。提示宁夏稻瘟病菌群体可能是单一的无性系谱占绝对优势。总体而言,宁夏稻瘟病菌群体遗传多样性水平较低(H=0.0963,I=0.1806)。     

重庆马铃薯晚疫病菌群体遗传结构研究

采用RAPD分子指纹技术,对86个重庆晚疲病菌菌株进行了DNA指纹扩增.结果表明:菌株间显示了DNA指纹的多态性,供试菌株扩增的务带分子量大小在500～2 000 bp之间.经UPGMA聚类分析,在0.80遗传相似水平下,供试菌株分为6个遗传谱系,其中谱系L1、L2、L3为优势谙系.重庆晚疫病菌的群体遗传结构较简单,菌株的遗传谱系与地理分布之间呈现一定的相关性.     

贵州稻瘟病菌遗传宗谱的组成及时空分布特征

利用Rep-PCR分子指纹对2003~2004年采自贵州7个地区22个县(市)的200个稻瘟病菌菌株进行了遗传结构分析。在83%遗传相似水平下,供试菌株被划分为87个单元型,17个宗谱。从稻瘟病菌遗传宗谱的组成与分布来看,时空特性表现较为明显。在空间上,各地区既有相同的优势单元型和优势宗谱,又有自己的特异性单元型与宗谱,且各地区病菌群体遗传结构与该地区的水稻品种布局相关;在时间上,不同年度的稻瘟病菌在遗传上存在一定程度的亲缘关系,各年度的特异性宗谱因当年水稻品种的类型而异。     

1999年江苏省稻瘟病菌群体遗传结构分析

对 1999年分离自江苏五大稻区代表地通州、高邮、赣榆、宜兴、吴江的 98个稻瘟菌标样进行了DNA指纹图谱分析 ,结果表明 :江苏田间自然发生的稻瘟菌有较丰富的遗传多样性 ,在 5 5 %的相似性水平上可以将参试菌株划分为 7个遗传系谱 ,各地区所含遗传系谱的数量和谱系分布均不相同 ,其中赣榆地区稻瘟菌遗传多样性较为复杂 ,而宜兴地区最为简单 ,仅含 2个系谱 ;采自不同地区或相邻地区不同田块同一水稻品种上的稻瘟菌同样存在遗传背景上的差异     

四川稻瘟病菌遗传宗谱的地理分布及与寄主品种的相关性研究

本研究应用rep-PCR分子指纹技术,对2000~2002年采自四川6个自然生态稻作区的137个稻瘟病菌菌株进行了DNA指纹谱型分析。以0.19遗传相似水平将供试菌株划分成37个遗传宗谱,层次较为丰富。结果表明,各稻作区稻瘟病菌遗传宗谱丰富,它们既有相同的遗传宗谱(即宗谱SCL36、37),又具有自己的特异性宗谱。在杂交稻和常规稻上检测出8个共同稻瘟病菌遗传宗谱,表明它们之间具有一定的亲缘关系;不同的宗谱在杂交稻与常规稻上的分布存在差异,有着自己的优势寄主。     

四川德昌野生香菇种质资源遗传差异分析

对四川德昌不同地区的39个野生香菇菌株进行了菌丝生长速度、酯酶同工酶和CMC酶相对活性分析。结果表明,基于酯酶同工酶的遗传相似性聚类图,在相似系数0．5的水平上,可划分为5大类群,具有丰富遗传多样性,且同一地理来源的菌株之间并无明显的遗传相关性。39个菌株菌丝生长速度差异显著,平均长速介于0．119—0．450cm／d;CMC酶相对活性存在显著差异,平均相对活性介于0—0．283cm／d。菌丝生长速度与CMC酶相对活性无必然联系。     

2000和2001年江苏省稻瘟病菌的群体结构

利用Pot2-rep-PCR技术分析了2000及2001年采自江苏省五大稻区稻瘟病菌的DNA指纹。单元型和系谱分析结果表明：稻瘟病菌在DNA水平上具有很高的多态性；不同的年份及地区间稻瘟病菌的群体结构存在明显差异，但也有部分菌株属于相同系谱甚至同一单元型，而JSL17是各稻区均有分布的优势系谱；来自不同地区、相同寄主品种的菌株有相似的遗传背景，说明寄主品种的遗传背景在病菌进化的变异中起着重要的作用。     

稻瘟病菌群体遗传宗谱组成与水稻品种布局的相关性分析

采用Rep-PCR分子指纹对来自贵州的200个稻瘟病菌菌株进行了群体遗传结构分析.结果表明,在0.83遗传相似水平下,供试菌株被划分为87个单元型,17个宗谱;同时,病菌群体遗传宗谱的组成与各地区水稻品种的布局有极大的相关性.以杂交稻为主栽品种的几个地区,如遵义、黔东南、黔西南等,稻瘟病菌群体的遗传宗谱相对单一,且多为优势宗谱GZL17;以地方品种或粳稻为主栽品种的地区,如六盘水和毕节,稻瘟病菌群体的遗传宗谱较为分散,各个宗谱所占的比例相对均匀,没有优势或次优势宗谱,显示出丰富的遗传多样性.因此,大面积种植杂交水稻可促使稻瘟病菌群体的遗传背景趋于一致,增加稻瘟病的成灾风险.     

重庆稻瘟病菌不同菌株DNA指纹图谱分析

采用rep-PCR指纹技术对70个不同来源的稻瘟病菌菌株的DNA指纹图谱进行了测定。菌株间显示了DNA图像的多态性,供试菌株分别扩增出2－15条DNA带。经聚类分析,在0．80遗传相似水平下,供试菌株分为9个遗传谱系,其中第3,6,9为优势谱系。菌株的遗传谱系与菌株的原寄主和原采集地之间均表现出较明显的相关性。     

黑龙江省稻瘟病菌遗传多样性研究

利用8个代表性菌株从153对引物组合中筛选出多态性高且稳定性好的10对引物组合,对来自黑龙江省各水稻主要产区的214个稻瘟病菌菌株进行RSAP(Restriction site amplified polymorphism)分析,得到134条多态性条带,经聚丙烯酰胺凝胶电泳,得到196个不同单元型(带型)的代表性菌株的指纹图谱。用UPGMA进行聚类分析,以相似系数0.83为界,将214个菌株196个单元型划分为10个遗传宗谱,10个遗传宗谱在黑龙江省的分布存在明显地域差异。     

Analysis of the Resistance Gene Analogue for Rice Cultivars in Yunnan Province

Genetic diversity of commercial and local rice cultivars in Yunnan Province was studied using the resistance gene analogue (RGA) based on resistance gene conserved sequences. The RGA analysis of 137cultivars was conducted by PCR amplification using three primers, i.e. S1/AS3, XLRR for/XLRR rev, and Pto-kin1/Pto-kin2, respectively. The results showed that both Indica and Japonica cultivars were genetically highly diverse. All cultivars were divided into 3 lineages according to the DNA band data at 96% dissimilarity,and into 20 lineages at 60% dissimilarity. The lineages were related to their genetic background and blast disease resistance with only a few exceptions. The RGA data can be useful in rice production by mixed-planting of different cultivars in the field and breeding of resistance cultivars by selecting different parental cultivars with great genetic diversity.