民猪、长白猪及其杂种母猪催乳素受体（PRLR）基因的NaeⅠ多态性与繁殖性状的相关分析

采用测序，结合PCR—RFLPs的方法在民猪、长白猪及其杂种母猪的催乳素受体（Prolactin Receptor，PRLR）cDNA序列（＋1628～＋1878）中首次发现一处NaeⅠ多态位点。该位点的多态性是由于第1789位点的碱基发生了A→G的突变，并导致氨基酸的变化（S→G），即由丝氨酸→甘氨酸的变化。分析结果表明，NaeⅠ酶切位点的基因型频率和等位基因频率在3个母猪群体间有显著差异（P〈0．01）。最小二乘分析结果显示，在民猪群体中，只存在AA和AB两种基因型，AB型母猪的初生窝重和21日龄仔猪均匀度显著高于AA型（P〈0．05）；在长白猪群体中，AA型母猪的21日龄窝重显著高于BB型（P〈0．05）；在F1代长民杂种猪群体中，BB基因型母猪的21日龄仔猪均匀度显著高于AB和AA型（P〈0．05）。     

松辽黑猪FOXA2基因第3外显子多态性及其与繁殖性状的关联分析

【目的】分析叉头框家族转录因子A2(forkhead box A2,FOXA2)基因第3外显子多态位点在地方猪种中的遗传多样性及其与松辽黑猪繁殖性状的相关性。【方法】采集90头健康经产松辽黑猪母猪耳组织,采用直接测序法检测FOXA2基因第3外显子SNP位点,利用SPSS 26.0软件分析FOXA2基因第3外显子SNP位点多态性(基因型频率、基因频率、遗传纯合度、遗传杂合度、有效等位基因数、多态信息含量)及其与松辽黑猪母猪繁殖性状(总产仔数、产活仔数、乳头数以及仔猪初生重、3周龄重、断奶重、断奶仔猪数)的相关性。【结果】松辽黑猪FOXA2基因第3外显子共检测出3个SNPs位点,1 337 bp处SNP位点(C1337A)上发现CC、CA和AA 3种基因型;1 343 bp处SNP位点(C1343G)上发现CC、CG和GG 3种基因型;1 626 bp处SNP位点(C1626T)上发现CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验表明,松辽黑猪FOXA2基因第3外显子的C1337A、C1626T位点符合哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05),C1343G位点偏离哈迪-温伯格平衡状态(P&...     

猪PRLR和FSHβ基因多态性检测及其与繁殖性状的关联分析

试验旨在研究催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)和卵泡刺激素β(follicle-stimulating hormoneβ,FSHβ)基因的多态性及其与母猪繁殖性状的关联分析。采用PCR-RFLP方法对大白猪、杜洛克猪和长白猪3个猪种共487头母猪进行了PRLR和FSHβ基因多态性检验,并采用单因子方差分析、LSD法分析不同基因型与母猪总产仔数、产活仔数、断奶窝重和断奶窝仔数等繁殖性状的相关性。结果表明,PRLR基因在大白猪和长白猪中B等位基因均为优势基因,基因频率分别为0.717和0.548,大白猪BB基因型总产仔数显著高于AA基因型(P<0.05),长白猪BB基因型断奶窝重显著高于AB基因型(P<0.05);FSHβ基因在大白猪、杜洛克猪和长白猪3个猪种中B等位基因均为优势基因,基因频率分别为0.804、0.760和0.789,长白猪BB基因型总产仔数和产活仔数均显著高于AB基因型(P<0.05),呈现BB>AA>AB趋势。因此,PRLR和FSHβ基因对荣昌猪场母猪繁殖性能有一定影响,可作为母猪繁殖性能分子选育的候选参考基因。     

松辽黑猪HBEGF基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

【目的】分析肝素结合型表皮生长因子样生长因子(heparin-binding EGF-like growth factor, HBEGF)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点在松辽黑猪中的遗传多样性及其与繁殖性状的相关性。【方法】选择90头健康经产松辽黑猪母猪,采用Sanger直接测序法检测HBEGF基因的SNP位点,利用SPSS 26.0软件分析HBEGF基因SNP位点与松辽黑猪繁殖性状(总产仔数、产活仔数、初生重、3周龄重、断奶重、断奶仔猪数和乳头数)的相关性。【结果】在松辽黑猪HBEGF基因第5外显子及第2、3、4、5内含子上共发现22个SNPs位点,其中有8个SNPs位点与繁殖性状存在显著关联。g.142114384 A>G和g.142104389＿142104388ins A>G位点存在AA、AG和GG 3种基因型;g.142114375 C>A位点存在CC、CA和AA 3种基因型;g.142111433 C>T位点存在CC和CT 2种基因型;g.142106003 G>A和g.1421...     

大白猪和长白猪EPOR基因第4内含子多态性与繁殖性状的关联分析

本研究以大白猪和长白猪为研究对象,以促红细胞生成素受体(erythropoietin receptor,EPOR)基因作为产仔性状的候选基因,采用PCR-SSCP方法来检测EPOR基因第4内含子C\T突变多态性,研究此位点多态性与猪繁殖性状之间的关联性。结果发现,在长白猪和大白猪中存在AA、AB和BB共3种基因型,在2个群体中处于中度多态。利用SAS 8.0软件采用最小二乘法拟合线性模型,将不同基因型与总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)和初生重(WB)进行了关联分析,结果表明,长白猪初产母猪BB基因型个体的WB显著高于AB、AA基因型个体(P<0.05);经产母猪BB基因型个体的TNB显著高于AB基因型个体(P<0.05);B等位基因对初产母猪TNB、NBA和WB均表现为正效应。大白猪初产母猪BB基因型个体的TNB、NBA和WB都高于AA型和AB型个体,但差异均不显著(P>0.05);经产母猪AB基因型个体的WB显著高于AA基因型个体(P<0.05);B等位基因对初产母猪TNB、NBA和WB都表现为正效应。     

猪PRLR和FSHβ基因多态性检测及其与繁殖性状的关联分析

试验旨在研究催乳素受体（prolactin receptor,PRLR）和卵泡刺激素β（follicle-stimulating hormone β,FSHβ）基因的多态性及其与母猪繁殖性状的关联分析。采用PCR-RFLP方法对大白猪、杜洛克猪和长白猪3个猪种共487头母猪进行了PRLR和FSHβ基因多态性检验,并采用单因子方差分析、LSD法分析不同基因型与母猪总产仔数、产活仔数、断奶窝重和断奶窝仔数等繁殖性状的相关性。结果表明,PRLR基因在大白猪和长白猪中B等位基因均为优势基因,基因频率分别为0.717和0.548,大白猪BB基因型总产仔数显著高于AA基因型（P<0.05）,长白猪BB基因型断奶窝重显著高于AB基因型（P<0.05）;FSHβ基因在大白猪、杜洛克猪和长白猪3个猪种中B等位基因均为优势基因,基因频率分别为0.804、0.760和0.789,长白猪BB基因型总产仔数和产活仔数均显著高于AB基因型（P<0.05）,呈现BB>AA>AB趋势。因此,PRLR和FSHβ基因对荣昌猪场母猪繁殖性能有一定影响,可作为母猪繁殖性能分子选育的候选参考基因。     

松辽黑猪RBP4基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

为探究松辽黑猪视黄醇结合蛋白4（RBP4）基因多态性及其与繁殖性状的关联性,试验选取132头松辽黑猪作为研究对象,以与猪繁殖性状相关的RBP4基因为候选基因,采用PCR-HRM分析与PCR产物直接测序相结合的方法检测松辽黑猪RBP4基因部分外显子的单核苷酸多态性（SNP）,分析RBP4基因SNP与母猪总产仔数、产活仔数、乳头数及仔猪初生重、3周龄重、断奶重的关联性。结果显示,松辽黑猪RBP4基因第3、5外显子上各存在1个SNP位点,分别命名为为G45A和C170T,其中在G45A位点检测到GG、GA和AA 3种基因型,在C170T位点检测到CC和CT 2种基因型。群体遗传参数分析及卡方适合性检验结果显示,RBP4基因G45A位点在松辽黑猪群体中分布较为均匀,遗传变异程度处于中等水平,偏离Hardy-Weinberg平衡（P<0.01）;C170T位点在松辽黑猪群体中分布不均匀,遗传变异程度较低,未偏离Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。关联分析结果表明,在RBP4基因G45A位点上,3种基因型的总产仔数及产活仔数均表现为：GG > GA > AA,其中GG基因型的总产仔数、产活仔数显著高于AA基因型（P<0.05）;GG基因型仔猪3周龄重显著低于GA基因型（P<0.05）;GG基因型仔猪断奶重显著低于GA及AA基因型（P<0.05）;各基因型在仔猪初生重及母猪乳头数上未表现出显著差异（P>0.05）。在C170T位点上,不同基因型松辽黑猪的总产仔数、产活仔数、乳头数及仔猪初生重、3周龄重、断奶重均无显著差异（P>0.05）。综上,RBP4基因G45A位点对松辽黑猪产仔数具有显著影响,但该位点是否可作为松辽黑猪产仔数相关的遗传标记,有待进一步研究;RBP4基因C170T位点可能不是松辽黑猪繁殖性状相关的突变位点,在后期工作中需扩大群体做进一步验证。     

松辽黑猪METTL23基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

为探究松辽黑猪METTL23基因多态性及其与繁殖性状的关联性,试验选取178头松辽黑猪母猪为研究对象,利用Sanger直接测序法查找METTL23基因外显子1~5的单核苷酸多态性(SNP),使用SPSS 19.0软件分析METTL23基因SNP位点与松辽黑猪繁殖性状(总产仔数、产活仔数、断奶仔猪数、初生重、3周龄重、断奶重、乳头数)的关联性。结果显示,仅在松辽黑猪METTL23基因外显子4发现1个SNP位点,命名为A62G,在A62G位点上检测到3种基因型,分别是AA、AG和GG。GG和G分别为优势基因型和优势等位基因,且A62G位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。该位点的遗传纯合度(Ho)为0.6516,高于遗传杂合度(He,0.3484),说明其在松辽黑猪群体中的变异较小;多态信息含量(PIC)为0.2877,属于中度多态位点(0.25<PIC<0.5),说明该遗传标记能够提供一定量的遗传信息。关联分析结果表明,GG基因型个体总产仔数、产活仔数和断奶仔猪数均显著或极显著高于AA基因型个体(P<0.05;P<0.01),总产仔数还显著高于AG基因型个体(P<0.05);AG基因型个体断奶仔猪数显著高于AA基因型个体(P<0.05);初生重、3周龄重、断奶重、乳头数各基因型间差异均不显著(P>0.05)。综上所述,METTL23基因外显子4存在多态性位点A62G,该位点与松辽黑猪产仔数存在显著关联,可作为松辽黑猪产仔数的遗传标记,用于分子育种。     

猪催乳素受体基因第8内含子多态性检测及效应分析

采用PCR-SSCP技术分析了杜洛克猪、长白猪、大白猪、马身猪、山西瘦肉型猪SD-〖KG-*4〗Ⅰ系、SD-〖KG-*4〗Ⅱ系、SD-〖KG-*4〗Ⅲ系和山西白猪等8个猪种372头个体催乳素受体基因（PRLR）第8内含子多态性,检测到A、B、C 3个等位基因和AA、AB、AC和CC 4种基因型。等位基因A在所有品种中频率都较高（0.50~0.62）,等位基因B在杜洛克猪中频率较低（0.12）,在其它品种中频率为中等（0.24~0.44）,等位基因C在杜洛克猪和SD-Ⅲ系中频率较高（0.26）,在其他品种中频率很低（0~0.04）。对AA和CC 2种纯合子进行克隆测序和同源序列比较,发现在扩增片段内有4处突变,即G→A、T→C、A→G的转换突变和TTT插入突变,都发生在PRLR基因的第8内含子。利用140头母猪头胎产仔记录和118头山西白猪后备猪生长发育记录,采用最小二乘分析方法研究了PRLR基因型对猪繁殖性状和生长发育性状的影响,结果表明不同基因型母猪的头胎总产仔数和产活仔数差异不显著。但PRLR基因型对后备猪乳头数、6月龄体重和背膘厚等性状有显著影响,AA型个体的乳头数显著高于AC型（P<0.05）;AC型个体的6月龄体重和背膘厚显著高于AB型（P<0.05）。     

松辽黑猪KPNA7基因多态性及其与繁殖性状的关联分析

实验旨在分析KPNA7基因多态位点在地方猪种中的遗传多样性及其与繁殖性状的相关性。选择90头健康经产松辽黑猪母猪,采用直接测序法检测KPNA7基因的SNP位点,SPSS 26.0软件分析KPNA7基因的SNP位点多态性与松辽黑猪母猪繁殖性状的相关性。在松辽黑猪KPNA7基因第9外显子和第4、8内含子共发现6个SNP位点,其中在KPNA7基因第4内含子的g.385302 T>C发现TT、TC、CC 3种基因型,g.385256G>A和g.385248G>A存在连锁突变,均检测到2种基因型：GG、GA;在第8内含子的g.372731A>G发现3种基因型：AA、AG、GG,g.372629C>T处检测到3种基因型：CC、CT、TT。KPNA7的突变位点均处于哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05)。多态信息含量(PIC)计算显示,KPNA7的突变位点均为中度多态(0.25C.位点TT基因型个体的3周龄重、断奶重显著高于TC、CC基因型个体,TT、CC基因型个体的乳头数显著或极显著高于...     

嵊县花猪PRLR基因多态性与繁殖性状的相关分析

应用PCR-RFLP技术检测嵊县花猪PRLR基因第10外显子NaeⅠ酶切位点多态性，并采用SPSS13．0统计软件分析该位点多态性对母猪繁殖性能的影响。结果表明，该位点多态性对头胎、第3和第10胎母猪繁殖性能有显著影响，表现为第1胎AA型母猪产活母仔数和断奶母仔数比AB型母猪多1．68头和1．60头；第10胎AA型母猪产活仔数、活母仔数和断奶母仔数比AB型母猪分别多0．91头，1．67头和1．19头；而第3胎AB型母猪产活仔数、活母仔数和断奶母仔数比AA型母猪分别多1．09头、1．19头和1．05头。     

牛催乳素受体(PRLR)基因HinfⅠ多态性与奶牛生产性能相关性研究

采用PCR-RFLP方法检测了牛催乳素受体（PRLR）基因intron 8多态性。结果表明：中国荷斯坦牛、加拿大荷斯坦和澳洲荷斯坦牛群体中HinfⅠ酶切后均有A和B两个等位基因存在。利用最小二乘分析研究了该多态位点对奶牛305 d产奶成年当量、乳脂肪率、乳蛋白率、初次配种日龄和初次产犊日龄的影响。结果表明：不同基因型个体的乳脂率、初次配种日龄和初次产犊日龄的差异均未达到显著水平,但呈现出AA〉AB〉BB的趋势。BB型个体的305 d成年当量与AA型、AB型个体有显著差异（P〈0.05）,BB型个体的乳蛋白率与AA型、AB型个体有极显著差异（P〈0.01）。对305 d成年当量、乳脂肪率、乳蛋白率、初次配种日龄和初次产犊日龄A基因的加性效应分别为296.00 kg/胎次、0.08%-、0.14%、4.55 d/头、15.10 d/头,A等位基因的显性效应为259.80 kg/胎次、0.07%、-0.10%、0.95 d/头和4.90 d/头。     

4个主效基因与英系长白猪繁殖性能的相关性分析

为寻找有效的分子标记用于英系长白猪辅助育种进而提高其繁殖性能,在英系长白猪群（169头）中采用PCR-RFLP技术,进行雌激素受体（estrogen receptor,ESR）、视黄醛结合蛋白（retinol binding protein 4,RBP4）、瘦素（leptin,LEP）和促卵泡素亚基β（follicle-stimulating hormone β,FSHβ） 4种与繁殖性状相关基因的基因型频率检测,利用SPSS 19.0统计软件,采用最小二乘法将各基因不同基因型与总产仔数、产活仔数、断奶窝重、断奶头数进行了相关分析。结果显示,ESR、RBP4、LEP基因均以A为优势等位基因,FSHβ基因以B为优势等位基因,其中LEP、FSHβ基因多态位点符合Hardy-Weinberg平衡定律（P>0.05）,而ESR、RBP4基因多态位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态（P<0.01）;LEP基因在长白猪母猪中表现为BB基因型为有利基因型,其总产仔数、产活仔数、断奶头数分别比AB基因型高1.3219、1.6855、1.1710头（P<0.05）;FSHβ基因中AA基因型为不利基因型,BB基因型断奶窝重比AA基因型高5.1129 kg（P<0.05）;ESR、RBP4基因对长白母猪繁殖性能均无显著影响（P>0.05）,而LEP、FSHβ基因可能作为有价值的候选基因应用于英系长白猪的分子标记辅助选择。     

The Association Analysis of Prolactin Receptor Gene Polymorphisms with Milk Yield in Yili Horse

This experiment was designed to analyze association of prolactin receptor (PRLR) gene polymorphism with milk yield of Yili horse.The number of 60 horse were selected as samples, detected genetic polymorphism of PRLR gene using PCR-SSCP technique and sequencing technology, and then analyzed the polymorphism with milk yield of Yili horse.The results showed that there were two polymorphism fragments of PRLR gene flanking region, there were three genotypes:AA, AB and BB.Two novel SNPs (g.29764513 G>A and g.30106804 C>A) were identified of PRLR gene flanking region by sequencing.The g.29764513 G>A SNP caused amino acid variations as p.33His>Arg, while the g.30106804 C>A SNP was synonymous mutation without causing amino acid changes.Statistical results indicated that the g.29764513 G>A and g.30106804 C>A SNPs were significantly associated with daily milk yield in Yili horse (P<0.05).These mutations might be as a crucial DNA genetic markersfor milk production traits selection in Yili horse.     

The Association Analysis Between 4 Major Genes and Reproductive Traits in British Landrace Pigs

The purpose of this study was to identify candidate genes associated with reproduction traits and explore the available molecular marker in British Landrace pig breed. The PCR-RFLP technique was applied to analyze the distribution of estrogen receptor (ESR), retinol binding protein 4 (RBP4), leptin (LEP) and follicle-stimulating hormone β (FSHβ) genes in British Landrace pigs. The genetic effects of ESR, RBP4, LEP and FSHβ on the reproductive traits included total number born, number born alive, weaning weight of litter, weaning piglet, which were analyzed by using least square method of SPSS 19.0 software. This results demonstrated that A was dominant allele in ESR, RBP4, LEP genes, and B was dominant allele in FSHβ gene. The result of χ² test showed that the polymorphic sites of LEP, FSHβ genes were fit with Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05), while this site of ESR and RBP4 were not fit with Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.01). In addition, the statistical analysis indicated that the total number born, number born alive and number of alive weaning litter with BB genotype of LEP were higher than AA genotype, which were significantly increased by 1.3219, 1.6855 and 1.1710 (P<0.05), respectively;The FSHβ loci had a remarkable effect on reproductive performance, the average weaning weight with BB genotype was significantly higher than AA genotype, which was significantly increased by 5.1129 kg (P<0.05). The ESR and RBP4 loci had no significant effect on reproductive traits (P>0.05), while the LEP and FSHβ genes were valuable candidates for possible marker-assisted selection in British Landrace pigs population.     

伊犁马催乳素受体基因的遗传多态性及其与产奶量的关联分析

试验旨在研究伊犁马催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因多态性及其与产奶量之间的关联性。以60匹伊犁马为研究对象,选取PRLR基因侧翼区的部分片段,采用PCR-SSCP技术检测其遗传多态性,并与伊犁马的日产奶量进行关联分析,研究PRLR基因的多态性与伊犁马产奶性能的关系。结果显示,PRLR基因侧翼区的2个片段均具有多态性,都存在3种基因型:AA、AB和BB,测序结果显示PRLR-P1的碱基突变位置为g.29764513 G>A,该突变为错义突变,导致其编码的氨基酸由组氨酸变成精氨酸,经关联分析发现,该突变对伊犁马日产奶量有显著影响(P<0.05);PRLR-P2的碱基突变位置为g.30106804 C>A,该突变为同义突变,未导致其编码的氨基酸发生改变,经关联分析发现,该突变对伊犁马日产奶量有显著影响(P<0.05)。伊犁马PRLR基因侧翼区的碱基突变与日产奶量之间存在关联性,且可能是影响伊犁马产奶性能的重要位点。