贵州白菜型油菜地方品种遗传多样性分析

利用RAPD技术对65个贵州白菜型油菜地方品种的遗传多样性进行了研究。从78个引物中筛选出16个多态性和重复性好的引物对供试材料进行标记分析。16个随机引物共扩增出153个位点条带,其中137个表现出多态性,占89．5％;主要分布于150～1800bp,平均每个引物扩增出8．6条多态性条带。遗传距离的变化幅度为0．1431～0．9904,遗传相似性变异范围为0．3714—0．8667。65个参试品种中遗传距离最小的是凤冈花油菜（2）和麻江花油菜（2）,为0．1431;遗传相似性为0．8667。结果表明：贵州白菜型油菜品种间具有丰富的遗传多样性,并表现出比较明显的地域性。     

西藏白菜型油菜遗传多样性分析

本研究利用SSR分子标记技术分析了169份来自西藏不同地区的白菜型油菜材料的遗传多样性。从本实验室已有SSR引物中筛选出23对扩增效果较好的引物用于聚类分析。结果表明:23对引物共扩增出80条条带,平均每对引物扩增出3.5条带,条带大小在50-400bp之间;在相似系数为0.50、0.53、0.56、0.59、0.62和0.70,供试材料可被划分为2类、4类、6类、9类、14类和29类。根据分子标记的聚类结果,可以初步判定这些油菜的亲缘关系,但是需要进一步结合这些材料的形态和地理分布特点,才能知道材料的起源和分化状态。     

26份贵州省芥菜型油菜地方品种遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD标记,对26份贵州省芥菜型油菜地方品种的遗传多样性进行了分析.16条RAPD随机引物共扩增出148条带,其中85条带具有多态性,多态率达57%.通过UPMGA法建立了贵州省26份芥菜型油菜的亲缘关系聚类图,在遗传距离0.30740上,26份材料分为Ⅰ、Ⅱ两个类群,第1类群2个品种,第Ⅱ类群24个品种;在遗传距离0.90337上,第Ⅱ类群划分为3个亚簇ⅡA、ⅡB、ⅡC,亚簇ⅡA有1个品种,亚簇ⅡB有6个品种,亚簇ⅡC有17个品种.万山苦油菜和镇远苦油菜之间的遗传距离最小,为0.44168,亲缘关系最近.结果表明,贵州芥菜型油菜资源间差异明显,具有丰富的遗传多样性.     

冬性白菜型油菜的遗传多样性分析

利用15对SSR引物,对51份冬性白菜型油菜种质资源进行了遗传多样性分析.共检测到96条多态性条带,多态性比率为100%;平均每对引物检测到6.4个等位变异,PIC变幅为0.5834~0.8740,平均为0.7794.51份种质资源间遗传相似系数0.500~0.969.聚类分析表明,在相似系数0.63处,51份种质资源被分为2个类群,第一类包含33个品种(系),第二类包含18个品种(系).每个类群又可以分为多个不同的亚簇.来源于甘肃省内的材料间表现出较大的遗传差异,说明甘肃省冬性白菜型油菜具有非常丰富的遗传多样性,这种来源于特殊地域的种质能够为白菜型油菜的育种提供优良基因资源.     

利用RAPD标记研究中国芥菜型油菜遗传多样性

利用ＲＡＰＤ标记,对以我国西北和西南为主的６８个芥菜型油菜地方品种和４个加拿大引进品种（系）的遗传多样性进行了研究。通过３１个随机引物的ＲＡＰＤ分析,表明选用的７２个品种（系）间存在广泛的遗传变异,多态性位点比率达８５．３１％。经ＵＰＧＭＡ聚类分析将它们划分为６大类群,从聚类图可得如下结论：（１）地理差异和生态环境对遗传差异有重要影响,即来自同一省份的品种基本上聚在同一类群中。（２）我国冬播和春播     

地黄品种遗传多样性RAPD分析

用CTAB法提取10个地黄品种幼叶的基因组DNA，用紫外分析法和琼脂糖凝胶电泳方法检测基因组DNA的纯度、大小和浓度。结果表明，从80条RAPD引物中分别筛选出适合于地黄RAPD标记分析的引物17条。17条RAPD引物对10个地黄品种（系）扩增出177条带，多态条带比率（PPB）为61．58％，平均多样性指数（I）为0．3135，遗传相似系数（GS）在0．63～0．93，平均GS为0．7545。RAPD标记的聚类分析结果，将10个地黄品种分为2类：第1类含有6个品种，包括组培85—5、大田85—5、组培9302、金白地黄、金状元和大田9302；第2类含有4个品种，包括北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄。     

中国西南地区芥菜型油菜资源遗传多样性分析

 【目的】研究中国西南地区丰富的芥菜型油菜资源遗传多样性，为芥菜型油菜资源的保护和育种利用提供有益的数据。【方法】选取以西南地区为主的73份芥菜型油菜资源，分别进行14个随机引物RAPD标记多态性分析结果的聚类分析和15个主要植物学性状量测数据的聚类分析。【结果】RAPD标记多态性分析结果的聚类分析显示为3大类，共15个亚类：四川盆地资源为第1大类，含川东、川南、川北和重庆来源等6个亚类；盆周及盆周高原和云南部分资源为第2大类，分川东南、川西南和川西北来源等4个亚类；云贵高原及长江两岸为第3大类，以贵州、云南来源的资源为主，分贵阳周边、金沙江流域和云南中部来源等5个亚类。植物学性状量测数据的聚类分析显示为4大类，共14个亚类：第1大类以川东南、重庆和云南来源的资源为主，分3个亚类；第2大类以川南、川北、云南和贵州来源的资源为主，分4个亚类；第3大类以贵州、四川来源的资源为主，分4个亚类；第4大类以川西北来源的资源为主，含3个亚类。【结论】西南地区芥菜型油菜资源间差异明显，具有丰富的遗传多样性；RAPD标记多态性分析结果和植物学性状量测数据的聚类分析结果，显示分类主要遵循地域和生态环境规律，可分清芥菜型油菜资源间的亲缘关系和遗传距离远近；在分子水平上，分类结果可能更深入和准确可靠。     

攀枝花芒果遗传多样性的RAPD分析

采用RAPD分子标记技术对12个芒果品种进行遗传多样性研究。结果发现,6条RAPD引物共检测到36条清晰谱带,其中多态性条带占比为77.78%。芒果在物种水平上遗传多样性较高,而在居群水平上遗传多样性相对较低;居群间遗传变异较高,在居群水平上,金白花的遗传多样性最高,遗传分化程度最低;乳芒和马亚的遗传多样性最低,遗传分化程度最高。聚类分析结果表明,相似系数为0.72时,12种芒果品种可分为4个大类群,金白花和鹰嘴芒的遗传一致度最大,贵妃和鹰嘴芒遗传一致度最低。     

应用RAPD标记分析黑麦属的遗传多样性

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记，对黑麦属（Secale L）7个种共12份材料进行了遗传多样性检测。结果表明，被测材料间RAPD标记多态性较高。40个随机引物中，有25个引物（占62．5％）的扩增产物具有多态性。25个引物共扩增出167条带，其中89条带（占53．2％）有多态性，每个引物可扩增出1－10条多态性带，平均3．6条。RAPD标记遗传距离（GD）变异范围为0．1382－0．4512，平均值为0．2712。聚类分析表明，在GD值0．3850水平上，12份材料可聚3类，S.africamum和S.silvestre与其它材料间的遗传分化较大，分别单独聚为一类，其余10份材料则聚为一类。据此认为，RAPD标记可以作为黑麦属物种鉴定的指纹图谱。     

不结球白菜种质资源遗传多样性RAPD分析

为挖掘不结球白菜种质资源的遗传潜力以及为不结球白菜的起源和演化提供分子证据,用RAPD分子标记对国内外64份不结球白菜种质资源的DNA遗传多样性进行了分析。结果表明：23个引物共检测出147个位点,其中71个为多态性位点,多态性位点比例达48．30％,平均每个引物产生6．39个位点和3．09个多态性位点。不结球白菜各类型中以普通白菜的Nei’s基因多样性和Shannon信息指数为最高,分别为0．1269和0．1946;各生态区域中以江淮流域不结球白菜的Nei’s基因多样性和Shannon信息指数为最高,分别为0．1237和0．1888;中国不结球白菜的这2项指数高于国外材料。不结球白菜的遗传分化系数为59．05％,说明大部分变异主要存在于种群间;基因流为0．4995,说明群体间基因流动较少。     

鄂西地区青蒿遗传多样性研究

利用RAPD和ISSR分子标记技术对11份鄂西野生青蒿种质进行了遗传多样性研究.结果表明,筛选出的8条RAPD和8条ISSR引物分别产生86条和102条扩增带,其中多态性条带分别为53条和62条,分别占总数的61.63%和60.78%.用POPGENE对两种标记方法的遗传多样性进行计算.有效等位基因数分别为1.355 2和1.370 7,基因多样性为0.2110和0.214 3,Shannon信息指数为0.318 8和0.321 6.以Nei氏遗传距离矩阵按UPGMA方法聚类分析RAPD和ISSR标记的遗传距离分别为0.035 5～0.411 3和0.142 3～0.401 1,平均值各为0.228 8和0.233 8,表明青蒿种质具有比较丰富的遗传变异,同时也说明,尽管Mantel相关性检测两种标记方法相关性较低(r=0.543 9,P0..05).但都可以有效地揭示青蒿种质的遗传多样性状况.     

贵州辣椒地方品种分子遗传多样性分析

在辣椒基因组的75个SSR标记中选出多态性丰富的17个,用于检测48个贵州辣椒地方品种,按类平均法作聚类分析.在遗传距离0.51阈值处,将参试材料分为五类:第一类含3个品种;第二类只有1个品种;第三类为2个品种;第四类分为5个亚类,第一亚类6个材料,第二亚类9个材料,第三亚类15个材料,第四亚类9个材料,第五亚类2个材料;第五类只有1个品种.参试材料的7种果型分别归于不同的类或亚类中,表明聚类结果与果型有一定的关联,同果型材料问遗传差异较小,但少数同果型的材料分布在不同类群中,与其他同果型材料间有较大遗传差异.另外,17个标记平均可检测3.8个等位基因.平均多态信息量为0.6.平均标记索引系数为2.32,48个品种同的遗传距离在0～0.566,说明,贵州辣椒种质资源的遗传多样性相对较丰富,具有良好的应用前景.     

基于SSR标记13个紫苏品种(系)的亲缘关系及遗传多样性

为紫苏种质资源利用提供参考,利用14对SSR引物对13个紫苏品种(系)提取的DNA进行PCR扩增,并对其亲缘关系进行鉴定与遗传多样性分析。结果表明:1)从13个紫苏品种(系)中共检测出51条清晰DNA条带,其中多态性条带47条,占92.16%。2)13个紫苏品种(系)的遗传距离为0.086~0.576,平均遗传距离为0.336;遗传相似性系数为0.424~0.914,平均遗传相似性系数为0.654。3)在遗传距离(SM)为0.59时,13个紫苏品种(系)可聚为2类群。类群Ⅰ为开阳紫苏(CK)1个品种(系),类群Ⅱ包括奇苏1~6号及其原种1~6号共12个品种(系)。在SM为0.67时,类群Ⅱ又可分为2部分,第1部分包括奇苏1号和奇苏6号及其原种1号和原种6号共4个品种(系);第2部分包含奇苏2~5号及其原种2~5号共8个品种(系)。在SM为0.80时,原种2号、原种3号和原种4号的亲缘关系最近,但经系选改良后,其亲缘关系已有一定距离。     

新疆大豆品种资源遗传多样性分析

[目的]探究新疆大豆品种资源遗传相似性,为确定杂交育种骨干亲本奠定基础.[方法]采用主成分分析的方法研究了26份大豆资源的形态多样性.[结果]主成分分析表明,大豆品种的生物学性状可分为产量性状因子和粒重性状因子.根据各品种第一、二主成分值进行聚类分析,把所选材料分成了七类,Ⅰ类:晚熟高产类型;Ⅱ类:大粒类型;Ⅲ类:植株高大类型;Ⅳ类:一般类型;Ⅴ类:植株矮小型;Ⅵ类:早熟类型;Ⅶ类:多荚多粒类型.[结论]分类的结果与品种实际表现型的拟合度较高,可以为杂交亲本选择提供依据.     

贵州南部野生兜兰SRAP遗传多样性分析

利用SRAP分子标记对贵州南部地区8个野生兜兰的遗传多样性进行分析,从合成的360对引物中筛选出8对多态性丰富、重复性好且扩增条带清晰的引物分别对野生兜兰DNA进行扩增,建立野生兜兰最适的PCR扩增反应体系,并利用UPGMA法对野生兜兰进行亲缘关系的聚类分析。结果表明：PCR反应共扩增出152个条带,其中多态性条带122条,多态性位点百分率为80.26%;平均观察等位基因数(N_a)为1.763 2,平均有效等位基因数(N_e)为1.506 1,Nei′s基因多样性指数(H)为0.287 9,Shannon信息指数(I)为0.424 1;供试材料的遗传相似性系数变化范围为0.513~0.756,以相似系数0.67为阀值,将不同来源野生兜兰分为3组,研究显示兜兰基于SRAP分子标记的聚类分析与形态学分类结果一致。     

红景天种内遗传多样性分析AFLP方法建立

研究建立一种用于药用植物红景天种内遗传多样性分析的AFLP分子标记方法.以提取红景天(Rhodiola.rosea L)种基因组DNA为模板,25 μL酶切体系中采用两步双酶切(Mse I、EcoR I),在20 μL连接体系中采用T4连接酶,22℃连接过夜,50 μL体系预扩增,Taq Plus酶2.5 U,dNTP 160 μM,对应引物0.5 μM,10×PCR Buffer(含Mg2+) 4.5 μL,25 μL体系选择性扩增,Taq Plus酶1.5 U,dNTP 80 μM,对应引物 0.25 μM,10×PCR Buffer(含Mg2+) 2.5 μL.AFLP分子标记技术是一种快速、准确、稳定的药用植物红景天的种内遗传多样性分析手段.     

不同类型芥菜变种遗传差异的SSR分子标记检测

为了解不同类型芥菜变种间的遗传多样性,利用66对 SSR引物对16份芥菜变种进行检测。结果表明,共扩出602个条带,多态性条带占92.5％,多态信息量（PIC）变幅为0.56～0.97,平均值为0.91。遗传相似系数为0.41～0.75,平均值为0.60,当相似系数为0.61时,可将供试材料分成4类。薹芥和抱子芥均单独为一类,第3类包括笋子芥、小叶芥和叶瘤芥,第4类包括白花芥、宽柄芥、长柄芥、大叶芥、凤尾芥、分蘖芥、卷心芥、茎瘤芥、花叶芥、结球芥和大头芥。表明16个芥菜变种间存在一定的遗传多样性。通过主成分分析也将供试材料分成4大类群,2种聚类分析结果基本一致,都说明来自相同省份的绝大部分材料聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律,但聚类结果与芥菜形态没有必然联系。     

津南芹菜EST-SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

以天津市津南11个芹菜育种材料为研究对象,利用EST-SSR分子标记技术构建津南芹菜分子指纹图谱,并用于遗传多样性分析。从GenBank数据库查询芹菜EST序列1122条,使用BatchPrimer3在线软件扫描分析获得194个候选EST-SSR位点,并设计141对SSR-PCR引物。选择其中47对引物进行多态性分析,确认8对引物具有多态性。构建基于Excel格式的津南芹菜EST-SSR指纹图谱,包括8对引物在供试材料中扩增到的44条多态性条带信息。遗传多样性分析显示,供试材料间遗传相似系数介于0.409～0.864之间,平均为0.664。本研究建立的津南芹菜EST-SSR指纹图谱稳定有效,可用于芹菜种质资源鉴定和品种真实性检测。     

10个小黑麦品种(系)的遗传多样性分析

采用RAPD分子标记技术,对10个小黑麦品种(系)进行遗传多样性分析,结果表明,通过PCR扩增出384条带,其中79条谱带具有多态性,多态性比例为20.6%,平均扩增条带为20.3条,不同品种(系)间的遗传相似系数在0.250~0.833。聚类分析表明,以遗传相似系数0.580为阈值,可将10个小黑麦品种(系)分为3类。